王景 博士后, 电子邮件：zhenjiaofenjie@sjtu.edu.cn
通讯地址：上海交大闵行校区生物药学楼3-213
个人主页：https://www.researchgate.net/profile/Jing_Wang269



教育背景 2011-2018 上海交通大学，生命科学技术学院，微生物代谢国家重点实验室，微生物学专业，博士
2007-2011 上海交通大学，生命科学技术学院，生命科学与技术基地班，生物信息学专业，本科

工作经历 2020至今 上海交通大学，海洋学院，深部生命中心，博士后
- 探索海洋环境中，特别是深海中微生物群落的结构与功能如何参与和影响碳、氮、硫、磷、铁等元素在深海中的循环
- 基于基因组尺度的代谢网络建模与代谢流分析
- 阐释水圈微生物特殊代谢表型的具体代谢机制
- 模拟和预测海洋微生物间的互利和竞争关系，阐释不同元素在不同微生物中的代谢流动。
- 预测海洋微生物群落利用或产生海洋中各种无机物和有机物的潜在能力，阐释海洋微生物群落的结构与功能和海洋环境的互作关系。
2017-2020 美国罗德岛大学，环境与生命科学学院，细胞与分子生物学系，访问****
- 参与美国国家科学基金项目（**）
- 大脑神经细胞回路中的代谢网络构建，并对小鼠在运动技能学习过程中的神经细胞代谢的变化情况进行数值模拟；
- 在细菌与古菌基因组中开展比较基因组学与泛基因组（pan-genome）分析；
- 参与开发代谢网络模型分析软件PSAMM（Portable System for the Analysis of Metabolic Models）；
- 指导本科生参与实验室科研实践。
2012-2018 参与国家科技重大专项（2012ZX**-009）
- 研究了慢性乙型肝炎患者中肠道菌群失调现象对肝病发生发展的作用，揭示了肠道菌群可能通过干预宿主代谢的方式参与了慢性乙型肝炎向肝硬化的发展过程；
- 提出了肠道菌群失调指数，该指数用肠道中“有害菌”对“有益菌”的丰度差异来指征慢性乙型肝炎患者肠道菌群的失调情况；
- 负责患者样品中16S rRNA基因扩增子文库的制备以及Illumina MiSeq平台高通量测序操作；
- 负责全程生物信息学分析，包括数据处理，统计分析以及算法开发。
2012-2018 参与国家自然科学基金项目（**）
- 开发了一套算法用以最大程度地减少16s rRNA基因扩增子测序数据中错误序列对于群落多样性分析的影响；
- 使用重采样模拟的方式评估了测序深度对反映群落多样性特征的影响；
- 研究下一代测序技术在微生物群落结构与功能分析中的应用；
- 研究16S rRNA基因不同高变区的选择对于微生物群落结构分析的影响。
2011-2018 负责本实验室的测序仪器与计算平台的维护与日常运行
- 针对实验室的日常科研需求编写应用程序及统计工具；
- 指导测序平台的上机操作，出具测序质量报告；
- 负责测序数据的质量控制，流程化分析处理以及数据管理；
- 负责计算服务器软、硬件维护。

出访及挂职经历 2017-2020 美国罗德岛大学，环境与生命科学学院，细胞与分子生物学系，访问****

研究方向 微生物生态学；代谢网络模拟；多组学、高维数据分析；算法与软件开发；生物信息学分析平台。

代表性论文专著 1. L. E. Williams, N. Cullen, J. A. DeGiorgis, K. J. Martinez, J. Mellone, M. Oser, J. Wang, Y. Zhang, Variation in genome content and predatory phenotypes between Bdellovibrio sp. NC01 isolated from soil and B. bacteriovorus type strain HD100. Microbiology (2019), doi:10.1099/mic.0.000861.
2. X. Tong, J. Xu, F. Lian, X. Yu, Y. Zhao, L. Xu, M. Zhang, X. Zhao, J. Shen, S. Wu, X. Pang, J. Tian, C. Zhang, Q. Zhou, L. Wang, B. Pang, F. Chen, Z. Peng, J. Wang, Z. Zhen, C. Fang, M. Li, L. Chen, L. Zhao, Structural alteration of gut microbiota during the amelioration of human type 2 diabetes with hyperlipidemia by metformin and a traditional chinese herbal formula: A multicenter, randomized, open label clinical trial. mBio. 9 (2018), doi:10.1128/mBio.02392-17.
3. J. Wang, Q. Zhang, G. Wu, C. Zhang, M. Zhang, L. Zhao, Minimizing spurious features in 16S rRNA gene amplicon sequencing. PeerJ Preprints, in press, doi:10.7287/peerj.preprints.26872v1.
4. L. Zhao, F. Zhang, X. Ding, G. Wu, Y. Y. Lam, X. Wang, H. Fu, X. Xue, C. Lu, J. Ma, L. Yu, C. Xu, Z. Ren, Y. Xu, S. Xu, H. Shen, X. Zhu, Y. Shi, Q. Shen, W. Dong, R. Liu, Y. Ling, Y. Zeng, X. Wang, Q. Zhang, J. Wang, L. Wang, Y. Wu, B. Zeng, H. Wei, M. Zhang, Y. Peng, C. Zhang, Gut bacteria selectively promoted by dietary fibers alleviate type 2 diabetes. Science. 359, 1151–1156 (2018).
5. Y. Wang, H. Tian, F. Huang, W. Long, Q. Zhang, J. Wang, Y. Zhu, X. Wu, G. Chen, L. Zhao, L. R. Bakken, ?. Frosteg?rd, X. Zhang, Time-resolved analysis of a denitrifying bacterial community revealed a core microbiome responsible for the anaerobic degradation of quinoline. Scientific Reports. 7, 1–11 (2017).
6. J. Wang, Y. Wang, X. Zhang, J. Liu, Q. Zhang, Y. Zhao, J. Peng, Q. Feng, J. Dai, S. Sun, Y. Zhao, L. Zhao, Y. Zhang, Y. Hu, M. Zhang, Gut Microbial Dysbiosis Is Associated with Altered Hepatic Functions and Serum Metabolites in Chronic Hepatitis B Patients. Frontiers in Microbiology. 8 (2017), doi:10.3389/fmicb.2017.02222.
7. L. C. Bridgewater, C. Zhang, Y. Wu, W. Hu, Q. Zhang, J. Wang, S. Li, L. Zhao, Gender-based differences in host behavior and gut microbiota composition in response to high fat diet and stress in a mouse model. Scientific Reports. 7 (2017), doi:10.1038/s41598-017-11069-4.
8. J. Wang, J. Wang, X. Pang, L. Zhao, L. Tian, X. Wang, Sex differences in colonization of gut microbiota from a man with short-term vegetarian and inulin-supplemented diet in germ-free mice. Scientific Reports. 6, 36137 (2016).
9. Q. Zhang, Y. Wu, J. Wang, G. Wu, W. Long, Z. Xue, L. Wang, X. Zhang, X. Pang, Y. Zhao, L. Zhao, C. Zhang, Accelerated dysbiosis of gut microbiota during aggravation of DSS-induced colitis by a butyrate-producing bacterium. Scientific Reports. 6, 27572 (2016).
10. G. Wu, C. Zhang, J. Wang, F. Zhang, R. Wang, J. Shen, L. Wang, X. Pang, X. Zhang, L. Zhao, M. Zhang, Diminution of the gut resistome after a gut microbiota-targeted dietary intervention in obese children. Scientific Reports. 6, 24030 (2016).

软件版权登记及专利 赵立平，王景，张梦晖，微生物操作分类单元确定和序列辅助分离, CNA