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南开大学药物化学生物学国家重点实验室 2018 年硕士研究生招生导师名单(5)

本站小编 免费考研网/2018-04-25



代表性论文:

    Nicolaou, K. C.;* Lu, Z.;? Li, R.;? Woods, J. R.; Sohn, T., Total Synthesis of Shishijimicin A. Journal of the American Chemical Society 2015, 137, 8716–8719. (? these authors contributed equally).

    Xiong, X.;? Li, Y.;? Lu, Z.; Wan, M.; Wu, S.; Shao, H.;* Li, A.,* Synthesis of the 6,6,5,7-Tetracyclic Core of Daphnilongeranin B. Chemical. Communications. 2014, 50, 5294–5297. (? these authors contributed equally).

    Lu, Z.;? Li, Y.;? Deng, J.; Li, A.,* Total Synthesis of the Daphniphyllum Alkaloid Daphenylline. Nature Chemistry 2013, 5, 679–684. (? these authors contributed equally).

    Deng, J.;? Zhu, B.;? Lu, Z.; Yu, H.; Li, A.,* Total Synthesis of (–)-Fusarisetin A and Reassignment of the Absolute Configuration of Its Natural Counterpart. Journal of the American Chemical Society 2012, 134, 920–923. (? these authors contributed equally).

11.刘艺锦

姓名:刘艺锦 职称:特聘研究员

学科方向:微生物与生化药学,化学生物学

研究方向:1. 有催化功能的特殊 RNA 分子的结构和催化机理 2. 基于 RNA 核酶的靶向 RNA 药物设计

3. 荧光小分子在研究 RNA 结构特征过程中的应用

通讯地址:天津市津南区海河教育园区同砚路 38 号,南开大学药物化学生物学国家重点实

验室 300350

电子邮件:ribozyme_lab@foxmail.com 教师简介:

1999-2003 山东师范大学物理系学士

2003-2008 中国科学院生物物理研究所生物化学与分子生物学博士(导师:饶子和 院士) 2008-2011 英国癌症研究中心中国学者计划 (Cancer Research UK China Fellow Program) 2011-2015 英国邓迪大学核酸结构研究团队 Associate

(Nucleic Acid Structure Research Group,英国皇家科学院 David Lilley 院士团队)

2015-2018 英国邓迪大学核酸结构研究团队 Senior Associate

2018-南开大学药物化学生物学国家重点实验室特聘研究员博士生导师 主要研究内容:

刘艺锦博士长期从事有关具有催化功能的特殊 RNA 分子—核酶( ribozyme) 的分子结构、催 化机理以及基于 RNA 核酶分子的靶向目标 RNA 的药物设计工作。其他研究方向包括荧光小 分子在研究 RNA 分子的示踪折叠过程中的应用,具有重要意义的核酸酶的结构以及催化机 理。研究手法包括结构生物学(晶体学、冷冻电镜)、化学生物学、单分子荧光及细胞生物 学等相关技术。近期的研究成果以第一作者发表于 Nature Chemical Biology (两篇)、Cell Reports、Biophysical Journal 等。

代表性论文(近五年):

    Liu,Y., and and D. M. J. Lilley (2017). Crystal structures of cyanine fluorophores stacked onto the end of double-stranded RNA." Biophysical Journal 113(11):2336-2343

    Liu, Y., T. J. Wilson and D. M. J. Lilley (2017). "The structure of a nucleolytic ribozyme that employs a catalytic metal ion." Nat Chem Biol 13(5): 508-513.

    Wilson, T. J., Y. Liu, C. Domnick, S. Kath-Schorr and D. M. Lilley (2016). "The Novel Chemical Mechanism of the Twister Ribozyme." J Am Chem Soc 138(19): 6151-6162.

    Liu, Y., A. D. Freeman, A. C. Declais, T. J. Wilson, A. Gartner and D. M. Lilley (2015). "Crystal Structure of a Eukaryotic GEN1 Resolving Enzyme Bound to DNA." Cell Rep 13(11): 2565-2575.

    Lilley, D. M., Y. Liu and T. J. Wilson (2015). "84 The crystal structure and catalytic mechanism of the twister ribozyme." J Biomol Struct Dyn 33 Suppl 1: 54-55.

    Liu, Y., T. J. Wilson, S. A. McPhee and D. M. Lilley (2014). "Crystal structure and mechanistic investigation of the twister ribozyme." Nat Chem Biol10(9): 739-744.

    Freeman, A. D., Y. Liu, A. C. Declais, A. Gartner and D. M. Lilley (2014). "GEN1 from a

thermophilic fungus is functionally closely similar to non-eukaryotic junction-resolving enzymes." J Mol Biol 426(24): 3946-3959.

12.张宏恺

张宏恺博士,南开大学药物化学生物学国家重点实验室特聘研究员、博导(生命科学学院双 聘),国家青千、天津青千、南开大学百青计划。Scripps 研究所 Lerner 课题组客座研究员。 南开大学生物科学本科(2000.9-2004.6),南开大学生物化学与分子生物学博士(2004.9-2009.6, 导师:曹又佳 博士)。The Scripps Research Institute Richard A. Lerner 博士课题组任博士后研 究员(2009.9-2013.10)、高级科学家(2013.10-2016.3),2016 年 4 月加入南开大学药物化 学生物学国家重点实验室。近五年在 Nature Communications、Angewandte Chemie、PNAS 等期刊发表 13 篇论文并申请 3 项国际专利。回国一年来主持国家自然科学基金 1 项,参与

国家重点研发计划 1 项(学术骨干),承担国内外制药企业技术攻关项目 2 项,并与国内外 多家知名实验室开展学术合作。


研究方向为生物制药,尤其是抗体工程: 一、新型肿瘤免疫抗体和多肽药物 二、新型特发性肺纤维化抗体药物

三、新技术开发,例如靶向 GPCR 抗体的开发和双特异性抗体技术


联系方式: hongkai(at)nankai.edu.cn hongkaizhang(at)126.com 13.杨雪

姓名:杨雪

职称:副研究员 学科方向:钙离子信号转导;结构生物学 招生方向:微生物与生化药学

通讯地址:天津市津南区南开大学新校区综合实验楼D214 电话:022-85358251

电子邮件: yangxue@nankai.edu.cn

教师简介:

2002年至2006年,就读于中国农业大学,获学士学位;

2007年至2012年,就读于南开大学生命科学学院生物化学与分子生物学专业,获博士学位;

2012年7月至2014年12月 南开大学药物化学生物学国家重点实验室担任助理研究员;

2014年12月至今南开大学药物化学生物学国家重点实验室担任副研究员。 主要研究方向是钙离子信号相关蛋白的三维结构解析与功能调控的分子机理探讨。目前承担 国家自然科学基金青年基金1项。天津市应用基础与前沿技术研究计划青年项目1项,参与国 家重点基础研究发展计划(973计划)子课题两项。以第一作者及通讯作者身份在Nat.
Commun.、PNAS、EMBO J、FASEB J.、Nucleic Acids Res.、PLoS One等国际期刊发表研 究性论文十余篇。

代表性论文:

1. Li X, Wu G, Yang Y, Fu S, Liu X, Kang H,Yang X*, Su XC*, Shen Y* Calmodulin dissociates the STIM1-Orai1 complex andSTIM1 oligomers. Nat Commun. 2017 Oct 19;8(1):1042

    Li L, Xing Y, Chang D, Fang S, Cui B, Li Q, Wang X, Guo S, Yang X*, Men S*, Shen Y*. CaM/BAG5/Hsc70 signaling complex dynamically regulates leaf senescence. Sci Rep. 2016 Aug 19;6:31889

    Shao J, Fu Z, Ji Y, Guan X, Guo S, Ding Z, Yang X*, Cong Y*, Shen Y*. Leucine

    zipper-EF-hand containing transmembrane protein 1 (LETM1) forms a Ca2 /H antiporter. Sci Rep. 2016 Sep 27;6:34174.

    Wang L, Yang X (co-first author), Li S, Wang Z, Liu Y, Feng J, Zhu Y, Shen Y* Structural and mechanistic insights into MICU1 regulation of mitochondrial calcium uptake. EMBO J. 2014 Mar 18;33(6):594-604.

    Wang Z, Yang X (co-first author), Guo S, Yang Y, Su X, Shen Y*, Long J* Crystal structure of the ubiquitin-like domain-CUT repeat-like tandem of special AT-rich sequence binding protein 1 (SATB1) reveals a coordinating DNA-binding mechanism. J. Bio. Chem. 2014 Aug; 289(40).

    Cui B, Yang X (co-first author), Li S, Lin Z, Wang Z, Dong C, Shen Y.* The inhibitory helix controls the intramolecular conformational switching of the C-terminus of STIM1.PLoS One. 2013 Sep 19;8(9)

    Fang S, Li L, Cui B, Men S, Shen Y, Yang X.* Structural insiht into plant programmed cell death mediated by BAG proteins in Arabidopsis thaliana.ActaCrystallogr. D Biol. Crystallogr. 2013 Jun;69(Pt 6):934-45

    Dong C, Yang X (co-first author), Hou HF, Shen YQ*, Dong YH* Structure of Escherichia coli BamB and its interaction with POTRA domains of BamA.ActaCrystallogr D BiolCrystallogr.2012 Sep;68(Pt 9)

    Wang Z., Yang X (co-first author), Chu X., Zhang J., Zhou H., Shen Y.*, Long J.*. The structural basis for the oligomerization of the N-terminal domain of SATB1.Nucleic Acids Res. 2012 May; 40(9), 4193-202.

    Yang X., Jin H., Cai X., Li S., Shen Y.* Structural and Mechanistic Insights into the Activation of STIM1, Proc. Nati. Acad. Sci. USA, 2012 April; 109(15), 5657–5662.

    Li FZ., Li SW., Wang Z., Shen YQ, Zhang TC.*, Yang X.* Structure of the kinase domain of human RNA-dependent protein kinase with K296R mutation reveals a face-to-face dimer. Chinese Sci. Bull. 2013 Vol. 58 (9): 998-1002

    Zhang J., Yang X., Wang Z., Shen Y.* Long J.* (2012) Structure of an L27 domain heterotrimer from the cell polarity complex Patj/Pals1/Mals2 reveals a mutually independent L27 domain assembly mode., J. Biol. Chem. 2012 Feb; 68 (Pt2): 95-101

    Dong C., Hou H., Yang X.,Shen Y., Dong Y.*. Structure of Escherichia coli BamD and its functional implications in outer membrane protein assembly.ActaCrystallogr. D Biol. Crystallogr. 2012 Feb;68 (Pt 2):95-101.

    Zhang J., Yang X.*,Shen Y., Long J. Crystallization and preliminary X-ray data collection of the L27PATJ–(L27N,L27C)Pals1–L27MALS tripartite complex.ActaCrystallogr. Sect. F Struct. Biol. Cryst. Commun.2011 Nov 1;67(Pt 11):1443-7

    Wang X., Yang X., Yang C., Wu Z., Xu H.*, Shen Y.* Crystal structure of outer membrane protein NMB0315 from Neisseria meningitidis. PLoS One. 2011 Oct;6(10): e26845.

    Qin X., Ren L., Yang X., Bai F., Wang L., Geng P., Bai G.*, Shen Y.* Structures of human pancreatic α-amylase in complex with acarviostatins: Implications for drug design against type II diabetes.. J. Struct. Biol. 2011 Apr; 174(1): 196-202.
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