南开大学药物化学生物学国家重点实验室 2018 年硕士研究生招生导师名单

1.于仲波 姓名：于仲波 职称：特聘研究员

天津市青年****获得者 学科方向：生物分析与药物传输

研究方向：生物化学、分子生物学和生物物理。利用单分子生物物理技术，譬如磁镊和激光 镊，对生物大分子，譬如核酸和蛋白，进行实时探测和力学分析，发现大分子相互作用的动 态事件，设计药物进行干预。

通讯地址：南开大学药物化学生物学国家重点实验室 天津海河教育园区同砚路 38 号，

300350

电子邮件：zyu@nankai.edu.cn 教师简介

南开大学药学院，药物化学生物学国家重点实验室，特聘研究员。 从事单分子生物物理研究，关注白血病的分子病理生理，尤其是 MLL 基因易位的机理、MLL 蛋白超级复合体内部相互作用网络、以及 MLL 蛋白对下游基因的转录调控，譬如，HOXA9。 使用的技术主要是单分子激光镊和磁镊，致力于研发新的单分子仪器平台，用于疾病分子机 理研究与新药设计和筛选。在国际学术刊物和专著发表论文 19 篇，出版专著 1 部，申请专 利 1 项。 本课题组开放自由，专注于成员个人发展，欢迎有兴趣的同学加入。希望申请者开朗活泼， 对科学问题具有天然的好奇心，并且有较好的数理化基础，或者生物化学和分子生物学背景， 或者生物物理知识，或者熟悉 LabView 和 MatLab 编程环境。

最近三年发表的论文：

    Yu Z, Dulin D, Cnossen J, K?ber M, van Oene MM, Ordu O, Berghuis BA, Hensgens T, Lipfert J, Dekker NH. A force calibration standard for magnetic tweezers. Rev Sci Instrum. 2014 Dec;85(12):123114. doi: 10.1063/1.4904148. PubMed PMID:25554279.

    Yu Z, Cui Y, Selvam S, Ghimire C, Mao H. Dissecting cooperative ommunications in a protein with a high-throughput single-molecule scalpel. Chemphyschem. 2015 Jan 12;16(1):223-32. doi: 10.1002/cphc.201402443. Epub 2014 Dec 2. PubMed PMID:25470139.

    Lipfert J, Skinner GM, Keegstra JM, Hensgens T, Jager T, Dulin D, K?ber M, Yu Z, Donkers SP, Chou FC, Das R, Dekker NH. Double-stranded RNA under force and torque: similarities to and striking differences from double-stranded DNA. Proc Natl Acad Sci U S A. 2014 Oct 28;111(43):15408-13. doi: 10.1073/pnas.1407197111. Epub 2014 Oct 13. PubMed PMID:

    25313077; PubMed Central PMCID: PMC4217419

    Ghimire C, Park S, Iida K, Yangyuoru P, Otomo H, Yu Z, Nagasawa K, Sugiyama H, Mao H. Direct quantification of loop interaction and π-π stacking for G-quadruplex stability at the submolecular level. J Am Chem Soc. 2014 Nov 5;136(44):15537-44. doi: 10.1021/ja503585h. Epub 2014 Oct 22. PubMed PMID: 25296000.

    Selvam S, Koirala D, Yu Z, Mao H. quantification of topological coupling between DNA superhelicity and G-quadruplex formation. J Am Chem Soc. 2014 Oct 8;136(40):13967-70. doi: 10.1021/ja5064394. Epub 2014 Sep 23. PubMed PMID: 25216033.

    Yu Z, Selvam S, Mao H. Intermediates stabilized by tryptophan pairs exist in trpzip Beta-hairpins. Biochemistry. 2014 Sep 30;53(38):5978-86. doi: 10.1021/bi500194g. Epub 2014 Sep 17. PubMed

    PMID: 25164564.

    Dhakal S, Cui Y, Koirala D, Ghimire C, Kushwaha S, Yu Z, Yangyuoru PM, Mao H. Structural and mechanical properties of individual human telomeric G-uadruplexes in molecularly crowded solutions. Nucleic Acids Res. 2013 Apr 1;41(6):3915-23. doi: 10.1093/nar/gkt038. Epub 2013 Feb

    PubMed PMID: 23396442; PubMed Central PMCID: PMC3616730.

    Yu Z, Mao H. Non-B DNA structures show diverse conformations and complex transition kinetics comparable to RNA or proteins--a perspective from mechanical unfolding and refolding experiments. Chem Rec. 2013 Feb;13(1):102-16. doi: 10.1002/tcr.201200021. Epub 2013 Feb 6. PubMed PMID: 23389854.

    Yu Z, Koirala D, Cui Y, Easterling LF, Zhao Y, Mao H. Click chemistry assisted single-molecule fingerprinting reveals a 3D biomolecular folding funnel. J Am Chem Soc. 2012 Aug 1;134(30):12338-41. doi: 10.1021/ja303218s. Epub 2012 Jul 24. PubMed PMID: 22799529.

    .Dhakal S, Lafontaine JL, Yu Z, Koirala D, Mao H. Intramolecular folding in human ILPR fragment with three C-rich repeats. PLoS One. 2012;7(6):e39271. doi: 10.1371/journal.pone.0039271. Epub 2012 Jun 25. PubMed PMID: 22761750; PubMed Central PMCID: PMC3382603.

2.帅领

姓名：帅领，博士生导师 职称：特聘研究员 学科方向：药物靶标的疾病分子机制研究 研究方向：干细胞与遗传学

通讯地址：天津市津南区同砚路 38 号，南开大学综合实验楼 D420； 邮编：300350；

电话：022-85358245；

电子邮箱: lshuai_nk@163.com


教师简介 3.

帅领研究员，男，1986 年生。药物化学生物学国家重点实验室研究员。系东北农业大学八 年制“本硕博”连读理科基地班优秀毕业生，于 2013 年获理学博士学位。帅领博士毕业后， 师从中国科学院动物研究所周琪院士从事博士后研究工作，并于 2015 年 11 月加入药物化学 生物学国家重点实验室任特聘研究员。同年，帅领研究员入选“天津市优秀国际博士后计划”， 出访瑞士联邦理工学院生命健康分子所任访问科学家（2016 年 3 月至 6 月）。帅领研究员主 要从事细胞重编程和基因筛选相关领域的研究。近 5 年已发表 SCI 科技论文 12 篇，其中包 括第一作者身份 6 篇，参与作者 6 篇，其代表性作《Androgenetic haploid embryonic stem cells produce live transgenic mice》刊登于世界顶级期刊《Nature》，并被科技部评选为“2012 年 中国科学十大进展”。该研究在世界范围内，首次实现了利用基因修饰的单倍体胚胎干细胞 获得健康成活的转基因哺乳动物。帅领研究员目前主持国家自然科学基金项目 2 项，天津市 自然科学基金重点项目 1 项。


代表性论文：

    Li W#, Shuai L#, Wan HF#, Dong MZ#, Wang M, Sang LS, Feng CJ, Luo GZ, Li TD, Li X, Wang LB, Zheng QY, Sheng C, Wu HJ, Liu ZH, Liu L, Wang L, Wang XJ, Zhao XY*, Zhou Q*. Androgenetic haploid embryonic stem cells produce live transgenic mice. Nature 490(7420) (2012):407-411.（#:

    Equal contribution）

    Liu ZC#, Wan HF#, Wang EY#, Zhao XY, Ding CH, Zhou SY, Li TQ, Shuai L, Feng CJ, Yu Y, Zhou Q*, Beaujean N*. Induced pluripotent stem induced cells show better constitutive heterochromatin

    remodeling and developmental potential after nuclear transfer than their parental cells. Stem Cell Development 21(16) (2012):3001-3009.

    Shuai L#, Feng CJ#, Zhang HJ#, Gu Q, Jia YD, Wang L, Zhao XY, Liu ZH*, Zhou Q*. Derivation of androgenetic embryonic stem cells from m-carboxycinnamic acid bishydroxamide (CBHA) treated androgenetic embryos. Chinese Science Bulletin 58(23) (2013):2862-2868.

    Wan HF#, He ZQ#, Dong MZ, Gu TT, Luo GZ, Teng F, Xia BL, Li W, Feng CJ, Li X, Li TD, Shuai L, FuR, Wang L, WangXJ, Zhao XY* and Zhou Q*. Parthenogenetic haploid embryonic stem cells produce fertile mice. Cell research 23(2013):1330-1333.

    Shuai L, Zhou Q*. Haploid embryonic stem cells serve as a new tool for mammalian genetic study. Stem Cell Research & Therapy 5(1) (2014):20.

    Li W#, Li X#, Li TD#, Jiang MG#, Wan HF, Luo GZ, Feng CJ, Cui XL, Teng F, Yuan Y, Zhou Q, Gu Q, Shuai L, Sha JH, Xiao YM, Wang L, Liu ZH, Wang XJ, Zhao XY, Zhou Q*. Genetic modification and screening in the rat using haploid embryonic stem cells. Cell Stem Cell 14(3) (2014):404-414.

    Shuai L., Li W, Wan H, Zhao XY, Wang L, Zhou Q. Generation of Mammalian Offspring by Haploid Embryonic Stem Cells Microinjection. Curr. Protoc. Stem Cell Biol. 31(2014):1A.6.1–1A.6.15.

    Shuai L#, Wang Y#, Dong M#, Wang X#, Sang L, Wang M, Wan H, Luo G, Gu T, Yuan Y, Feng C, Teng F, Li W, Liu X, Li T, Wang L, Wang XJ, Zhao XY, Zhou Q*. 2015 Durable pluripotency and haploidy in epiblast stem cells derived from haploid embryonic stem cells in vitro. Journal of Molecular Cell Biology 7(4) (2015):326-337.

    Li X#, Wang JQ#, Wang LY#, Wan HF, Li YF, Li TD, Wang YK, Shuai L, Mao YH, Cui XL, Wang L, Liu ZH, Li W, Zhou Q*. Co-participation of paternal and maternal genomes before the blastocyst stage is not required for full-term development of mouse embryos. Journal of Molecular Cell Biology 7(5) (2015):486-488.

    .Li X#, Cui XL#, Wang JQ#, Wang YK, Li YF, Wang LY, Wan HF, Li TD, Feng GH, Shuai L, Li ZK, Gu Q, Hao J, Wang L, Zhao XY, Wang XJ, Liu ZH, Li W*, Zhou Q*. Generation and Application of Mouse-Rat Allodiploid Embryonic Stem Cells. Cell 164(1-2) (2016):279-292.

    .Li.T.D.#, Shuai.L.#, Mao.J.J.#, Wang. X.P., Wang.M., Zhang X.X., Wang.L., Li.Y.N., Li.W., Zhou.Q*.

    Efficient production of fluorecent transgenic rats using the piggyback transposon. Scientific Reports. (2016): Doi:10.1038/srep33225.

    Gu Q, Zhu H, Chen L, Shuai L, Fang J, Wu J, Liu L, Li W, Dai J, Hao J*, Zhou Q*l: Three dimensional collagen scaffolds promote iPSC induction with higher pluripotency. Protein Cell (2016), 7(11):844-848.


3. 李昌华

李昌华 职称：特聘研究员，博士生导师、天津市青年****获得者 学科方向：化学生物学 招生方向：药物化学、高分子化学、有机化学 通讯地址：南开大学药物化学生物学国家重点实验室 电子邮件：chli@nankai.edu.cn


研究兴趣： 开发用于生物检测和光介导治疗的有机光功能材料，包括有机小分子和纳米组装体。在生物 检测方面，力图从小分子结构和超分子组装两方面进行创新以实现对细胞内复杂生化过程的

探测或者生物活性分子的动态测量；在光介导治疗方面，主要聚焦在制备疾病微环境响应的 小分子或纳米光敏剂以提升光介导治疗的特异性和可控性。


代表性论文:


    H. L. Chen, X. J. He, M. H. Su, W. H. Zhai, H. Zhang, Changhua Li* "A General Strategy Toward Highly Fluorogenic Bioprobes Emitting across the Visible Spectrum"J. Am. Chem. Soc. 2017, 139, 10157-10163. (Highlighted by JACS Spotlights; 10.1021/jacs.7b07502)