世界许多国家的经验表明，传统农业在向现代农业转变的过程中，必须得到现代工业和现代高新技术的支持，在高校学科建设中实现农科和工科等学科的结合，是提升和发展农科学科综合实力的有力保障，是我国实现农业现代化的迫切需要。

21 世纪是生命科学与生物技术崛起的时代，学院积极探索综合性大学农科本科创新人才培养模式，着力用现代生物技术与信息技术等高新技术改造和提升传统农业学科，构建农科学科基础课程教学平台（含生物学基础、生物化学、微生物学、生态学、遗传学、分子生物学、生物统计学等七门课程，共 31 学分），旨在为学生的可持续发展奠定宽厚的生物科学基础。学生完成学业后，能在生物科学领域从事创新研究和管理等工作。

2004 年，学院以“生物技术”和“环境生态类”专业大类招生，新生入学时不分专业，修读相同的课程。第二学年末，按前两学年的课程成绩、个人志向、社会需求预测等，经个人申请，院校批准后，在学院内的五个专业中选读一个专业。此外，大多数学生可选修第二学科学士学位；第七学期，一定比例的优秀学生可直升硕、博研究生。

学院现有专任教师 101 人。其中，具有博士学历的有 49 人；教授 26 人、副教授 46 人；博导 18 人、硕导 61 人；国家“ 863 ”计划专家 1 人，国务院学位委员会第五届学科评议组成员 2 人。全院的教学、科研部门主要有：植物科学系、动物科学系、园林科学与工程系、资源与环境系、食品科学与工程系、复旦 - 交大 - 诺丁汉植物生物技术研发中心、生物技术研究所、区域发展研究所等。现有植物生物技术、动物生物技术、资源环境科学、园林、食品科学与工程等 5 个全日制本科专业；作物遗传育种、动物营养与饲料科学、蔬菜学、园林植物与观赏园艺、农业生物环境与能源工程、预防兽医学、生态学、农药学、食品科学、农业推广等 10 个硕士点， 1 个一级学科（环境科学工程）博士点（与环境科学与工程学院合作）， 3 个二级学科（生物技术、预防兽医学与畜禽产品安全、设施园艺工程）博士点。作物遗传育种、兽医传染病与预防兽医学、农艺学、园林学等 4 个学科是上海市市级重点学科。兽医生物技术实验室是上海市市级重点实验室。目前，学院主持“ 973 ”国家重点基础研究项目 1 项、“ 863 ”计划项目 3 项、参与 10 项，国家自然科学基金项目 8 项，其他国家级、省部级重大、重点项目 50 余项。学院已成为培养高级农业科学技术人才、开展现代农业科学研究和高新技术开发与示范的重要基地。