石建新 副研究员

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学术经历
2012-今，是<Trends in Plant Sciences>, <Trends in Genetics>, <Plant Biotechnology Journal>, <Molecular Plant>, <Plant Physiology>, <New Phytologist>, <Journal of Experimental Botany>, <Plant Cell and Environment>, <BMC Plant Biology>, <Plant Cell Reports>, <Journal of Genetics and Genomics>, <Planta>, <Journal of Integrative Plant Biology>, <Plant Signaling & Behavior>, <Scientific Report>, <Journal of Agricultural and Food Chemistry>, <Food Chemical Toxicology>, <Journal of Food Processing & Technology>等期刊的审稿人。






2012-今，是<Trends in Plant Sciences>, <Trends in Genetics>, <Plant Biotechnology Journal>, <Molecular Plant>, <Plant Physiology>, <New Phytologist>, <Journal of Experimental Botany>, <Plant Cell and Environment>, <BMC Plant Biology>, <Plant Cell Reports>, <Journal of Genetics and Genomics>, <Planta>, <Journal of Integrative Plant Biology>, <Plant Signaling & Behavior>, <Scientific Report>, <Journal of Agricultural and Food Chemistry>, <Food Chemical Toxicology>, <Journal of Food Processing & Technology>等期刊的审稿人。





研究方向
植物角质层代谢的调控机理及其对植物生长发育和逆境反应...


转基因（包括基因编辑）生物分子特征识别技术的研发和应...


植物代谢与种子发育及品质形成的分子机制






通过遗传、生化、分子生物学和组学等手段研究植物（以水稻和拟南芥为主）角质层脂类代谢途径相关酶和蛋白编码基因影响植物雄性发育（花药和花粉发育）和植物抗逆（温度和真菌病害）的功能及分子机制。


运用核酸（PCR, inverse PCR, Tail PCR, digital PCR, RT-PCR, NGS）和代谢物（代谢组学）检测技术，从核酸和代谢物水平揭示转基因生物和CRISPR/Cas9生物的分子特征，并据此建立转基因生物事件特异性检测方法，用于安全性评价；对农业农村部指定的转基因事件进行分子特征验证。


通过遗传（包括群体遗传）、生化、分子生物学、生物信息学等手段研究植物（以水稻和拟南芥为主）种子发育及其种子脂肪组分的分子机制。






研究方向

植物角质层代谢的调控机理及其对植物生长发育和逆境反应... 通过遗传、生化、分子生物学和组学等手段研究植物（以水稻和拟南芥为主）角质层脂类代谢途径相关酶和蛋白编码基因影响植物雄性发育（花药和花粉发育）和植物抗逆（温度和真菌病害）的功能及分子机制。



转基因（包括基因编辑）生物分子特征识别技术的研发和应... 运用核酸（PCR, inverse PCR, Tail PCR, digital PCR, RT-PCR, NGS）和代谢物（代谢组学）检测技术，从核酸和代谢物水平揭示转基因生物和CRISPR/Cas9生物的分子特征，并据此建立转基因生物事件特异性检测方法，用于安全性评价；对农业农村部指定的转基因事件进行分子特征验证。



植物代谢与种子发育及品质形成的分子机制 通过遗传（包括群体遗传）、生化、分子生物学、生物信息学等手段研究植物（以水稻和拟南芥为主）种子发育及其种子脂肪组分的分子机制。











代表论著
? OsTKPR1 functions in anther cuticle development and pollen wall formation in rice. BMC Plant Biology, 2019 19:104. https://doi.org/10.1186/s12870-019-1711-4

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? Development of methods for e?ective identification of CRISPR/Cas9-induced indels in rice. Plant Cell Reports, 2019, 38(4): 503-510. https://doi.org/10.1007/s00299-019-02392-3

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? Arabidopsis HSP70-16 is required for flower opening under normal or mild heat stress temperatures. Plant Cell and Environment. 2019; 42:1190–1204. https://doi.org/10.1111/pce.13480

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? Rice fatty acyl-CoA synthetase OsACOS12 is required for tapetum programmed cell death and male fertility. Planta. 2017, 246:105–122. https://doi.org/10.1007/s00425-017-2691-y

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? Molecular characterization of genetically-modified crops: Challenges and strategies. Biotechnology Advance. 2017, 35(2):302-309. https://doi.org/10.1016/j.biotechadv.2017.01.005

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? Identification of conserved and diverse metabolic shifts during rice grain development. Scientific Reports. 2016, 6: 20942. https://doi.org/10.1038/srep20942

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? Metabolic changes in transgenic maize mature seeds over-expressing the Aspergillus niger phyA2. Plant Cell Report. 2016, 35(2), 429-437. https://doi.org/ 10.1007/s00299-015-1894-6

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? Genetic and biochemical mechanisms of pollen wall development. Trends in Plant Science. 2015, 20(11): 741-753. https://doi.org/10.1016/j.tplants.2015.07.010

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? Metabolic variation between japonica and indica rice cultivars as revealed by non-targeted metabolomics. Scientific Reports 2014, 4: 5067. https://doi.org/10.1038/srep05067

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? Metabolic map of mature maize kernels. Metabolomics 2014, 10 (5): 775-787. https://doi.org/10.1007/s11306-014-0624-3

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获奖情况
2012年获得上海市科技进步一等奖；
2013年获得中国分析测试协会科技二等奖；
2018年获得中国商业联合会科学技术奖一等奖。





教学情况

2012年上海交通大学硕导
2016年上海交通大学遴选为博导
本科生课程：生物安全导论（2012-2016，32学时/年，双语）、生化分析原理和方法（2012-2014,8学时/年，双语）和植物生物技术（2016-2017,2学时/年，双语）
研究生课程：生物安全（2012-2016，32学时/年，双语；2017年至今，32学时/年，英文）、生物化学技术原理及应用（2013-2014年，12学时/年，双语）和动物、植物和微生物信号传导（2013-2014，6学时/年，全英文）




国家自然基金面上项目《OsLP1决定水稻种子三酰甘油含量自然变异的遗传基础和调控网络研究》, 2020-2023
国家自然基金面上项目《热激蛋白AtHSP70X在拟南芥萼片开裂中的功能及机理研究》, 2017-2020
国家自然基金“中以合作项目子课题”《基于脂质组学的植物鞘脂调控低氧响应的分子机制研究》,2014-2017
973子课题《食品加工过程安全性评价及危害物风险评估》, 2011-2015
国家转基因重大专项课题《转基因生物分子特征的识别技术和验证研究》, 2016-202
国家转基因重大专项子课题《转基因作物多点鉴定与综合评价》,2017-2020

承担项目


学生培养
孙文礼2019硕士生
陈子璨2018硕士生
冉晓茹2017硕士生
Sukumar Biswas2016博士生
Muhanmmad Asharf 2017博士生
石垒2017博士生
洪骏（协助指导，2014）博士生




陈雨沁 2016 硕士生
Kiran Siddique 2016 硕士生
刘艳艳 2015 硕士生
刘会昌 2014 硕士生
刘 莹 2013 硕士生
李思钒 2012 硕士生
许 义（协助指导2011） 硕士生
崔 波（协助指导2011） 硕士生
冉 冉（协助指导2011） 硕士生
饶 军（协助指导2010） 博士生
胡朝阳（协助指导2011） 博士生





在读学生
毕业学生



在读学生
毕业学生

孙文礼2019硕士生
陈子璨2018硕士生
冉晓茹2017硕士生
Sukumar Biswas2016博士生
Muhanmmad Asharf 2017博士生
石垒2017博士生
洪骏（协助指导，2014）博士生




陈雨沁 2016 硕士生
Kiran Siddique 2016 硕士生
刘艳艳 2015 硕士生
刘会昌 2014 硕士生
刘 莹 2013 硕士生
李思钒 2012 硕士生
许 义（协助指导2011） 硕士生
崔 波（协助指导2011） 硕士生
冉 冉（协助指导2011） 硕士生
饶 军（协助指导2010） 博士生
胡朝阳（协助指导2011） 博士生