职　　务： 基因组稳定调控学科组 负责人
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通讯地址： 云南省昆明市盘龙区茨坝街道龙欣路17号 510室 650201
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简　　历

2020.09 – 至今 中国科学院昆明动物研究所，研究员，博士生导师
2017.06 – 2020.07 The Wistar Institute，美国费城，博士后
2016.01 – 2017.05 中国科学院昆明动物研究所，副研究员
2013.08 – 2015.12 中国科学院昆明动物研究所，助理研究员
2007.09 – 2013.07 中国科学院昆明动物研究所，获理学博士学位
2003.09 – 2007.06 烟台大学，生命科学学院，获理学学士学位


研究方向

基因组稳定(Genomic Stability)调控是生命活动的基础和关键内容。一方面，基因组时刻受到DNA复制叉异常、代谢活性氧物质等内源因素，或低氧、紫外线和基因毒性化合物等环境因素胁迫，产生不同类型的基因组损伤。基因组损伤类型包括单链/双链DNA损伤、DNA链交联、染色体结构/数目异常、端粒损伤等。细胞能够通过精密的应对机制维持基因组稳定。相对应地，基因组不稳定(Genomic Instability)与发育异常、肿瘤、衰老及退行性疾病等密切关联。另一方面，适度DNA损伤和基因突变是细胞和物种适应环境胁迫的必要条件，为适应性演化提供原始驱动力。
课题组围绕基因组稳定调控这一主题，以人类重大疾病机理解析和治疗策略研发为导向，运用干细胞生物学、肿瘤生物学、衰老生物学和生物信息学等技术平台，结合基因组稳定分析功能实验体系（DNA修复、DNA复制、染色体和端粒分析技术等），开展如下工作：
1.低氧与基因组稳定调控
研究低氧胁迫对基因组稳定调控系统的影响，低氧胁迫与遗传调控的互作机制及关键节点分子，低氧引起的DNA损伤和基因组变异规律，以基因组稳定调控系统的重塑为切入点解析低氧耐受和适应。
2.端粒保护及稳定性调控
利用在端粒保护中具有鲜明特征的细胞体系如胚胎干细胞、蝙蝠细胞等，研究区别于经典机制的新的端粒保护机制，解析新机制对端粒相关人类疾病机理解析和治疗的借鉴意义。
3.灵长类特异的DNA损伤调控
在灵长类着床前胚胎细胞和神经元细胞体系中，研究灵长类特异的DNA损伤发生及调控机制，应用于灵长类脑高级结构和功能研究，以及灵长类动物精准高效基因编辑技术的建立。


承担科研项目


专家类别

研究员
社会任职


获奖及荣誉

2016年：中国科学院青年创新促进会会员
2016年：国际干细胞学会（ISSCR）年会旅行奖，美国旧金山
2015年：国际干细胞学会（ISSCR）年会旅行奖，瑞典斯德哥尔摩
2015年：云南省科研机构联合会，年度优秀论文奖


代表论著

以第一/共同第一作者身份发表论文:
1. Bo Zhao, Wei-dao Zhang, Ying-liang Duan, Yong-qing Lu, Yi-xian Cun, Chao-hui Li, Kun Guo, Wen-hui Nie, Lei Li, Rugang Zhang, Ping Zheng*. Filia is an ESC-specific regulator of DNA damage response and safeguards genomic stability. Cell Stem Cell, 16: 684-98. 2015.
2. Bo Zhao^#, Weidao Zhang^#, Yixian Cun, Jingzheng Li, Yan Liu, Jing Gao, Hongwen Zhu, Hu Zhou, Rugang Zhang, Ping Zheng*. Mouse embryonic stem cells have increased capacity for replication fork restart driven by the specific Filia-Floped protein complex. Cell Research, 28: 69-89. 2018.
3. Bo Zhao, Jianhuang Lin, Lijie Rong, Shuai Wu, Zhong Deng, Nail Fatkhutdinov, Joseph Zundell, Takeshi Fukumoto, Qin Liu, Andrew Kossenkov, Stephanie Jean, Mark G. Cadungog, Mark E. Borowsky, Ronny Drapkin, Paul M. Lieberman, Cory T. Abate-Shen, Rugang Zhang*. ARID1A promotes genomic stability through protecting telomere cohesion. Nature Communications. 2019 Sep 6;10(1):4067.
4. Bo Zhao, Pingyu Liu, Takeshi Fukumoto, Timothy Nacarelli, Nail Fatkhutdinov, Shuai Wu, Jianhuang Lin, Katherine M. Aird, Hsin-Yao Tang, Qin Liu, David W. Speicher, Rugang Zhang*. Topoisomerase 1 cleavage complex enables pattern recognition and inflammation during senescence. Nature Communications. 2020 Feb 19;11(1):908.
5. Xue Hao^#; Bo Zhao^#; Wei Zhou; Heng Liu; Takeshi Fukumoto; Dmitry Gabrilovich; Rugang Zhang*; Sensitization of ovarian tumor to immune checkpoint blockade by boosting senescence-associated secretory phenotype. iScience. 2021, 24(1): 102016.
6. Huan Liu^#, Bo Zhao^#, Yongchang Chen^#, Dewen You, Rui Liu, Mingqiang Rong, Weizhi Ji*, Ping Zheng, Ren Lai*. Multiple coagulation factor deficiency protein 2 contains the ability to support stem cell self-renewal. FASEB J. 27: 3298-305, 2013.
7. Bo Zhao, Yi-Xian Cun, Xie-Chao He，Ping Zheng*. Maternal-effect Floped gene is essential for the derivation of embryonic stem cells in mice. Zoological Research, 34: E82-6. 2013.
以合作者身份发表论文:
1. Huaixiao Ma^#, Jinglei Zha^#, Haifeng Wan^#, Xiangxiang Jiang^#, Xiaoxiao Wang, Lin Wang, Yunlong Xiang, Xiechao He, Zhen-Ao Zhao, Bo Zhao, Ping Zheng*, Lei Li*, Hongmei Wang*. In vitro culture of cynomolgus monkey embryos beyond early gastrulation. Science. 2019 Oct 31. pii: eaax7890.
2. Sergey Karakashev, Takeshi Fukumoto, Bo Zhao, Jianhuang Lin, Shuai Wu, Nail Fatkhutdinov, Pyoung-Hwa Park, Galina Semenova, Stephanie Jean, Mark G. Cadungog, Mark E. Borowsky, Andrew V. Kossenkov, Qin Liu, Rugang Zhang*. EZH2 Inhibition Sensitizes CARM1-High, Homologous Recombination Proficient Ovarian Cancers to PARP Inhibition. Cancer Cell. 37, 1–11, February 10, 2020.
3. Sergey Karakashev^#, Hengrui Zhu^#, Yuhki Yokoyama^#, Bo Zhao, Nail Fatkhutdinov, Andrew V. Kossenkov, Andrew J. Wilson, Fiona Simpkins, David Speicher, Dineo Khabele, Benjamin G. Bitler, Rugang Zhang*. BET bromodomain inhibition synergizes with PARP inhibitor in epithelial ovarian cancer. Cell Reports, 21: 3398-3405, 2017.
4. Weidao Zhang^#, Zhongliang Chen^#, Dengfeng Zhang, Bo Zhao, Lu Liu, Zhengyuan Xie, Yonggang Yao, Ping Zheng*. KHDC3L mutation causes recurrent pregnancy loss by inducing genomic instability of human early embryonic cells. PLOS Biology, 2019 Oct 14;17(10):e**.
5. Jingzheng Li^#, Yafang Shang, Lin Wang, Bo Zhao, Chunli Sun, Jiali Li, Siling Liu, Cong Li, Min Tang, Fei-Long Meng*, Ping Zheng*. Genome integrity and neurogenesis of postnatal hippocampal neural stem/progenitor cells require a unique regulator Filia. Science Advances, 2020, 6(44): eaba0682.

研究团队

工作人员
涂秋 博士 特别研究助理
李开琴 博士 特别研究助理
刘秀云 硕士 研究实习员
陈琼芳 硕士 研究实习员
常青 硕士 学科组秘书
博士研究生
黄晓妍