相册


基本信息 The basic information
姓名: 呼加璐

学院: 计算机学院


学历: 博士研究生毕业

学位: 博士


职称: 副教授

职务:


学科:





教育经历 Education Experience
2004年－2008年 西安电子科技大学计算机学院 学士
2008年－2010年 西安电子科技大学计算机学院 硕士
2010年－2014年 德国柏林自由大学计算机与数学学院 博士
2015年－2016年 美国俄勒冈州立大学 博士后



工作经历 Work Experience
西北工业大学计算机学院 副教授



招生信息 Admission Information
常年招收对生物信息学(Bioinformatics)、数据挖掘(Data mining)、机器学习(machine learning)有科研热情的本科生、硕士研究生参与我的科研项目，欢迎感兴趣的同学与我联系（jhu[at]nwpu.edu.cn)，实验室主页：http://www.nwpu-bioinformatics.com
1）主要目的是：培养学生的科研能力，为将来他们参与科研活动打下良好的基础。科研能力包括：文献阅读能力、数学建模能力、计算机编程能力、学术沟通表达能力、团队合作能力；
2）科研奖励：对于在科研项目中表现优异的同学，我们提供科研奖励；
3）优先招收有特长、有想法的学生，为这些学生提供平台、提供资金，如果需要，可以增配科研助手帮助完成；
3）优先招收有以下两种以上编程经验的学生：C++、R、python、perl、Java、html、javascript、PHP、css、MYSQL、Shell语言。


指导过的研究生、本科生：
Kim本科生，美国俄勒冈州立大学大二本科生，经过一学期的科研训练，研究微生物对癌症的影响，获得学校5000美金的科研奖励；
高**硕士生，经过一学期的本科毕设，完成了西北工业大学数据挖掘与生物信息学实验室的网站开发，获得优秀本科毕设称号，研一在国际知名期刊《BMC Systems Biology》等上发表SCI 2区文章5篇，优秀毕业硕士论文，获国家奖学金2次，资助赴西班牙参加国际会议；
郑**博士生，该同学已经被直接录取为博士生，开发了水稻基因组转座子的查询工具，在CCF B类会议发表一篇文章，在《BMC Medical Genomics》上发表SCI 3区文章一篇，实验室资助去美国参加国际会议一次，去新加坡国立大学联合培养；
王**硕士生，发表SCI 2区文章1篇，资助参加国内会议1次；
何**硕士生，开发蛋白质相互作用网络的比对软件, 资助参加国内会议1次，在《BMC Genomics》、《BMC bioinformatics》上发表SCI 2区文章两次；
钟**硕士生，资助参加国际会议2次，发表SCI 2区文章1次， 发表CCF B类会议1次。


研究生毕业去向：
新加坡国立大学联合培养1人、百度1人、字节跳动1人、蚂蚁金服1人、阿里巴巴1人







科学研究 Scientific Research
数据挖掘基础与应用
1、数据挖掘、机器学习理论与方法
2、图挖掘技术及社交网络数据分析
3、文本挖掘方法
生物数据分析及在疾病中的应用
1、生物数据网络建模与高效分析算法
2、癌症疾病中模式挖掘与分析方法
3、基因组转座子分析方法
图论及其算法的应用
1、图同构算法
2、复杂网络拓扑结构特征分析



学术成果 Academic Achievements
最近更新于2019年3月27日
[18] Jialu Hu,Jingru Wang, Xuequn Shang, MD-SVM: A novel SVM-based algorithm for the motif discovery of transcription factor binding sites, BMC Systems Biology, (2019), 20(7)
[17] Jialu Hu,Yan Zheng, and Xuequn Shang,MiteFinderII: A novel tool to identify miniature inverted-repeat transposable elementshidden in eukaryotic genomes, BMC Medical Genomics (2018), 11(5):101
[16] Jialu Hu, Yiqun Gao, Xuequn Shang,KF-finder: Identification of key factors from host-microbial networks in cervical cancer, BMC Systems Biology(2018) ,12(4):54
[15] Jialu Hu,Yiqun Gao, Junhao He, Yan Zheng and Xuequn Shang,WebNetCoffee: a web-based application to identify functionally conserved proteins from multiple PPI networks,BMC Bioinformatics (2018), 19(1):422
[14] Hu J.,He J., Gao Y., Zheng Y., Shang X.NetCoffee2: A Novel Global Alignment Algorithm for Multiple PPI Networks Based on Graph Feature Vectors. In: Huang DS., Jo KH., Zhang XL. (eds) Intelligent Computing Theories and Application. ICIC 2018. Lecture Notes in Computer Science, vol 10955. pp 241-246, Springer, Cham
[13] Jialu Hu, Yan Zheng, and Xuequn Shang.MiteFinder: A fast approach to identify miniature inverted-repeat transposable elements on a genome-wide scale. IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine (BIBM2017),Kansas city, Nov. 13-16, 2017:164-168
[12] Jialu Hu, Xuequn Shang,Detection of Network Motif Based on A Novel Graph Canonization Algorithm from Transcriptional Regulation Networks, Molecules(2017),22(12),2194
[11] Khiem Lam, Dariia Vyshenska,Jialu Hu el ta. Transkingdom network reveals bacterial players associated with cervical cancer gene expression program, PEERJ, 2018, 6:e5590, doi:10.7717/peerj.5590
[10]Danelishvili, L and Shulzhenko, N and Jjj, Chinison and Babrak, L andHu, J. and Morgun, A and Burrows, G and Bermudez, L. E., "Mycobacterium tuberculosis proteome response to anti-tuberculosis compounds reveals metabolic "escape" pathways that prolong bacterial survival",Antimicrobial Agents & Chemotherapy, 2017.
[9] Jialu Hu, Birte Kehr and Knut Reinert,NetCoffee: a fast and accurate global alignment approach to identify functionally conserved proteins in multiple networks, Bioinformatics (2014) 30 (4): 540-548, doi: 10.1093 /bioinformatics / btt715（IF=7.307）
[7]Jialu Huand Knut Reinert,LocalAli: an evolutionary-based local alignment approach to identify functionally conserved modules in multiple networks, Bioinformatics (2015) 31 (3): 363-372, doi:10.1093/bioinformatics/btu652（IF=7.307）
[6]Jialu Hu,Birte Kehr, and Knut Reinert,M-NetAligner: a novel global alignment approach to identify functional orthologs in multiple networks, 17th Annual International Conference on Research in Computational Molecular Biology (RECOMB) 2013, Beijing, Apr 7-10, 2013, P207
[5] Jiajie Peng, Qianqian Li, Bolin Chen,Jialu Hu, Xuequn Shang,Analyzing factors involved in the HPO-based semantic similarity calculation, IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine (BIBM), 2016, Shenzhen, Dec, DOI: 10.1109/BIBM.2016.**
[4]Jialu Hu, Khiem Lam, Xiaoxi Dong, Heidi Lyng, Natalia Shulzhenko, and Andrey Morgun,Identification of bacterial pathogens from host-microbe interaction networks, CGRB fall conference, Corvallis, Sep 18, 2015
[3] Khiem Lam,Jialu Hu, Xiaoxi Dong, Heidi Lyng, Natalia Shulzhenko, and Andrey Morgun, The Microbiome of Cervical Cancer,Microbiome of cervical cancer, Symposium on Host-Microbe Systems Biology: Synthesis and Selection of Host-Microbe Systems, Eugen, July 31-August 2, 2015
[2]Jialu Hu, Lin Gao, and Guimin Qin,Evaluation of subgraph searching algorithms detecting network motif in biological networks, Frontiers of Computer Science in China (2009) 3(3):412-416
[1]Qin Gui-min，Hu Jia-lu，Gao Lin，A review on algorithms for network motif discovery in biological networks，Chinese Journal of Electronics(2009)37(10)：2258-2265




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