培养具有生物工程领域坚实的理论基础和宽广的专业知识，掌握解决生物工程领域实际问题的先进技术与方法，具有创新意识，能独立进行生物工程技术研发、工程设计、运行和管理的应用型高层次人才。生物工程硕士要求掌握相关的生物工程领域的新理论、新方法和新技术，具备计算机应用及外语翻译能力。具备较系统的生物工程的基本理论、基本知识、基本技能，能在工业、医疗、食品、农业等领域的企事业和行政管理部门从事相关的应用研究、技术开发、生产管理等工作。
二、研究方向1、生物医学工程2、医疗器械工程3、制药工程4、医学影像工程5、食品安全与检测6、生化工程及装备7、低温生物工程
三、学习年限非全日制专业学位硕士研究生的学制为3年。从事科研与论文工作时间不得少于1年。
四、课程设置及学分要求课程教学实行学分制，在规定的学习期内学员应至少修满30学分,其中学位课不少于19学分。课程设置见附表。 五、学位论文
1、学位论文的选题应来自于生物工程相关领域的实践，并与硕士生的本职工作联系紧密；2、论文内容应注重于解决生物工程领域实际问题，并有较高的水平和应用价值；3、论文的工作程序应包括开题、中期检查、预答辩、答辩等过程。其中，论文自开题后的实际工作时间应不少于一年。4、论文指导实行双导师制，选题、开题、答辩均需校内外导师共同参与并签署书面意见。5、论文应有2位专家评阅，其中一位校外专家。答辩委员会由3-5位专家组成，其中至少有一位非高校的专家。6、硕士研究生除完成学位论文外，在答辩前必须达到学校关于外语水平和公开发表学术论文（或专利）的要求。
六、其它说明关于学位授予：通过课程考试取得规定学分并通过学位论文答辩的研究生，符合授予学位条件者，经上海理工大学学位评定委员会审核批准授予工程硕士学位。
附表、课程设置明细| 选课类型 | 课程编号 | 课程名称 | 总学时 | 学分 | 开课季节 | 必修 |
| 学位课 | 32000007 | 自然辩证法概论 | 18 | 1.00 | 秋季 | 是 |
| 学位课 | 15000404 | 综合英语（一） | 72 | 1.00 | 春季 | 是 |
| 学位课 | 15000405 | 综合英语（二） | 72 | 1.00 | 秋季 | 是 |
| 学位课 | 22000132 | 工程数学 | 54 | 3.00 | 秋季 | 是 |
| 学位课 | 26000002 | 科技文献检索与论文写作 | 18 | 1.00 | 秋季 | 是 |
| 学位课 | 32000006 | 中国特色社会主义理论与实践研究 | 36 | 2.00 | 春季 | 是 |
| 学位课 | 19000003 | 专业英语（生物工程领域） | 36 | 1.00 | 秋季 | 否 |
| 学位课 | 19000013 | 生物医学信号处理 | 36 | 2.00 | 春季 | 否 |
| 学位课 | 19000017 | 现代医学仪器设计原理 | 36 | 2.00 | 春季 | 否 |
| 学位课 | 19000018 | 生物医学检测技术 | 36 | 2.00 | 秋季 | 否 |
| 学位课 | 19000019 | 生物医学工程前沿 | 20 | 1.00 | 秋季 | 否 |
| 学位课 | 19000020 | 医疗器械工程导论 | 54 | 3.00 | 春季 | 否 |
| 学位课 | 19000024 | 医学图像处理与分析 | 36 | 2.00 | 秋季 | 否 |
| 学位课 | 19000026 | 制药化工原理 | 36 | 2.00 | 秋季 | 否 |
| 学位课 | 19000028 | 实验方法与数据分析 | 36 | 2.00 | 秋季 | 否 |
| 学位课 | 19000030 | 食品、药品的冷冻干燥技术 | 36 | 2.00 | 春季 | 否 |
| 学位课 | 19000047 | 微生物学 | 36 | 2.00 | 春季 | 否 |
| 学位课 | 19000048 | 食品科学与工程专题 | 36 | 2.00 | 秋季 | 否 |
| 学位课 | 19000049 | 酶学原理 | 36 | 2.00 | 秋季 | 否 |
| 学位课 | 19000050 | 生物技术进展 | 36 | 2.00 | 秋季 | 否 |
| 非学位课 | 19000035 | 有限元法 | 18 | 1.00 | 春季 | 否 |
| 非学位课 | 19000037 | 医疗器械质量与安全工程导论 | 18 | 1.00 | 春季 | 否 |
| 非学位课 | 19000041 | 食品冷冻冷藏 | 36 | 2.00 | 秋季 | 否 |
| 非学位课 | 19000042 | 量热分析与实验 | 18 | 1.00 | 春季 | 否 |
| 非学位课 | 19000056 | 医疗器械注册技术与方法 | 36 | 2.00 | 秋季 | 否 |
| 非学位课 | 19000057 | 数字化医疗器械 | 36 | 2.00 | 秋季 | 否 |
| 非学位课 | 19000010 | 医学基础 | 36 | 2.00 | 秋季 | 否 |
| 非学位课 | 19000011 | 生物力学 | 36 | 2.00 | 秋季 | 否 |
| 非学位课 | 19000012 | 生物医学光学 | 36 | 2.00 | 秋季 | 否 |
| 非学位课 | 19000016 | 医学信息系统与网络技术 | 36 | 2.00 | 春季 | 否 |
| 非学位课 | 19000022 | 生物医学超声 | 18 | 1.00 | 春季 | 否 |
| 非学位课 | 19000031 | 机电测控系统 | 36 | 2.00 | 春季 | 否 |
| 非学位课 | 19000036 | 医学影像物理及其应用 | 36 | 2.00 | 春季 | 否 |
| 非学位课 | 19000038 | 电子线路设计和仿真 | 18 | 1.00 | 春季 | 否 |
| 非学位课 | 19000039 | 食品物性学 | 18 | 1.00 | 秋季 | 否 |
| 非学位课 | 19000043 | 现代生物分离工程 | 36 | 2.00 | 秋季 | 否 |
| 非学位课 | 19000044 | 食品分析检测新技术 | 36 | 2.00 | 秋季 | 否 |
| 非学位课 | 19000045 | 食品安全信息化监管技术 | 18 | 1.00 | 春季 | 否 |
| 非学位课 | 19000046 | 传感器信号处理 | 18 | 1.00 | 春季 | 否 |
| 非学位课 | 19000089 | 微创外科技术与器械 | 36 | 2.00 | 春季 | 否 |
| 非学位课 | 19000052 | 功能性食品 | 36 | 2.00 | 春季 | 否 |
| 非学位课 | 19000053 | 食品安全学 | 18 | 1.00 | 春季 | 否 |
| 非学位课 | 19000054 | 低温生物医学技术 | 36 | 2.00 | 秋季 | 否 |
