会议开幕式由孔杰研究员主持。长江所所长邹桂伟致欢迎词，简要介绍了长江所在水产育种方面取得的成绩，他表示，长江所高度重视遗传育种学科发展，希望以本次研讨会为契机，进一步加强与参会专家间的交流和合作，共同为推动我国水产种业发展做出新的贡献。高勇处长、王丹副处长分别讲话，充分肯定了持续召开十一届的“全国水产遗传育种学术研讨会”在业界同行中的引领作用。刘英杰副院长回顾了“十二五”以来水产遗传育种领域所取得的成绩，他指出，“十三五”水产育种工作要从育种方法探索、技术方案设计、选育方向拓展、育种材料选择和收集、产业需求结合、整体能力提升等方面重点加强，力争培育一批竞争力强、区域特征明显的新品种，增强物种多样性保护能力和优良新品种创新与转化能力，完善良种质量评价与监测体系和现代水产种业产业体系，加快提升水产种业综合竞争力，为水产种业提质增效、转型升级提供有力科技支撑。
本次会议特邀了国内知名专家和企业代表做报告，对我国水产、家禽、畜牧等领域遗传育种理论方法、前沿技术和产业化发展路径等进行了研讨。研讨会上，桂建芳院士、邹桂伟研究员、包振民教授、卢立志研究员、刘少军教授、傅衍教授分别做了题为“十三五水产遗传育种与水产种业发展的思考”、“我国淡水鱼类育种研究进展及发展趋势”、“GWAS与GS：技术的进展与方法的融合”、“中国家禽遗传资源保护方法及效果评价”、“鱼类远缘杂交品系的建立及应用”、“遗传育种方法改进生产效益的途径”的会议主题报告；我国水产育种领域20位知名专家分别就大黄鱼、团头鲂、黄颡鱼、鲤、对虾、文蛤等我国重要养殖品种良种培育工作最新研究进展、育种技术、关键问题和今后发展方向做了专题报告。会后，与会专家参观了“农业部鱼类种质资源保存与选育中心”和“农业部中华鲟保育基地”。
研讨会期间，水科院水产育种学科委员会还召开了全体委员会议，全面总结了学科委员会2016年工作成效，对2017年的重点工作计划进行了部署，并就新形势下育种学科建设和发展进行了研讨。
