基于生物信息学分析乙酰辅酶A酰基转移酶1在肾透明细胞癌中的表达及作用机制

李灿楦,陈洁

发布日期:2021-03-05
通讯作者:陈洁. E-mail:568161322@qq.com

基金资助:国家自然科学基金(81871155)

Expression and activity mechanism of acetyl-CoA acyltransferase 1 in clear cell renal cell carcinoma based on bioinformatics

LI Canxuan, CHEN Jie

Department of Urology, The First Affiliated Hospital of Jinan University, Guangzhou 510632, Guangdong, China

Published:2021-03-05

摘要/Abstract

摘要： 目的 探讨乙酰辅酶A酰基转移酶1(ACAA1)在肾透明细胞癌(ccRCC)中的表达及作用机制。 方法 基于GEO数据集(GSE36895、GSE66272、GSE53737)、TCGA-KIRC数据集和Human Protein Atlas数据库分析ACAA1在正常肾组织和ccRCC组织中的表达。经Ualcan数据库进行ACAA1 mRNA与ccRCC临床病理特征的相关性分析。通过GEPIA数据库分析ACAA1 mRNA表达与ccRCC患者的预后关系。此外,利用STRING和Metascape数据库分别进行ACAA1蛋白互作网络构建及其功能机制探索。最后,通过mirDIP和DIANA-TarBase v8数据库预测调控ACAA1的潜在miRNA。 结果 与正常肾组织相比,ACAA1 在ccRCC组织中显著低表达,且ACAA1 mRNA表达与ccRCC临床分期及组织学分级呈负相关。生存分析显示,ACAA1低表达的患者总体生存率以及无病生存率明显低于高表达患者。此外,通过STRING数据库构建了ACAA1蛋白互作网络,功能分析显示ACAA1及其相关基因主要参与脂肪酸β-氧化、脂肪酸代谢、线粒体β-饱和脂肪酸的氧化、过氧化物酶体蛋白转运、脂质代谢过程的调节和类固醇代谢过程等途径。最后,hsa-miR-25-3p和hsa-miR-363-3p可能通过靶向调节ACAA1进而影响ccRCC发生发展。 结论 ACAA1在ccRCC中低表达,并与其发生发展相关,为深入研究ACAA1在ccRCC中的作用机制提供理论帮助。


PDF全文下载地址:

http://yxbwk.njournal.sdu.edu.cn/CN/article/downloadArticleFile.do?attachType=PDF&id=4231