李志勇 长聘教授

电话：+86-
邮箱：zyli@sjtu.edu.cn
地址： 上海市东川路800号上海交通大学生命科学技术学院
实验室网址：http://mbl.sjtu.edu.cn





学术经历
1998年7月于华南理工大学获得博士学位。1998年7月至2000年7月华东理工大学生物工程学院博士后。2000年7月被聘为副教授，在上海交通大学生命科学技术学院工作至今，2005年被聘为教授，2006年被聘为博士生导师，2016年晋升长聘教授。2007年12月至2008年12月美国加州大学圣地亚哥分校（UCSD）斯克林普斯海洋研究所（Scripps Institution of Oceanography:http://www.sio.ucsd.edu）海洋生物技术与生物医药中心访问教授。
2002年开始在国内较早开展海绵共生微生物研究，2013年扩展到珊瑚共生微生物，2018年作为大会主席承办第3届海绵微生物学国际会议大会，2019年主编出版海绵、珊瑚共生微生物组的英文学术专著Symbiotic Microbiomes of Coral Reefs Sponges and Corals （Springer Nature）。目前任国际期刊Frontiers in Microbiology与Frontiers in Marine Science副主编；中国海洋药物杂志编委。上海市微生物学会海洋微生物专业委员会主任；中国生物化学与分子生物学会海洋生化与分子生物学分会理事；中国微生物学会海洋微生物专业委员会委员；中华医学会航海医学分会的海洋生物工程专业委员会委员、海洋微生物与分子生物学专业委员会委员、上海药学会海洋药物委员会委员。


1998年7月于华南理工大学获得博士学位。1998年7月至2000年7月华东理工大学生物工程学院博士后。2000年7月被聘为副教授，在上海交通大学生命科学技术学院工作至今，2005年被聘为教授，2006年被聘为博士生导师，2016年晋升长聘教授。2007年12月至2008年12月美国加州大学圣地亚哥分校（UCSD）斯克林普斯海洋研究所（Scripps Institution of Oceanography:http://www.sio.ucsd.edu）海洋生物技术与生物医药中心访问教授。
2002年开始在国内较早开展海绵共生微生物研究，2013年扩展到珊瑚共生微生物，2018年作为大会主席承办第3届海绵微生物学国际会议大会，2019年主编出版海绵、珊瑚共生微生物组的英文学术专著Symbiotic Microbiomes of Coral Reefs Sponges and Corals （Springer Nature）。目前任国际期刊Frontiers in Microbiology与Frontiers in Marine Science副主编；中国海洋药物杂志编委。上海市微生物学会海洋微生物专业委员会主任；中国生物化学与分子生物学会海洋生化与分子生物学分会理事；中国微生物学会海洋微生物专业委员会委员；中华医学会航海医学分会的海洋生物工程专业委员会委员、海洋微生物与分子生物学专业委员会委员、上海药学会海洋药物委员会委员。





研究方向
海洋共生微生物组


海洋共生微生物天然产物生物合成


深海真菌分子生态学研究






重点研究海绵、珊瑚共生微生物的种群结构、代谢潜力与功能，同时研究宿主-微生物的共生互作及其对海洋环境、气候变化的适应机制


重点研究海绵、珊瑚共生放线菌、共生真菌的天然产物分离与发酵制备、生物合成机制。


重点针对深海真菌的多样性、元素循环与环境适应机制开展研究。






研究方向

海洋共生微生物组 重点研究海绵、珊瑚共生微生物的种群结构、代谢潜力与功能，同时研究宿主-微生物的共生互作及其对海洋环境、气候变化的适应机制



海洋共生微生物天然产物生物合成 重点研究海绵、珊瑚共生放线菌、共生真菌的天然产物分离与发酵制备、生物合成机制。



深海真菌分子生态学研究 重点针对深海真菌的多样性、元素循环与环境适应机制开展研究。











代表论著
? Zhiyong Li. ed. Symbiotic Microbiomes of Coral Reefs Sponges and Corals. Springer Nature, 2019

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? Analysis of functional gene transcripts suggests active CO₂ assimilation and CO oxidation by diverse bacteria in marine sponges. FEMS Microbiology Ecology. 2019, 95,fiz087

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? Symbiochlorum hainanensis gen. et sp. nov. (ulvophyceae, Chlorophyta) isolated from bleached corals living in the South China Sea. Journal of Phycology. 2018, 54, 811-817

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? New Genomic Insights into “Entotheonella” Symbionts in Theonella swinhoei: Mixotrophy, Anaerobic Adaptation, Resilience, and Interaction. Frontiers in Microbiology. 2016, 7,1333.

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? Metagenomic analysis of genes encoding nutrient cycling pathways in the microbiota of deep-sea and shallow-water sponges. Marine Biotechnology. 2016,18, 659-671

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? Pezizomycotina dominates the fungal communities of South China Sea Sponges Theonella swinhoei and Xestospongia testudinaria. FEMS Microbiology Ecology. 2014, 90, 935-945.

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? Functional transcripts indicate phylogenetically diverse active ammonia-scavenging microbiota in sympatric sponges. Marine Biotechnology. 2018, 20,131–143

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? New Metabolites From the Co-culture of Marine-DerivedActinomycete Streptomyces rochei MB037 and Fungus Rhinocladiellasimilis 35. Front. Microbiol. 2019,10, 915.

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? Biosynthesis in vitro of bacillamide intermediate-heterocyclic AlaCysthiazole by heterologous expression of nonribosomal peptide synthetase (NRPS). Journal of Biotechnology. 2019, 292:5-11

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? Engineered Streptomyces lividans strains for optimal identification and expression of cryptic biosynthetic gene clusters. Frontiers in Microbiology. 2018, 9, 3042

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教学情况

2001年至今在上海交大开设“细胞工程”本科生课程，负责创建“细胞工程”上海市精品课程（2009）、国家级精品课程（2010）、国家级精品资源共享课程（2013）。2018年主办首届全国细胞工程教学研讨会。目前还讲授研究生课程“海洋生态与生物技术”。荣获上海市高校优秀青年教师（2008）、宝钢优秀教师奖（2013）、上海市育才奖（2016）。2017年获得上海交通大学首届“教书育人奖”一等奖。2018年以第一完成人获得上海市高校优秀教学成果二等奖。
已主编出版高校教材9部，构建了包括理论课、实验课、英文教材、电子化教材的立体化教材体系。其中2部入选“十一五”国家级规划教材，1部入选“十二五”国家级规划教材，1部全英文教材入选国家走出去工程在海外发行，2部入选iCourse教材。2部获得上海交大优秀教材特等奖及上海市高校优秀教材一等和二等奖。任科学出版社“生物工程与生物技术能力培养型系列教材”编委会主任。主编和参编的教材如下：
1.李志勇。细胞工程。北京：科学出版社，2003
2.李志勇。细胞工程学。北京：高等教育出, 版社，2008
3.李志勇。细胞工程（第2版）。北京：科学出版社，2010
4.李志勇 主编。细胞工程实验。北京：高等教育出版社，2010
5.Li Zhiyong. ed. Cell Engineering. Science Press; Alpha Science International Ltd. Oxford,U.K. 2014
6. 李志勇 主编。细胞工程实验教程。高等教育出版社。2016
7.李志勇 主编。细胞工程学(第2版）。高等教育出版社。2019
8.罗九甫，李志勇 主编。生物工程原理与技术。北京：科学出版社，2006
9.蒋群，李志勇 主编。生物工程综合实验。北京：科学出版社，2010
10. 李志勇 参编。新编生物工艺学。上海：华东理工大学出版社，2002
11. 李志勇 参编。海洋药物导论。上海：上海科技出版社。2012




1.国家自然基金项目：海绵共生微生物种群结构与功能特征及其时空变化规律。2019.01 - 2021.12。负责人
2.国家自然基金项目：多种生境中海绵全功能体研究：宿主代谢、共生微生物活跃类群及其功能比较。2018.01 - 2021.12。负责人
3.国家自然基金项目：海绵微生物学国际学术会议。2017.06 - 2018.12。负责人
4.国家重大科学研究计划:南海珊瑚礁对多尺度热带海洋环境变化的响应、记录与适应对策研究：课题3-南海珊瑚礁退化机理与修复潜力。2013/01-2017/12，课题负责人。
5.国家自然基金项目：基于宏转录组学的海水酸化对南海近海珊瑚礁海绵共生微生物种群结构与生态学功能影响的研究。2014,1-2016,12。负责人
6.国家自然基金项目：利用深度测序与比较元基因组学分析海绵共生微生物群落代谢潜力与生态学功能。2012,1-2015,12。负责人
7.国家自然基金项目：海绵共生古菌、细菌的氮循环生态学功能的分子证据。2011-2013。负责人
8.国家863计划：海绵共生微生物药源化合物大规模制备工艺与调控技术。2011-2013。子课题负责人
9.国家863计划：海洋共生微生物资源的开发与利用。2007-2010。负责人
10.国家863计划：海绵共生细菌种群结构分子诊断技术的建立。2002-2004；2004-2005（滚动支持）。负责人

承担项目