黄金明研究员


姓名职称：
黄金明 研究员，泰山****青年专家，省****基金获得者
教育经历：
1995/09-1999/07南京农业大学，动物科技学院，本科。
1999/09-2002/07南京农业大学，动物科技学院，硕士，动物遗传育种与繁殖专业，导师：王根林教授。
2008/09-2011/06中国农业大学，动物科技学院，博士，动物遗传育种与繁殖专业，导师：吴常信院士
工作经历：
2002/07-2007/11山东省农业科学院畜牧兽医研究所，职位：助理研究员。
2013/10-2014/10美国密苏里大学，动物科学系，访问****。
2015/07-2016/08聊城市东阿县人民政府，副县长（挂职）
2007/12-至今 山东省农业科学院奶牛研究中心，副研究员、研究员，中心副主任。
研究兴趣，领域：
研究方向：牛基因组学与分子育种
1、研究地方牛品种的分子群体结构、揭示特殊环境适应的分子遗传机制，挖掘关键基因和标记。
2、系统解析奶牛主要经济性状的分子遗传基础，建立分子育种技术体系，培育核心种质。
3、应用基因编辑和体细胞克隆等技术，培育奶牛新种质、新品种。
4、研发基因组选择等分子育种新技术，培育优秀特色种质，应用于奶业生产。
主持科研项目及人才计划项目情况：
1. 山东省泰山****青年专家（2019-2023年, 100万元）；
2. 山东省农业良种工程（奶牛）项目（首席专家，编号：2019LGZC011，年限：2019-2022，600万元）；
3. 山东省****基金“牛基因组与分子育种（编号：JQ201709，年限：2017-2020，60万元）”；
4. 国家转基因重大专项“无过敏源奶牛新品种培育（编号：2018ZX**-002，年限：2018-2020，713万元）”；
5. 国家自然科学基金面上项目“渗入、混合和选择促进地方牛品种对特殊环境的遗传适应机制（编号：**，年限：2018-2021，65万元）；
6. 国家自然科学基金面上项目——奶牛microRNA与转录因子调控网络解析及其在乳腺炎抗性中的作用（编号：**，年限：2013-2016，80万元）；
7. 山东省农业科学院农业科技创新工程（编号：CXGC2018E14年限：2018-2020，155万元）；
8. 山东省农业科学院青年英才（年限：2014-2016，20万元）；
9. 国家转基因重大专项“无过敏源转基因奶牛扩繁（编号：2013ZX**-002年限：2013-2015，200万元）”；
10. 国家自然科学基金项目“健康奶牛与乳腺炎奶牛乳腺组织差异表达基因的可变剪切及其分子机制（编号：**；年限:2011-2013，23万元）”；
11. 国家“十二.五”科技发展计划研究任务“华东地区优质种牛快繁技术研究与应用（编号：2011BAD19B02-03；年限2011-2013，60万元）”；
12. 国家农业部转基因生物新品种培育重大专项课题子课题“多不饱和脂肪酸转基因奶牛新材料培育（编号：2011ZX08007-001；年限：2011-2013， 97万元）”；
13. 农业部转基因生物新品种培育重大专项课题“高品质转基因奶牛新品种的培育”子课题（编号：2008ZX08007-001；年限：2008-2010，120万元）；
14. 国家“十一五”科技支撑计划“西门塔尔牛的快速扩繁和种用价值遗传评定技术研究（编号：2008BADB2B09；年限：2008-2010，35万元）”。
代表性论文：
1. Ju Z, Jiang Q, Wang J, Wang X, Yang C, Sun Y, Zhang Y, Wang C, Gao Y, Wei X, Hou M, Huang J*.Genome-wide methylation and transcriptome of blood neutrophils reveal the roles of DNA methylation in affecting transcription of protein-coding genes and miRNAs in E. coli-infected mastitis cows. BMC Genomics. 2020,21(1):102. (通讯作者)
2. Ya Ran Zhang, Yan Hu, Xiu Ge Wang, Qiang Jiang, Han Zhao, Jin Peng Wang, Zhi Hua Ju, Li Guo Yang, Ya Ping Gao, Xiao Chao Wei, Jia Chen Bai, Yang Zhou*, Jin Ming Huang*. Population structure, and selection signatures underlying high-Altitude adaptation inferred from genome-wide copy number variations in Chinese indigenous cattle. Front. Genet. 2020, 10:1404.(通讯作者)
3. Qiang Jiang # , Han Zhao # , Rongling Li #, Yaran Zhang, Yong Liu, Jinpeng Wang, Xiuge Wang, Zhihua Ju, Wenhao Liu, Minghai Hou, Jinming Huang*. In silico genome-wide miRNA-QTL-SNPs analyses identify a functional SNP associated with mastitis in Holsteins. BMC Genetics, 2019, 20(1):46.(通讯作者)
4. Wang X, Yang C, Guo F, Zhang Y, Ju Z, Jiang Q, Zhao X, Liu Y, Zhao H, Wang J, Sun Y, Wang C, Zhu H, Huang J*. Integrated analysis of mRNAs and long noncoding RNAs in the semen from Holstein bulls with high and low sperm motility. Sci Rep. 2019,9(1):2092. (通讯作者)
5. Ju Z, Jiang Q, Liu G, Wang X, Luo G, Zhang Y, Zhang J, Zhong J, Huang J*. Solexa sequencing and custom microRNA chip reveal repertoire of microRNAs in mammary gland of bovine suffering from natural infectious mastitis. Anim Genet. 2018,49(1):3-18.(通讯作者)
6. Ju Z, Wang C, Wang X, Yang C, Zhang Y, Sun Y, Jiang Q, Li R, Li J, Zhong J,Huang J*.The effect of the SNP g.18475 A>G in the 3'UTR of NCF4 on mastitis susceptibility in dairy cattle. Cell Stress Chaperones. 2018,23(3):385-391.(通讯作者)
7. Zhang Y, Wang X, Jiang Q, Hao H, Ju Z, Yang C, Sun Y, Wang C, Zhong J, Huang J*, Zhu H*. DNA methylation rather than single nucleotide polymorphisms regulates the production of an aberrant splice variant of IL6R in mastitic cows. Cell Stress Chaperones. 2018,23(4):617-628. (通讯作者)
8. Wang X, Cui X, Zhang Y, Hao H, Ju Z, Liu D, Jiang Q, Yang C, Sun Y, Wang C, Huang J*, Zhu H*. Splicing-related single nucleotide polymorphism of RAB, member of RAS oncogene family like 2B (RABL2B) jeopardises semen quality in Chinese Holstein bulls. Reprod Fertil Dev. 2017,29(12):2411-2418.(通讯作者)
9. Wang XG, Ju ZH, Hou MH, Jiang Q, Yang CH, Zhang Y, Sun Y, Li RL, Wang CF, Zhong JF, Huang JM*. Deciphering Transcriptome and Complex Alternative Splicing Transcripts in Mammary Gland Tissues from Cows Naturally Infected with Staphylococcus aureus Mastitis.PLoS One. 2016,11(12):e**. (通讯作者)
10. Huang J*, Guo F, Zhang Z, Zhang Y, Wang X, Ju Z, Yang C, Wang C, Hou M, Zhong J. PCK1 is negatively regulated by bta-miR-26a, and a single-nucleotide polymorphism in the 3' untranslated region is involved in semen quality and longevity of Holstein bulls. Mol Reprod Dev. 2016,83(3):217-25.(通讯作者)
11. Ju Z, Wang C, Wang X, Yang C, Sun Y, Jiang Q, Wang F, Li M, Zhong J,Huang J*. Role of an SNP in Alternative Splicing of Bovine NCF4 and Mastitis Susceptibility. PLoS One. 2015,10(11):e**.（通讯作者）
12. Zhang Z, Wang X, Li R, Ju Z, Qi C, Zhang Y, Guo F, Luo G, Li Q, Wang C, Zhong J, Xu Y*, Huang J*. Genetic mutations potentially cause two novel NCF1 splice variants up-regulated in the mammary gland, blood and neutrophil of cows infected by Escherichia coli. Microbiol Res. 2015,174:24-32.（通讯作者）
13. Huang JM*, Luo G, Zhang Z, Wang X, Ju Z, Qi C, Zhang Y, Wang C, Li R, Li J, Yin W, Xu Y, Moisá SJ, Loor JJ, Zhong JF*. iTRAQ-proteomics and bioinformatics analyses of mammary tissue from cows with clinical mastitis due to natural infection with Staphylococci aureus. BMC Genomics. 2014,15:839. (共同通讯作者)
14. Wang XG, Zhong JF, Gao YD, Ju ZH,Huang JM*.A SNP in intron 8 of CD46 causes a novel transcript associated with mastitis in Holsteins. BMC Genomics. 2014,15:630 (通讯作者)
15. Bai Y#,Huang JM#, Liu G, Zhang JB, Wang JY, Liu CK, Fang MY. A comprehensive microRNA expression profile of the backfat tissue from castrated and intact full-sib pair male pigs. BMC Genomics. 2014,15:47 (共同第一作者)
16. Guo F, Yang B, Ju ZH, Wang XG, Qi C, Zhang Y, Wang CF, Liu HD, Feng MY, Chen Y, Xu YX*, Zhong JF*, Huang JM*.Alternative splicing, promoter methylation, and functional SNPs of sperm flagella 2 gene in testis and mature spermatozoa of Holstein bulls. Reproduction. 2014,147:241-252(共同通讯作者)
17. Wang XG,Huang JM*, Feng MY, Ju ZH, Wang CF, Yang GW, Yuan JD*, Zhong JF*. Regulatory mutations in the A2M gene are involved in the mastitis susceptibility in dairy cows. Animal Genetics. 2014,45(1):28-37. (共同通讯作者）
18. Decker JE. Huang JM, Taylor JF. Admixture and Selection after Initial Domestication of Cattle. International Plant and Animal Genome Conference XXIII 2015.
19. Liming Li, Jinming Huang*, Zhihua Ju, Qiuling Li, Changfa Wang, Chao Qi, Yan Zhang, Qinlei Hou, Suqin Hang* and Jifeng Zhong*. Multiple promoters and targeted microRNAs direct the expressions of HMGB3 gene transcripts in dairy cattle. Animal Genetics, 2013, 44(3):241-250 (共同通讯作者)
20. Wang, X.,J. Huang*, L. Zhao, Z. Ju et al., 2012. The exon 29 c.3535A>T in the alpha-2-macroglobulin gene causing aberrant splice variants is associated with mastitis in dairy cattle. Immunogenetics, 64:807-816. (共同通讯作者)
21. Li, L.,J. Huang*, X. Zhang, Z. Ju et al., 2012. One SNP in the 3’-UTR of HMGB1 gene affects the binding of target bta-miR-223 and is involved in mastitis in dairy cattle. Immunogenetics, 64:817-824. (共同通讯作者)
22. Hou, Q#.,J. Huang#, Z. Ju, Q. Li and L. Li et al., 2012. Identification of splice variants, targeted microRNAs and functional SNPs of the BOLA-DQA2 Gene in dairy cattle. DNA and Cell Biol., 31:739-744. (共同第一作者)
23. Wang, Z.,J. Huang*, J. Zhong and G. Wang. 2012. Molecular cloning, promoter analysis, SNP detection of clusterin gene and their associations with mastitis in Chinese Holstein cows. Mol. Biol. Rep., 39:2439-2445. (共同通讯作者)
24. Huang, J*., Z. Ju, Q. Li, Q. Hou and C. Wang et al., 2011. Solexa sequencing of novel and differentially expressed microRNAs in testicular and ovarian tissues in Holstein cattle. Int. J. Biol. Sci., 7: 1016-1026. (通讯作者)
25. Huang, J., H. Wang, C. Wang, J. Li, Q. Li, M. Hou and J. Zhong, 2010. Single nucleotide polymorphisms, haplotypes and combined genotypes of lactoferrin gene and their associations with mastitis in Chinese Holstein cattle. Mol. Biol. Rep., 37: 477-483.

授权发明专利：
1、一套同时检测93种牛遗传缺陷基因和致死单倍型的引物组合、试剂盒及其用途（ZL 8.9）。
2、同时检测奶牛β-酪蛋白不同变体型的一组专用引物及其试剂盒（香港专利，0.3；HKP**）。
3、影响奶牛乳腺炎易感/抗性HMGB3基因的核心启动子及其功能性分子标记与应用（ZL 2.9）。
4、一种改善奶牛的抗乳腺炎能力的实现方法及其应用（ZL 8.5）
5、突变的A2M基因5端侧翼区和3端非翻译区及其检测引物、试剂盒和检测方法（ZL 7.5）。
6、一种筛查牛退化性轴突病携带者的方法及其试剂盒（ZL 0.0）。
7、睾丸特异蛋白基因基因序列引物和非电泳检测鉴定奶牛胚胎性别的方法（ZL 0.0）

荣誉、奖励及参加学术团体的情况：
奖励：
1、山东省科技进步一等奖，山东省人民政府（2014年，位次10/12）
2、吴常信动物遗传育种科技成果奖，中国农业大学教育基金会（2017年，位次5/7）
3、第十届国际发明展览会暨第三届世界发明创新论坛“发明创业奖.项目奖”金奖，中国发明协会（2018年，位次7/10）。
4、2018-2019年度农业农村部神农中华农业科技奖二等奖（2019年，位次1/15）。

学术兼职：
1、《J Biol Sci》和《Int J Dairy Sci》杂志副主编
2、山东师范大学、河北工程大学兼职硕士生导师
3、山东省农业科学院博士后导师
4、中国畜牧兽医学会动物繁殖学分会理事
5、国家畜牧科技创新联盟常务理事
6、中国畜牧兽医学会动物遗传标记分会理事
7、中国畜牧兽医学会动物遗传育种学分会理事
8、全国家畜繁殖员职业技能大赛裁判员