基本信息
徐伟男硕导中国科学院昆明植物研究所
电子邮件： xuwei@mail.kib.ac.cn
通信地址： 云南省昆明市盘龙区蓝黑路132号中国科学院昆明植物研究所
邮政编码： 650201

研究领域
主要研究方向为植物种子发育的表观调控以及适应性进化，集中开展以下两个方面的研究：
1）种子发育与表观调控：围绕种子生物学重要科学问题，如种子发育、休眠、萌发、胚乳发育、种子大小以及储藏物质生物合成，通过分子生物、功能基因组学和表观遗传学，鉴别种子农艺形状发生的关键功能基因和调控网络；重点解析基因组印迹、DNA甲基化、组蛋白修饰以及非编码RNAs对种子发育和储藏物质累积的调控。同时，结合高通量测序和GWAS分析，解析种子重要性状发生的分子基础。


2）植物表型变异与适应性的遗传与表观调控研究：植物作为固着生长的生物，在长期的进化中已经形成了多样的分子机制来适应环境，表现出很强的表型可塑性，但对于植物表型变异的调控机理以及植物如何适应不断变化的环境还不清楚。蓖麻是世界上重要的特种油料作物之一，其基因组小（330 Mb），表型变异特别丰富（从一棵多年生的树到单年生的作物）且具有广泛的分布和适应性（在世界热带和亚热带地区均有分布），是研究表型变异和适应性的理想材料。研究重点利用自然群体的GWAS分析，解析蓖麻表型变异的遗传基础，同时结合表观遗传学（主要是DNA甲基化），解析蓖麻适应性形成的分子基础，特别是表观记忆（或者胁迫记忆）的形成和隔代遗传。




招生信息
招生专业 071010-生物化学与分子生物学

招生方向 种子和胚乳发育
植物表观遗传学
种子储藏物质生物合成的调控研究


教育背景2013-09--2016-12云南大学与中科院昆明植物研究所联合培养理学博士学位
2009-09--2012-07扬州大学理学硕士学位
2005-09--2009-07河北师范大学学士学位

学历 博士研究生

学位 理学博士

专利与奖励
奖励信息 （1） 云南省高层次人才培养支持计划 “青年拔尖人才”, 省级, 2020
（2） 蓖麻胚乳油脂累积的生理与分子基础研究, 二等奖, 省级, 2019
（3） 中国科学院青年创新促进会会员, 院级, 2019

专利成果 （ 1 ） 一种植物基因组差异甲基化区域的检测方法, 发明, 2020, 第 5 作者, 专利号: ZL 2018 1 **.3
（ 2 ） 一种对质子浓度发生响应的荧光探针及其应用, 发明, 2021, 第 4 作者, 专利号: ZL 2018 1 **.4


出版信息
代表性论文 （1）Genomic insights into the origin, domestication and genetic basis of agronomic traits of castor bean,Genome Biology,2021,第1作者
（2）Blue genome: chromosome-scale genome reveals the evolutionary and molecular basis of indigo biosynthesis in Strobilanthes cusia,The Plant Journal,2020,第1作者
（3）Differential expression networks and inheritance patterns of long non-coding RNAs in castor bean seeds,The Plant Journal,2018,第1作者
（4）Transcriptome analysis reveals crucial genes involved inthe biosynthesis of nervonic acid in woody Malania oleifera oilseeds,BMC Plant Biology,2018,通讯作者
（5）Genomic DNA Methylation Analyses Reveal the Distinct Profiles in Castor Bean Seeds with Persistent Endosperms,Plant Physiology,2016,第1作者
（6）Genomic imprinting, methylation and parent-of-origin effects in reciprocal hybrid endosperm of castor bean,Nucleic Acids Research,2014,第1作者
（7）Genome-wide survey and expression profiles of the AP2/ERF family in castor bean (Ricinus communis L.),BMC Genomics,2013,第1作者

发表著作 （1）The castor bean genome-10 Chapter: Epigenetic Regulation in Castor Bean Seeds DNA Methylation and Genomic Imprinting in Castor Bean,Springer International Publishing,2019-03,第1作者


科研活动
科研项目 （ 1 ） 蓖麻栽培驯化和表型变异的遗传和表观调控研究, 主持,市地级,2019-03--2023-03
（ 2 ） 长链非编码RNAs在蓖麻胚 乳发育过程 中的表达网 络及其表观调控研究, 主持,国家级,2018-01--2020-12
（ 3 ） 蓖麻种子发育与储藏油脂累积的分子机制研究, 主持,省级,2018-01--2019-12
（ 4 ） 蓖麻从多年生木本到一年生油料作物栽培驯化过程中的遗传变异研究与种质资源 发掘, 参与,国家级,2017-01--2021-12
（ 5 ） 蓖麻起源、进化以及种子发育调控研究, 主持,部委级,2020-01--2023-12
（ 6 ） 蓖麻胚乳基因组印迹对储藏物质代谢的调控及其发生的分子机理研究, 主持,国家级,2020-01--2023-12

参与会议 （1）蓖麻种子基因组印迹、DNA甲基化与长链非编码RNAs第五届全国计算生物学与生物信息学学术会议2018-04-21


合作情况
长期与英国University of Southampto的Mark A. Chapman教授合作，在国际主流期刊Genome Biology和 Plant Direct上发表合作论文；
获得两项中国科学院国际人才交流项目




指导学生现指导学生
周倩倩硕士研究生086000-生物与医药