丁蓓

本组招收2021年博士生，欢迎联系。
本组长期招收博士后和研究助理（本科或硕士毕业），欢迎联系。


1. 基本信息
姓名：丁蓓
职称：特别研究员
电话：
邮箱：bei.ding@sjtu.edu.cn
主页：scce.sjtu.edu.cn
通讯地址：


2. 教育经历
2005-2009：北京大学化学与分子工程学院 ，化学，学士
2009-2014：美国密西根大学，电气工程（光学方向），硕士
美国密西根大学， 物理化学，博士


3. 工作经历
2014-2017：美国宾夕法尼亚大学，博士后
2017-至今：上海交通大学化学化工学院，特别研究员，博士生导师（物理化学和生物化学方向）


4. 研究方向
1） 含黄素辅基的光敏蛋白动力学机理研究
含黄素辅基的蛋白质在自然界有广泛的分布并展现了多样的功能。课题组结合分子生物学和超快光谱学手段研究此类蛋白的分子机理。目前课题组开展的课题包括：1. 解析蓝光光受体蛋白BLUF域的光化学和异构化过程，理解其生物功能。2. 结合非平衡态电子转移理论，研究黄素氧化还原蛋白的光致电子转移过程。3. 解析光解酶光致还原机理和修复损伤DNA机理。
2） 疾病相关淀粉样蛋白聚集动力学研究
淀粉样蛋白的聚集和多种退神经性疾病例如阿兹海默症、渐冻症、帕金森症密切相关。课题组结合非天然氨基酸修饰和红外光谱，研究淀粉样蛋白片段特定位点的聚集动力学。目前课题组研究的体系是与渐冻症相关的SOD 1蛋白片段和与糖尿病相关的胰淀素蛋白片段。

5. 科研项目
科技部重点研发计划青年项目首席科学家、主持国家自然科学基金面上项目、青年科学基金、上海科委“扬帆计划”项目、上海教委“晨光计划”项目。


6. 荣誉奖励
2013年 美国密西根大学Barbour Scholarship
2012年 美国密西根大学Rackham InternationalResearch Fellowship
2008年 北京大学莙政****

7. 代表性论文
Ding, B.; Yang, L.; Mukherjee,D.; Chen, J.; Gao, Y.; Gai, F. Microscopic Insight into the ProteinDenaturation Action of Urea and Its Methyl Derivatives. J. Phys. Chem. Lett. 2018, 9, 1–12.
Hilaire,M. R.^#; Ding, B. ^#;Mukherjee, D. ^#; Chen, J.; Gai, F. Possible Existence of α-Sheets inthe Amyloid Fibrils Formed by a TTR _105–115 Mutant. J. Am. Chem.Soc. 2018, 140 (2), 629–635. (^#co-first author)
Ding, B.; Mukherjee, D.; Chen,J.; Gai, F. Do Guanidinium and Tetrapropylammonium Ions Specifically Interactwith Aromatic Amino Acid Sidechains? Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2017, 114, 1003-1008
Ding, B.; Hilaire, M. R.; Gai,F. Infrared and Fluorescence Assessment of Protein Folding and FunctionalDynamics. J. Phys. Chem. B (FeatureArticle), 2016, 120, 5103-5113
Ding, B.; Jasensky, J.; Li, Y.;Chen, Z. Engineering and Characterization of Peptides and Proteins at Surfacesand Interfaces: A Case Study in Surface-Sensitive Vibrational Spectroscopy. Acc. Chem. Res. 2016, 49, 1149-1157
Ding, B.; Panahi, A.; Ho, J. J.;Laaser, J. E.; Brooks, C. L.; Zanni, M. T.; Chen, Z. Probing Site-SpecificStructural Information of Peptides at Model Membrane Interface in Situ. J. Am. Chem. Soc. 2015, 137, 10190-10198
Ding, B.; Tesmer, J.; Chen, Z.Unveiling the Membrane-Binding Properties of N-terminal and C-terminal Regionsof G Protein-Coupled Receptor Kinase 5 by Combined Optical Spectroscopies. Langmuir 2013, 30, 823-831
Ding, B.; Laaser J. E.; Liu Y.;Wang P.; Zanni M. T., Chen, Z. Site-specific Orientation Determination of an α-helicalPeptide Ovispirin-1 from Isotope labeled Sum Frequency Generation. J. Phys. Chem. B 2013, 117, 14625-14634
Ding, B.; Soblosky L., Nuygen, K.;Geng J.; Yu X.; Ramamoorthy A.; Chen, Z. Physiologically-Relevant Modes ofMembrane Interactions by the Human Antimicrobial Peptide, LL-37, Revealed bySFG Experiments. Sci. Rep. 2013, 3, 1854
Ding, B.; Chen, Z. MolecularInteractions between a Cell Penetrating Peptide Pep-1 and Model Cell Membranes. J. Phys. Chem. B 2012, 116, 2545-2552
Ding, B.; Washington, V.;Dunietz, B. D. On the Conditions for Enhanced Transport Through MolecularJunctions Based on Metal Centers Ligated by Pyridazino-derived Ligands. Mol. Phys. 2010, 108, 2591-2599

8. 其它
课题组长期欢迎化学学院优秀本科生进组进行科研实习，要求对物理化学或生物化学有一定兴趣。课题组项目属于交叉领域，也欢迎有一定计算机、光学或生物背景的外院本科生加入。目前课题组本科生已成功申报莙政项目一项，PRP项目4项，致远****项目1项。