姓 名:
刘长宁性 别:
男
职 务:
职 称:
研究员(自然科学)
通讯地址:
云南省勐腊县勐仑镇西双版纳热带植物园
邮政编码:
666303电子邮件:
liuchangning@xtbg.ac.cn

中文简历：
　　


个人情况

姓名 刘长宁；性别 男；出生年月 1978年12月

籍贯 湖南长沙；婚姻及家庭状况 已婚；

有效联系方式 151-9873-0541 liuchangning@xtbg.ac.cn

　　

教育履历

1996.9 - 2000.7 武汉大学 国家生物学基地班 学士 （导师 黄诗笺教授）

2002.9 - 2007.7 中科院计算技术研究所 生物信息学 博士 （导师 李国杰院士、陈润生院士）

2006.6 - 2007.1 哈佛大学Dana Farber癌症研究所 访问学生

　　

工作经历

2007.7 - 2010.7 中科院计算技术研究所 助理研究员

2010.7 - 2014.9 中科院计算技术研究所 副研究员

2011.1 - 2013.1 德克萨斯大学达拉斯分校 访问学者

2014.9 – 至今 中科院西双版纳热带植物园 研究员

　　

荣誉及奖励情况

2011 中国科学院青年创新促进会首批会员

2008 中国科学院卢嘉锡青年人才奖

2007 中国科学院计算技术研究所首批百星计划成员

2007 中国科学院院长优秀奖学金

2007 中国科学院三好学生

2006 中国科学院计算技术研究所所长奖学金

2006 中国科学院三好学生标兵

2003 中国科学院研究生院优秀研究生奖学金

1999 武汉大学数学和生物学新星奖学金

1997 武汉大学丙等人民奖学金

1996 武汉大学丙等人民奖学金



科研项目主持情况

基于多组学数据整合的肿瘤相关长非编码RNA优化筛选和调控机制研究（国家自然科学基金2015.01-2018.12 90万 负责人）　　

长非编码RNA数据库及应用软件平台的构建（科技部863 2014.1-2016.12 95万 负责人）　

非编码RNA参与的复杂网络研究（中科院青促会 2012.01-2014.12 30万 负责人）

非编码RNA与蛋白质相互作用预测算法的研究（国家自然科学基金2011.01-2013.12 18万 负责人）

非编码RNA与蛋白质相互作用功能Domain分析（中科院院长奖专项 2009.01-2010.12 10万 负责人）



学术和国际国内组织兼职情况

中国科学院青年创新促进会 会员

Asia Pacific Bioinformatics Network (APBioNET) 会员

中科院数学、计算机与生命科学交叉研究青年论坛 组委会成员

SCI国际期刊PLoS One，BMC Genomics，Cell Proliferation，Journal of Theoretical Biology，BioMed Research International审稿人
英文简历：

研究领域：
生物信息
社会任职：

获奖及荣誉：

代表论著：
代表性论文 （#并列第一作者，*通讯作者）

1) Liu, C., B. Bai, et al. "Noncode: An Integrated Knowledge Database of Non-Coding Rnas." Nucleic Acids Res 33, no. Database issue (2005): D112-5. (影响因子 8.06 引用次数 153)



2) Zhang, Z.#, C. Liu#, G. Skogerbo, et al. "Dynamic Changes in Subgraph Preference Profiles of Crucial Transcription Factors." PLoS Comput Biol 2, no. 5 (2006): e47. (影响因子 5.94)



3) He, S.#, C. Liu#, G. Skogerbo, et al. "Noncode V2.0: Decoding the Non-Coding." Nucleic Acids Res 36, no. Database issue (2008): D170-2. (影响因子 8.06 引用次数 84)



4) Zhao, Y.#, S. He#, C. Liu#, S. Ru, et al. "Microrna Regulation of Messenger-Like Noncoding Rnas: A Network of Mutual Microrna Control." Trends Genet 24, no. 7 (2008): 323-7. (影响因子 9.33)



5) He, S.#, H. Su#, C. Liu#, G. Skogerbo, et al. "Microrna-Encoding Long Non-Coding Rnas." BMC Genomics 9, (2008): 236. (影响因子 4.62)



6) Yuan, X.#, C. Liu#, P. Yang, et al. "Clustered Micrornas' Coordination in Regulating Protein-Protein Interaction Network." BMC Syst Biol 3, (2009): 65. (影响因子 3.30 引用次数 57)



7) Liu, C.*, J. Li and Y. Zhao. "Exploring Hierarchical and Overlapping Modular Structure in the Yeast Protein Interaction Network." BMC Genomics 11 Suppl 4, (2010): S17. (影响因子 4.62)



8) Liao, Q.#, C. Liu#, X. Yuan, et al. "Large-Scale Prediction of Long Non-Coding Rna Functions in a Coding-Non-Coding Gene Co-Expression Network." Nucleic Acids Res 39, no. 9 (2011): 3864-78. (影响因子 8.06 引用次数 75)



9) Liao, Q., H. Xiao, ..., Z. Wu, C. Liu* and Y. Zhao*. "Ncfans: A Web Server for Functional Annotation of Long Non-Coding Rnas." Nucleic Acids Res 39, no. Web Server issue (2011): W118-24. (影响因子 8.06)



10) Li, J., Z. Xuan and C. Liu*. "Long Non-Coding Rnas and Complex Human Diseases." Int J Mol Sci 14, no. 9 (2013): 18790-808. (影响因子 2.73 invited review)
承担科研项目情况：