张永杰，男，1979年生，博士，教授，博士生导师，山西省“三晋英才”支持计划入选者。毕业于中国科学院研究生院（现中国科学院大学），曾先后留学加拿大麦克马斯特大学和美国加州大学伯克利分校。担任中国菌物学会理事，《菌物学报》、《菌物研究》、《食用菌学报》等期刊编委，生命科学学院生物工程系主任和教工第二党支部书记。
一、教学与指导学生情况：
目前，承担本科生的《微生物学》、《新生研讨课》、《毕业论文指导》等课程和研究生的《现代微生物分类学》、《微生物代谢产物的开发与利用》、《现代生物技术及应用》、《生命科学前沿》等课程的教学工作。还曾承担过本科生的《生物制药基础及应用》和研究生的《微生物资源与生态学》课程。
指导完成本科生科研训练项目3期共9人次和本科生毕业论文设计共21人次。
2009年起受聘硕士生导师，2019年起受聘博士生导师，累计指导研究生共21人，已毕业15人。培养的研究生中多人次获国家奖学金、校优秀研究生、校优秀毕业研究生、校优秀学位论文、学业奖学金等荣誉。
本研究团队可招收研究生的专业：微生物学、细胞生物学、食品科学、农业推广（含资源利用与植物保护、食品加工与安全2个专业）、食品工程。我们长期招收研究生，欢迎报考！
二、研究兴趣：
进化生物学（Evolutionary Biology）是研究生物进化过程和生物多样性的学科，近二十年来经历了一个快速发展和变革的时期，已成为生命科学领域发展最为迅速的分支学科之一。随着微生物生理学和基因组学的快速发展，以及微生物本身具有繁殖周期短的特性，微生物成为研究生物进化的理想材料。本课题组主要利用现代组学技术（基因组学、转录组学、比较基因组学、群体基因组学、宏基因组学等）开展微生物进化生物学的研究。主要研究内容有：1）真菌群体遗传与进化：利用多基因序列分析技术和组学手段研究重要真菌的群体遗传学，探究其物种分化水平、群体遗传结构、演化历程、谱系地理学等；2）真菌线粒体基因组学：组装重要真菌的线粒体基因组，通过种内和种间水平的比较寻找真菌线粒体DNA的进化规律，筛选重要真菌的线粒体遗传标记；3）真菌与宿主及环境的互作关系：从分子水平探究典型真菌与宿主及环境间的互作关系；4）食品微生物组：利用DNA高通量测序、质谱技术等研究发酵类食品及相关材料中的微生物群落结构及功能，鉴别功能微生物种类。本课题组瞄准微生物进化与利用的核心科学问题，将澄清一些重要微生物的进化历程，丰富和发展微生物进化理论体系，为珍稀真菌资源的保护及有益微生物的合理利用提供理论依据。
三、科研成果：
截至目前，本课题组已在国内外学术期刊上累计发表论文70余篇，其中在Mol Ecol、Environ Microbiol等国际刊物发表SCI论文37篇（总影响因子约110；单篇影响因子大于5的有4篇；累积引用愈千次）；1篇论文曾入选“中国精品科技期刊顶尖学术论文”（F5000）。主编和参编学术专著各1部，获省、市级科学技术奖各1项，授权专利2项。
代表性文章：(#共同第一作者, *通讯作者)
1. Zhang Y.J., Zhang S., Li Y.L., Ma S.L., Wang C.S., Xiang M.C., Liu X., An Z.Q., Xu J.P.*, Liu X.Z.* Phylogeography and evolution of a fungal-insect association on the Tibetan Plateau. Molecular Ecology, 2014, 23(21): 5337-5355. (IF="6.494; SCI 2区)
2. Fan W.W., Zhang S.*, Zhang Y.J*. The complete mitochondrial genome of the Chan-hua fungus Isaria cicadae : a tale of intron evolution in Cordycipitaceae. Environmental Microbiology, 2019, 21(2):864-879 (IF="5.395；SCI 2区)
3. Wang L., Zhang S., Li J.H.*, Zhang Y.J.*. Mitochondrial genome, comparative analysis and evolutionary insights into the entomopathogenic fungus Hirsutella thompsonii . Environmental Microbiology, 2018, 20(9): 3393-3405 (IF="5.395;" SCI 2区)
4. Zhang S., Hao A.J., Zhao Y.X., Zhang X.Y., Zhang Y.J.* Comparative mitochondrial genomics toward exploring molecular markers in the medicinal fungus Cordyceps militaris . Scientific Reports, 2017, 7: 40219 (IF="5.228;" SCI 2区).
5. Zhang S., Zhang Y.J.*. Proposal of a new nomenclature for introns in protein-coding genes in fungal mitogenomes. IMA Fungus, 2019, 10:15 (IF="4.5；SCI 2区)
6. Zhang Y.J., Zhang S., Wang M., Bai F.Y., Liu X.Z.* High diversity of the fungal community structure in naturally-occurring Ophiocordyceps sinensis. PLoS ONE, 2010, 5(12): e15570. (IF="4.411；SCI 4区)
7. Zhang Y.J.#, Xu L.L.#, Zhang S., Liu X.Z.*, An Z.Q., Wang M., Guo Y.L. Genetic diversity of Ophiocordyceps sinensis , a medicinal fungus endemic to the Tibetan Plateau: Implications for its evolution and conservation. BMC Evolutionary Biology, 2009, 9: 290. (IF=4.294；SCI 4区)
8. Nie Y.#, Wang L.#, Cai Y., Tao W., Zhang Y.J.*, Huang B*. Mitochondrial genome of the entomophthoroid fungus Conidiobolus heterosporus provides insights into evolution of basal fungi. Applied Microbiology and Biotechnology, 2019, 103(9):1379–1391 (IF="3.34;" SCI 2区)
9. Zhang S.*, Zhang Y.J.*, Li Z.L. Complete mitogenome of the entomopathogenic fungus Sporothrix insectorum RCEF 264 and comparative mitogenomics in Ophiostomatales. Applied Microbiology and Biotechnology, 2019, 103(14):5797-5809 (IF="3.34; SCI 2区)
10. Sandor S., Zhang Y.J., Xu J.P*. Fungal mitochondrial genomes and genetic polymorphisms. Applied Microbiology and Biotechnology, 2018, 102: 9433-9448. (IF="3.34;" SCI 2区)
11. Zhang Y.J.*, Yang X.Q., Zhang S., Humber R.A., Xu J.P.* Genomic analyses reveal low mitochondrial and high nuclear diversity in the cyclosporin-producing fungus Tolypocladium inflatum . Applied Microbiology and Biotechnology, 2017, 101(23): 8517-8531. (IF="3.34; SCI 2区)
12. Zhang Y.J.*, Zhang H.Y., Liu X.Z., Zhang S*. Mitochondrial genome of the nematode endoparasitic fungus Hirsutella vermicola reveals a high level of synteny in the family Ophiocordycipitaceae. Applied Microbiology and Biotechnology, 2017, 101(8): 3295-3304(IF="3.34; SCI 2区).
13. Zhang S., Wang X.N., Zhang X.L., Liu X.Z., Zhang Y.J.* Complete mitochondrial genome of the endophytic fungus Pestalotiopsis fici : features and evolution. Applied Microbiology and Biotechnology, 2017, 101(4): 1593–1604 (IF="3.34;" SCI 2区).
14. Zhang Y.J.*, Hou J.X., Zhang S., Hausner G., Liu X.Z.*, Li W.J. The intronic minisatellite OsMin1 within a serine protease gene in the Chinese caterpillar fungus Ophiocordyceps sinensis . Applied Microbiology and Biotechnology, 2016, 100(8): 3599-3610 (IF="3.34;" SCI 2区)
15. Zhang Y.J.#, Skaar I.#, Sulyok M., Liu X.Z., Rao M.Y., Taylor J.W*. The microbiome and metabolites in fermented Pu-erh tea as revealed by high-throughput sequencing and quantitative multiplex metabolite analysis. PLoS One, 2016, 11(6): e**. (IF="3.057;" SCI 3区)
16. Wang N.N.#, Zhang Y.J. #, Jiang X.Z., Shu C., Hamid M.I., Hussain M., Chen, S.Y., Xu J.P., Xiang M.C., Liu X.Z. Population genetics analyses of Hirsutella rhossiliensis , a dominant parasite of cyst nematode juveniles at a continental scale. Applied and Environmental Microbiology, 2016, 82(21): 6317-6325. (IF="3.823;" SCI 3区)
17. Zhang Y.J.*, Zhang S., Zhang G.Z., Liu X.Z., Wang C.S., Xu J.P.* Comparison of mitochondrial genomes provides insights into intron dynamics and evolution in the caterpillar fungus Cordyceps militaris . Fungal Genetics and Biology, 2015, 77: 95-107. (IF="2.933；SCI 3区)
18. Zhang S.#, Zhang Y.J.#, Liu X.Z.*, Zhang H., Liu D.S. On the reliability of DNA sequences of Ophiocordyceps sinensis in public databases. Journal of Industrial Microbiology and Biotechnology, 2013, 40: 365-378 (IF="2.505;" SCI 2区).
19. Sun X.Y.#, Kang S. #, Zhang Y.J. #, Tan X.Q., Yu Y.F., He H.Y., Zhang X.Y., Liu Y.F., Wang S., Sun W.X., Cai L., Li S.J.* Genetic diversity and population structure of rice pathogen Ustilaginoidea virens in China. PLOS ONE, 2013, 8(9): e76879 (IF="3.534;" SCI 2区)
20. Zhang Y.J., Bai F.R., Zhang S., Liu X.Z*. Determining novel molecular markers in the Chinese caterpillar fungus Ophiocordyceps sinensis by screening a shotgun genomic library. Applied Microbiology and Biotechnology, 2012, 95: 1243-1251 (IF="3.689; SCI 2区)
21. Zhang S.#, Zhang Y.J.#, Liu, X.Z.*, Wen H.A., Wang M., Liu D.S. Cloning and analysis of the MAT1-2-1 gene from the traditional Chinese medicinal fungus Ophiocordyceps sinensis . Fungal Biology, 2011, 115(8): 708-714. (IF="2.809;" SCI 3区)
22. Zhang Y.J., Liu X.Z.*, Wang M. Cloning, expression and characterization of two novel cuticle-degrading serine proteases from the entomopathogenic fungus, Cordyceps sinensis . Research in Microbiology, 2008, 159(6): 462-469. (IF="2.055;" SCI 3区)
更多文章详见：https://www.researchgate.net/profile/Yong_Jie_Zhang/research
著作：
1. Zhang Y.J., Xu J.P. Molecular Mechanisms of Fungal Adaptive Evolution, In: P.H. Rampelotto (Ed.), Molecular Mechanisms of Microbial Evolution, Springer, Cham, Switzerland, 2018, pp. 409-435
2. 张永杰. 冬虫夏草菌的生物学研究. 北京：科学出版社，2012
四、科研项目:
先后承担科研项目19项，其中省部级以上16项。代表性科研项目如下:
1. 国家自然科学基金：蛹虫草线粒体DNA的遗传多样性与线粒体遗传机制的研究（**），2019
2. 国家自然科学基金：通过多基因序列分析研究冬虫夏草菌与寄主昆虫的协同进化（**），2012
3. 国家自然科学基金：冬虫夏草的真菌群落结构及对真菌资源开发潜力的评价（**），2012
4. 教育部高等学校博士学科点专项科研基金：名贵药材冬虫夏草真菌群落研究（007），2011
5. 山西省回国留学人员科研资助项目：基于线粒体基因组的虫草类真菌的系统进化研究（2017-015），2017
6. 山西省自然科学基金：山西省虫草资源调查及其虫草菌的研究 （201601D011065），2016
7. 山西省留学回国人员科技活动择优资助项目：参与普洱茶后发酵生产的关键微生物物种的鉴别，2016
8. 山西省自然科学基金：分离自冬虫夏草可培养真菌资源的前期开发研究（-2），2014
9. 真菌学国家重点实验室开放课题：冬虫夏草菌的线粒体基因组测序及比较线粒体基因组学研究，2013
联系方式:
E-mail: zhangyj2008@sxu.edu.cn
电话：壹叁伍肆陆叁捌零叁伍贰
地 址：山西省太原市小店区坞城路92号 山西大学生命科学学院
邮 编：030006