郑舰艇 长聘教轨副教授

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学术经历
山东大学微生物专业学士，中国科学院微生物研究所生物化学与分子生物学博士，美国马里兰大学帕克分校和德州大学奥斯汀分校博士后，中国科学院过程工程研究所生化工程国家重点实验室研究员。现任上海交通大学特别研究员，博士生导师。主要从事结构酶学研究，以X-射线蛋白晶体衍射为主要手段解析微生物天然产物合成酶的三维结构，结合有机化学、生物化学以及分子生物学等手段阐明其分子机制，并以此为基础对天然产物合成途径进行人工优化设计和改造。相关研究已发表于Nature Chemical Biology、ACS Chemical Biology和Structure等国际期刊。


山东大学微生物专业学士，中国科学院微生物研究所生物化学与分子生物学博士，美国马里兰大学帕克分校和德州大学奥斯汀分校博士后，中国科学院过程工程研究所生化工程国家重点实验室研究员。现任上海交通大学特别研究员，博士生导师。主要从事结构酶学研究，以X-射线蛋白晶体衍射为主要手段解析微生物天然产物合成酶的三维结构，结合有机化学、生物化学以及分子生物学等手段阐明其分子机制，并以此为基础对天然产物合成途径进行人工优化设计和改造。相关研究已发表于Nature Chemical Biology、ACS Chemical Biology和Structure等国际期刊。





研究方向

天然产物合成酶的结构与功能



生物合成途径的基因工程改造与优化



微生物来源新功能酶的发现、表征与改造






天然产物合成酶的结构与功能


生物合成途径的基因工程改造与优化


微生物来源新功能酶的发现、表征与改造






研究方向


天然产物合成酶的结构与功能 天然产物合成酶的结构与功能




生物合成途径的基因工程改造与优化 生物合成途径的基因工程改造与优化




微生物来源新功能酶的发现、表征与改造 微生物来源新功能酶的发现、表征与改造











代表论著
? Zhang, F., Ji, H., Ali, I., Deng, Z., Bai, L. & Zheng, J. (2020). Structural and Biochemical insights to the Recruitment of Acyl Carrier Protein-linked Extender Units in Ansamitocin Biosynthesis. Chembiochem 21, 1309-1314.

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? He, B.-B., Zhou, T., Bu, X.-L., Weng, J.-Y., Xu, J., Lin, S., Zheng, J.-T., Zhao, Y.-L. & Xu, M.-J. (2019). Enzymatic Pyran Formation Involved in Xiamenmycin Biosynthesis. ACS Catal 9, 5391-5399.

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? Zhang, F., Shi, T., Ji, H., Ali, I., Huang, S., Deng, Z., Min, Q., Bai, L., Zhao, Y. L. & Zheng, J. (2019). Structural Insights into Substrate Specificity of Acyltransferases from Salinomycin Polyketide Synthase. Biochemistry 58, 2978-2986.

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? Zhang, L., Ji, J., Yuan, M., Feng, Y., Wang, L., Deng, Z., Bai, L. & Zheng, J. (2018). Stereospecificity of Enoylreductase Domains from Modular Polyketide Synthases. ACS Chem Biol 13, 871-875.

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? Liu, C., Yuan, M., Xu, X., Wang, L., Keatinge-Clay, A. T., Deng, Z., Lin, S. & Zheng, J. (2018). Substrate-bound Structures of a Ketoreductase from Amphotericin Modular Polyketide Synthase. J Struct Biol 203, 135-141.

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? Wang, F., Wang, Y., Ji, J., Zhou, Z., Yu, J., Zhu, H., Su, Z., Zhang, L. & Zheng, J. (2015). Structural and functional analysis of the loading acyltransferase from avermectin modular polyketide synthase. ACS Chem Biol 10, 1017-25.

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? Zheng, J., Piasecki, S. K. & Keatinge-Clay, A. T. (2013). Structural studies of an A2-type modular polyketide synthase ketoreductase reveal features controlling alpha-substituent stereochemistry. ACS Chem Biol 8, 1964-71.

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? Zheng, J., Fage, C. D., Demeler, B., Hoffman, D. W. & Keatinge-Clay, A. T. (2013). The Missing Linker: A Dimerization Motif Located within Polyketide Synthase Modules. ACS Chem Biol 8, 1263-70.

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? Zheng, J., Gay, D. C., Demeler, B., White, M. A. & Keatinge-Clay, A. T. (2012). Divergence of multimodular polyketide synthases revealed by a didomain structure. Nat Chem Biol 8, 615-21.

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? Zheng, J., Taylor, C. A., Piasecki, S. K. & Keatinge-Clay, A. T. (2010). Structural and Functional Analysis of A-Type Ketoreductases from the Amphotericin Modular Polyketide Synthase. Structure 18, 913-22.

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教学情况

结构生物学 研究生课程
学术写作、规范与伦理 研究生课程
应用生物信息学 本科生课程




国家重点研发计划课题，2019YFA**，氨基糖苷类药物合成代谢机制与系统互动优化，2020.01-2024.12，在研，主持
国家自然科学基金面上项目，**，酮基还原酶和酰基载体蛋白在聚酮合成中的相互作用解析，2018.01-2021.12，在研，主持
国家自然科学基金面上项目，**，聚酮合成起始单元选择的分子机制研究，2016.01 - 2019.12，在研，主持
973，2013CB734002，异源模块与生物底盘之间交互式作用的计算与预测，2015.01- 2017.12，结题，参加
国家自然科学基金面上项目，**，I 型聚酮手性中心形成的分子机制研究，2014/01 - 2017/12，结题，主持
北京市自然科学基金青年项目，**，改造细胞色素P450 单加氧酶DoxA 提高阿霉素产量的研究，2014.01 - 2015.12，结题，主持

承担项目


学生培养
季慧凝 博士生
刘桂扬 博士生
黄舒昕 博士生
丰媛媛 博士生
ASAD ULLAH SAEED 博士生
IMTIAZ ALI 博士生
王逸群 硕士生
费卓涵 硕士生




张法 博士生
徐徐 硕士生
李海伟 硕士生
张露允 硕士生
刘宸光 硕士生





在读学生
毕业学生



在读学生
毕业学生

季慧凝 博士生
刘桂扬 博士生
黄舒昕 博士生
丰媛媛 博士生
ASAD ULLAH SAEED 博士生
IMTIAZ ALI 博士生
王逸群 硕士生
费卓涵 硕士生




张法 博士生
徐徐 硕士生
李海伟 硕士生
张露允 硕士生
刘宸光 硕士生