陈善元
云南大学，生态与环境学院，教授，硕士生导师。主要从事动物遗传与基因组学、群体遗传与基因组学、系统发育地理学等方面的研究，已在国内外学术期刊发表论文58篇，其中国际SCI期刊论文43篇，主编出版专著1部，先后主持完成葡萄牙科技基金会（FCT）项目2项、国家自然科学基金项目1项。
研究领域与方向
(1)动物基因组多样性 (AnimalGenomicDiversity)
以家牛和山羊为研究对象，旨在摸清云南及周边地区家牛和山羊地方品种资源的基因组多样性状况、群体遗传结构及遗传混合程度、受到选择作用的基因或基因组区域。
(2) 整合组学 (Integrative Genomics)
采用多组学包括表观基因组学、基因组学、转录组学、蛋白质组学、功能基因组学等手段，以商业化家牛和山羊品种为对照，解析部分云南地方家牛和山羊品种抗病力性状产生的分子遗传基础。
(3) 生态基因组学 (EcologicalGenomics)
以我国特有的金线鲃属（Sinocyclocheilus）鱼类为研究对象，采用生态基因组学方法探究地表型和洞穴型金线鲃物种之间重要表型性状（如体色、眼睛、额凸）差异的分子遗传机理。
教育经历
(1) 2003-09至2006-07，云南大学，生命科学学院，生态学专业，博士
(2) 2000-09至2003-07，云南大学，生命科学学院，动物学专业，硕士
(3) 1996-09至2000-07，云南农业大学，动物科学技术学院，畜牧专业，学士
科研与学术工作经历
(1) 2020-05至今，云南大学，生态与环境学院，教授
(2) 2014-11至2020-05，云南大学，生命科学学院，教授
(2) 2014-01至2014-10，云南大学，生命科学学院，讲师
(3) 2010-02至2013-12，葡萄牙波尔图大学，生物多样性与遗传资源研究中心(CIBIO-InBio)，项目负责人
(4) 2007-03至2010-01，葡萄牙波尔图大学，生物多样性与遗传资源研究中心(CIBIO-InBio)，博士后
主持或参加科研项目（课题）情况
(1) 国家自然科学基金委员会，地区科学基金项目，**，利用生态基因组学方法解析金线鲃属鱼类体色性状演化的分子机理，2016-01至2019-12，45.6万元，已结题，参加
(2) 国家自然科学基金委员会，地区科学基金项目，**，云南家牛地方品种的基因组多样性与选择信号研究，2015-01至2018-12，50万元，已结题，主持
(3) 葡萄牙科技基金会（FCT），研发项目，PTDC/CVT/099782/2008，Detecting functional genetic variation using an “exomics” approach: massively parallel sequencing of exons from cattle and pigs，2010-03至2013-08，19.449万欧元，已结题，主持
(4) 葡萄牙科技基金会（FCT），研发项目，PTDC/CVT/105223/2008，Genome-wide diversity and origins of the domestic cattle: identifying adaptive alleles introgressed into domestic cattle from other wild bovine species，2010-02至2013-08，19.206万欧元，已结题，主持
主持或入选人才项目或教指委情况
(1) 2018年12月，入选第一批云南省“****”青年拔尖人才专项
(2)2018年10月，受聘任2018-2022年教育部高等学校大学生物学课程教学指导委员会委员
(3)2018年4月，受聘任2018-2022云南省高等学校大学生物学课程教学指导委员会主任委员
(4) 2014年6月，入选第四批云南省“百名海外高层次人才引进计划”引进人才
(5) 2014年1月，入选云南大学“优秀学科带头人”
(6) 2006年8月，荣获第三届中国青少年科技创新奖
代表性论文和专著情况（“#”表示所有共同第一作者，“*”表示通讯作者及共同通讯作者）
SCI/SCIE期刊论文
1. Li R, Li C, Chen H, Li R, Chong Q, Xiao H*, Chen S*. 2020. Genome-wide scan of selection signatures in Dehong humped cattle for heat tolerance and disease resistance. Animal Genetics, 51(2):292-299.
2. Chen H, Li C, Liu T, Chen S*, Xiao H*. 2020. A Metagenomic Study of Intestinal Microbial Diversity in Relation to Feeding Habits of Surface and Cave-Dwelling SinocyclocheilusSpecies. Microbial Ecology, 79(2):299-311.
3. Chen Y, Yang Y, Li C, Li R, Xiao H, Chen S*. 2020. Genetic diversity of TLR3and TLR8genes among five Chinese native cattle breeds from southwest China. Livestock Science, 232:103895.
4. Li R, Li C, Chen H, Liu X, Xiao H, Chen S*.2019. Genomic diversity and admixture patterns among six Chinese indigenous cattle breeds in Yunnan. Asian-Australasian Journal of Animal Sciences, 32(8):1069-1076.
5. Chen Y, Zeng B, Shi P*, Xiao H*, Chen S*. 2019. Comparative Analysis of the Liver and Spleen Transcriptomes between Holstein and Yunnan Humped Cattle. Animals, 9(8):527.
6. Li C, Chen Y, Ning T, Zhang S, Chen S*, Xiao H*. 2019. The complete mitochondrial genome of Sinocyclocheilus tingi (Cypriniformes: Cyprinidae): characterization and phylogenetic position. Conservation Genetics Resources, 11(2):125-128.
7. Pérez-Pardal L#, Chen S#, Costa V, Liu X, Carvalheira J, Beja-Pereira A*. 2018. Genomic differentiation between swamp and river buffalo using a cattle high-density single nucleotide polymorphisms panel. Animal, 12(3):464-471.
8. Li R, Li C, Liu H, Zeng B, Xiao H, Chen S*.2018. Mitochondrial diversity and phylogeographic structure of native cattle breeds from Yunnan, Southwestern China. Livestock Science, 214:129-134.
9. Chen YY, Li R, Li CQ, Li WX, Yang HF, Xiao H*, Chen SY*. 2018. Testing the validity of two putative sympatric species from Sinocyclocheilus (Cypriniformes: Cyprinidae) based on mitochondrial cytochrome bsequences. Zootaxa, 4476(1):130-140.
10. Chen Y, Li C, Yan H, Xiao H, Chen S*. 2018. The complete mitochondrial genome sequence of Buceros bicornis(Bucerotiformes: Bucerotidae). Conservation Genetics Resources, 10(3):287-290.
11. Chen S, Gomes R, Costa V, Santos P, Charneca R, Zhang Y, Liu X, Wang S, Bento P, Nunes JL, Buzgó J, Varga G, Anton I, Zsolnai A, Beja-Pereira A*.2013. How immunogenetically different are domestic pigs from wild boars: a perspective from single-nucleotide polymorphisms of 19 immunity-related candidate genes. Immunogenetics, 65(10):737-748.
12.Chen S, Gomes R, Costa V, Rocha I, Zsolnai A, Anton I, Charneca R, Santos P, Nunes JL, Buzgó J, Varga G, Zhang Y, Beja-Pereira A*. 2012. Novel coding genetic variants of the GBP1gene in wild and domestic pigs (Sus scrofa). Livestock Science, 146(1):1-4.
13.Chen S, Costa V, Beja-Pereira A*. 2011. Evolutionary patterns of two major reproduction candidate genes (Zp2and Zp3) reveal no contribution to reproductive isolation between bovine species. BMC Evolutionary Biology, 11:24.
14. Chen S#, Lin BZ#, Baig M, Mitra B, Lopes RJ, Santos AM, Magee DA, Azevedo M, Tarroso P, Sasazaki S, Ostrowski S, Mahgoub O, Chaudhuri TK, Zhang Y, Costa V, Royo LJ, Goyache F, Luikart G, Boivin N, Fuller DQ, Mannen H, Bradley DG, Beja-Pereira A*. 2010. Zebu cattle are an exclusive legacy of the South Asia Neolithic. Molecular Biology and Evolution, 27(1):1-6.
15. Chen SY, Zhang RD, Feng JG, Xiao H, Li WX, Zan RG, Zhang YP*. 2009. Exploring factors shaping population genetic structure of the freshwater fish Sinocyclocheilus grahami(Teleostei, Cyprinidae). Journal of Fish Biology,74(8):1774-1786.
16. Chen SY, Costa V, Azevedo M, Baig M, Malmakov N, Luikart G, Erhardt G, Beja-Pereira A*. 2008. Short Communication: New alleles of the bovine κ-caseingene revealed by resequencing and haplotype inference analysis. Journal of Dairy Science, 91(9):3682-3686.
17.Chen SY#, Duan ZY#, Sha T, Xiangyu JG, Wu SF, Zhang YP*. 2006. Origin, genetic diversity, and population structure of Chinese domestic sheep. Gene, 376(2):216-223.
18. Chen SY#, Zhou F#, Xiao H, Sha T, Wu SF, Zhang YP*. 2006. Mitochondrial DNA diversity and population structure of four Chinese donkey breeds. Animal Genetics, 37(4):427-429.
19. Chen SY, Su YH, Wu SF, Sha T, Zhang YP*.2005. Mitochondrial diversity and phylogeographic structure of Chinese domestic goats. Molecular Phylogenetics and Evolution, 37(3):804-814.
20. Xiao H#, Chen SY#, Liu ZM, Zhang RD, Li WX, Zan RG*, Zhang YP*. 2005. Molecular phylogeny of Sinocyclocheilus(Cypriniformes: Cyprinidae) inferred from mitochondrial DNA sequences. Molecular Phylogenetics and Evolution, 36(1):67-77.
专著
陈善元主编: 瘤牛抗病力分子机制研究. 北京: 科学出版社; 2020.03;ISBN 978-7-03-064497-8.
中文核心期刊论文
1. 徐永媛, 李蓉, 陈艳艳, 陈善元*, 肖蘅*. 2019. 中国部分地区黑胸大蠊遗传多样性与系统发育地理结构研究. 生物学杂志, 36(1):65-69.
2. 陈泓宇, 闫海亚, 赵胤丞, 肖蘅, 陈善元*. 2018. 宏基因组学及其在鱼类肠道微生物中的研究进展. 水产科学, 37(05):699-706.
3. 段昕妤, 肖蘅, 陈善元*. 2018. DNA甲基化测序技术及其在哺乳动物中的应用研究进展. 生物学杂志, 35(05):79-82+86.
4. 李蓉, 陈艳艳, 和忠廷, 杨洪福, 李春青, 曾本娟, 陈善元*, 肖蘅*. 2018. 云南丘北仙女虾一物种的分子鉴定. 生物学杂志, 35(1):46-51.
5. 刘涛#, 李蓉#, 肖蘅*, 陈善元*. 2018. RAD-seq技术在鱼类基因组学中的研究进展. 云南大学学报(自然科学版), 40(06):1283-1289.
6. 刘合松, 李蓉, 肖蘅, 陈善元*. 2018. 世界家牛基因组多样性研究进展. 基因组学与应用生物学, 37(3):1183-1189.
7. 陈泓宇, 陈艳艳, 李蓉, 肖蘅*, 陈善元*. 2017. 代表性鱼类物种全基因组测序研究进展. 生物学杂志, 34(6):73-77.
8. 段昕妤, 肖蘅, 陈善元*. 2017. 动物类群中水平基因转移的研究进展. 生命科学研究, 21(4):360-364.
9. 李蓉#, 郑雨田#, 李春青, 陈艳艳, 杨振升, 陈善元*, 肖蘅*. 2017. 基于线粒体COI基因序列的壮真蝎与普洱真蝎的分子鉴定. 四川动物, 36(2):139-144.
10. 曾本娟, 李蓉, 肖蘅, 陈善元*. 2017. 家养牛品种间抗病力差异的分子遗传基础研究进展. 畜牧兽医学报, 48(2):193-200.
11. 陈善元, 张亚平*. 2006. 家养动物起源研究的遗传学方法及其应用. 科学通报, 51(21):2469-2475.