学校生理学为国家重点学科，生物学、公共卫生与预防医学、临床医学3个一级学科设有博士后科研流动站，细胞生理学实验室为省部共建教育部重点实验室，临床医学、预防医学、法医学、药学、护理学5个专业为国家级特色专业建设点，临床技能实训中心为国家级实验教学示范中心，重症医学、泌尿外科学、中医护理学、骨科学、肾病学、普通外科学、老年病学、急诊医学、风湿免疫学、护理学、病理学、眼科学、心血管内科13个学科为国家临床重点专科；生物学为山西省优势重点学科，公共卫生与预防医学、临床医学、护理学为山西省特色重点学科。另有10个省级重点学科、5个省级特色专业、7个省级品牌专业、6个省重点实验室、6个省级实验教学示范中心、2个省级工程研究中心、1个省级研究所。
　　学校是全国首批硕士学位、学士学位授权单位，山西省首批博士学位授权单位，现有生物学、临床医学、公共卫生与预防医学、护理学4个一级学科博士学位授权点，42个二级学科博士学位授权点；生物学、基础医学、临床医学、公共卫生与预防医学、药学、中药学、护理学7个一级学科硕士学位授权点，57个二级学科硕士学位授权点；临床医学、口腔医学、公共卫生、护理、药学5个硕士专业学位授权点。
　　2013年，学校获准立项各类研究计划项目350余项，学科建设与科研总经费达8570余万元；在国际性和国家级期刊发表科研论文2060余篇，其中SCI收录论文167篇；出版学术著作43部；获各类省级成果奖29项，获批专利21项。
　　直属附属医院中，第一医院、第二医院是山西省规模最大的综合性三级甲等医院，全国百姓放心医院，共开放床位3400余张，技术力量雄厚，医疗水平领先；口腔医院是省内唯一一所三级乙等口腔专科医院，拥有日本森田3D牙科CT机、德国西门子数字化全景机等一批先进医疗设备。
　　学校与美国、德国、澳大利亚、意大利、日本、新加坡以及香港、台湾等多个国家和地区的大学和机构建立了教育、科技、医疗合作关系，并开展了多项实质性的交流合作。
　　经过九十多年的薪火相传，经过几代人的艰辛拼搏，山西医科大学取得了辉煌的成就。在未来的征程中，学校将继承优良办学传统，抓住发展机遇，加快发展步伐，为建成建好特色鲜明的教学研究型医科大学而努力奋斗。