柳军涛
柳军涛
1988年11月生；讲师；硕士生导师；博士
研究领域：生物信息学；组合优化

联系方式
地址：山东省威海市文化西路180号，山东大学（威海）数学与统计学院邮编：264209 电子邮件：juntao@sdu.edu.cn；juntaosdu@126.com
行政职务与学术兼职
1. Frontiers in Genetics杂志：Review Editor;2. 多个学术杂志（如：Bioinformatics, BMC Genomics, Applied Spectroscopy, Plos One等）的审稿人；
访问经历
2015.10 - 2016.10，美国加州大学河滨分校，计算机科学与工程系，联合培养博士
学习经历
2017.6 - 2019.3，博士后，山东大学2012.09 - 2017.06，山东大学数学学院，运筹学与控制论，博士学位 2008.09 - 2012.06，山东大学数学学院，信息与计算科学，学士学位
工作经历
2017.07 - 至今，山东大学（威海）数学与统计学院2019.03 - 2020.03，挂职山东大学（威海）人事处副处长
项目
1.基于参考基因组的转录组拼接算法研究及其在癌症中的应用，国家自然科学基金青年基金（项目号：**），25万，主持，2019/01-2021/12；2.基于高通量RNA-seq数据的转录组拼接算法设计与应用，山东省自然科学基金培养基金（项目号：ZR2018PA001），5万，主持，2018/03-2020/06;3.基于二代RNA-seq数据转录组拼接的理论研究与算法设计，中国博士后科学基金面上资助（项目号：2018M632659），5万，主持（已结题）；4.基于图与组合优化的生物数据和网络数据挖掘算法研究，国家自然科学基金委重点项目（项目号：**），10万，子课题负责人，2020/01-2024/12；5.山东大学“青年****未来计划”基金，50万，2020/01-2024/12；
论著
14. Ting Yu, Zengchao Mu, Zhaoyuan Fang, Xiaoping Liu, Xin Gao, Juntao Liu* (通讯作者 2020.8.17), TransBorrow: Genome-guided transcriptome assembly by borrowing assemblies from different assemblers. Genome Research, 30(8). (SCI, 中科院1区Top，IF：11.093)13. Xiangyu Liu, Di Li, Juntao Liu, Zhengchang Su, Guojun Li (2020.7.11) RecBic: a fast and accurate algorithm recognizing trend-preserving biclusters. Bioinformatics. (SCI, 中科院1区Top，IF：5.61)12.Ting Yu#, Juntao Liu# (共同一作), Xin Gao, Guojun Li (2020.1.27) iPAC: a genome-guided assembler of isoforms via phasing and combing paths. Bioinformatics, doi: 10.1093/bioinformatics/btaa052. (SCI, 中科院1区Top，IF：4.531)11.Zengchao Mu, Ting Yu, Enfeng Qi, Juntao Liu* (通讯作者), Guojun Li (2019.06) DCGR: Feature extractions from protein sequences based on CGR via remodeling multiple information. BMC Bioinformatics, 20:351. (SCI, 中科院2区，IF：2.511)10. Juntao Liu, Ting Yu, Zengchao Mu, Guojun Li (2019.4.9) TransLiG: a de novo transcriptome assembler that uses line graph iteration.?Genome Biology, 28(81). (SCI, 中科院1区Top, IF：14.028)9. Juntao Liu, Xiangyu Liu, Xianwen Ren, Guojun Li (2019.3.31) scRNAss: a single-cell RNA-seq assembler via imputing dropouts and combing junctions. Bioinformatics. (SCI, 中科院1区Top，IF：4.531) 8. Juntao Liu, Ting Yu, Tao Jiang, Guojun Li (2016.10.19) TransComb: genome-guided transcriptome assembly via combing junctions in splicing graphs. Genome Biology, 17(213). (SCI, 中科院1区Top, IF：14.028)7. Juntao Liu, Guojun Li, Zheng Chang, Ting Yu, Bingqiang Liu, Rick McMullen, Pengyin Cheng, Xiuzhen Huang (2016.2.19) BinPacker: Packing-Based De Novo Transcriptome Assembly from RNA-seq Data. Plos Computational Biology, 12(2): e**. (SCI, 中科院1区Top, IF：4.428)6. Juntao Liu, Jianyang Sun, Xiuzhen Huang, Guojun Li, Bingqiang Liu (2015.7) Goldindec: A Novel Algorithm for Raman Spectrum Baseline Correction. Applied Spectroscopy, 69(7): 834. (SCI, 2区, IF：1.872)5. Juntao Liu, Xiaoyun Duan, Jianyang Sun, Yanbin Yin, Guojun Li, Lushan Wang, Bingqiang Liu (2013.11.20) Bi-Factor Analysis Based on Noise-Reduction (BIFANR): A New Algorithm for Detecting Coevolving Amino Acid Sites in Proteins. Plos One, 8(11):e79764. (SCI, 2区, IF：2.766)4. Bo Gao, Yue Zhao, Yang Li,?Juntao Liu, Lushan Wang, Guojun Li, Zhengchang Su (2018.12) Prediction of Driver Modules via Balancing Exclusive Coverages of Mutations in Cancer Samples.?Advanced Science. (SCI, 中科院1区Top，IF：15.804)3. Ashraful Arefeen, Juntao Liu, Xinshu Xiao, Tao Jiang (2018.2.23) TAPAS: Tool for Alternative Polyadenylation Site Analysis. Bioinformatics. (SCI, 中科院1区Top，IF：4.531)2. Bo Gao, Guojun Li, Juntao Liu, Yang Li, Xiuzhen Huang (2017.3.21) Identification of driver modules in pan-cancer via coordinating coverage and exclusivity. Oncotarget, doi: 10.18632/oncotarget.16433. (SCI, 1区，IF：5.168)1. Zheng Chang, Guojun Li, Juntao Liu, Yu Zhang, Cody Ashby, Deli Liu, Carole L. Cramer, Xiuzhen Huang (2015.2) Bridger: A new framework for de novo transcriptome assembly using RNA-seq data. Genome Biology. (SCI, 中科院1区Top, IF：14.028)
在读研究生（以入学时间为序）
王春祥（硕士）