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中科院昆明植物研究所研究生导师简介-孙桂玲

昆明植物研究所 免费考研网/2016-01-27

姓  名:
孙桂玲
学  科:
生物化学与分子生物学
电话/传真:
**
电子邮件:
sung@mail.kib.ac.cn
通讯地址:
云南省昆明市蓝黑路132号 650201
更多信息:


简历:
2001年毕业于河南大学生命科学学院,生物教育,学士
2007年毕业于中科院昆明动物研究所,动物学,博士
2009年2月-2011年10月,美国东卡罗莱纳大学生物系,博士后
2011年11月- 至今,中国科学院昆明植物研究所,副研究员,硕士生导师
在水平基因转移和基因资源挖掘方面取得良好进展,共发表论文21篇。其中以第一作者或通讯作者在《Mol Biol Evol》、《BMC Evol Biol》、《BMC Plant Biol》、《BMC Genomics》、《PLoS ONE》、《Funct Integr Genomics》、《Plant Mol Biol》等国际著名SCI刊物上发表论文12篇,累积影响因子49.1。论文累积他引95次。曾应邀为多个国际SCI刊物审稿。迄今累积得到150万元的经费支持。

研究领域:
1.水平基因转移:以共生或者寄生的植物和微生物为研究对象,使用比较基因组学和进化生物学的方法,在基因组水平鉴定从共生和寄生的宿主(或者其它来源)中水平转移的基因。通过生物化学、分子和细胞生物学以及生态学的技术手段,进一步鉴定获得基因在该生物内执行的分子、细胞和可能的生态功能。并由此探讨水平基因转移在这些生物中的重要角色和水平基因转移的分子机制。

2.植物与寄生植物的相互作用:研究植物受到寄生植物进攻时所产生的防御反应,以及寄生植物如何寻找寄主、产生吸器、建立寄生关系等的分子机理;鉴定寄生植物与寄主之间遗传物质(RNA和DNA)转运的种类并探讨转运的分子机制,研究转运的RNA和DNA在受体内不同组织中的分布、命运和生物功能。   

3.

基因资源挖掘:使用新一代测序技术,通过基因组和转录组分析,获得参与重要代谢途径、生物和非生物胁迫响应的候选基因,为探讨重要代谢产物(如抗癌药物紫杉醇等)的生物合成途径和细胞调控网络提供重要前期基础。

社会任职:

获奖及荣誉:

代表论著:
近五年代表性研究论文:

  Huang, J., Sun, G., and Zhang, D. (2010). Molecular evolution and phylogeny of the angiosperm ycf2 gene. J Syst Evol 48, 240-248.

  Sun, G., Yang, Z., Ishwar, A., and Huang, J. (2010). Algal genes in the closest relatives of animals. Mol Biol Evol 27, 2879-2889.

  Sun, G., and Huang, J. (2011). Horizontally acquired DAP pathway as a unit of self-regulation. Journal of evolutionary biology 24, 587-595.

  Frazier, T.P., Sun, G., Burklew, C.E., and Zhang, B. (2011). Salt and drought stresses induce the aberrant expression of microRNA genes in tobacco. Mol Biotechnol 49, 159-165.

  Sun, G., Wang, Q.L., and Zhang, B. (2011). MicroRNAs in Cotton. In Non Coding RNAs in Plants, E.V. A. and J. Barciszewski, eds, pp. 301-312.

  Sun, G., Xie, F., and Zhang, B. (2011). Transcriptome-wide identification and stress properties of the 14-3-3 gene family in cotton (Gossypium hirsutum L.). Functional & integrative genomics 11, 627-636.

  Sun, G., Yang, Z., Kosch, T., Summers, K., and Huang, J. (2011). Evidence for acquisition of virulence effectors in pathogenic chytrids. BMC evolutionary biology 11, 195.

  Xie, F., Sun, G., Stiller, J.W., and Zhang, B. (2011). Genome-wide functional analysis of the cotton transcriptome by creating an integrated EST database. PloS one 6, e26980.

  Sun, G. (2012). MicroRNAs and their diverse functions in plants. Plant molecular biology 80, 17-36.

  Ni, T., Yue, J., Sun, G., Zou, Y., Wen, J., and Huang, J. (2012). Ancient gene transfer from algae to animals: mechanisms and evolutionary significance. BMC evolutionary biology 12, 83.

  Sun, G., Stewart, C., Pan, X., and Zhang, B. (2012). MicroRNA expression analysis in the cellulosic biofuel crop switchgrass (Panicum virgatum) under abiotic stress. PloS one 7, e32017.

  Sun, G., Yang, Y., Xie, F., Wen, J., Wu, J., Wilson, I.W., Tang, Q., Liu, H., and Qiu, D. (2013). Deep sequencing reveals transcriptome re-programming of Taxus * media cells to the elicitation with methyl jasmonate. PloS one 8, e62865.

  Yue, J.P., Sun, G.L., Hu, X.Y., and Huang, J.L. (2013). The scale and evolutionary significance of horizontal gene transfer in the choanoflagellate Monosiga brevicollis. Bmc Genomics 14.

  Yang, Y., Zhao, H., Barrero, R., Zhang, B., Sun, G., Wilson, I., Xie, F., Walker, K., Parks, J., Bruce, R., Guo, G., Chen, L., Zhang, Y., Huang, X., Tang, Q., Liu, H., Bellgard, M., Qiu, D., Lai, J., and Hoffman, A. (2014). Genome sequencing and analysis of the paclitaxel-producing endophytic fungus Penicillium aurantiogriseum NRRL 62431. Bmc Genomics 15.

  Zhang, N., Han, Z.T., Sun, G.L., Hoffman, A., Wilson, I.W., Yang, Y.F., Gao, Q., Wu, J.Q., Xie, D., Dai, J.G., and Qiu, D.Y. (2014). Molecular cloning and characterization of a cytochrome P450 taxoid 9a-hydroxylase in Ginkgo biloba cells. Biochemical and biophysical research communications 443, 938-943.

  Zhang, D.L., Qi, J.F., Yue, J.P., Huang, J.L., Sun, T., Li, S.P., Wen, J.F., Hettenhausen, C., Wu, J.S., Wang, L., Zhuang, H.F., Wu, J.Q., and Sun, G.L. (2014). Root parasitic plant Orobanche aegyptiaca and shoot parasitic plant Cuscuta australis obtained Brassicaceae-specific strictosidine synthase-like genes by horizontal gene transfer. Bmc Plant Biol 14.


承担科研项目情况:
  200901-201112,糖酵解和糖异生途径在衣藻细胞内的定位及其进化研究,云南省自然科学基金委,5万,主持

  201111-201411,植物与寄生植物的相互作用研究,中国科学院,20万,主持

  201310-201609,菟丝子对寄主RNA 的“掠夺”和基于RNAi 技术的生物防治,云南省自然科学基金委,10万,主持

  201401-201612,根寄生和茎寄生植物中的水平基因转移研究及其机制探讨,国家自然科学基金委,23万,主持

  201303-201403,烟草转录组和基因芯片数据分析及技术开发,云南省烟草农业科学研究院,79万,主持

  201305-201504,人贾第虫和蛙贾第虫的比较基因组学研究,中科院昆明动物研究所遗传与资源国家重点实验室,11万,主持

201301-201512,菟丝子从宿主转运的mRNA种类和转运机理探讨,教育部留学回国人才科研启动基金,3万,主持
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