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上海交通大学生命科学技术学院导师教师师资介绍简介-赵一雷
本站小编 Free考研考试/2021-01-03
赵一雷 教授
电话:+86-
邮箱:yileizhao@sjtu.edu.cn
地址:东川路800号
实验室网址:http://cbb.sjtu.edu.cn/faculty.php#zhao
聚焦计算生物化学研究,如DNA磷硫酰化引起的双螺旋结构微扰和化学性质变化、生物合成酶和工业酶突变的反应势能面与催化效能关系。在JACS、ACS Catalysis等化学主流期刊上发表了近90篇SCI论文,获UCLA优秀博士后、上海市浦江人才和****、教育部新世纪优秀人才等奖励。
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研究方向
化学生物学
结构生物信息学
分子光谱和XCMS
反应机理与分子识别机制的理论研究
蛋白质和核酸的化学修饰与生物学功能
生物代谢中的表征应用
研究方向
化学生物学 反应机理与分子识别机制的理论研究
结构生物信息学 蛋白质和核酸的化学修饰与生物学功能
分子光谱和XCMS 生物代谢中的表征应用
代表论著
? He, B.-B.; Zhou, T.; Bu, X.-L.; Weng, J.-Y.; Xu, J.; Lin, S.-J.; Zheng, J.-T.;* Zhao, Y.-L.;* Xu, M.-J.* (2019) “Enzymatic Pyran Formation Involved in Xiamenmycin Biosynthesis” ACS Catalysis, 9(6): 5391-5399
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? Zhang, Z.; Jamieson, C.; Zhao, Y.-Lei; Li, D.; Ohashi, M.; * K. N. Houk, * & Y. Tang (2019) “Enzyme-catalyzed inverse-electron demand Diels-Alder reaction in the biosynthesis of antifungal ilicicolin H” J. Am. Chem. Soc.. 141 (14), pp 5659–5663
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? Zhou, J.-Y.; Wang, Y.; Xu, G.-C.; Wu, L.; Han, R.-Z.; Schwaneberg, U.; Rao, Y.-J.; Zhao, Y.-L.; Zhou, J.-H.; * Ni, Y* (2018) “Structural insight into enantioselective inversion of an alcohol dehydrogenase reveals a “polar gate” in stereo-recognition of diaryl ketones” J. Am. Chem. Soc. 140(39): 12645-12654
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? Nie, Y.; Wang, S.; Xu, Y.; Luo, S.; Zhao, Y.-L.;* Xiao, R.;* Montelione, G.; Hunt, J.; Szyperski, T. (2018) “Enzyme engineering based on X-ray structures and kinetic profiling of substrate libraries: alcohol dehydrogenases for stereospecific synthesis of a broad range of chiral alcohols” ACS catalysis. 8, 5145−5152
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? Shi, T.; Liu, L.; Tao, W.; Luo, S.; Fan, S.; Wang, X.-L.; Bai, L.; Zhao, Y.-L.* (2018) “Theoretical studies on the catalytic mechanism and substrate diversity for macrocyclization of pikromycin thioesterase” ACS catalysis. 2018, 8, 4323−4332
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? Chen, X.-P.; Shi, T.; Wang, X.-L.; Wang, J.; Chen, Q.; Bai, L.; Zhao Y.-L.* (2016) “Theoretical studies on the mechanism of thioesterase-catalyzed macrocyclization in erythromycin biosynthesis” ACS catalysis. 6, 4369-4378.
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? Qi, Y.-B; Wang, X.-L.; Shi, T.; Liu, S.; Xu, Z.-H.; Li, XQ; Shi, XL; Xu, P.; Zhao Y.-L.* (2015) “Multicomponent Kinetic Analysis and Theoretical Studies on the Phenolic Intermediates in the Oxidation of Eugenol and Isoeugenol Catalyzed by Laccase” Physical Chemistry Chemical Physics, 17 (44), 29597-29607
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? Huang, Y.; Tian, M.; Zhang, YC; Sheng, G.; Chen, Z.; Ma, Y.; Chen, Y.; Peng, YH; Zhao, Y.-L.*; Wang, YL.; Zhang, LH; Yang, ZJ* (2015) “D-Isonucleotide (isoNA) incorporation around cleavage site of passenger strand promotes the vibration of Ago2-PAZ domain and enhances in vitro potency of siRNA”. Organic & Biomolecular Chemistry, 13(44), 10825-10833.
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? Chen, L.; Wang, X.-L.; Shi, T.; Wu, T.; Deng, Z.; Zhao, YL* (2015) “Theoretical Study on the Relationship between Rp-Phosphorothioation and Base-Step in S-DNA: Based on Energetic and Structural Analysis”. J. Phys. Chem. B, 119, 474–481.
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? Zhang, Y.-C.; Liang, J.; Lian, P.; Han, Y.; Chen, Y.; Bai, L.; Wang, Z.; Liang, J.; Deng, Z.; Zhao, YL* (2012) “Theoretical Study on Steric Effects of DNA Phosphorothioation: B-Helical Destabilization in Rp-Phosphorothioated DNA”. J. Phys. Chem. B, 116, 10639–10648.
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获奖情况
2005年UCLA优秀博士后
2005-2007年度美国交叉学科创新研究(INEST)Fellowship
2011年上海市浦江人才计划
2012年教育部新世纪优秀人才计划
教学情况
<计算生物化学>
本科生专业课,内容为生化实验数据处理、建模、量化计算以及分子模拟
2018YFA** 污染物降解元件分子识别和催化机制的理论计算及预测 (国家重点研发计划子课题——所属课题“难降解有毒污染物分解代谢功能元器件的挖掘与创制”/难降解有毒污染物智能生物降解体系)
** 基于预反应态模型的生物合成关键酶设计和应用 (国家自然科学基金 面上项目)
** DNA磷硫酰化修饰中分子识别及其抗氧化机理研究 (国家自然科学基金 面上项目)
承担项目
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郑有丽实验师电话:+86-邮箱:zylji@sjtu.edu.cn地址:上海交通大学叶杰全楼218室学术经历1998年获得上海交通大学理学学士学位2006年获得上海交通大学硕士学位1998年8月至今在上海交通大学生命科学技术学院实验教学中心工作1998年获得上海交通大学理学学士学位2006年获得上海 ...上海交通大学师资导师 本站小编 Free考研考试 2021-01-03上海交通大学农业与生物学院导师教师师资介绍简介-奥岩松
奥岩松职称:教授所属学科:植物遗传育种与生物技术研究方向:(1)园艺植物生理生态(2)设施园艺工程(3)园艺商品学电话:021**传真:021**电子信箱:shanghaijt@hotmail.com个人简历奥岩松,男,1963年5月生。教授,博士生导师,山西兴县人。19 ...上海交通大学师资导师 本站小编 Free考研考试 2021-01-03上海交通大学农业与生物学院导师教师师资介绍简介-安渊
安渊职称:研究员、博士生导师电话:86-21-**电子信箱:anyuan@sjtu.edu.cn研究方向:(1)植物逆境生理与分子调控(2)紫花苜蓿栽培与利用(3)草田轮作理论与技术(4)农林复合生态系统安渊、博士,研究员,博士生导师,植物科学系主任,农业部都市农业重点实验室副主任。1987&mda ...上海交通大学师资导师 本站小编 Free考研考试 2021-01-03上海交通大学农业与生物学院导师教师师资介绍简介-蔡润
蔡润职称:教授、博士生导师所属学科:园艺植物遗传育种研究方向:(1)分子遗传(2)基因工程(3)分子育种电话:021**传真:021**电子信箱:cairun@sjtu.edu.cn1955年生,男,本科毕业于沈阳农业大学农学系,硕士毕业于中国农业科学院作物遗传育种专业, ...上海交通大学师资导师 本站小编 Free考研考试 2021-01-03上海交通大学农业与生物学院导师教师师资介绍简介-包岩
包岩职称:长聘教轨副教授,博士生导师,课题组长所属学科:植物学研究方向:平衡植物抗逆与生长电子信箱:yanbao@sjtu.edu.cn联系地址:上海交通大学农业与生物学院创新楼B-306室个人简介2020.12-至今上海交通大学,农业与生物学院,长聘教轨副教授2017.01-2020.12,美国密 ...上海交通大学师资导师 本站小编 Free考研考试 2021-01-03上海交通大学农业与生物学院导师教师师资介绍简介-常丽英
常丽英职称:副教授所属学科:园艺学研究方向:(1)园艺作物模型和专家系统(2)设施作物智能化管理和环境调控(3)园艺作物生理生态电话:电子信箱:changly@sjtu.edu.cn联系地址:上海市东川路800号个人简介:2007年7月毕业于南京农业大学农学院,获得农学博士学位。2007年8月开始在 ...上海交通大学师资导师 本站小编 Free考研考试 2021-01-03上海交通大学农业与生物学院导师教师师资介绍简介-曹越平
曹越平职称:教授、博士生导师所属学科:作物遗传育种办公室电话号码:86-邮箱:yuepingcao@sjtu.edu.cn研究方向:(1)大豆种质资源的研究与利用(2)大豆抗病遗传与育种(3)大豆转基因育种及转基因作物安全性研究工作学习简历1967年3月生于黑龙江哈尔滨。1989年毕业于东北农业大学 ...上海交通大学师资导师 本站小编 Free考研考试 2021-01-03上海交通大学农业与生物学院导师教师师资介绍简介-陈火英
陈火英职称:长聘教授、博士生导师所属学科:园艺学研究方向:(1)园艺植物种质资源的创新与利用(2)植物生物技术(3)植物种子种苗科学与技术电话:传真:电子信箱:chhy@sjtu.edu.cn;huoying1015@163.com个人简历陈火英,女,1962年生于上海,教授、博士生导师。本科、硕士 ...上海交通大学师资导师 本站小编 Free考研考试 2021-01-03上海交通大学农业与生物学院导师教师师资介绍简介-陈诚
陈诚职称:长聘教轨副教授(博士生导师,独立PI)所属学科:园艺学,细胞生物学研究方向:细胞器生物学电话:电子邮箱:cgchen@sjtu.edu.cn办公室地址:上海交通大学农业与生物学院B527实验室地址:上海交通大学农业与生物学院B520个人简介:2006年7月毕业于沈阳农业大学生物科学技术学院 ...上海交通大学师资导师 本站小编 Free考研考试 2021-01-03上海交通大学农业与生物学院导师教师师资介绍简介-方玉达
方玉达职称:****所属学科:植物学研究方向:细胞核与染色质结构和功能电话/传真:**电子信箱:yuda.fang@sjtu.edu.cn联系地址:上海交通大学农业与生物学院B-521个人简介:1985.7皖南农学院农学专业本科毕业,获农学学士;1987.7南京农业大学作物遗传育种研究生班毕业;19 ...上海交通大学师资导师 本站小编 Free考研考试 2021-01-03