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浙江大学医学院导师教师师资介绍简介-杨帆

本站小编 Free考研考试/2021-04-05

杨帆 浙江大学 离子通道研究

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杨帆,男,浙江大学医学院生物物理学系研究员,博士生导师。中国神经科学学会离子通道与受体分会委员,副秘书长。
专长于膜蛋白的功能与动态构象变化研究,以及基于蛋白质三维结构的生物大分子理性设计。围绕着刺激感受的TRP通道,深入研究了低温、高温、辣椒素、薄荷醇以及多肽大分子等物理化学因素激活TRPV1与TRPM8通道的动态门控机制,并开发了针对TRPV1通道的具有镇痛效果的调控分子。近五年来在Nature Chemical Biology (2015)、Nature Communications (2020,2019,2018,2015)、PNAS (2020,2016,2010)、Science Advances (2017)、PloS Biology (2018) 等知名学术期刊上以通讯作者与第一作者(含共同)身份发表多篇文章。其中PNAS论文(2016, 2010)被F1000网站好评推荐;2018年PloS Biology论文成果已经入选法国中小学生教材和美国K-12教育科普教材。担任Journal of Neurophysiology、Journal of Cellular Physiology和Molecular and Cellular Endocrinology等期刊审稿人。

教育背景
2006.09-2012.06 加州大学戴维斯分校,生理学,博士。导师:郑劼教授
2002.09-2006.06 浙江大学,竺可桢学院工科混合班(生命科学专业),学士
工作经历
2012.11-2017.6 加州大学戴维斯分校,生理学,博士后。导师:郑劼教授,Vladimir Yarov-Yarovoy教授
2017.6-至今,浙江大学医学院,基础医学院生物物理学系,研究员


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离子通道及其药理学,生物物理学
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2017-06-25 11:40:00
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研究简介
\r 离子通道是位于细胞膜上的膜蛋白,由于它们的开闭直接决定了细胞内外离子的跨膜运动与神经电信号,所以它们是一大类药物作用靶点。深入理解小分子化合物调控离子通道功能的机制对于新药物的研发有着十分重要的指导作用。要理解这样的机制,就需要在原子层面掌握小分子化合物与膜蛋白的相互作用细节。作为膜蛋白,通过传统的蛋白质晶体X射线衍射的方法来解析离子通道的三维结构十分困难;随着冷冻电镜(cryo-EM)技术在近几年来的飞跃,以TRPV1离子通道为代表的一系列膜蛋白的高分辨率三维结构得到了解析,这些成果明确地显示了冷冻电镜技术的解析膜蛋白结构中远大前景。然而,即使在高分辨率冷冻电镜结构上,小分子化合物及其与膜蛋白的相互作用也经常不能得到有效解析。以TRPV1通道的冷冻电镜结构为例,虽然辣椒素结合状态的TRPV1通道结构达到了4.2?的分辨率,但是对辣椒素分子本身,仅仅有一小块电子密度可见,其大小远远小于辣椒素的化学结构,且它与通道的相互作用细不可见。这样,如何从越来越多的膜蛋白冷冻电镜结构中提取小分子化合物与其互作的信息就成为了一个挑战。
\r
\r 通过使用RosettaMembrane等计算生物学工具,首次实现了在细胞膜环境内的辣椒素分子与TRPV1通道的对接,并在原子层面计算了辣椒素分子与通道蛋白质残基之间的范德华力,氢键等各种相互作用的位置与强度。进一步通过双突变循环,单通道记录等电生理实验手段,验证了之前计算的预测。这样通过“计算 + 实验”的研究范式,阐明了辣椒素激活TRPV1通道的结构机制。这样的研究范式有双重意义:第一,TRPV1通道是重要的镇痛药物靶点,所以阐明辣椒素作为其经典的小分子化合物激动剂的作用机制对将来开发更多的TRPV1调节药物有着重要的指导作用;第二,TRPV1的三维结构解析是有着里程碑意义的冷冻电镜技术成果,从这个三维结构上进一步提取小分子化合物与通道蛋白的相互作用细节,为将来在其它蛋白质冷冻电镜结构上研究小分子化合物的作用机制树立了榜样。
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\r教育背景
\r2006.09-2012.06 加州大学戴维斯分校,生理学,博士。导师:郑劼教授
\r2002.09-2006.06 浙江大学,竺可桢学院工科混合班(生命科学专业),学士
\r工作经历
\r2012.11-2017.6 加州大学戴维斯分校,生理学,博士后。导师:郑劼教授,Vladimir Yarov-Yarovoy教授
\r代表性论文
\r1)F. Yang#, S. Vu#, Yarov-Yarovoy and J. Zheng (2016) Rational design and validation of a vanilloid-sensitive TRPV2 ion channel, Proceedings of the National Academy of Sciences, 113(26): E3657-66.(Recommended by Faculty 1000)(#共同第一作者)
\r2)F. Yang#, X. Xiao#, W. Cheng, W. Yang, PL. Yu, ZZ. Song, V. Yarov-Yarovoy and J. Zheng (2015) Structural mechanism underlying capsaicin binding and activation of the TRPV1 ion channel, Nature Chemical Biology, doi: 10.1038\/nchembio.1835. (#共同第一作者)
\r3) SL. Yang#, F. Yang#, NN. Wei#, J. Hong, BW. Li, L. Luo, MQ. Rong, V. Yarov-Yarovoy, J. Zheng, KW. Wang and R. Lai (2015) A pain-inducing centipede toxin targets the heat activation machinery of nociceptor TRPV1, Nature Communications, 6:8279. (#共同第一作者)
\r4)F. Yang and J. Zheng(2014) High temperature sensitivity is intrinsic to voltage-gated potassium channels, eLife, 3:e03255
\r5)F. Yang#, L. Ma#, X. Cao#, KW. Wang and J. Zheng (2014) Divalent cations activate TRPV1 through promoting conformational change of the extracellular region, Journal of General Physiology, 14, 91-103.(#共同第一作者)
\r6)F. Yang, Y. Cui, KW. Wang and J. Zheng (2010) Thermosensitive TRP channel pore turret is part of the temperature activation pathway, Proceedings of the National Academy of Sciences, 107(15): 7083-8 (Highlighted by Cell 141(3):377 and Faculty 1000 Biology
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浙江大学紫金港校区医学院教学楼C座307室
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2021-01-25 08:09:08
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杨帆,男,浙江大学医学院生物物理学系研究员,博士生导师。中国神经科学学会离子通道与受体分会委员,副秘书长。
专长于膜蛋白的功能与动态构象变化研究,以及基于蛋白质三维结构的生物大分子理性设计。围绕着刺激感受的TRP通道,深入研究了低温、高温、辣椒素、薄荷醇以及多肽大分子等物理化学因素激活TRPV1与TRPM8通道的动态门控机制,并开发了针对TRPV1通道的具有镇痛效果的调控分子。近五年来在Nature Chemical Biology (2015)、Nature Communications (2020,2019,2018,2015)、PNAS (2020,2016,2010)、Science Advances (2017)、PloS Biology (2018) 等知名学术期刊上以通讯作者与第一作者(含共同)身份发表多篇文章。其中PNAS论文(2016, 2010)被F1000网站好评推荐;2018年PloS Biology论文成果已经入选法国中小学生教材和美国K-12教育科普教材。担任Journal of Neurophysiology、Journal of Cellular Physiology和Molecular and Cellular Endocrinology等期刊审稿人。

教育背景
2006.09-2012.06 加州大学戴维斯分校,生理学,博士。导师:郑劼教授
2002.09-2006.06 浙江大学,竺可桢学院工科混合班(生命科学专业),学士
工作经历
2012.11-2017.6 加州大学戴维斯分校,生理学,博士后。导师:郑劼教授,Vladimir Yarov-Yarovoy教授
2017.6-至今,浙江大学医学院,基础医学院生物物理学系,研究员


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