姓 名:
伊廷双
学 科:
生物化学与分子生物学
电话/传真:
**
电子邮件:
tingshuangyi@mail.kib.ac.cn
通讯地址:
云南省昆明市蓝黑路132号 650201
更多信息:
简历:
教育经历:
1999.9-2002.7,中国科学院昆明植物研究所,2002.7获得博士学位
1996.9-1999.7,中国科学院昆明植物研究所,1999.7获得硕士学位
1992.9-1996.7,山东师范大学生物系,1996.7年获得学士学位
博士后/访问学者/访问教授:
2012.7.9-2012.8.11,访问教授,东京大学,Komaba Graduate School of Arts and Science。
2009.2-2009.4,访问学者,美国自然历史博物馆,史密斯研究所。
2006.8-2006.9,访问学者,美国自然历史博物馆,史密斯研究所。
2004.11- 2006.8,博士后,美国匹茨堡大学生物系。合作教授:Susan Kalisz博士。
2002.11-2004.11,博士后,美国芝加哥Field 自然历史博物馆植物系。合作教授:Jun Wen博士。
工作经历:
2011.5-, 研究员,中科院昆明植物研究所中国西南种质资源库。
2006.10-2011.5,副研究员,中科院昆明植物研究所中国西南种质资源库。
主要从事植物分子系统发育基因组学、”iFlora”平台构建、生物地理学和保护遗传学研究。与本所同事首次提出新一代“iFlora”(智能植物志)的发展目标(集成现代植物科学、DNA测序、超算和云计算等技术、现代信息化手段和技术,构建综合数据库平台,率先制定植物的国际综合识别和评价标准),列为研究所“十二五”的重大突破目标,希望能够引领植物科学数字化发展方向,为国家和科研服务。开展盐肤木属和清香木属多个北温带间断类群的分子系统学和生物地理学研究,对北温带间断分布格局形成原因有重要贡献。主持国家自然科学基金海外及港澳学者合作研究基金、国家自然科学基金面上项目、中国科学院科技创新“交叉与合作团队”等10余项研究项目,参加国家重大科学研究计划、国家自然科学基金重点项目、科技基础性工作专项重点项目等10余项研究项目。在Molecular Phylogenetics and Evolution, American Journal of Botany, Taxon, Plos One等本领域主流期刊发表研究论文40余篇;参加编写专著1部,译著1部。
研究领域:
1. 分子系统发育基因组组学
利用核和叶绿体基因基因组数据重建被子植物,特别是蔷薇目及该目下蔷薇科、鼠李科、大麻科和榆科的生命之树,揭示主要支系和属种的分类范畴、系统发育关系,构建分类系统;探讨杂交、多倍化起源和演化机制;结合古地质、古气候和化石证据推断类群的起源,现在分布格局形成的历史,物种多样化历史限制和驱动因子。
2. 智能植物志“iFlora”
开展中国维管植物“iFlora”平台构建。以蔷薇目,及该目下蔷薇科、鼠李科、大麻科等类群开展DNA条形码和组学数据为主的Meta Barcoding研究,并完成相关类群“iFlora”平台构建。
3. 重要物种形成和遗传多样性保护
利用基因片段、SSR等分子标记技术和组学数据开展野生大豆、香水月季和翠柏等物种形成、谱系分化和遗传多样性分析。
社会任职:
获奖及荣誉:
2012年度中国科学院王宽诚西部学者突出贡献奖。
云南省中青年学术技术带头人后备人才(2011年入选)。
代表论著:
发表论文:
He Shui-lian, Yang Yang, Morrell L. Peter, Yi Ting-Shuang* (corresponding author). 2015. Nucleotide Sequence Diversity and Linkage Disequilibrium of four nuclear loci in Foxtail Millet (Setaria italica). Plos One 10: e**. (IF = 3.234).
Yi Ting-Shuang, Jin Gui-Hua, Wen Jun, 2015. Chloroplast capture and intra- and inter- continental biogeographic diversification in the Asian - New World disjunct plant genus Osmorhiza (Apiaceae). Molecular Phylogenetics and Evolution 85: 10-21. (IF = 3.916).
Xie Lei, Yang Zhi-Yun, Wen Jun, Li De-Zhu, Yi Ting-Shuang* (corresponding author), 2014. Biogeographic history of Pistacia (Anacardiaceae), emphasizing the evolution of the Madrean-Tethyan and the eastern Asian-Tethyan disjunctions. Molecular Phylogenetics and Evolution 77: 136–146. (IF = 3.916).
Ishikawa Naoko, Ikeda Hajime, Yi Ting-Shuang, Takabe-Ito Eriko, Okada Hiroshi, Tsukaya Hirokazu, 2014. Lineage diversification and hybridization in the Cayratia japonica–Cayratia tenuifolia species complex. Molecular Phylogenetics and Evolution 75: 227–238. (IF = 4.018, top 30%).
Yang Zhi-Yun, Yi Ting-Shuang, Zeng Liang-Qin, Gong Xun, 2014. The population genetic structure and diversification of Aristolochia delavayi (Aristolochiaceae), an endangered species of the dry hot valleys of the Jinsha River, southwestern China. Botany-Botanique 92: 579-587.
Wu Zeng-Yuan, Monro K. Alex, Milne I. Richard, Wang Hong, Yi Ting-Shuang, Liu Jie, Li De-Zhu, 2013. Molecular phylogeny of the nettle family (Urticaceae) inferred from multiple loci of three genomes and extensive generic sampling. Molecular Phylogenetics and Evolution 69: 814–827 (IF = 4.018, top 30%)
Li Xiang, Peng Li-Yan, Zhang Shu-Dong, Zhao Qin-Shi, Yi Ting-Shuang* (corresponding author), 2013. The Relationships between Chemical and Genetic Differentiation and Environmental Factors across the Distribution of Erigeron breviscapus (Asteraceae). Plos One: e74490. (IF = 3.534, top 15%)
Li Rong, Ma Peng-Fei, Wen Jun, Yi Ting-Shuang* (corresponding author), 2013. Complete Sequencing of Five Araliaceae Chloroplast Genomes and the Phylogenetic Implications. Plos One: e78568. (IF = 3.534, top 15%)
Yang Mei-Qing, van Velzen Robin, Bakker T. Freek, Sattarian Ali, Li De-Zhu, Yi Ting-Shuang* (corresponding author), 2013. Molecular phylogenetics and character evolution of Cannabaceae. Taxon 62: 473-495. (IF = 2.708, top 30%)
Li Xiang, Zhang Shu-Dong, Yang Zhi-Yun, Song Ke-Xian, Yi Ting-Shuang* (corresponding author), 2013. Conservation genetics and population diversity of Erigeron breviscapus (Asteraceae), and important Chinese herb. Biochemical Systematics and Ecology 49: 156-166.
Yahara Tetsukazu, Javadi Firouzeh, Onoda Yusuke, de Queiroz Luciano Paganucci, Faith P. Daniel, Prado E. Darién, Akasaka Munemitsu, Kadoya Taku, Ishihama Fumiko, Davies Stuart, Slik J.W. Ferry, Yi Ting-Shuang, Ma Ke-Ping, Chen Bin, Darnaedi Dedy, Pennington R. Toby, Tuda Midori, Shimada Masakazu, Ito Motomi, Egan N. Ashley, Buerki Sven, Raes Niels, Kajita Tadashi, Vatanparast Mohammad, Mimura Makiko, Tachida Hidenori, Iwasa Yoh, Smith F. Gideon, Victor E. Janine, Nkonki Tandiwe, 2013. Global legume diversity assessment: Concepts, key indicators, and strategies. Taxon 62: 249-266. (IF = 2.708, top 30%)
唐敏, 伊廷双, 王欣, 谭美华, 周欣, 2013. Metabarcoding技术在植物鉴定和多样性研究中的应用。 植物分类与资源学报 35 : 769-773。
马莉萍, 伊廷双, 左显维, 张彪, 李云霞, 韩根亮,2013. 构建基于磁珠微流控芯片的iFlora遗传信息高效获取系统。植物分类与资源学报 35: 779-783。
He Shui-Lian, Wang Yun-Sheng, Volis Sergei, Li De-Zhu, Yi Ting-Shuang* (corresponding author), 2012. Genetic diversity and population structure: implications for conservation of wild soybean (Glycine soja Sieb.et Zucc) based on nuclear and chloroplast microsatellite variation. International Journal of Molecular Sciences 13:12608-12628.
Li Rong, Yi Ting-Shuang, Li Heng, 2012. Is Remusatia (Araceae) monophyletic? Evidence from three plastid regions. International Journal of Molecular Sciences 13: 71-83.
李德铢, 王雨华, 伊廷双* (通讯作者), 王红, 高连明, 杨俊波,2012. 新一代植物志:iFlora. 植物分类与资源学报 34: 525-531.
李洪涛, 曾春霞, 高连明, 伊廷双, 杨俊波, 2012. 遗传信息及其获取技术与iFlora. 植物分类与资源学报 34: 585-591.
骆洋, 何延彪, 李德铢, 王雨华, 伊廷双, 王红,2011. 中国植物志、Flora of China 和维管植物新系统中科的比较. 植物分类与资源学报 33: 101-107.
骆洋, 何延彪, 李德铢, 王雨华, 伊廷双, 王红,2012. 中国植物志、Flora of China和维管植物新系统中科的比较. 植物分类与资源学报 34: 231-238.
骆洋, 何延彪, 李德铢, 王雨华, 伊廷双, 王红,2012. 中国植物志、Flora of China 和维管植物新系统中科的比较. 植物分类与资源学报 34: 1001-1007.
曾春霞, 杨俊波, 杨静, 伊廷双, 林春艳, 2012. 关于iFlora创建工作框架的建议. 植物分类与资源学报 34: 555-561.
China Plant BOL Group, 2011. Comparative analysis of a large dataset indicates that ITS should be incorporated into the core barcode for seed plants. Proceedings of the National Academy of Sciences, USA 108: 19641-19646.
Li Xiang, Song Ke-Xian, Yang Jing, Yi Ting-Shuang* (corresponding author), 2011. Isolation and Characterization of 11 New Microsatellite Loci in Erigeron breviscapus (Asteraceae), an Important Chinese Traditional Herb. International Journal of Molecular Sciences 12: 7265-7270.
Meng Jing, Fougère-Danezan Marie, Zhang Li-Bing, Li De-Zhu, Yi Ting-Shuang* (corresponding author), 2011. Untangling the hybrid origin of the ancient Chinese tea roses: Evidence from DNA sequences of single-copy nuclear and chloroplast genes. Plant Systematics and Evolution 297:157–170.
Lu Jin-Mei, Li De-Zhu, Lutz Sue, Soejima Akiko, Yi Ting-Shuang, Wen Jun, 2011. Biogeographic Disjunction between Eastern Asia and North America in the Maidenhair Fern Adiantum pedatum Complex. American Journal of Botany 98:1680-1693.
Zhang Shu-Dong, Soltis E. Douglas, Yang Yang, Li De-Zhu, Yi Ting-Shuang* (corresponding author), 2011. Multi-gene analysis provides a well-supported phylogeny of Rosales. Molecular Phylogenetics and Evolution 60: 21-28.
Zhou Yan-Ying, Luo Shi-Hong, Yi Ting-Shuang, Li Chun-Huan, Luo Qian, Hua Juan, Liu Yan, Li Sheng-Hong, 2011. Secondary Metabolites from Glycine soja and Their Growth Inhibitory Effect against Spodoptera litura. Journal of Agricultural and Food Chemistry 59: 6004–6010.
Xie Lei, Yi Ting-Shuang* (corresponding author), Li Rong, Li De-Zhu, Wen Jun *, 2010. Evolution and biogeographic diversification of the witch-hazel genus (Hamamelis L., Hamamelidaceae) in the Northern Hemisphere. Molecular phylogenetics and Evolution 56:675-689.
Song Ke-Xian, Wang Yu-Hua, Yi Ting-Shuang, Yang Zhi-Yun, 2010. Karyological studies of Erigeron breviscapus and related species. Caryologia 63: 176-183.
Meng Jing, Li De-Zhu, Yi Ting-Shuang* (corresponding author), Yang Jun-Bo, and Zhao Xing-Feng 2009. Development and characterization of microsatellite loci for Rosa odorata var. gigantea Rehder & E. H. Wilson (Rosaceae). Conservation Genetics 10: 1973-1976.
Yi Ting-Shuang, Wen Jun, Golan-Goldhirsh Avi, Parfitt E. Dan 2008. Phylogenetics of Pistacia (Anacardiaceae) inferred from multiple molecular data sets. American Journal of Botany 95: 241-251.
Wen Jun, Berggren T. Scott, Lee Chung-Hee, Ickert-Bond Stefanie, Yi Ting-Shuang, Yoo Ki-Oug, Xie Lei, Shaw Joey, Potter Dan, 2008. Phylogenetic inferences in Prunus (Rosaceae) using chloroplast ndhF and nuclear ribosomal ITS sequences. Journal of Systematics and Evolution 46: 322–332.
Yi Ting-Shuang, Miller J. Allison, Wen Jun, 2007. The phylogeny of Rhus (Anacardiaceae) based on sequences of nuclear NIA-i3 intron and chloroplast trnC-D suggests reticulate evolution. Systematic Botany 32:379-391.
Dillon O. Dillon, Tu Tie-yao, Soejima Akiko, Yi Ting-Shuang, Nie Ze-Long, Tye Alan, Wen Jun, 2007. Phylogeny of Nolana (Nolaneae, Solanoideae, Solanaceae) as inferred from granule-bound starch synthase I (GBSSI) sequences. Taxon 56: 1000-1011.
Yi Ting-Shuang, Li Heng, Li De-Zhu, 2005. Chromosome studies on the genus Pinellia (Araceae). Botanical Journal of the Linnean Society 147: 449-455.
Yi Ting-Shuang, Miller J. Allison, Wen Jun, 2004. Phylogenetic and Biogeographic diversification of Rhus (Anacardiaceae) in the Northern Hemisphere. Molecular and Phylogenetic Evolution 33: 861-879.
Yi T.-S., Lowry II P. Porter, Plunkett M. Gregory, Wen Jun, 2004. Chromosomal evolution in Araliaceae and close relatives. Taxon 53: 987-1005.
Yang Zhi-Yun, Yi Ting-Shuang, Li Heng, Gong Xun, 2003. A cytological study on three species of Colocasia (Araceae) from Yunnan. Caryologia 56: 323-327.
Yi Ting-Shuang, Li Heng, 2002. Arisaema danzhuense (Araceae), a new species from the Gaoligong Mountains, Northwestern Yunnan, China. Novon 11: 512-514.
伊廷双,李恒,李德铢,2002. 天南星科分类系统的沿革. 武汉植物学研究 20: 48-61.
伊廷双,胡虹,罗桂芬,2001. 昆明地区香石竹病毒病流行状况调查及脱病毒苗的制备.云南植物研究 23:345-349.
伊廷双,胡虹,张石宝,2001. 香石竹的脱病毒苗与带病毒苗生长发育特性比较.云南植物研究 23:251-255.
专著:
He San-An, Yi Ting-Shuang, Pei Sheng-Ji, Huang Hong-Wen, 2013. Crop plants and their wild relatives. In: Hong De-Yuan and Stephen Blackmore (Eds.), Plants of China, A companion to the Flora of China. Science Press, Beijing, pp. 309-323.
Yi Ting-Shuang, Morell L. Peter, Pei Sheng-Ji, He Shan-Aan, 2013. Major introduced economic plants. In: Hong De-Yuan and Stephen Blackmor (Eds.), Plants of China, A companion to the Flora of China. Science Press, Beijing, pp. 357-382.
李德铢等,2012. 植物系统学Plant Systematics: A Phylogentic Approach. 北京:高等教育出版社。(伊廷双负责305-409页)。
会议和学术报告:
Tingshuang Yi, 2014. 6.19. The phylogenomics of Malus. The Missouri Botanic Garden (Libing Zhang).
伊廷双 2014.5.15. The Biogeography of North Hemisphere. 上海辰山植物园学术报告 (田代科)。
Tingshuang YI 2013. Chloroplast capture and genetic diversification in Osmorhiza (Apiaceae). A meeting report at 2013 Fifth International Barcode of Life Conference, October 27 -31, Kunming, China.
伊廷双 2011. Phylogeny and historical biogeography of Pistacia (Anacardiaceae) as inferred from multiple nuclear and plastid DNA sets. 在2011 “海峡两岸生物多样性学术研讨会”做分组报告,11月14-12.1,台湾。
伊廷双 2011. Phylogeny and Historical biogeography of Pistacia. 在2011年全国系统与进化植物学研讨会暨第十届青年学术研讨会做分组报告,10月25-28,昆明,中国。
Tingshuang Yi 2011. Legume crops and their wild relatives in China. A meeting report at 2011 “the workshop on the global legume diversity assessment”,August 19-22, Fukuoka,Japan.
Yi, T.-S. 2010. New Frontiers in Systematic and Evolutionary Biology, Beijing.
Yi, T.-S. 2010. The disjunction distribution of North Hemisphere, related to paleoclimate chang, Kunming, Yunnan, China. Gave a meeting report “The disjunction distribution of North Hemisphere, related to paleoclimate change”.
Yi, T-S, Kalisz, S. 2006. The evolution of Cycloidea in Collinsia and Antirrhinum. A poster presented by Tingshuang Yi at the Evlution 2006 Meetings, Stony Brook, New York
Yi, T-S., A. J. Miller and J. Wen. 2004. Phylogenetic and biogeographic diversifications of Rhus (Anacardiaceae) in the Northern Hemisphere. A poster presented by Jun Wen at the Botany 2004 Meetings, Snowbird, Utah, USA.http://www.botanyconference.org/engine/search/index.php?func=detail&aid=629
Yi, T., P. P. Lowry II, G. M. Plunkett, and J. Wen. 2003. Chromosomal evolution in the Araliaceae. A poster presented at the Botany 2003 meetings, July 26-31, 2003, in Mobile, Alabama, USA.
承担科研项目情况:
2014.01-2017.12,¥1,200,00。西南山地典型生态系统植物多样性对气候变化的响应。国家重大科学研究计划项目(项目批准号:2014CB954100;项目负责人:李德铢)。第一课题:植物多样性格局与气候要素的耦合关系(课题负责人:陈之端;课题参加人)。排名 11.
2013.01-2015.12,¥1,000,000。非洲资源植物种子库建设。中国科学院中-非联合研究中心资助项目。(课题批准号:SAJC201302;课题负责人)。
2013.01-2017.12,¥1,200,00。《中国植物志》的数字化和DNA条形码。科技基础性工作专项重点项目(项目批准号:2013FY112600; 项目负责人: 张宪春,王红)。子课题:20个3E维管植物属iFlora构建(子课题负责人:伊廷双)。排名 3
2013.01-2015.12,¥1,000,000。iFlora交叉与合作团队。中国科学院科技创新“交叉与合作团队” (课题批准号:**;课题负责人)。
2013.01-2016.12,¥900,000。大麻科分子系统发育和多样化时空格局重建。国家自然科学基金(课题批准号:**;课题负责人)。
2011.01-2014.12,¥60,000。云南省中青年学术技术带头人后备人才 (课题批准号:2011CI042;课题负责人)。
2012.01-2015.12,¥1,200,000。东亚-北美间断植物类群的分子系统学和生物地理学。国家自然科学基金海外及港澳学者合作研究基金 (课题批准号:**;课题共同负责人)。
2011.1-201,3.12,¥600,000。 楤木属-人参属复合群(Aralia-Panax complex)的系统重建、生物地理与种质资源保护。中国科学院知识创新工程重要方向项目(课题批准号:**;课题参加人,第二)
2011.1-2013.12, ¥350,000。野生大豆亲缘地理学与保护生物学研究。国家自然科学基金(课题批准号:**;课题负责人)。
2009.1-2014.12, ¥200,000。东亚-北美间断植物类群的分子系统学和生物地理学。国家基金海外及港澳合作研究基金 (课题批准号:**,联合课题负责人)。
2009.1-1012.12, ¥150,000。西部药用植物资源可持续利用研究。中国科学院知识创新工程领域前沿重点项目(项目负责人:赵勤实、李唯奇)。子课题:灯盏细辛(灯盏花)分子鉴定与种质资源评价(课题负责人)。
2009.1-2012.12,¥450,000。生命之树共生固氮植物支系重要类群的起源、分化和环境制约。国家自然科学基金重点项目 (课题批准号:**;课题负责人:李德铢; 课题参加人)。
2009.1-2010.12,¥25,000。《中国植物志》(英文版)编写项目(课题批准号:1ZO**B1;课题负责人)。
2009,¥300,000。参见云南省创新团队(课题负责人:李德铢; 课题参加人)。
2009.1-2009.12,¥50,000。中科院生物多样性与生物地理学重点实验室资助(课题负责人)。
2008.1- 2010.12,¥300,000。漆树科北温带间断分布关键属的分子系统学和生物地理学研究。国家自然科学基金(课题批准号:**;课题负责人)。
2008.1-2010.12,¥1,500,000,生命之树中固氮植物和鱼类重要支系的分子系统发育。中国科学院知识创新工程重要方向项目(课题批准号:**;课题负责人:陈之端;项目参加人)。
2007.11.28-2011.7.9,¥130,000。西南地区重要野生植物种质。国家专项任务(大科学工程、空间专项等)(课题批准号:1Z2005DKA21006;子课题负责人)。
2007.1-2011.12, ¥20,0000。中国-喜马拉雅地区生物多样性演变和保护研究。国家973项目(项目负责人:张亚平;项目批注号:2007BC411600)。子课题:重要生物类群的演变与地理格局(课题批准号:2007CB41160;课题负责人:李德铢;项目参加人)。
2006.11.15-2009.11.30,¥300,000,中国栽培作物起源与进化。中国科学院昆明植物所海外引进人才启动经费(课题批准号: 51O**; 项目负责人)。
2006,¥20,000。王宽诚教育基因回国人员专项经费(课题负责人)。
2006, $5,000, 美国自然科学基金(植物分子和器官发育研究,博士后培养基金) (课题负责人)。
2002-2005,¥230,000,天南星科半夏属的系统学和生物地理学研究。中国自然科学基金面上项目(课题批准号:No. **,课题主要参加人)。
2002-2005 ¥50,000,天南星科半夏属的系统学和生物地理学研究。云南省自然科学基金面上项目 (课题批准号:No. 2001c0056M;课题主要参加人)。
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中科院昆明植物研究所研究生导师简介-伊廷双
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