2016年5月，科技部国际合作司根据《国家国际科技合作基地管理办法》、《国家国际科技合作基地评估办法（试行）》的要求，组织专家开始对2009-2011年间认定的全国135家国际科技合作基地进行评估。12月9日，科技部国际合作司公布了评估结果，其中依托黄海水产研究所建设的“海洋渔业国际科技合作基地”评估结果为“良好”。
“海洋渔业国际科技合作基地”于2010年被科技部国际合作司认定为国家国际科技合作基地。基地授牌以来，黄海所以基地为依托，着力推进海洋渔业科技的国际合作工作，充分利用世界动物卫生组织（OIE）白斑综合征参考实验室、OIE传染性皮下和造血组织坏死病参考实验室、NACA水生动物健康区域资源中心、中韩渔业联合研究中心、中-美鱼类功能基因组联合开放实验室等国际合作平台，不断拓宽国际合作渠道，打造全方位、多渠道、多领域、多层次、高水平的国际科技合作与交流的平台，有效提升我国海洋渔业科技自主创新能力，推动渔业产业转型升级，也加强了我国海洋渔业科技的对外影响力和国际话语权，对我国海洋渔业科技国际合作发挥了重要的引领和示范作用。