其他题名Genome-wide analysis of putative sugar transporter proteins in eukaryotic microalgae
刘亚铭; 陈高; 秦松
; 崔玉琳; 崔红利发表期刊生物学杂志
ISSN2095-1736
2019
卷号36期号:5页码:31-35
关键词真核微藻糖转运蛋白比较基因组学Eukaryotic MicroalgaeSugar Transporter ProteinsComparative Genomics
研究领域Plant Sciences
产权排序(1) 中国科学院烟台海岸带研究所海岸带生物学与生物资源利用重点实验室
; (2) 中国科学院大学; (3) 山东省农业科学院生物技术研究中心; (4) 山东省作物遗传改良与生态生理重点实验室; (5) 山西农业大学分子农业与生物能源研究所
作者部门海岸带生物学与生物资源保护实验室
英文摘要Sugar transporter proteins are located in the cell membrane and are a group of important transmembrane proteins.Sugar transporter proteins transport carbohydrate from extracellular to intracellular for the use of cells.Sugar transporter proteins,as sugar sensors,play an important role in eukaryotic microalgae,breast-feeding animals and higher plants.In this study,comparative genomics analyses were applied to study sugar transporter proteins and to explore their distribution,classification,phylogeny,evolution and structure in eukaryotic microalgae.Twenty-eight eukaryotic microalgae genomes were examined for putative genes of sugar transporter proteins and 70 putative sugar transporter protein sequences were found,which were 9 types of HUP1,39 types of HUP2 and 22 types of HUP3.Sugar transporter genes of eukaryotic microalgae were origin of bacterium.In this study,a general framework of the sequence-structure-function connections of the sugar transporter genes was revealed.
中文摘要糖转运蛋白是一种位于细胞膜上的重要载体蛋白,负责将胞外的糖类物质转运至细胞内供细胞代谢利用,除了转运功能外,糖转运蛋白还可以作为糖传感器在真核微藻、哺乳动物和高等植物中发挥重要作用。以真核微藻基因组数据为基础,在基因组水平对糖转运蛋白基因的分布、结构和进化规律进行了系统的研究。对测序完成的28株真核微藻糖转运蛋白家族进行了比较基因组学分析,从中发现了70个假定的糖转运蛋白序列,即为9个HUP1,39个HUP2和22个HUP3类型的糖转运蛋白基因。初步推断真核微藻的糖转运蛋白基因是细菌起源的。建立了微藻糖转运蛋白基因-结构-功能的框架结构,对之后构建优良藻株具有重要的理论和现实意义。
收录类别CSCD
语种中文
关键词[WOS]真核微藻; 糖转运蛋白; 比较基因组学; Eukaryotic Microalgae; Sugar Transporter Proteins; Comparative Genomics
研究领域[WOS]Plant Sciences
CSCD记录号CSCD:6595809
引用统计
文献类型期刊论文
条目标识符http://ir.yic.ac.cnhttp://ir.yic.ac.cn/handle/133337/25134
专题海岸带生物学与生物资源利用重点实验室_海岸带生物学与生物资源保护实验室
作者单位1.中国科学院烟台海岸带研究所海岸带生物学与生物资源利用重点实验室;
2.中国科学院大学;
3.;
4.山东省作物遗传改良与生态生理重点实验室;
5.山西农业大学分子农业与生物能源研究所山东省农业科学院生物技术研究中心
推荐引用方式
GB/T 7714刘亚铭,陈高,秦松,等. 真核微藻糖转运蛋白基因的比较基因组学分析[J]. 生物学杂志,2019,36(5):31-35.
APA刘亚铭,陈高,秦松,崔玉琳,&崔红利.(2019).真核微藻糖转运蛋白基因的比较基因组学分析.生物学杂志,36(5),31-35.
MLA刘亚铭,et al."真核微藻糖转运蛋白基因的比较基因组学分析".生物学杂志 36.5(2019):31-35.
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