中东研究所的主要研究方向如下：
　　一、中东与当代国际关系研究
　　主要研究当代中东地区的政治、经济、社会、文化、军事、国际关系等方面。其基本内容包括：
　　（1）中东政治。包括政治制度、思想、政党、组织、人物等。
　　（2）中东经济。包括发展模式、石油问题、地区合作、人力资源、教育等。
　　（3）中东社会文化。包括社会结构、现代化、妇女问题、部落问题、风俗习惯等。
　　（4）中东国际关系。包括阿以冲突、海湾战争等地区冲突及大国与中东的关系、中东国家之间及其与周边地区的关系等。
　　（5）中国与中东的关系。
　　本方向的研究特色：
　　（1）以相对定型的重大专题作为研究对象，侧重于分析战后中东政治经济社会发展的规律，而不是关注热点的跟踪研究。
　　（2）采取现状与历史相结合的研究方法，从历史出发审视现实，从而增加对现实的理解深度，把握中东政治经济发展的大趋势。
　　（3）以当代问题为重点。
　　（4）采用多学科的研究方法，包括政治学、经济学、历史学、社会学、国际关系学等学科的方法。近十余年来，中东所在中东与当代国际关系研究方面取得了重大成就，在一些重大专题上形成独有优势和特长，如民族主义、伊斯兰教、以色列政治、沙特阿拉伯研究、巴勒斯坦问题、人力资源、海湾问题、妇女问题等，出版了一批高质量的专著、译著和论文，在国内产生了广泛的影响。另外，中东所也积极致力于研究中东与中国、尤其是中国西北地区关系的研究，为西部大开发服务。
　　
　　二、中东历史研究
　　主要研究中东地区的历史，其具体内容包括：
　　（1）中东近现代史。中东近现代的社会、经济、政治、文化、军事、宗教、国际关系方面的历史。
　　（2）中东古代史。中东古代（含上古和中古）的社会、经济、政治、文化、军事、宗教、国际关系方面的历史。
　　（3）中东与中国关系史。包括中东与中国政治、经济、文化、宗教等方面关系的历史。
　　本方向的主要特点为：
　　（1）以历史交往理论作为主要的理论指导，从而探讨中东民族和国家的起源、文明的发展和更替、游牧民族与农耕民族的关系、与周边文明的交汇和冲突等。
　　（2）注重作为基础的国别史研究，并以一些中东大国为中心形成研究特色和优势，如阿富汗、沙特阿拉伯、伊拉克、伊朗、以色列和巴勒斯坦的历史等，《中东国家通史》是这一方面的代表作；
　　（3）以一些有优势、有传统、理论性强的大专题为研究中心，如民族主义、中东的现代化与全球化、中东的民族国家构建、伊斯兰教等。

　　三、世界宗教文化研究
　　主要研究内容包括：
　　（1）伊斯兰教。包括其起源、发展演变、教派、教义教法、典章制度、传播、与当代社会的关系、中国伊斯兰教等。
　　（2）其他方面。包括基督教、犹太教、祆教、中东古代宗教等。
　　本方向的主要特点如下：
　　（1）既注重从宗教学角度对教义、教派、典章制度等方面的研究，也强调从宗教社会学方面进行研究，尤其是对两世兼重的伊斯兰教和犹太教。
　　（2）从文化交往的角度进行宗教史研究。中东地区宗教和教派繁多，相互影响及与周边的希腊、中亚、南亚宗教文化的交往频繁，因此研究上述宗教的相互影响具有重要意义。
　　（3）把对外国宗教的研究与中国西北地区相同宗教的研究相结合，使宗教学研究更好地为国家和地方建设服务，发挥其社会效益。我校位于西北地区，而西北是伊斯兰教最先传入中国的地区，有着大量有关的寺院和历史遗迹，也是中国穆斯林的主要聚居区；西北地区在地理上与西亚、中亚毗邻，民族、宗教和风俗相近，这为研究上述宗教提供了地缘优势。