招生简介致考生书招生院系与专业导师介绍参考书籍联系方式信息公告
白凤武

导师姓名
白凤武
研究方向工业系统生物学及微生物代谢工程;生物反应器工程及放大技术
联系方式通讯地址：生物楼4号楼107室

邮政编码：200240

联系电话：34208028

Email：fwbai@sjtu.edu.cn
个人简介

主要研究方向：1.工业系统生物学及微生物代谢工程；2.生物能源基础研究和关键技术；3.清洁生产与环境友好生物技术；4.生物反应器工程及放大技术。长期从事生物化工学科基础研究和技术开发工作，带领课题组先后主持并完成了包括国家自然科学基金，国家863项目，国家科技攻关项目，国家高新技术产业化示范工程项目及企业委托技术开发项目在内多项课题的研究和工程设计等工作。
代表性论著
Books1.BiotechnologyinChinaIII:BiofuelsandBioenergy(Spriner,2012)2.IndustrialBiotechnologyandBulkCommodities(Elsevier,2011)3.BiotechnologyinChinaII:FromBioreactiontoBioseparation(Springer,2009)BookChapters1.ZhaoXQ,ZiLH,BaiFW,LinHL,HaoXM,YueGJ,HoNWY.2012.Bioethanolfromlignocellulosicbiomass.InBiotechnologyinChinaIII:BiofuelsandBioenergy.AdvancesinBiochemicalEngineering/Biotechnology128:25-52(Springer)2.WangBW,ShiAQ,TuR,ZhangXL,WangQH,BaiFW.2012.Branched-chainhigheralcohols.InBiotechnologyinChinaIII:BiofuelsandBioenergy.AdvancesinBiochemicalEngineering/Biotechnology128:101-118(Springer)3.BaiFW,ZhaoXQ.2011.Highgravityethanolfermentationsandyeasttolerance.InMicrobialstresstoleranceforbiofuels.MicrobiologyMonographs22:117-135(Springer)4.BaiFW,ZhaoXQ,XuJF.2011.ImmobilizationTechnology:Cells.In:EngineeringFundamentalsofBiotechnology,ComprehensiveBiotechnology(Elsevier)PeerReviewArticles1.YuanWJ,ZhaoXQ,ChenLJ,BaiFW.EthanolfermentationfromJerusalemartichoketubersbyrecombinantSaccharomycescerevisiaeexpressinginulinasegeneofKluyveromycesmarxianus.LifeSciencesinEngineering,inpress.2.LiuZ,ZhaoXQ,BaiFW.Identificationofanalkalinetolerantmarine-derivedStreptomycesstrainasaxylanaseproducerandimprovementofitsxylanaseproductionbyribosomeengineering.AppliedMicrobiologyandBiotechnology,inpress.3.XueC,ZhaoJB,LiuFF,LuCC,YangST,BaiFW.2013.Two-stageinsitugasstrippingforenhancedbutanolfermentationandenergy-savingproductrecovery.BioresourceTechnology135:396-402.4.LiuCG,XueC,LinYH,BaiFW.2013.Redoxpotentialcontrolandapplicationsinmicroaerobicandanaerobicfermentations.BiotechnologyAdvances31:257-265.5.WanC,ZhaoXQ,GuoSL,AlamMA,BaiFW.2013.BioflocculantproductionfromSolibacillussilvestrisW01anditsapplicationincost-effectiveharvestofmarinemicroalgaNannochloropsisoceanicabyflocculation.BioresourceTechnology,135:207-212.
白林泉

导师姓名
白林泉
研究方向微生物生物合成;微生物功能基因组学
联系方式通讯地址：华山路１９５４号上海交通大学徐汇校区科学馆

邮政编码：２０００３０

联系电话：13816062751

Email：bailq@sjtu.edu.cn
个人简介

男，1971年8月出生，博士，上海交通大学微生物学教授，博士导师，基金委“重要微生物合成与分解代谢的分子机理”创新研究群体和微生物代谢国家重点实验室研究骨干。1992年获得山东大学微生物系学士学位。1995年获得华中农业大学微生物专业硕士学位。1998年获得华中农业大学分子生物学专业理学博士学位。1999年至2002年4月在美国华盛顿大学化学系从事博士后研究。之后回国到上海交通大学生命科学技术学院工作。2006年至2007年初在德国Tuebingen大学微生物研究所从事生物合成调节方面的合作研究。主要从事抗肿瘤安丝霉素、抗水稻纹枯病井冈霉素等微生物药物的生物合成机理研究、合成生物学结构改造和功能基因组学研究，在PNAS、JACS、NPR、Chemistry&Biology、AEM、Chembiochem等杂志发表50篇研究论文，其中第一作者及通讯作者20篇。研究成果被NatureBiotechnology、NatureChina、Facultyof1000Biology等专文评价，被评为06年“中国高等学校十大科技进展”、07年“教育部自然科学二等奖”和08年“国家自然科学二等奖”。07年应邀在第14届国际放线菌大会、08年在第13届国际生物技术大会做分组报告。承担和参加了国家自然科学基金4项及国家863计划项目2项。07年入选教育部“新世纪优秀人才支持计划”，08年入选上海市教委“曙光人才计划”,09年获得“明治乳业生命科学奖”和“第十一届中国青年科技奖”。
代表性论著
null
曹成喜

导师姓名
曹成喜
研究方向重要生物技术-电泳学新概念、新技术与新仪器设备;先进生物分离与分析技术在糖尿病和肿瘤诊断中的应用
联系方式通讯地址：东川路800号生命学院

邮政编码：200240

联系电话：021-34205820

Email：cxcao@sjtu.edu.cn
个人简介

上海交通大学教授，博士生导师，优秀教师。主讲多门本科和研究生课程，包括《生物分离工程》、《生物分析化学》和《高等电泳与色谱技术》等。TOACJ（BenthamSciencePublishersLtd出版）编委，中国化学会有机分析专业委员会委员，中国仪器仪表学会纳米成像仪器委员会委员。2000年年获中国科技大学理学博士学位，毕业后留校工作。2006年澳大利亚LaTrobe大学学术交流访问。2002年-现在，于上海交通大学生科院工作。应邀担任国家基金、科技部863、上海市科委和山东省等科研项目评审专家，应邀为Anal.Chem.,Electrophoresis,J.Chromatogr.A,Analyist,Anal.ChimActa,Talanta和J.Chromatogr.B等十多种学术期刊担任论文评议人。应邀为英国Analyst和DrugMetabolism期刊等撰写评论性综述。先后主持20多项科研项目，包括NSFC课题7项（重点基金1项)、973重大基础子课题1项、863重点支撑项目子课题1项、国家重大新药创制子课题1项、卫生部课题1项。先后在Anal.Chem.,J.Chromatogr.A,Electrophoresis,ANALYST和J.Chromatogr.B等重要学术期刊发表论文80余篇（其中SCI论文50余篇），近几年获得或申请国家发明专利10项，主编《分析生物化学技术》和《生物化学仪器分析基础》。主要学术贡献：1、发展了系统的移动反应界面(MRB)电泳理论、方法及其应用；2、提出了系统的等电聚焦电泳（IEF)动力学理论,研制了相关的稳定IEF关键部件；3、发展了MRB-毛细管电泳富集技术的理论和方法，包括相关应用；4、研制了国际上首台重力自平衡-自由流电泳系统；5、发展了MCB和CE数学模型和计算机模拟软件；6、提出了基于MRB电泳的电迁移酸碱滴定新方法。
代表性论著
1.Q.Yang,L.Y.Fan,...,CXCao*,Equivalence-PointElectromigrationAcid-BaseTitrationviaMovingNeutralizationBoundaryElectrophoresis,Electrophoresis,inpress,IF3.1.2.C.Sun,X.D.Yang,...,C.X.Cao*,StackinganddeterminationofPCAwithlowpKainsoilviaMRBformedbyalkalineanddouble-acidicbuffersinCE,Anal.Bioanal.Chem,inpress.IF3.5.3.J.Shao,L.-Y.Fan,...,C.-X.Cao*,Purificationofphenazine-1-carboxylicacidbyFree-FlowElectrophoresisfromfermentationbrothofPseudomonasM-18,Electrophoresis,2010,31,3499-3507.IF3.14.J.Shao,C.-X.Cao*,S.Li,etal.,ControllingofBandWidth,ResolutionandSampleLoadingbyInjectionSysteminaSimplePreparativeFree-FlowElectrophoresiswithGratisGravityJ.Chromatogr.A,2010,1217,2182-2186.IF4.1.5.J.Meng,W.Zhang,C.X.Cao*,L.Y.Fan,MovingAffinityBoundaryElectrophoresisandItsExclusiveCaptureofTargetMetaboliteinhumanurine,Analyst,2010,1351592-1599.IF3.3.6.W.Zhang,J.F.Chen,...,C.X.Cao*,AnovelIsotachophoresisofCobaltandCopperComplexesbyMetalIonSubstitutionReactioninaContinuousMCB,Analyst,2010,135,140-148.IF3.3.7.S.Chen,J.F.Palmer,...,L.Y.Fan**,...,C.X.Cao*,ASimplePreparativeFFEJoinedwithGratisGravity:I.GasCushionInjectorandSelf-balanceCollectorinsteadofMultipleChannelPump,Electrophoresis,2009,30,1998-2007.IF3.1.8.L.-Y.Fan,W.Yan,...,C.X.Cao*,ExperimentsonMIBsandTheirCharacteristicsofFocusingandProbingofBothGuestandHostTargetMolecules,Anal.Chim.Acta,2009,650,111-117.(invited)IF3.8.9.J.Jin,J.Shao,...,C.-XCao*,ComputersimulationonacontinuousMCRinEDTA-basedsamplesweepinginCE,J.Chromatogr.A,2009,1216,4913-4922.IF4.110.C.X.Cao*,L.Y.Fan,W.Zhang,ReviewonthetheoryofMRB,electromigrationreactionmethodsandapplicationsinIEFandsamplepreconcentration,Analyst,(invited),2008,133,1139-1157.IF3.3.11.L.Y.Fan,C.J.Li,...,C.X.Cao*,MCB:Model,TheoryandItsControllableMetalIonicStackingEfficiencyinCE.Electrophoresis,2008,29,3989-3998.IF3.2.12.M.Li,L.Y.Fan,...,C.X.Cao*,StackingandquantitativeanalysisoflovastatininurinesamplebytransientMRBinCE,Anal.Bioanal.Chem.,2007,387,2719-2725.IF3.5.13.X.Wang,W.Zhang,...,C.X.Cao*,QuantitativedetectionofmatrineandoxymatrineinrateplasmabyCEwithMRB-basedsamplestacking,Anal.Chim.Acta,2007,594,290-296.IF3.8.14.Q.L.Wang,L.Y.Fan,...,C.X.Cao*,SensitiveanalysisoftwobarbituratesinhumanurinebyCZEwithsamplestackinginducedbyMRB,Anal.Chim.Acta,2006,580,200-205.IF3.8.15.C.-X.Cao,W.Zhang,W.-H.Qin,etal.,QuantitativepredictionstoconditionsofzwitterionicstackingbyMRBcreatedwithweakelectrolyticbuffersinCZE,Anal.Chem.,2005;77,955-963.IF5.3.16.C.-X.Cao,Y.-Z.He,M.Li,etal.StackingionizableanalytesinasamplematrixwithhighsaltbyaMRBinCZE,Anal.Chem.,2002;74:4167-4174.IF5.3.17.C.-X.Cao*,S.-L.Zhou,etal.,InvestigationsonfactorsthatinfluenceMNBmethodforCEandIEF,J.Chromatogr.A,2002;952:29-38.IF4.118.C.-X.Cao,Y.-Z.He,etal.,ImprovingseparationefficiencyofCZEoftryptophanandphenylalaninewithMRBmethod,J.Chromatogr.A,2002;952:39-46.IF4.1.
邓子新

导师姓名
邓子新
研究方向硫基生命优势;微生物药物化学生物学
联系方式通讯地址：上海交通大学生命学院

邮政编码：200030

联系电话：021-62933404

Email：zxdeng@sjtu.edu.cn
个人简介

邓子新，中国科学院院士，上海交通大学教授，微生物学家。1957年出生于湖北房县。1982年毕业于华中农业大学微生物专业，1987年获英国EastAnglia大学分子微生物学博士学位。现任上海交通大学Bio-X生命科学研究中心副主任，兼任5个国际刊物编委。　　长期从事微生物分子生物学研究，在重要类别抗生素生物合成基因克隆、定位、结构功能分析、表达和遗传调控机制、抗生素代谢工程与药物创新、天然产物的生物化学与组合生物合成等方面取得了系统性研究进展,提出了多个国际认同的抗生素生物合成分子机制的理论模型,利用遗传操作高产了重要抗生素，并产生了系列药物衍生物,是我国在微生物代谢途径与代谢工程研究领域的主要学术带头人之一。在众多细菌DNA大分子上首次发现了硫(S)修饰,打开了DNA硫化修饰新领域。
代表性论著
null
冯雁

导师姓名
冯雁
研究方向分子酶学;合成生物学
联系方式通讯地址：上海市东川路800号上海交通大学生命科学与技术学院

邮政编码：200240

联系电话：34207189

Email：yfeng2009@sjtu.edu.cn
个人简介

null
代表性论著
null
何亚文

导师姓名
何亚文
研究方向微生物群体感应机理;微生物源绿色农药研发与应用
联系方式通讯地址：东川路800号，上海交通大学，生科院

邮政编码：200240

联系电话：34207941

Email：yawenhe@sjtu.edu.cn
个人简介

1992年毕业于华中师范大学生物系；1995年于中国科学院华南植物研究所获植物生理学硕士学位；1995-1997年在中国科学院华南植物研究所工作，任助理研究员；1997年9月赴新加坡国立大学(NationalUniversityofSingapore,NUS)留学，1999年9月获植物学硕士学位；1999年12月加入新加坡分子农业生物学院(InstituteofMolecularAgrobiology)，任AssistantResearchOfficer；2002年并入新加坡分子与细胞生物研究院(InstituteofMolecularandCellBiology,IMCB)，任JuniorResearchFellow，主要研究黄单胞菌(Xanthomonas)群体感应(Quorumsensing)机理；2006年获NUS-IMCB联合培养理学博士学位（研究型）；2007年任分子与细胞生物研究院ResearchFellow，主持黄单胞菌群体感应和低氧感应分子机理研究。2010年始任上海交通大学生命科学院特别研究员，博导。
代表性论著
近年发表论文：1.WuDQ,YeJ,OuHY,WeiX,HuangX,HeYW*andXuY*(2011)Genomicanalysisandtemperature-dependenttranscriptomeprofilesoftherhizosphereoriginatingstrainPseudomonasaeruginosaM18.BMCGenomics，12：438(*correspondingauthors).2.ZhouL,VorholterFJ,HeYQ,JiangBL,TangJL,XuY,PuhlerA,HeYW*(2011)Genediscoverybygenome-wideCDSre-predictionandmicroarray-basedtranscriptionalanalysisinphytopathogenXanthomonascampestris.BMCGenomics,12(1):359（*correspondingauthors).3.HeYW*,WuJ,ZhouL,YangF,JiangBL,TangJL,BaiL,XuY,DengZ,ZhangLH*(2011)Xanthomonascampestrisdiffusiblefactoris3-hydroxybenzoicacidandassociatedwithxanthomonadinbiosynthesis,cellviability,antioxidantactivityandsystemicinvasion.MolPlantMicrobeInteract.24(8):948-57（*correspondingauthors).4.HeYW*,WuJE,ChaJS,ZhangLH*(2010)RicebacterialblightpathogenXanthomonasoryzaepv.oryzaeproducesmultipleDSF-familysignalsinregulationofvirulencefactorproduction.BMCMicrobiology,10:187(*correspondingauthors).5.ChengZ*,HeYW*,LimSC*,QamraR*,WalshMA,ZhangLH,SongH(2010)StructuralBasisoftheSensor-SynthaseInteractioninAutoinductionoftheQuorumSensingSignalDSFBiosynthesis.Structure,18(9):1199-1209(*equalcontributors).影响因子：5.96.HeYW,WuJE,ChaJS,ZhangLH*(2010)RicebacterialblightpathogenXanthomonasoryzaepv.oryzaeproducesmultipleDSF-familysignalsinregulationofvirulencefactorproduction.BMCMicrobiology,10:187(*correspondingauthors).影响因子：2.97.TaoF,HeYW,WuDH,SwarupS,ZhangLH(2010)ThecyclicnucleotidemonophosphatedomainofXanthomonascampestrisglobalregulatorClpdefinesanewclassofcyclicdi-GMPeffectors.TheJournalofBacteriology,192(4):1020-9.影响因子：3.98.HEYW,BoonC,ZhouL,ZhangLH(2009)Co-regulationofXanthomonascampestrisvirulencebyquorumsensingandanoveltwo-componentregulatorysystemRavS/RavR.MolecularMicrobiology71(6):1464-1476.影响因子：5.49.HeYW,ZhangLH(2008)QuorumSensingandVirulenceRegulationinXanthomonascampestris.FEMSMicrobiologyReviews32:842-857.影响因子：9.810.BoonC,DengY,WangLH,HeYW,XuJL,FanY,PanSQ,ZhangLH(2008)AnovelDSF-likesignalfromBurkholderiacenocepaciainterfereswithCandidaalbicansmorphologicaltransition.InternationalSocietyofMicrobialEcologyJournal(ISMEJ).2(1):27-36.影响因子：6.411.HeYW,NgYJ,XuM,LinKandZhangLH(2007)Xanthomonascampestriscell-cellcommunicationinvolvesanucleotidereceptorproteinClpandahierarchicalsignalingnetwork.MolecularMicrobiology64(2):281-292.影响因子：5.412.HeYW,WangC,ZhouL,SongH,DowJM,ZhangLH(2006)DualsignalingfunctionsofthehybridsensorkinaseRpfCofXanthomonascampestrisinvolveeitherphosphorelayorreceiverdomain-proteininteraction.TheJournalofBiologicalChemistry281:33414–33421.影响因子：5.313.RyanRP,FouhyY,LuceyJF,CrossmanLC,SpiroS,HeYW,ZhangLH,HeebS,CamaraM,WilliamsP,DowJM(2006)Cell-cellsignalinginXanthomonascampestrisinvolvesanHD-GYPdomainproteinthatfunctionsincyclicdi-GMPturnover.ProceedingsofNationalAcademyofScienceofUSA103(17):6712-6717.影响因子：9.414.HeYW,XuM,LinK,NgYJ,WenCM,WangLH,LiuZD,ZhangHB,DongYH,DowJMandZhangLH(2006)GenomescaleanalysisofdiffusiblesignalfactorreguloninXanthomonascampestrispv.campestris:identificationofnovelcell-cellcommunication-dependentgenesandfunctions.MolecularMicrobiology59(2):610-622.影响因子：5.415.WangLH,HeYW,GaoYF,WuJE,DongYH,WangRB,HeCZ,WangSX,WengLX,XuJL,TayL,FangRX,ZhangLH(2004)Abacterialcell-cellcommunicationsignalwithcross-kingdomstructuralanalogs.MolecularMicrobiology51(3):903-12.影响因子：5.4
贺光

导师姓名
贺光
研究方向精神疾病遗传学;肿瘤遗传学
联系方式通讯地址：华山路1954号上海交通大学Bio-X中心小白楼207室

邮政编码：200030

联系电话：021-62932779-8207

Email：heguang@sjtu.edu.cn
个人简介

贺光，女，1973年生。2002年获中国医科大学医学遗传学博士，目前为上海交通大学Bio-X中心研究员，博士生导师，上海市人才计划科技启明星A类，获上海交通大学晨星人才计划A类资助，上海交通大学与阿斯利康制药有限公司合作研究室主任，中华遗传学会精神遗传学组组长。作为课题负责人主持的973课题“遗传与营养等因素对导致精神疾病发生机理的研究”已顺利通过科技部验收并被评为“优”。先后主持的两项国家自然基金项目，作为主要参与人参加了两项精神分裂症相关基因的专利申请，其中一项专利已获授权。迄今为止在MolecularPsychiatry，AmericanJournalofHumanGenetics等发表SCI论文58篇，其中第一作者（含并列第一作者）及通讯作者论文共计23篇（近年来IF>15的有两篇），第一作者及通讯作者论文他引累计次数207次，参加编写专著、译著四部。
代表性论著
1.WangY,HeG,HeL,McGrathJ.Dosharedmechanismsunderlyingcellcycleregulationandsynapticplasticityunderliethereducedincidenceofcancerinschizophrenia?SchizophreniaResearch2011;130(1-3):282-4.2.WangY,ZhangJ,LiuB,ShaoL,WeiZ,LiX,JiJ,YangF,WangT,LiuJ,WanC,LiB,XuY,FengG,HeL,HeG.GeneticpolymorphismsintheSCN8AgeneareassociatedwithsuicidalbehaviorinpsychiatricdisordersintheChinesepopulation.WorldJournalofBiologicalPsychiatry2010;11(8):956-63.3.ZhangJ,LiX,WangY,JiJ,YangF,FengG,WanP,LindpaintnerK,HeL,HeG.AssociationstudyonthemitochondrialgeneNDUFV2andbipolardisorderintheChineseHanpopulation.JournalofNeuralTransmission2009;116(3):357-61.4.ShiYY,HeG,ZhangZ,TangW,ZhangJJr,ZhaoQ,ZhangJSr,LiXW,XiZR,FangC,ZhaoXZ,FengGY,HeL.AstudyofrarestructuralvariantsinschizophreniapatientsandnormalcontrolsfromChineseHanpopulation.MolecularPsychiatry2008;13(10):911-3.5.ZhaoX,QinS,ShiY,ZhangA,ZhangJ,BianL,WanC,FengG,GuN,ZhangG,HeG,HeL.SystematicstudyofassociationoffourGABAergicgenes:glutamicaciddecarboxylase1gene,glutamicaciddecarboxylase2gene,GABA(B)receptor1geneandGABA(A)receptorsubunitbeta2gene,withschizophreniausingauniversalDNAmicroarray.SchizophreniaResearch2007;;93(1-3):374-84.6.HeG,LiuX,QinW,ChenQ,WangX,YangY,ZhouJ,XuY,GuN,FengG,SangH,WangP,HeL.MPZL1/PZR,anovelcandidatepredisposingschizophreniainHanChinese.MolecularPsychiatry2006;11(8):748-51.7.ChenQ,HeG,QinW,ChenQY,ZhaoXZ,DuanSW,LiuXM,FengGY,XuYF,StClairD,LiM,WangJH,XingYL,ShiJG,HeL.Family-basedassociationstudyofsynapsinIIandschizophrenia.TheAmericanJournalofHumanGenetics2004;75(5):873-7.8.ChenQ,HeG,WangXY,ChenQY,LiuXM,GuZZ,LiuJ,LiKQ,WangSJ,ZhuSM,FengGY,HeL.PositiveassociationbetweensynapsinIIandschizophrenia.BiologicalPsychiatry2004;56(3):177-81.
贺林

导师姓名
贺林
研究方向精神疾病遗传学;单基因病遗传学
联系方式通讯地址：华山路1954号上海交通大学Bio-X研究院小白楼

邮政编码：200030

联系电话：62833148

Email：helin@sjtu.edu.cn
个人简介

贺林，遗传生物学家，中国科学院院士，“****”特聘教授，国家杰青，上海交通大学教授。1953年出生于北京。1991年毕业于英国佩士来大学，获理学博士学位。现任上海交通大学Bio-X研究院院长，中国科学院上海生命科学研究院营养科学研究所室主任。两任国家973计划首席科学家，数届国家863计划专家，第6、7届国务院学位评定委员会成员。发表SCI论文300多篇。目前被聘为BiologicalExperimentandMedicine,HumanGenetics等十多种杂志的副主编或编委。　　长期从事人类遗传学和各类组学的研究，揭开了困扰人类几乎整整一个世纪的有史以来所记载的第一例孟德尔常染色体显性遗传病A-1型短指（趾）症的致病之谜；发现了得到国际公认的第一例以中国人姓氏“贺－赵缺陷”命名的新遗传病并成功对其致病基因进行了定位；发现了怀孕期营养不良的影响可增加胎儿以后的精神分裂症发病率；在中国人群中发现和证实了多个精神疾病易感基因。在所从事领域做出了具有力度、特色和国际影响的开创性工作。　　贺林院士本人先后荣膺：国家杰出青年、国务院津贴、香港“求是”杰出青年、上海科技精英、“何梁何利”、教育部《****奖励计划》特聘教授、第三世界科学院院士、美国国家精神分裂症与抑郁症研究联盟（NARSAD）“杰出研究者”奖、第三世界科学院生物奖等。并且,还获得了教育部科学技术（自然科学）一等奖，上海市科学技术进步一等奖，国家自然科学奖二等奖。
代表性论著
1.BoGao,JianxinHu,SigmarStricker,MartinCheung,GangMa,KitFongLaw,FlorianWitte,JamesBriscoe,StefanMundlos,LinHe*,KathrynS.E.CheahandDannyChan*.AmutationinIHHthatcausesdigitabnormalitiesaltersitssignallingcapacityandrange.Nature2009,(advanceaccesspublishedonline)(IF:32.182,NaturePublishingGroup)2.YongyongShi,GuangHe,ZhaoZhang,WeiTang,JingZhang(Jr),QianZhao,JingZhang(Sr),XingwangLi,ZhengruiXi,ChaoFang,XinzhiZhao,GuoyinFeng,LinHe*.AstudyofrarestructuralvariantsinschizophreniapatientsandnormalcontrolsfromChineseHanpopulation.MolPsychiatry.2008Oct;13(10):911-3.(IF:11.804,NaturePublishingGroup)3.XinzhiZhao,RuqiTang,BoGao,YongyongShi,JianZhou,ShengzhenGuo,JingZhang,YabingWang,WeiTang,JunweiMeng,ShengLi,HongshengWang,GangMa,ChuwenLin,YueXiao,GuoyinFeng,LinZ,ShaominZhu,YanglingXing,HongSang,StClairD,LinHe*.FunctionalVariantsinthePromoterRegionofChitinase3-Like1(CHI3L1)andSusceptibilitytoSchizophrenia.AmJHumGenet.2007Jan;80(1):12-18.(IF:12.649)4.RuqiTang,XinzhiZhao,YongyongShi,WeiTang,NiufanGu,GuoyinFeng,YanglinXing,ShaomingZhu,HongSang,PeijiLiangandLinHe*.Family-basedassociationstudiesofEpsin4andschizophrenia.MolecularPsychiatry.2006.Apr;11(4):395-399(IF:11.804,NaturePublishingGroup)5.XiChen,YifeiWang,QiangLiu,ZhizhouZhang,ChunhaiFan,LinHe*.ConstructionofmolecularlogicgateswithaDNA-cleavingdeoxyribozyme.AngewChemIntEdEngl.2006Mar3;45(11):1759-62.(IF:10.232)
贺新义

导师姓名
贺新义
研究方向DNA异常修饰和限制酶作用的分子机制;肽核苷类抗生素的生物合成
联系方式通讯地址：沪华山路1954号科学馆213室

邮政编码：200030

联系电话：021-62932943-2131

Email：xyhe@sjtu.edu.cn
个人简介

贺新义：博士，上海交通大学微生物代谢国家重点实验室副教授，国家自然科学基金委创新研究群体科学基金项目研究骨干。科研兴趣主要有：1）研究模式链霉菌变铅青链霉菌和天蓝色链霉菌中异常的DNA修饰和限制系统，参与了DNA硫修饰发现的工作，并指导学生发现了第一例能够识别并且切割硫修饰DNA的限制酶；2）核酸前体参与肽核苷类抗生素的次级代谢途径。以第一或通讯作者在PLoSGenet,MolMicrobiol,ApplEnvironMicrobiol,Chembiochem等国际权威学术期刊上发表7篇SCI研究论文，包括Nature主刊在内的其它SCI合作研究论文15篇。申请发明专利6项，实用新型专利2项，授权专利1项。先后主持国家自然科学基金项目3项，参与自然基金委创新群体项目1项，863项目2项，973项目1项，教育部博士点优先发展项目1项。获得2005年中国高校十大科技进展、2009年第15届国际放线菌大会‘StudentForum’分会场中方主席、2010年获得上海交通大学SMC-晨星青年学者奖励计划A类。
代表性论著
15.LiuG,OuHY,WangT,LiL,TanH,ZhouX,RajakumarK,DengZ*,HeX*.CleavageofPhosphorothioatedDNAandMethylatedDNAbytheTypeIVRestrictionEndonucleaseScoMcrA.PLoSGenet.2010Dec23;6(12):e1001253.[Abstract]14.ShaoY,HeX,HarrisonEM,TaiC,OuHY,RajakumarK,DengZ.mGenomeSubtractor:aweb-basedtoolforparallelinsilicosubtractivehybridizationanalysisofmultiplebacterialgenomes.NucleicAcidsRes.2010Jul;38(WebServerissue):W194-200.13.WangJ,YuY,TangK,LiuW,HeX*,HuangX*,DengZ.ApplEnvironMicrobiol.2010Apr;IdentificationandanalysisofthebiosyntheticgeneclusterencodingthethiopeptideantibioticcyclothiazomycininStreptomyceshygroscopicus10-22.76(7):2335-44.Epub2010Feb12.12.HarrisonEM,CarterME,LuckS,OuHY,HeX,DengZ,O'CallaghanC,KadiogluA,RajakumarK.InfectImmun.2010Apr;PathogenicityislandsPAPI-1andPAPI-2contributeindividuallyandsynergisticallytothevirulenceofPseudomonasaeruginosastrainPA14.78(4):1437-46.Epub2010Feb1.11.OuHY,HeX,ShaoY,TaiC,RajakumarK,DengZ.PLoSOne.2009;dndDB:adatabasefocusedonphosphorothioationoftheDNAbackbone.4(4):e5132.Epub2009Apr9.10.ChenW,HuangT,HeX,MengQ,YouD,BaiL,LiJ,WuM,LiR,XieZ,ZhouH,ZhouX,TanH,DengZ.JBiolChem.2009Apr17;CharacterizationofthepolyoxinbiosyntheticgeneclusterfromStreptomycescacaoiandengineeredproductionofpolyoxinH.284(16):10627-38.Epub2009Feb20.9.SunY,HeX,LiangJ,ZhouX,DengZ.ApplMicrobiolBiotechnol.2009Feb;AnalysisoffunctionsinplasmidpHZ1358influencingitsgeneticandstructuralstabilityinStreptomyceslividans1326.82(2):303-10.Epub2008Dec6.8.LiL,XuZ,XuX,WuJ,ZhangY,HeX*,ZabriskieTM,DengZ.Chembiochem.2008May23;Themildiomycinbiosynthesis:initialstepsforsequentialgenerationof5-hydroxymethylcytidine5'-monophosphateand5-hydroxymethylcytosineinStreptoverticilliumrimofaciensZJU5119.9(8):1286-94.7.HeX,OuHY,YuQ,ZhouX,WuJ,LiangJ,ZhangW,RajakumarK,DengZ.MolMicrobiol.2007Aug;AnalysisofagenomicislandhousinggenesforDNAS-modificationsysteminStreptomyceslividans66anditscounterpartsinotherdistantlyrelatedbacteria.65(4):1034-48.Epub2007Jul19.6.OuHY,HeX,HarrisonEM,KulasekaraBR,ThaniAB,KadiogluA,LoryS,HintonJC,BarerMR,DengZ,RajakumarK.NucleicAcidsRes.2007Jul;MobilomeFINDER:web-basedtoolsforinsilicoandexperimentaldiscoveryofbacterialgenomicislands.35(WebServerissue):W97-W104.Epub2007May30.5.LiangJ,WangZ,HeX,LiJ,ZhouX,DengZ.NucleicAcidsRes.2007;DNAmodificationbysulfur:analysisofthesequencerecognitionspecificitysurroundingthemodificationsites.35(9):2944-54.Epub2007Apr16.4.WangL,YuY,HeX,ZhouX,DengZ,ChaterKF,TaoM.JBacteriol.2007Mar;RoleofanFtsK-likeproteiningeneticstabilityinStreptomycescoelicolorA3(2).189(6):2310-8.Epub2007Jan5.3.ZhouX,HeX,LiangJ,LiA,XuT,KieserT,HelmannJD,DengZ.MolMicrobiol.2005Sep;AnovelDNAmodificationbysulphur.57(5):1428-38.2.ZhuD,HeX,ZhouX,DengZ.JBacteriol.2005May;ExpressionofthemelCoperoninseveralStreptomycesstrainsispositivelyregulatedbyAdpA,anAraCfamilytranscriptionalregulatorinvolvedinmorphologicaldevelopmentinStreptomycescoelicolor.187(9):3180-7.1.ZhouX†,HeX†,LiA†,LeiF,KieserT,DengZ.ApplEnvironMicrobiol.2004Dec;StreptomycescoelicolorA3(2)lacksagenomicislandpresentinthechromosomeofStreptomyceslividans66.70(12):7110-8.(并列第一作者)
李保界

导师姓名
李保界
研究方向干细胞与发育;肿瘤学
联系方式通讯地址：上海市东川路880号，上海交大生科院1号楼

邮政编码：200240

联系电话：21-62833148

Email：libj.bio@gmail.com
个人简介

李保界，教育部“****奖励计划”特聘教授，干细胞国家重大科学研究计划首席科学家。1966年9月生；1997获美国纽约AlbertEinsteinCollegeofMedicine细胞生物学博士；于1997-2001在哥伦比亚大学HowardHughesMedicalInstitute(HHMI)作博士后，师从美国科学院院士SteveGoff教授，并获美国HHMI和CancerResearchInstitute博士后基金。2001至2006任新加坡国立分子与细胞生物研究院实验室主任，助理教授。2007年后为资深实验室主任和副教授。于2009年起，任上海交通大学特聘教授。　　现为国际杂志BMCDevelopmentalBiology副主编和其他三种杂志的编委，并作为JCI、PNAS、Blood、HMG、MCB、JBC等审稿人。李保界教授曾获美国骨矿研究协会“事业提升奖”(ASBMR:CareerEnhancementAward，USA)。确立了两个骨骼疏松症的动物模型和一个骨质增生症的模型。共在NatureGenetics、GenesandDevelopment、PNAS、JournalCellBiology，HumanMolecularGenetics，NatureCellBiology,NatureCommunications,Cell等杂志发表50余篇学术文章，在国际上被引用次数>1000次。
代表性论著
1.GangMa,LiliLi,YuanyuHu,BijinAu,LinHeandBaojieLi*(2012).P53repressesSmad1expressionviap21-E2Fpathwaytocontrolmesenchymalstemcelldifferentiation.JMolCellBiol,4(2):118-120.2.JennyChau,YuanyuHu,JianheWang,ZhiLiu,BiJinAu,YujiMishina,Ye-GuangChen,ChristineBiondi,ElizabethRobertson,Yue-ZhengDu,DongXie,XueyingWang,QiangYu,andBaojieLi*(2012).IntegrationofBMPsignalingandAtm-p53pathwayatSmad1inDNAdamageresponseandoncogenesis.NatureCommunications,3:836.3.KengPoLai,WaiFookLeong,JennyFungLingChau,DeyongJia,LiZeng,HuijuanLiu,AijunHao,LinHe,HongbingZhang,DavidMeek,ChakradharVelagapudi,SamyL.Habib,andBaojieLi*(2010).S6K1isamultifacetedregulatorofMdm2thatconnectsnutrientstatusandDNAdamageresponse.EMBOJ.,29(17):2994-3006.4.KuaHY,LiuH,LeongWF,LiL,JiaD,MaG,HuY,WangX,ChauJF,ChenYG,MishinaY,BoastS,YehJ,XiaL,ChenGQ,HeL,GoffSP,andBaojieLi*(2012)c-Ablpromotesosteoblastexpansionbydifferentiallyregulatingcanonicalandnon-canonicalBMPpathwaysandp16(INK4a)expression.NatureCellBiology.14(7):727-375.WangX,GohCH,LiB*.p38MAPKregulateosteoblastdifferentiationthroughosterix.Endocrinology.2007;148(4):1629-1637.6.RasheedN,WangX,NiuQT,YehJ,LiB*.Atmdeficientmice:anosteoporosismodelwithdefectiveosteoblastdifferentiationandincreasedosteoblastogenesis.HumanMolecularGenetics.2006;15(12):1938-1948.7.WangX,KuaHY,HuY,GuoK,ZengQ,WuQ,NgHH,KarsentyG,deCrombruggheB,YehJ,LiB*.p53repressestheexpressionoftranscriptionfactorosterixandfunctionsasanegativeregulatorofosteoblastogenesisandboneformation.J.CellBiol.2006;172:115-125.8.HuY，WangX，ZengL，CaiD，SabapathyK，GoffSP，FirpoEJandLiB*(2005).ERKphosphorylatesp66shcAonSer36andsubsequentlyregulatesp27kip1expressionviatheAkt-FOXO3apathway:implicationofp27kip1incellresponsetooxidativestress.Mol.Biol.Cell.16:3705-3718.9.LiB*,WangX,RasheedN,HuY,BoastS,IshiiT,NakayamaK,NakayamaKI,GoffSP.Distinctrolesforc-AblandAtminPrxIinductionbymodulatingexpressionofproteinkinaseC.GenesandDevelopment.2004;18:1824-1837.10.HuY,ChanE,WangX,andLiB*(2003)Activationofp38MAPKisrequiredforosteoblastdifferentiation.Endocrinology144(5):2068-2074.11.LiB,BoastB,delosSantosK,SchierenI,QuirozM,TeitelbaumSL,TondraviMM,andGoffSP(2000).c-Ablknockoutmiceareosteoporoticandshowdefectsinosteoblastmaturation.NatureGenetics24(3):304-308.*Correspondingauthor
李明发

导师姓名
李明发
研究方向干细胞及相关细胞谱系发育的表观遗传调控;模式动物的发育遗传学
联系方式通讯地址：上海市闵行东川路800号上海交通大学生命学院

邮政编码：200240

联系电话：02134204918

Email：mfli@sjtu.edu.cn
个人简介

李明发,1964年10月生。上海交通大学生命科学技术学院遗传学教授、博士生导师，主持发育遗传学实验室工作。现为美国遗传学会、美国发育生物学会会员，兼任中国细胞生物学学会理事（2007-2015）、《中国细胞生物学学报》编委（2007-2014），为《JournalofProteomeResearch》,《CellResearch》,《MolecularandCellularBiochemistry》等期刊审稿人。1999年获得德国海德堡大学(UniversityofHeidelberg)肿瘤生物学专业博士学位。随后(1999.5-2004.8)在德国国家癌症研究中心(GermanCancerResearchCenter,Heidelberg)、哈佛大学医学院(HarvardMedicalSchool,Boston)从事遗传与发育生物学的博士后研究工作，任Researchfellow。迄今在Nature,Genes&Development,Development,JournalofMolecularBiology,DevelopmentalBiology,CellResearch等国内外著名学术期刊上发表论文二十余篇,论文被引用500余次。主持、完成国家自然科学基金、科技部重大科学研究计划及上海市浦江人才计划等课题多项。曾获省部级科技进步二等奖、(1995)、三等奖(1992,1994)共三项（均排名第三），先后被评为《江苏省高等学校优秀青年骨干教师》(1994)、《江苏省高等学校“青蓝工程”跨世纪学术带头人培养人选》(1996)，2005年入选首届“上海市浦江人才计划”，2012年获得第二届“中国细胞生物学报-CellSignalingTechnology”细胞生物学科学研究优秀人才奖。本实验室以黑腹果蝇（Drosophilamelanogaster）为模式生物体，探讨相关发育过程的遗传及表观遗传调控机理。实验室目前主要开展以下三个方向的研究：1．干细胞及相关细胞谱系发育的遗传与表观遗传调控：研究发育卵巢组织中两大细胞谱系-生殖细胞和成体滤泡细胞的分化发育的遗传及表观遗传调控机理。具体探究生殖干细胞/成体干细胞的自我更新及分化、生殖细胞/滤泡细胞的谱系发育、滤泡上皮组织的体轴模式建成/形态发生、卵母细胞与滤泡细胞的双向信号交流机制等。致力于发现和鉴定新的重要功能基因、细胞命运决定因子及表观遗传调控因子等2．成虫盘组织发育：探讨其中上皮细胞顶底极性建立与维持的机理、细胞增殖、组织生长、成虫盘组织的头尾及背腹模式建成的信号机制以及可能的表观遗传调控方式。3．JNK信号通路：筛选、鉴定新的JNK信号通路的调节因子/效应因子，探讨其发育生物学功能及其调节JNK信号通路活性的分子机理，丰富对JNK信号通路调控网络及其作用机制的认识热忱欢迎对细胞及发育生物学基础研究有浓厚兴趣，有良好的科学素养、优良的意志品质和团队协作精神、并有志于将来从事这方面工作的同学报考我们实验室！
代表性论著
1.Xuan,T.,Xin,T.,He,J.,Tan,J.,Gao,Y.,Feng,S.,He,L.,Zhao,G.,Li,M*.dBre1/dSet1-dependentpathwayforhistoneH3K4trimethylationhasessentialrolesincontrollinggermlinestemcellmaintenanceandgermcelldifferentiationintheDrosophilaovary.DevelopmentalBiology.2013,379:167-1812.Li,Q.,Feng,S.,Yu,L.,Zhao,G.,Li,M*.RequirementsofLglincelldifferentiationandmotilityduringDrosophilaovarianfollicularepitheliummorphogenesis.Fly(Austin),2011,5:81-873.Zhu,M.,Xin,T.,Weng,S.,Gao,Y.,Zhang,Y.,Li,Q.,Li,M*.ActivationofJNKsignalinglinkslglmutationstodisruptionofthecellpolarityandepithelialorganizationinDrosophilaimaginaldiscs.CellResearch,2010,20:242-2454.Li,Q.,Shen,L.,Xin,T.,Xiang,W.,Chen,W.,Gao,Y.,Zhu,M.,Yu,LandLi,M*.RoleofScribandDlginanterior-posteriorpatterningofthefollicularepitheliumduringDrosophilaoogenesis.BMCDevelopmentalBiology.2009,9:60(1-15)5.Miles,WO.,Jaffray,E.,Campbell,SG.,Takeda,S.,Bayston,LG.,Basu,SP.,Li,M.,Raftery,LA.,Ashe,MP.,Hay,RT.,andAshe,HL.MedeaSUMOylationrestrictsthesignalingrangeoftheDppmorphogenintheDrosophilaembryo.Genes&Development.2008,22(18):2578-2590.6.Li,Q.,Xin,T.,Chen,W.,Zhu,M.,andLi,M*.Lethal(2)giantlarvaeisrequiredinthefolliclecellsforformationoftheinitialAPasymmetryandtheoocytepolarityduringDrosophilaoogenesis.CellResearch.2008,18:372-384.(Thispaperisthecoverstoryontheissue)。7.Alone,DP.,Tiwari,AK.,Mandal,L.,Li,M.,Mechler,BM,andRoy,JK.Rab11isrequiredduringDrosophilaeyedevelopment.InternationalJournalofDevelopmentalBiology.2005,49:873-79.8.Sutherland,DJ.,Li,M.,Liu,X.,Stefancsik,R.,andRaftery,LA.StepwiseformationofaSmadactivitygradientduringdorsal-ventralpatterningoftheDrosophilaembryo.Development.2003,130:5705-5716.9.Mao,B.,Wu,W.,Davidson,G.,Marhold,J.,Li,M.,Mechler,BM.,Delins,H.,Hoppe,D.,Stannek,P.,Glink,A.,andNiehrs,C.KremensarenovelDickkopfreceptorsthatregulateWntsignaling.Nature.2002,417;664-667.10.Li,M.,Marhold,J.,Gato,A.,Toeroek,I.,andMechler,BM.DifferentialexpressionoftwoscribbleisoformsduringDrosophilaembryogenesis.MechanismsofDevelopment.2001,108:185-190.11.Li,M.,Strand,D.,Krehan,A.,Pyerin,W.,Neumann,B.,andMechler,BM.Caseinkinase2bindsandphosphorylatesthenucleosomeassemblyprotein-1(NAP1)inDrosophilamelanogaster.JournalofMolecularBiology.1999,293:1067-1084.
李荣秀

导师姓名
李荣秀
研究方向生物制药纯化过程科学;创新生物药设计研究
联系方式通讯地址：东川路800号生物楼4-405

邮政编码：200240

联系电话：021-34205517

Email：rxli@sjtu.edu.cn
个人简介

一、学习及工作简历男，1962年2月生。教授，博士生导师。1985年清华大学化学与化学工程系学士；1988年中国科学院上海生物化学研究所硕士；1991-1994剑桥大学(UniversityofCambridge)生物技术博士；1988－1991北京大学生物系讲师；1995－1997剑桥大学(UniversityofCambridge)生物技术博士后；1997－2003中国科学院生物工程研究中心研究员；1998年入选中国科学院“百人计划”。2003至今为上海交通大学生命科学技术学院生物工程系教授。二、主要研究领域和方向(1)生物工程产品规模化制备新技术研究：天然和基因重组蛋白和多肽，天然和生物组合生物活性化合物在提高人类健康和生活品质方面具有重要作用。目前高收率、低成本大规模生产纯化技术水平是重要的技术瓶颈。本研究方向研究和发展基于分子识别科学的亲和分离方法及涉及的科学问题。研究内容包括生物分子三维结构结构测定与模拟，结合靶点筛选与评估，亲和配体分子设计，组合化学合成，分子相互作用研究，分离纯化工艺研究，以及中试生产研究;(2)疾病相关生物标志物筛选：细胞或组织中的一些重要生物活性蛋白，如基因转录、翻译的调控蛋白、疾病标志物的表达量一般都非常低，与高丰度蛋白(如部分housekeepinggene等)的浓度差可高达1010倍以上，远超过目前研究方法和仪器所能达到的灵敏度及检测范围。本方向主要研究化学生物学理论和方法，具有不同识别和结合性能的仿生亲和分离系统简化生物样品中蛋白质的复杂性的解决方法及涉及的科学问题；(3)癌症治疗新方法和治疗性癌症疫苗研发：癌症是至少700种疾病的统称，癌症组织生物学特征具有高度复杂性、多样性、和可变性：肿瘤细胞在快速进化，基因水平上可分叉平行突变，形成异质性和进化出更恶性的特征，肿瘤的发生、发展是遗传、环境和免疫共同作用的结果。本方向以系统性主动免疫预防和治疗癌症为目标，用系统性长期持续抑制其中的关键癌症保护或促进因子，阐明肿瘤-免疫系统互动规律；以工程的思想战略集成和整合肿瘤免疫领域已有的研究数据，针对肿瘤-免疫既是对立的两面又是互动统一的系统，挑选对该系统具有抑制和增强效应的因子(细胞和分子靶点)，用主动免疫能够实现长期持续抑制靶点功能的手段，用DOE（DesignofExperiment试验设计）设计多因子联合干预，研究临床治疗后复发肿瘤和免疫系统的互动规律，探索系统性主动免疫治疗癌症的新型医疗技术、研发癌症治疗性疫苗新药。有别于目前肿瘤免疫领域所流行的选定单因子深入研究信号网络，以追求发表高影响力论文为首要目标的研究模式。具有现实可行性和应用价值。三、近期主要研究课题(1)国家重大新药创制科技专项：生物技术新药中试放大及分离纯化技术平台；IL-6和TNF靶向治疗性疫苗研究(2)国家蛋白类生物药和疫苗发展专项项目(3)重大新药创制科技专项：上海市配套项目；四、获得荣誉1990年：获国家教育委员会科学技术进步二等奖。1997年：入选上海市启明星人才计划1998年：入选中国科学院“百人计划”1998年：享受国务院有突出贡献专家的政府特殊津贴2012年：入选上海市优秀技术带头人五、有关科技机构、科技计划项目等任职情况(1).中国药学会第五、六、七界生化与生物技术药物专业委员会委员(2).十一五国家科技重大专项-重大新药创制项目评审专家(3).国家自然基金项目评审专家
代表性论著
一、代表性论文(1).Li,Rongxiu*,DowdV,StewartDJ,BurtonSJ,LoweCR.，Design,SynthesisandApplicationofanArtificialProteinA，NatureBiotechnology.(1998)16,190-195(2).XizhiShi,AiboWu,GuorunQu,RongxiuLi,DabingZhang，Developmentandcharacterisationofmolecularlyimprintedpolymersbasedonmethacrylicacidforselectiverecognitionofdrugs，Biomaterials，(2007)28，3741–3749；(3).TanQQ,DongDX,YeL,LiRX，CombinedusageofcascadeaffinityfractionationandLC-MS/MSfortheproteomicsofadultmousetestis.J.Sep.Sci.(2009)32,1–9.(IF2008=2.746)。(4).QingqiaoTan,DexianDong,LongYe,ChenxiHuo,FeiyunHuangandRongxiuLi,Pre-fractionationofratlivercytosolproteinspriortomassspectrometry-basedproteomicanalysisusingtandembiomimeticaffinitychromatography,JournalofMolecularrecognition(2010)23,93-100(F2009=2.776)。(5).HongyanYao,TianZhang,HongweiXue,KexuanTang,RongxiuLi,BiomimeticaffinitypurificationofCandidaantarcticalipaseB.JChromatogrBAnalytTechnolBiomedLifeSci.2011Nov4.InPress,CorrectedProof,IF(2010)=2.97二、授权发明专利:(1).利血平分子印迹聚合物的制备方法；专利号：ZL200610026662.1(2).分子印迹固相萃取小柱制备方法；专利号：ZL200610023904.1(3).降纤酶的亲和分离材料和降纤酶的亲和纯化方法　专利号：ZL200610028636.2(4).内切木聚糖酶的仿生亲和纯化方法　专利号：ZL200810036158(5).天然精氨酸酯酶的制备方法及其药物组合物　专利号：ZL200710037286.0　(6).脂肪酶的仿生亲和纯化方法　专利号：ZL200610119253.6(7).白介素I天然拮抗剂的仿生亲和纯化方法　专利号：ZL200510030655.4(8).卵黄免疫球蛋白的仿生亲和纯化方法　专利号：ZL200510030657.3(9).纤溶酶原激活剂的仿生亲和纯化方法　专利号：ZL200510030656.9(10).新的眼镜蛇神经毒素亲和层析介质和纯化方法　　专利号：ZL00115402.8(11).分子表面印迹聚合物的制备方法　专利号：ZL200410084542.8(12).一种新的亲和介质和用该介质纯化白蛋白的方法　专利号：ZL　99124061.8三、申请发明专利：(1).蛋白A的亲和分离材料及应用，中国专利申请号：201110087262.2(2).吩嗪-1-羧酸系列衍生物及其制备方法，中国专利申请号：201010509746.7(3).利用亲和柱分析全蛋白的方法，200910307795.X(4).PROCESSFORDIFFERENTIALPOLYPEPTIDESDETECTIONANDUSESTHEREOF，U.S.PatentApplicationNo.12/784,627，filedonMay21,2010；(5).PROCESSFORDIFFERENTIALPOLYPEPTIDESDETECTIONANDUSESTHEREOF，(6).AFFINITYMATRIXLIBRARYANDITSUSE，U.S.PatentApplicationNo.12/402,272，filedonMarch11,2009；
李卫东

导师姓名
李卫东
研究方向神经精神疾病的模式生物学;神经精神疾病的干细胞研究
联系方式通讯地址：上海市闵行区东川路800号生命药学楼1号楼209室

邮政编码：200240

联系电话：021-34205687

Email：weidong76@gmail.com
个人简介

李卫东上海交通大学特别研究员,上海市高校特聘教授（东方学者），Bio-X研究院/教育部重点实验室（遗传发育与精神神经疾病）精神行为动物模型研究组组长，国家973计划、自然科学基金等课题负责人。主要从事神经精神疾病的基因模式生物学研究。曾获UCLA最佳博士后研究校董奖（2006年）、两届美国国家精神分裂症及抑郁症研究联盟(NARSAD)青年研究者奖（2005-2007年、2007-2009年）、美国儿童肿瘤基金会(CTF)青年研究者奖（2008-2010年）、上海市“曙光学者”（2010年）、上海市“浦江人才”（2011年）。工作、学习经历：学士(1990-1996)中国医科大学博士(1997-2001)日本信州大学医学部非常勤讲师(2001-2002)日本信州大学医学部博士后(2002-2007)美国加州大学洛杉矶分校助理研究员（2007-2010）美国加州大学洛杉矶分校特别研究员(2009-)上海交通大学研究兴趣：神经科学是对现代生物学及医学研究的最大挑战之一。近几十年来科学研究对脑功能及精神神经疾病的认识取得了日新月异的进步，推动了人类认识自我，治疗精神神经疾病的能力。但记忆的形成、存储及提取机制仍然是人体中最大的未解之谜。同时精神及神经疾患在我国的疾病社会总负担中已位居首位，这主要是因为我们对很多精神及神经疾患的发病机理还不清楚，以至于没有很好的有效治疗手段。而对于疾病机理的深入研究及开发新药，动物模型的建立和研究往往是至关重要的。本课题组以基因敲除、转基因、病毒载体脑区定位注入等小鼠模型为实验平台，从基因水平、蛋白质水平、细胞水平、神经网络、认知行为学等多层次深入研究精神及神经疾患的发病机理和探索治疗方法，并研究学习、记忆的分子机制。研究方向：1.利用可诱导的DISC1转基因小鼠及DISC1特异shRNAknockdown病毒脑区定位注入实验揭示DISC1基因功能障碍所导致的神经发育及行为改变，揭示DISC1基因、神经发育及成年神经新生在精神分裂症及抑郁症发病机制中的作用。2.制备及研究其他精神分裂症和抑郁症易感基因敲除或转基因的小鼠模型，制备环境因素及表观遗传学因素的小鼠模型，研究精神分裂症及抑郁症的发病机制。3.利用NF1基因敲除小鼠模型揭示神经纤维瘤中NF1基因缺失造成的学习、记忆、注意力、社交能力缺陷的分子机制以及对多动症、自闭症发病的影响机制，并且探索该病的治疗手段。4.制备或引入重大神经精神疾病小鼠模型，如自闭症、老年痴呆症（阿尔茨海默病）、帕金森氏病、结节性硬化症、神经胶质瘤等，研究相关疾病的分子发病机制并且探索治疗方法。5.利用CREB、CaMKII、FosGFP等小鼠模型研究学习、记忆的分子机制。6.神经干细胞在学习、记忆以及精神神经疾病中的作用与机制
代表性论著
1)ZhouM#,LiW*＃,HuangS,SongJ,KimJY,TianX,KangE,SanoY,LiuC,J.Balaji,WuS,ZhouY,ZhouY,ParivashSN,EhningerD,HeL,SongH,MingG-L,SilvaAJ*.mTORInhibitionAmelioratesCognitiveandAffectiveDeficitsCausedbyDisc1KnockdowninAdult-BornDentateGranuleNeurons,Neuron,20;77(4):647-754,2013Feb（#并列第一作者　*共同通讯作者）2)LiW*＃,ZhouY#,TianX#,KimT,ItoN,WatanabeK,TsujiA,NiimiK,AoyamaY,AraiT,TakahashiE*,Newataxictottering-6jmouseallelecontainingaCacna1agenemutation,PLoSONE,7(8):e44230,2012Aug（#并列第一作者　*共同通讯作者）3)YuanA,YiZ,SunJ,DuY,YuT,ZhangC,LiuY,ZhouY,LiuD,LiH,XuY,ChengZ,LiW*,YuS*.EffectofSOX10genepolymorphismonearlyonsetschizophreniainChineseHanpopulation，NeurosciLett,521(2):93-7，2012Jul19（*共同通讯作者）4)EhningerD,LiW,FoxK,StrykerM.P,SilvaA.J,Reversingneurodevelopmentaldisordersinadults,Neuron,60(6):950-960,2008Dec265)LiW,ZhouY,JentschJ.D,EhningerD,BrownR.A.M,TianX,HennahW,PeltonenL,LönnqvistJ,HuttunenM.O,KaprioJ,TrachtenbergJ.T,SilvaA.J,CannonT.D.,Specificdevelopmentaldisruptionofdisrupted-in-schizophrenia-1functionresultsinschizophrenia-relatedphenotypesinmice,PNAS,104(46):18280-18285,2007Nov136)LiW,YCui,KushnerS.A,BrownR.A.M,FranklandP.W,JentschJ.D,CannonT.D,SilvaA.J，TheHMG-CoAreductaseinhibitor,lovastatin,reversesthelearningandattentiondeficitsinamousemodelofNeurofibromatosisType1.，CurrBiol.,15(21),pp1961-1967,2005/11/87)LiW,OkanoA,TianQB,NakayamaK,FurihataT,NawaH,SuzukiT.，CharacterizationofanovelsynGAPisoform,synGAP-beta.，JBiolChem.,276((24)),pp21417-21424,2001/6/15
李亦学

导师姓名
李亦学
研究方向生物信息学;计算系统生物学
联系方式通讯地址：上海市徐汇区岳阳路320号，细胞大楼306，邮编：200031

邮政编码：200235

联系电话：13916378087

Email：yxli@sibs.ac.cn
个人简介

李亦学，男，1955年11月出生，博士，上海交通大学生命技术学院生物信息学与生物统计学系主任，教授，博士生导师，中科院上海生命科学研究院系统生物学重点实验室副主任,研究员，博士生导师，上海生物信息技术研究中心主任，现为国家“十一五”863生物医药技术领域专家组专家，中科院“十一五”信息化专家组专家，国家自然科学基金委员会生命科学部自然科学基金专职评审专家，上海市公共研发服务平台建设专家委员会主任。曾任国家中长期发展规划第十五专题组副组长，上海市2002年科学预见专家，中国科学院计划局生命科学领域战略发展专家组专家，国家“十五”863计划生物和农业技术领域生物信息技术主题专家组组长，国家科技部中英E-Science国际合作计划中方协调人。1982年2月获新疆大学获物理学学士学位，1987年10月获新疆大学获理论物理学硕士学位，1996年10月获德国海德堡大学理论物理研究所理论物理博士学位。1996年11月至1997年3月在德国斯图加特大学数学系第三计算机应用研究所从事计算数学博士后研究。1997年4月至2000年6月在欧洲分子生物学实验室（EMBL）从事生物物理博士后研究。2000年7月回国到中科院上海生命科学研究院生物信息中心工作，任常务副主任，2002年任主任，2002年6月任上海生物信息技术研究中心主任，2006年12月任中科院系统生物学重点实验室副主任。先后获教育部自然科学一等奖，排名第五；获上海市自然科学二等奖，排名第一；获得上海市科教兴市领军人才称号；获得上海市优秀学科带头人称号；上海市劳动模范；全国五一国际劳动奖章获得者；享受国务院特殊津贴。2000年回国后，承担了国家“九五”863计划生物技术领域《生物信息学数据库开发和建设》重大项目。作为首席科学家主持了中科院《生物信息学重大基础理论与应用》重大研究项目；承担国家973《重大疾病相关蛋白质组学生物信息学》子课题项目；主持了上海市科教兴市重大产业化“一网两库”项目，目前是国家基础科学研究计划蛋白质科学研究重大专项《模式生物和细胞等功能系统的系统生物学研究》专题项目首席科学家。德国JournalofIntegrativeBioinformatics杂志编辑，英国BMCBioinformatics杂志责任编辑,国内《科学通报》特邀编辑，生物物理和生物化学学报、中国生物工程杂志以及Genomics,ProteomicsandBioinformatics，THEOPENPROTEOMICSJOURNAL等杂志编委。共发表200余篇科学论文。发表论文包括Science,NatureGenetics,NatureBiotechnology,NatureCommunications,PNAS,Diabetes,MolecularandCellularProteomics,GenomeBiology,Oncogene,MolecularSystemsBiology,PlosComputationalBiology,PlosOne,NAR,Bioinformatics，BMCBioinfomatics,BMCGenomics,BBRC,FEBSLetter等。总影响因子超过800，H因子33。李亦学教授的研究兴趣覆盖了生物信息学、系统生物学研究的广泛领域，在比较基因组学、转录组学、蛋白质组学、系统建模、疾病生物标志物识别、蛋白质相互作用、基因调控网络构建等方面的研究都有很好的建树，回国九年来，培养了数十名优秀的硕士、博士研究生和博士后研究人员，不少学生目前都在国外著名的实验室和大学里工作，有的在国内重要科研单位、大学和世界500强大企业的研发中心工作，不少学生在他们的工作岗位上也取得了优异的科研成果。
代表性论著
1.GuohuiDing，ZhenWang,…,YixueLi*,HeMeng*,2012,Genomesequencesofthewildanddomesticbactriancamels,acceptedbyNatureCommunications.(共同通讯作者)2.HongLi,XiaobingXing,GuohuiDinproteomicg,LuXie*,RongZeng*,YixueLi*,SysPTM-asystematicresourceforresearchofpost-translationalmodifications,MolecularandCellularProteomics.2009,8(8):1839-49.（通讯作者）3.Ruo-YuLuo,Hai-BinWei,LinYe,KankanWang,LeiLiu,Yuan-YuanLi,Yi-XueLi*andYangZhong*,PhotosyntheticmetabolismofC3plantsshowshighlycooperativeregulationtomaintainfunctionunderchangingenvironmentalconditions:asystemsbiologicalanalysisofrobustness,ProcNatlAcadSciUSA.,2009,vol.106no.3847-852.（共同通讯作者）4.RuoyuLuo,ShaLiao,GuanyangTao,YuanyuanLi,YixueLi*,QingmingLuo*.2006,Dynamicanalysisofoptimalityinmyocardialmetabolicnetworkundernormalandischemicconditions,MolecularSystemsBiology,2:2006.0031.（共同通讯作者）5.PeiHao,…,YixueLi*，GuopingZhao*,2005,Cross-hostevolutionofSARScoronavirusinpalmcivetandhuman,ProcNatlAcadSciUSA.102(7)，2430–2435.（共同通讯作者）6.WangZ,DingG,GeistlingerL,LiH,LiuL,ZengR,TatenoY,LiY*.Evolutionofproteinphosphorylationfordistinctfunctionalmodulesinvertebrategenomes.MolBiolEvol.2011Mar;28(3):1131-40.(通讯作者)
李志勇

导师姓名
李志勇
研究方向海洋共生微生物种群结构与功能;海洋共生微生物代谢产物与生物合成
联系方式通讯地址：上海东川路800号上海交大生命学院

邮政编码：200240

联系电话：02134204036

Email：zyli@sjtu.edu.cn
个人简介

上海交通大学生命科学技术学院生物工程系教授，博士生导师。教育部新世纪优秀人才，上海市青年科技启明星，上海市高校优秀青年教师。海洋生物技术研究室负责人。2007年12月至2008年12月美国加州大学圣地亚哥分校（UCSD）ScrippsInstitutionofOceanography海洋生物技术与生物医药中心访问学者。BlueBiotechnologyJournal（USA，海洋生物技术杂志）编委、中国海洋药物杂志编委。中国生物化学与分子生物学会海洋生化与分子生物学分会理事；中国微生物学会海洋微生物专业委员会委员；上海市微生物学会海洋微生物专业委员会（筹）副主任；中华医学会航海医学分会的海洋生物工程专业委员会委员、海洋微生物与分子生物学专业委员会委员；上海市药学会海洋药物专业委员会委员。研究方向为海洋共生微生物，重点从环境基因组、分子生态、功能基因（簇）、次生代谢产物、酶等方面全面、深入地开展海绵、珊瑚共生微生物的研究。近年来主持1项973课题、3项国家863项目、2项国家自然基金项目，以及多项教育部、上海市科委、上海市教委课题，以第一作者或通讯作者在国际知名期刊PLoSONE,JBacteriology,ScientificReports,FungalDiversity,MarineBiotechnology,BioresourceTechnology,MicrobialEcology,ProcessBiochemistry等上发表研究论文30多篇，SCI论文他引300多次。参编国际专著2章节。已授权专利8项，公开专利6项。创建并负责国家级精品课程“细胞工程”。主编出版高校教材6部。
代表性论著
【1】Sun,W.,Peng,C.,Zhao,Y.,Li,Z.*Functionalgene-guideddiscoveryoftypeIIpolyketidesfromculturableactinomycetesassociatedwithsoftcoralScleronephthyasp.PLoSONE.2012,7:e42847.【2】Yang,Z.,Li,Z.*Spatialdistributionofprokaryoticsymbiontsandammoxidation,denitrifierbacteriainmarinespongeAstrosclerawilleyana.ScientificReports.2012,2:528.【3】Liu,F.,Sun,W.,Su,F.,Zhou,K.,Li,Z.*Draftgenomesequenceofthesponge-associatedBacillusatrophaeusC89,apotentialproducerofmarinedrugs.JournalofBacteriology.2012,194:4454.【4】Zhou,K.,Zhang,X.,Zhang,F.L.,Li,Z.Y*.Phylogeneticallydiversecultivablefungalcommunityandpolyketidesynthase(PKS),non-ribosomalpeptidesynthase(NRPS)genesassociatedwiththeSouthChinaSeasponges.MicrobialEcology.2011,62:644-654.【5】Yu,Z.,Zhang,B.,Sun,W.,Zhang,F.,Li,Z.*PhylogeneticallydiverseendozoicfungiintheSouthChinaSeaspongesandtheirpotentialinsynthesizingbioactivenaturalproductssuggestedbyPKSgeneandcytotoxicactivityanalysis.FungalDiveristy2012,DOI10.1007/s13225-012-0192-7.online.【6】Liu,F.,Han,M.Q.,Zhang,F.L.,Li,Z.Y.*DistributionandabundanceofarchaeainSouthChinaSeaspongeHoloxeasp.andthepresenceofammonia-oxidizingarchaeainspongecells.Evidence-BasedComplementaryandAlternativeMedicine.2011,doi:10.1155/2011/723696.【7】Jin,L.J.,Ma,W.,Peng,C.S,,Yin,Y.,Xu,B.L.,Zhang,F.L.,Guo,Y.W.,Li,Z.Y*.BacillamideCproductionbytheoptimizedcultivationoftheBacillusatrophaeusstrainC89associatedwiththeSouthChinaSeaspongeDysideaavara.ProcessBiochemistry.2011,46:1153-1159.【8】Han,M.,He,L.,Lin,H.,Li,Z.*2012.BacterialandarchaealsymbiontsintheSouthChinaSeaspongePhakelliafusca:Communitystructure,relativeabundance,andammonia-oxidizingpopulations.MarineBiotechnology.14:701-713.【9】Ding,B,Yin,Y,Zhang,F,Li,Z*.2010.RecoveryandphylogeneticdiversityofculturablefungiassociatedwithmarinespongesClathrinaluteoculcitellaandHoloxeasp.intheSouthChinaSea.MarineBiotechnology.13:713-721.【10】Han,Y,Yang,B,Zhang,F,Miao,X,Li,Z*.2009.CharacterizationofantifungalchitinasefrommarineStreptomycessp.DA11associatedwithSouthChinaSeaspongeCraniellaaustraliensis.MarineBiotechnology.11:132-140.【11】Zhang,W,Li,Z*,Miao,X,Zhang,F.2009.Thescreeningofantimicrobialbacteriawithdiversenovelnonribosomalpeptidesynthetase(NRPS)genesfromSouthChinaSeasponges.MarineBiotechnology.11:346-355.【12】Li,Z.2009.AdvancesinmarinemicrobialsymbiontsintheChinaSeaandrelatedpharmaceuticalmetabolites.MarineDrugs.7:113-129.【13】Li,Z.Y.*,He,L.M.Wu,J.,Jiang,Q.BacterialcommunitydiversityassociatedwithfourmarinespongesfromtheSouthChinaSeabasedon16SrDNA-DGGEfingerprinting.JournalofExperimentalMarineBiologyandEcology.2006,329:75-85.【14】Li,Z*,Guo,S,Li,L,Cai,M.2007.EffectofmagneticfieldonthegrowthandnutritioncompositionofSpirulinaplatensis.BioresourceTechnology.98:700-705.【15】Li,Z*,Guo,S,Li,L.2003.BioeffectsofseleniteonthegrowthofSpirulinaplatensisanditsbio-transformation.BioresourceTechnology.89:171-176.*Correspondingauthor
梁婉琪

导师姓名
梁婉琪
研究方向植物发育生物学;植物表观遗传学
联系方式通讯地址：东川路800号上海交通大学生物药学楼2-503

邮政编码：200240

联系电话：021-34205073

Email：wqliang@sjtu.edu.cn
个人简介

梁婉琪，女，博士，上海交通大学生命科学与技术学院副教授。现阶段主要从事水稻生殖发育、表观遗传调控方面的研究工作。自1998年以来一直从事植物分子生物学和农业生物技术研究，包括生物反应器、水稻分子标记辅助育种、水稻功能基因组研究等。期间曾主持或参与多项国家和地方的科研项目，如上海市科委基础研究重点项目“基因沉默的分子基础研究”、国家科技部863计划“控制水稻花粉育性的淀粉合成及代谢途径解析”、国家自然基金项目“拟南芥中MIR168a/b基因的表达调控研究”、国家转基因重大专项“一个新的水稻温敏核不育主效基因的克隆和功能验证”等。在近十年间，与所在研究小组的其他成员一起分离了十多个水稻生殖发育阶段的关键基因，以第一作者身份在PlantCell等期刊上发表多篇高质量研究论文。这些研究工作阐明了水稻生殖发育过程中，花序形态建成、花器官形态建成及数目控制、花药和花粉发育等过程的一些关键步骤的分子机理。作为主要完成人之一的研究成果“主要转基因农产品定性定量检测技术研究”获2004年上海市科学技术进步一等奖，“利用转基因马铃薯研制口蹄疫基因工程亚单位疫苗”2006年获宁夏回族自治区科学进步奖一等奖，2008年获上海交通大学“晨星学者”称号。
代表性论著
1.HuLF,LiangWQ(co-firstauthor),YinCS,CuiX,ZongJ,WangX,HuJPandZhangDB,ThePlantCell.2011,23:515-5332.ZhangH,LiangWQ(co-firstauthor),YuanXJ,LuoX,JiangN,MaHongandZhangDB.ThePlantCell,2010,22:672-6893.LiHF,LiangWQ(co-firstauthor),JiaRD,YinCS,ZongJ,KongHZ,ZhangDB*.CellRes.2010,20:299-313.4.GaoXC,LiangWQ(co-firstauthor),YinCS,JiSM,WangHM,SuX,GuoCC,KongHZ,XueHW,ZhangDB.PlantPhysiol,2010,153:728-740.5.HuifengShen,BingjunQian,WeiweiChen,ZhenhuaLiu,LitaoYang,DabingZhangandWanqiLiang*(correspondingauthor)ActaBiochimBiophysSin,2010,42(8):558-567.6.DashengZhang,WanqiLiang(co-firstauthor),ChangsongYin,JieZong,FangweiGuandDabingZhang.PlantPhysiol,2010,154:149-162.7.ZhangDS,LiangWQ(co-firstauthor),YuanZ,LiN,ShiJ,WangJ,LiuYM,YuWJandZhangDB.MolecularPlant20081(4):599-610.8.LiangWQ,HuangYH,YangXH,ZhouZA,PanAH,QianBJ,HuangC,ChenJX,ZhangDB.FEMSImmunology&MedicalMicrobiol.2006,46:393-399.
林双君

导师姓名
林双君
研究方向微生物天然产物;化学生物学
联系方式通讯地址：上海市徐汇区番禺路869弄

邮政编码：200030

联系电话：021-62932943-2052;34206722

Email：linsj@sjtu.edu.cn
个人简介

null
代表性论著
null
刘建华

导师姓名
刘建华
研究方向基因表达与调控;微生物基因组工程
联系方式通讯地址：上海市东川路800号生物楼2-203室

邮政编码：200240

联系电话：021-54743192

Email：jianhualiudl@sjtu.edu.cn
个人简介

男，1962年10月生，上海交通大学生命科学技术学院教授，博士生导师。1982年毕业于武汉大学生物系，1989年毕业于中国科学院上海生物化学研究所并获得博士学位，1990年-1993年在美国加州大学欧文分校（UCIrvine）医学院生化系做博士后。1994年-1998年任中科院上海生命科学研究中心副研究员、真核基因表达调控研究组组长。98年至今任上海交通大学生命科学技术学院教授、博士生导师、基因芯片研究室主任。主要开展蛋白质结构与功能，基因表达与调控研究。
代表性论著
1.HuiYuan,Xi-PengLiu,ZhongHan,ThorstenAllers,Jing-LiHouandJian-HuaLiu,RecJ-likeproteinfromPyrococcusfuriosushas3'–5'exonucleaseactivityonRNA:implicationsforproofreadingof3'-mismatchedRNAprimersinDNAreplication.NucleicAcidsResearch,2013,1–10.doi:10.1093/nar/gkt2752.Juan-JuanXie,Xi-PengLiu,ZhongHan,HuiYuan,YouWang,Jing-LiHou,Jian-HuaLiu.ChlamydophilapneumoniaeendonucleaseIVpreferstoremovemismatched3'-ribonucleotides:Implicationinproofreadingmismatched3'-terminalnucleotidesinshort-patchrepairsynthesis.DNARepair12(2013)140–147.3.LuZheng,LiangRubing,LiuXipeng,HouJingli,LiuJianhua.RNaseHIIIfromChlamydophilapneumoniaecanefficientlycleavedouble-strandedDNAcarryingachimericribonucleotideinthepresenceofmanganese.MolMicrobiol.2012Mar;83(5):1080-93.
马小京

导师姓名
马小京
研究方向免疫;肿瘤免疫与自身免疫
联系方式通讯地址：上海交通大学生命科学技术学院

邮政编码：200240

联系电话：null

Email：xim2002@sjtu.edu.cn
个人简介

null
代表性论著
null
欧竑宇

导师姓名
欧竑宇
研究方向微生物基因组学;生物信息学
联系方式通讯地址：上海市华山路1954号上海交通大学哲生馆(原科学馆)213室

邮政编码：200030

联系电话：021-62933765*2132

Email：hyou@sjtu.edu.cn
个人简介

欧竑宇，博士，微生物学教授。1997年毕业于南京农业大学食品工程专业，获得学士学位；2001年于天津科技大学发酵工程专业获得硕士学位，师从贾士儒教授；2004年于天津大学物理系获得生物信息学博士学位，师从张春霆教授；随后在英国莱斯特大学医学院担任为期两年的细菌基因组学博士后研究助理。2006年到上海交通大学生命科学技术学院任教至今。现从事微生物基因组学和生物信息学研究，主要包括(i)耐药条件致病菌可移动遗传元件的功能解析,(ii)链霉菌基因组比较分析和抗生素生物合成基因簇的识别,(iii)以微生物学问题为导向的生物信息学应用研究。已发表SCI论文三十余篇，引用达一千多次，发表在NucleicAcidsResearch(9篇)、PLoSGenetics、MolecularMicrobiology、JournalofBacteriology、JournalofMolecularDiagnostics、JournalofMicrobiologicalMethods、CurrentMicrobiology、Int.J.Biochem.CellBiol.、FEBSLetters、BioorganicChemistry、PloSONE等国际生物学杂志上。近年来主持国家“863”计划项目、国家自然科学基金项目多项。2007年入选上海市“青年科技启明星计划”；2008年获“明治乳业生命科学奖”；2010年入选教育部“新世纪优秀人才资助计划”；2009年入选上海交通大学晨星青计划SMC优秀青年教师(A类)，2012年获跟踪支持。
代表性论著
更多论文信息请参考研究小组网站,http://bioinfo-mml.sjtu.edu.cn/(14)D.Bi,Z.Xu,E.Harrison,C.Tai,Y.Wei,X.He,S.Jia,Z.Deng.,K.Rajakumar*andH.Y.Ou*(2012)ICEberg:aweb-basedresourceforintegrativeandconjugativeelementsfoundinBacteria.NucleicAcidsResearch,40,D621-D626.(13)J.Li,X.Qu,X.He,L.Duan,G.Wu,D.Bi,Z.Deng,W.Liu*,H.Y.Ou*(2012)ThioFinder:aweb-basedtoolfortheidentificationofthiopeptidegeneclustersinDNAsequences.PloSONE,7,e45878.(12)C.Zhao,P.Li,Z.Deng,H.Y.Ou*,R.P.McGlinchey,D.O'Hagan*(2012)InsightsintofluorometabolitebiosynthesisinStreptomycescattleyaDSM46488throughknockoutmutants.BioorganicChemistry,44,1-7.(11)P.Liu,P.Li,X.Jiang,D.Bi,Y.Xie,C.Tai,Z.Deng,andH.Y.Ou*(2012)CompletegenomesequenceofKlebsiellapneumoniaesubsp.pneumoniaehs11286,amultidrug-resistantstrainisolatedfromhumansputum.JournalofBacteriology,JournalofBacteriology,194,1841-1842.(10)Y.Shao,E.M.Harrison,D.Bi,C.Tai,X.He,H.Y.Ou*,K.RajakumarandZ.Deng(2011)TADB:aweb-basedresourceforType2toxin-antitoxinlociinBacteriaandArchaea.NucleicAcidsResearch,39,D606-D611.(9)J.Zhang,J.JurriaanvanAartsen,X.Jiang,Y.Shao,C.Tai,X.He,Z.Tan,Z.Deng,S.Jia*,K.RajakumarandH.Y.Ou*(2011)ExpansionoftheknownKlebsiellapneumoniaespeciesgenepoolbycharacterizationofnovelalienDNAislandsintegratedintotmRNAgenesites.JournalofMicrobiologicalMethods,84,283-289.(8)H.Y.Ou*andK.Rajakumar*(2011)Bookchapter:“ArrayOme-&tRNAcc-facilitatedmobilomediscovery:comparativegenomicsapproachesforidentifyingrichveinsofbacterialnovelDNAsequences”,HandbookofMolecularMicrobialEcologyI:MetagenomicsandComplementaryApproaches,EditorF.J.deBruijn,JohnWiley&Sons,Inc.(7)G.Liu,H.Y.Ou,T.Wang,L.Li,H.Tan,X.Zhou,K.Rajakumar,Z.DengandX.He(2010)CleavageofPhosphothioatedDNAandMethylatedDNAbytheTypeIVRestrictionEndonucleaseScoMcrA.PLoSGenetics,6(12):e1001253.(6)Y.Shao,X.He,C.Tai,H.Y.Ou*,RajakumarK.andDengZ.(2010)mGenomeSubtractor:aweb-basedtoolforparallelinsilicosubtractivehybridizationanalysisofmultiplebacterialgenomes.NucleicAcidsResearch,38,W194-W200.(5)N.Chen$,H.Y.Ou$,J.J.vanAartsen,X.Jiang,M.Li,Z.Yang,Q.Wei,X.Chen,X.He,Z.Deng,K.Rajakumar,Y.Lu(2010)ThepheVphenylalaninetRNAgeneinKlebsiellapneumoniaeclinicalisolatesisanintegrationhotspotforpossibleniche-adaptationgenomicislands.CurrentMicrobiology,60,210-6.($Theseauthorscontributedequallytothiswork.)(4)H.Y.Ou,X.He,Y.Shao,C.Tai,K.RajakumarandZ.Deng(2009)dndDB:adatabasefocusedonphosphorothioationoftheDNAbackbone.PLoSONE,4,e5132.(3)H.Y.Ou$;,C.T.S.Ju$;,K.L.Thong,N.Ahmad,Z.Deng,M.R.BarerandK.Rajakumar(2007).TranslationalGenomicstoDevelopaSalmonellaentericaSerovarParatyphiAMultiplexPCRAssay.JournalofMolecularDiagnostics,2007,9,624-630.($Theseauthorscontributedequallytothiswork.)(CoverFigureandCommentin:JMolDiagn.,2007,9,572-573.)(2)H.Y.Ou,X.He,E.M.Harrison,B.R.Kulasekara,A.B.Thani,A.Kadioglu,S.Lory,J.C.Hinton,M.R.Barer,Z.DengandK.Rajakumar(2007).MobilomeFINDER:web-basedtoolsforinsilicoandexperimentaldiscoveryofbacterialgenomicislands.NucleicAcidsResearch,35,W97-W104.(1)X.He,H.Y.Ou,Q.Yu,X.Zhou,J.Wu,J.Liang,W.Zhang,K.RajakumarandZ.Deng(2007).AnalysisofagenomicislandhousinggenesforDNAS-modificationsysteminStreptomyceslividans66anditscounterpartsinotherdistantlyrelatedbacteria.MolecularMicrobiology,65,1034-48.
乔忠东

导师姓名
乔忠东
研究方向生殖生物学;环境因素对干细胞发育过程中信号传导等问题的研究
联系方式通讯地址：上海市东川路800号文选医学大楼224房间

邮政编码：200240

联系电话：021－34204925

Email：zdqiao@sjtu.edu.cn
个人简介

1982年12月本科毕业于山西医学院医学系。1985年月获山西医学院硕士学位。1989年10月赴德国杜塞尔多夫海涅大学分子寄生虫学教研室攻读博士学位，1993年3月获博士学位。1992年10月－1994年10月在德国杜塞尔多夫海涅大学“毒理学与环境卫生学院”从事博士后研究。1994年底回国后历任副教授、教授。厦门大学兼职教授、四川大学华西医学中心兼职教授、博士生导师，上海市医学遗传研究所兼职教授。现主要从事有关生殖遗传性、环境因素对细胞发育影响的分子机制等方面的研究。
代表性论著
1.TangM,WangZ,ZhouY,XuW,LiS,WangL,WeiD,QiaoZ.ANovelDrugCandidateforAlzheimer'sDiseaseTreatment:gx-50DerivedfromZanthoxylumBungeanum.JAlzheimersDis.2013Jan1;34(1):203-13.2.WangZ,WuW,TangM,ZhouY,WangL,XuW,QiaoZ.NF-κBpathwaymediatesvascularsmoothmuscleresponsetonicotine.IntJBiochemCellBiol.2013Feb;45(2):375-83.3.ZhuZ,XuW,DaiJ,ChenX,ZhaoX,FangP,YangF,TangM,WangZ,WangL,MaD,QaioZ.Thealterationofproteinprofileinducedbycigarettesmokingviaoxidativestressinmiceepididymis.IntJBiochemCellBiol.2013Mar;45(3):571-82.4.ShiShi,ZhaoxiaWang,ZhongdongQiao,Themultifunctionalanti-inflammatorydrugsusedinthetherapyofAlzheimer’sdisease,CurrentMedicinalChemistry,2013(accepted)5.LiX,BaoY,FangP,ChenY,QiaoZ.EffectofmifepristoneonCOX-2bothineutopicandectopicendometriuminmouseendometrioticmodel.ArchGynecolObstet.2012Oct;286(4):939-46.6.QinQ,NiuJ,WangZ,XuW,QiaoZ,GuY.AstragalusmembranaceusInhibitsInflammationviaPhospho-P38Mitogen-ActivatedProteinKinase(MAPK)andNuclearFactor(NF)-κBPathwaysinAdvancedGlycationEndProduct-StimulatedMacrophages.IntJMolSci.2012;13(7):8379-87.7.XuW,HuH,WangZ,ChenX,YangF,ZhuZ,FangP,DaiJ,WangL,ShiH,LiZ,QiaoZ.Proteomiccharacteristicsofspermatozoainnormozoospermicpatientswithinfertility.JProteomics.2012Sep18;75(17):5426-36.8.QinQ,NiuJ,WangZ,XuW,QiaoZ,GuY.Astragalusembranaceusextractactivatesimmuneresponseinmacrophagesviaheparanase.Molecules.2012Jun13;17(6):7232-40.9.WangZ.-X.,L.-Y.Wang,K.-J.Zhang,X.-W.Zhao,Z.-D.Qiao.Analysisofallergen-specificIgEin230childrenwithallergicairwaydiseaseinnorthernChina.Allergologie.2011;34(6):294-810.WangLL,ZhaoJL,LauW-B,ZhangYQ,QiaoZD,WangYJ,Estradiolpretreatmentattenuatednicotine-inducedendothelialcellapoptosisviaestradiolfunctionalmembranereceptor，IntImmunopharmacol.2011Jun;11(6):675-82.Epub2011Jan22.
师咏勇

导师姓名
师咏勇
研究方向分子遗传学;生物信息学
联系方式通讯地址：华山路1954号上海交通大学BIO-X中心小白楼208

邮政编码：200030

联系电话：021-62932779

Email：shiyongyong@sjtu.edu.cn
个人简介

null
代表性论著
null
孙涛

导师姓名
孙涛
研究方向神经发育和疾病的分子机理;非编码RNA基因表达调控
联系方式通讯地址：上海市东川路800号生物药学楼2-215

邮政编码：200240

联系电话：02134205081

Email：taosun11@sjtu.edu.cn
个人简介

本人于1991年获得厦门大学学士学位，1994年中科院北京动物所硕士学位，1999年获得伦敦大学学院（UniversityCollegeLondon）博士学位。2000-2005年在哈佛大学医学院(HarvardMedicalSchool)进行博士后工作。2005年被美国康奈尔大学威尔医学院(CornellUniversityWeillMedicalCollege)聘为助理教授，2011年提升为副教授。2013年聘为上海交通大学特聘教授，入选上海市****。本人在非编码RNA的神经发育机理及大脑不对称研究中处于国际领先地位。本人研究成果发表在《Science》,《Cell》，《CellReports》,《NatureReviewNeuroscience》，《PNAS》，《CurrentBiology》，《Development》，《JournalofNeuroscience》和《JournalofCellScience》等杂志上。本人获得EllisonMedicalFoundation杰出青年奖，QatarFoundation科研奖。本实验室的研究得到了美国国立卫生研究院NIH以及其他著名国际基金会的资金资助。
代表性论著
1,ShanBian,JanetHong,QingsongLi,LauraSchebelle,AndrewPollock,VidurGargandTaoSun(2013).microRNAclustermiR-17-92regulatesneuralstemcellexpansionandtransitiontointermediateprogenitorsinthedevelopingmouseneocortex.CellReports.S2211-1247(13)00161-7.2,TomaszJanNowakowski,VassilikiFotaki,AndrewPollock,TaoSun,ThomasPratt,andDavidJ.Price(2013)MicroRNA-92bregulatesthedevelopmentofintermediatecorticalprogenitorsinembryonicmousebrain.ProcNatlAcadSciUSA.110(17):7056-61.3,JenniferL.KnaussandTaoSun(2013)RegulatorymechanismsoflongnoncodingRNAsinneuraldevelopmentandfunction.Neuroscience.235:200-14.4,GaizkaOtaegi,AndrewPollock,JanetHongandTaoSun(2011).MicroRNAmiR-9modifiesmotorneuroncolumnsbyregulatingFoxP1levelsindevelopingspinalcords.JournalofNeuroscience.31(3):809-18.5,ShanBianandTaoSun(2011).FunctionsofnoncodingRNAsinneuraldevelopmentandneurologicaldiseases.MolecularNeurobiology.44(3):359-73.Epub2011Oct4.6,YokoKawase-Koga,RogerLow,GaizkaOtaegi,AndrewPollock,HaitengDeng,FrankEisenhaber,SebastianMaurer-StrohandTaoSun(2010).RNAaseIIIenzymeDicermaintainssignalingpathwaysfordifferentiationandsurvivalinmousecorticalneuralstemcells.JournalofCellScience,123(Pt4):586-94.7,ZhenyongHuang,YokoKawase-Koga,ShuqunZhang,JaneVisvader,MiklosToth,ChristopherA.WalshandTaoSun(2009).TranscriptionfactorLmo4definestheshapeoffunctionalareasindevelopingcorticesandregulatessensorimotorcontrol.DevelopmentalBiology,327(1):132-142.Epub2008Dec16.8,TaoSunandChristopherA.Walsh(2006).Molecularapproachestobrainasymmetryandhandedness.NatureReviewNeuroscience,7(8):655-662.9,TaoSun,ChristinaPatoine,JaneVisvader,EleanorSum,TimothyJ.Cherry,StuartH.Orkin,DanielH.GeschwindandChristopherA.Walsh(2005).Earlyasymmetryofgenetranscriptioninembryonichumanleftandrightcerebralcortex.Science,308(5729):1794-8.(Publishedonline12May2005).10,TaoSun,HualingDong,LiziWu,MichealKane,DavidH.RowitchandCharlesD.Stiles(2003).Cross-repressiveinteractionoftheOlig2andNkx2.2transcriptionfactorsindevelopingneuraltubeassociatedwithformationofaspecificphysicalcomplex.JournalofNeuroscience.23(29):9547-56.11,Q.RichardLu,TaoSun,ZhiminZhu,NanMa,MeritxellGarcia,CharlesD.StilesandDavidH.Rowitch(2002).CommondevelopmentalrequirementforOligfunctionindicatesamotorneuron/oligodendrocyteconnection.Cell109,75–86.12,TaoSun,YannEchelard,RichardLu,Dong-inYuk,SovannKaing,CharlesD.StilesandDavidH.Rowitch(2001).OligbHLHproteinsinteractwithhomeodomainproteinstoregulatecellfateacquisitioninprogenitorsoftheventralneuraltube.CurrentBiology11:1413–1420.
陶美凤

导师姓名
陶美凤
研究方向微生物新药先导物发掘;微生物次级代谢及其调控
联系方式通讯地址：上海市华山路1954号上海交通大学徐汇校区科学馆205#

邮政编码：200030

联系电话：13816536299

Email：tao_meifeng@sjtu.edu.cn
个人简介

陶美凤，上海交通大学特别研究员，教育部新世纪优秀人才，主要从事微生物药物先导物发掘、链霉菌次级代谢及其调控研究。1992年本科毕业于武汉大学生物化学专业，1999年在华中农业大学获生物化学与分子生物学专业博士学位，1999-2008年于华中农业大学生命科技学院和农业微生物学国家重点实验室任教，2009年至今在上海交通大学生命科技学院和微生物代谢国家重点实验室工作。1999-2002年(每年6个月)到英国约翰英纳斯研究中心(JohnInnesCenter)，进行链霉菌分化调控机理合作研究；2005-2007，到美国威斯康星大学-麦迪逊分校(UW-Madison)药学院从事微生物来源天然产物的生物合成研究。曾主持科技部863课题1项，自然科学基金项目5项，武汉市青年晨光计划1项。在MolMicro、JBacteriol、JBiolChem、MolBiosyst和ApplEnvironMicrobiol等国内外学术期刊发表学术论文20多篇，获发明专利1项。研究方向：1.后基因组时代的微生物药物先导物挖掘；2.微生物次级代谢及其途径工程；3.链霉菌次级代谢调控机理。Email：tao_meifeng@sjtu.edu.cn
代表性论著
null
王风平

导师姓名
王风平
研究方向极端微生物组学研究;海洋微生物
联系方式通讯地址：东川路800号上海交通大学生命科技学院

邮政编码：200240

联系电话：021-34207208

Email：fengpingw@yahoo.com
个人简介

分子生物学博士。1998年起至2008年，先后任国家海洋局第三海洋研究所助研、副研、研究员。其中，1999年8月至2002年4月，被聘为德国Osnabrueck大学博士后、客座研究员；2006年5月至12月，受聘为美国佐治亚州立大学客座教授。2009年1月起至今，被聘为上海交通大学教授，博士生导师。近年来主要以深海和深部生物圈极端微生物为研究对象，综合利用传统和现代微生物技术，结合基因组学、转录组学等组学技术和生物地球化学方法来探寻深部极端微生物适应性机理、关键代谢途径起源和极端生态系统演替等基础科学问题。发表SCI收录论文37篇，其中第一及通讯作者论文25篇。2008年获得中国青年女科学家奖提名奖。主持国家自然科学基金4项，海洋“863”项目2项，以及大洋项目2项。
代表性论著
1,LijingJiang,YanpingZheng,XiaotongPeng,HuaiyangZhou,ChuanlunZhang,XiangXiao,FengpingWangVerticaldistributionanddiversityofulfate-reducingprokaryotesinthePearlRiverestuarinesediments,southernChina.FEMSMicrobiolEcol200970:249-2622,MuhammadAamerMehmoodXiangXiao,FauziaYusufHafeez,YingbaoGai,FengpingWangPurificationandcharacterizationofachitinase3fromSerratiaproteamaculans.WorldJMicrobiolBiotechnol2009,25:1955–19613,ShufangWang,XiangXiao,LijingJiang,XiaotongPeng,HuaiyangZhou,JunMeng,andFengpingWangDiversityandAbundanceofAmmonia-OxidizingArchaeainHydrothermalVentChimneysoftheJuandeFucaRidgeApplEnvironMicrol,2009,75:4216–42204,ZengX,BirrienJL,FouquetY,CherkashovG,JebbarM,QuerellouJ,OgerP,Cambon-BonavitaMA,XiaoX,PrieurD.PyrococcusCH1,anobligatepiezophilichyperthermophile:extendingtheupperpressure-temperaturelimitsforlife.ISMEJ.20093(7):873-8765,BinLiu,GuangbinYe,FengpinWang,RyanBell,JohnNoakes,TimShort,andChuanlunZhang.CommunityStructureofArchaeaintheWaterColumnaboveGasHydratesintheGulfofMexico.GeomicrobiologyJournal,2009,26:363–369,20096,GuangbinYe,ShufangWang,LijingJiang,XiangXiao,FengpingWang(correspondingauthor),JohnNoakes,andChuanlunZhang.DistributionandDiversityofBacteriaandArchaeainMarineSedimentsAffectedbyGasHydratesatMississippiCanyonintheGulfofMexico.GeomicrobiologyJournal,2009,26:370–381,20097,WangFP,ZhouH,MengJ,etal.GeoChip-basedAnalysisofMetabolicDiversityofMicrobialCommunitiesattheJuandeFucaRidgeHydrothermalVent.ProcNatlAcadSci2009,106:4840-48458,WangFP,GaiYB,ChenM,XiaoX.Arthrobacterchitinipsychrophilussp.nov.,anovelpsychrotrophicbacteriumisolatedfromAntarctica.IJSEM2009Jul22.[Epubaheadofprint]9,WangF,XiaoX,OuHY,GaiYB,WangFP(Correspondingauthor).TheroleandregulationoffattyacidbiosynthesisinShewanellapiezotoleransWP3responsetodifferenttemperaturesandpressures.JBacteriol2009,191:2574-8410,MengJ,WangFP(co-firstauthor),WangF,etal.AnUncultivatedCrenarchaeotaContainsFunctionalBacteriochlorophyllaSynthase.ISMEJ2009,3:106-116
王玉炯

导师姓名
王玉炯
研究方向精神疾病遗传学;单基因病遗传学
联系方式通讯地址：宁夏银川市西夏区贺兰山西路539号

邮政编码：750021

联系电话：0951-2062033

Email：wyj@nxu.edu.cn
个人简介

现任宁夏大学生命科学学院院长、西部特色生物资源保护与利用教育部重点实验室主任、上海交通大学兼职教授，生物化学与分子生物学“211工程”重点学科带头人、“动物重大疫病综合防制研究自治区科技创新团队”团队带头人、“基础生物学”国家级教学团队带头人。国家级教学名师（2006）、全国模范教师（2004）、全国师德先进个人（2004）、国务院政府特殊津贴获得者（1998）、国家“百千万人才工程”跨世纪学术与技术带头人（1997）、教育部“跨世纪优秀人才”（2003）、“宝钢优秀教师特等奖”获得者（2008）、自治区“有突出贡献专业技术创新人才奖”获得者（2008）、“100位为宁夏建设作出突出贡献英雄模范人物”(2009)宁夏“十大杰出青年”（1999）、自治区先进工作者（2000）。长期从事微生物学、分子生物学以及基因工程等学科的教学与科研工作。曾多次赴美国、日本、比利时等国家进行学术交流。兼任教育部生物学基础课程教学指导委员会委员、宁夏高等学校本科理工科类学科专业教学指导委员会主任委员、中国微生物学会理事、宁夏生物学会理事长、自治区高级专家联合会常务理事、宁夏大学学术委员会副主任委员，《MolecularandCellularBiochemistry》长期审稿人、《高校生物学教学研究（电子版）》副主编、《宁夏大学学报》（自然版）常务编委、《生命世界》编委、《生物学杂志》编委。先后主持国家“863”计划项目2项、国家“973”计划项目子课题1项、国家自然科学基金资助计划项目4项、国家科技攻关计划项目2项、教育部重点（重大）项目4项、自治区科技攻关计划项目8项。获国家一类新药证书1项，获省部级科技进步一等奖2项、二等奖3项，申请国家发明专利4项，获国家级教学成果奖二等奖1项，获自治区教学成果奖特等奖1项（以上奖项均为第一完成人），发表论文100余篇。
代表性论著
1.M.Li,C.J.Ma,X.M.LiuandY.J.Wang*,MolecularcloningofHSP70inMycoplasmaovipneumoniaeandcomparisonwiththatofothermycoplasmas.GeneticsandMolecularResearch.2011,10(2):834-848.2.ZipingZhang,XiaomingLiu,YanfangHao,XueyunYang,andYujiongWang*.ComparativeEvaluationoftheAntioxidantEffectsoftheNaturalVitaminCAnalog2-O-β-D-glucopyranosyl-L-ascorbicAcidIsolatedfromGojiBerryFruit.ArchPharmRes.2011,34(5):801-810.3.XuezhangZhou，ZhenweiSong，XiaomingLi，FangJia，YujiongWang*.ProductionofRecombinantPorcineInterferonalphaUsingPHB–Intein-MediatedProteinPurificationStrategy.ApplBiochemBiotechnol.(2011)163:981–9934.ZhipingZhang,XiaomingLiu,TaoWu,JunhongLiu,XuZhang,XueyunYang,MichaelJ.Goodheart,JohnF.Engelhardt,YujiongWang*.SelectivesuppressionofcervicalcancerHelacellsby2-O-β-D-glucopyranosyl-L-ascorbicacidisolatedfromthefruitofLyciumbarbarumL.CellBiolToxicol.(2011)27:107–1215.GuangxianXu,HaoJia,YongLi,XiaomingLiu,MinLi,YujiongWang*.HemolyticphospholipaseRv0183ofMycobacteriumtuberculosisinducesinflammatoryresponseandapoptosisinalveolarmacrophageRAW264.7cells.Can.J.Microbiol.2010,56:916–924.6.GuangxianXu,YanZhang,HaoJia,JuanLi,XiaomingLiu,JohnF.Engelhardt,YujiongWang*.CloningandidentificationofmicroRNAsinbovinealveolarmacrophages.MolCellBiochem.2009,332:9-16.7.WangXP,ZhangJH,WangYJ*,FengY,ZhangX,SunXX,LiJL,DuXT,LambertMP,YangSG,ZhaoM,KleinWL,LiuRT.Conformation-dependentsingle-chainvariablefragmentantibodiesspecificallyrecognizebeta-amyloidoligomers,FEBSLetters,2009,583:579-584.8.YingFeng,Xiao-pingWanga,Yu-jiongWang,Xue-tingDua,Xiao-xiaSun,MinZhao,LeiHuang,Rui-tianLiu,Resveratrolinhibitsbeta-amyloidoligomericcytotoxicitybutdoesnotpreventoligomerformation.NeuroToxicologydoi:10.1016/j.neuro.2009.08.0139.XiaomingLiu,MeihuiLuo,ChenhongGuo,ZiyingYan,YujiongWang,DianaCMLei-ButtersandJohnFEngelhardt,AnalysisofAdeno-associatedVirusProgenitorCellTransductioninMouseLung.MolecularTherapy.2009,17(2):285-293.10.JiBH,QinW,SunT,FengGY,HeL,WangYJ*.AnoveldeletionmutationinCCM1gene(krit1)isdetectedinaChinesefamilywithcerebralcavernousmalformations.2006,YiChuanXueBao,Vol.33(2):105-110.
魏冬青

导师姓名
魏冬青
研究方向生物信息学;生物物理学
联系方式通讯地址：东川路800号生命学院

邮政编码：200240

联系电话：021-34204573

Email：dqwei@sjtu.edu.cn
个人简介

现任上海交通大学生物信息与生物统计系教授，博士生导师，副主任。Springer期刊“InterdisciplinarySciences–ComputationalLifeSciences”主编，“J.AtomicandMolecularPhysics”ManagingEditor,“MolecularSimulation”等九家杂志编委。主要从事两个方向的研究：生物信息学和计算物理学1，生物信息学：开发了分子模拟与计算机辅助药物设计软件SAMM，构建了小分子数据库(300万)，中药有效成分数据库，药物靶标数据库，以及细胞色素P450酶多态性基因型-表型相关性数据库。把支持向量机和神经网络等非线性方法开发了统计预测模型以及基于web的软件工具并应用到药物构效关系，药物代谢动力学和基因表型相关性的研究中。利用同源建模的方法预测出了多个蛋白质的3D结构,丰富并完善了由序列到结构的结构生物信息学方法。系统开展了重要膜蛋白(Alpha7,PLN,M2ofInfluenzaAandB)，DNA-蛋白体系(Sox2-Oct1-Hoxb1),以及重要工业用酶(脂肪酶T1lipase)的分子动力学模拟研究，提出了DNA转录的Tethered-Hopping模型，和药物小分子调控离子通道开关以及脂肪酶高温活性的分子机制。以蛋白（靶标）结构为基础开展了药效团/数据库搜索，对接，分子与蛋白相互作用和分子动力学模拟等系列工作。将现代计算机药物设计方法和中药有效成分等数据库应用到药物设计和分子优化的实践中，病毒(SARS,HIV,H5N1,H1N1)和老年痴呆等疾病的药物设计。在抗SARS药物研究中取得了较为突出成绩,完成了一种抗SARS八肽的设计，合成和生物活性评估。实验证明八肽制剂对病毒有一定的抑制作用，作用强弱与剂量有一定的相关性，其半数有效浓度(EC50)值为：2.7×10-5mg/ml，比其他药物小2个数量级（魏冬青等“一种抑制冠状病毒的多肽及其衍生物”,专利号：ZL200410018679.3）。发现了花椒有效成分gx-50对人类老年痴呆受体α7有抑制作用，有可能成为先导化合物。对CYP450酶进行了系列研究，从不同人的基因多态性出发，研究酶对药物代谢动力学的规律，对个性化用药和药物设计进行了初步探索。最近在A型流感病毒M2跨膜蛋白质子通道分子调控机制的研究中取得重要进展，成果发表在化学领域著名学术期刊《美国化学会志》（JournaloftheAmericanChemicalSociety）上。这项研究工作解释了看似相互矛盾的实验现象，同时有助于阐释药物调控离子通道的机理，对于药物设计有一定的指导作用。2.计算物理学：最近取得突破性进展，采用量子分子动力学的方法模拟了固体硝基甲烷爆炸的全过程，对其机理的理论研究有一定的意义。人类使用炸药已有千年的历史，但至今爆炸机理仍不清楚。被誉为该领域里程碑式的成果，论文发表在物理学最顶级的杂志Phys.Rev.Letter之上。最主要的学术成绩是首次从理论上证明了铁电液晶的存在，论文发表在《物理学评论快讯》以及《物理学评论》上，并被广泛引用(400多次)。它解决了统计物理上长期困扰的问题，这个问题是1916年由玻恩(MaxBorn)提出来的，即偶极相互作用可能形成方向有序的液体状态。他使人们认识到这个简单的体系包涵复杂的相结构和有趣的物理现象。同时这一发现开拓了液晶研究的新领域，即研究近球状分子形成的铁电液晶，著名的物理学家M.E.vanLeeuwenandB.Smit指出(Phys.Rev.Lett.71,3991-3994(1993))魏和Patey关于软球的分子动力学模拟代表了最重要的贡献,它证明了偶极相互作用力单独可以生成方向有序的液体状态，在高密度时变成铁电固体，也是首次证明了向列铁电液体的存在。主持两个国家自然科学基金项目，完成国家863项目，5个国家自然科学基金项目以及2个省部级重点项目。作为大会主席主持召开2008年理论与计算化学国际会议(TACC2008)，第二届IEEE生物信息学及生物医学工程大会(BioinformaticsandBiomedicalEngineeringConferences，2009),以及2009和2010年计算与系统生物学国际会议（InternationalConferenceonComputationalandSystemBiology）。至今发表SCI文章100多篇，编写专著5本，11篇邀请评述文章，参与13篇专著的有关章节编写。这些工作为国际同行所广泛引用和正面评述，经SCI检索，经SCI检索，已累积引用超过3000次，最高单篇他引约200次，130次以上4篇,70次以上14篇，50次以上20篇,共有33篇引用33次以上的文章，故H因子约为33。是国内同行中引用较高的学者之一。
代表性论著
引用较高的论文Cited204times,IF:2.59-K.C.Chou,D.Q.Wei,andW.Z.Zhong,“BindingMechanismofCoronavirusMainProteinaseWithLigandsanditsImplicationtoDrugDesignAgainstSARS”,BiochemicalandBiophysicalResearchCommunications,308,148(2003).Cited197times,IF:7.33-D.Q.WeiandG.N.Patey,“OrientationalOrderinSimpleDipolarLiquids:ComputerSimulationofaFerroelectricNematicPhase”,Phys.Rev.Letter,68,2043,(1992).Cited118times,IF:2.92-D.Q.WeiandD.R.Salahub,“HydratedProtonClustersandSolventEffectsontheProtonTransferBarrier:aDensityFunctionalStudy”,J.Chem.Phys.,101,7633(1994).Cited116times,IF:2.86-D.Q.WeiandG.N.Patey,“FerroelectricLiquidCrystalandSolidPhasesFormedbyStronglyInteractingDipolarSpheres”,Phys.Rev.,A,46,7783,(1992).Cited96times,IF3.88-SuzanneSirois,Dong-QingWei,QishiDu,Kuo-ChenChou,“VirtualScreeningforSARS-CoVProteaseBasedonKZ7088PharmacophorePoints”,J.Chem.Info.Comput.Sci.,44,1111,2004.最近的论文:IF:8.58-Ruo-XuGu,LiminAngelaLiu*,andDong-QingWei*,“Equilibriumoffourbindingstatesofanti-viraldrugrimantadineinM2-lipidbilayersystem”,J.Am.Chem.Soc.,133(28),10817–10825(2011).IF:7.33-JingChang,PengLian,Dong-QingWei*,Xiang-RongChen,ZizhengGongandQingmingZhang,“Thermaldecompositionofthesolidphaseofnitromethane:Abinitiomoleculardynamicssimulations”,Phys.Rev.Lett.105,188302-188305(2010).IF:4.351-PengLian,Dong-QingWei*,Jing-FangWang*,Kuo-ChenChou,“AnAllostericMechanismInferredfromMolecularDynamicsSimulationsonPhospholambanPentamerinLipidMembranes”,PLoSONE,6,e18587（2011）.IF:3.23.H.R.Arias,Ruo-XuGu,DominikFeuerbach,Bao-BaoGuo,YongYe,andD.Q.Wei*,“NovelPositiveAllostericModulatorsoftheHumanα7NicotinicAcetylcholineReceptor”,Biochemistry,50,5263–5278(2011)IF:3.55-Jing-FangWangandDong-Qing,Wei*,“RoleofStructuralBioinformaticsandTCMdatabasesinPharmacogenomics”,Pharmacogenomics,10,1213-1215(2009)(Editorial)IF:4.82-Jing-FangWang,Cheng-ChengZhang,,Jing-YiYan,Kuo-ChenChou,Dong-QingWei*,“StructureofcytochromeP450sandpersonalizeddrug”,CurrentMedicinalChem,16,232-244(2009)(Invitedreview)专著Dong-QingWei,XijunWang(editors),TheoryandApplicationofComputationalChemistry,AIPConferenceProceedingsVolume1102,AmericanInstituteofPhysicsPress,2009.ISBN:978-0-7354-0637-7.LiminAngelaLiu(Editor),DongqingWei(Editor),InterdisciplinaryResearchandApplicationsinBioinformatics,ComputationalBiology,andEnvironmentalSciences(Hardcover),ISBN:1609600649,2010.LiminAngelaLiu,Dong-QingWei,YixueLiandHuiminLei,“HandbookofResearchonComputationalandSystemsBiology:InterdisciplinaryApplications”,ISBN:9781609604912,IGIGlobal,2011.Rong-XiuLi,Dong-QingWeiandYanFeng,“TheProteinStructureSimulationandDesign”,ChineseChemicalIndustrial,2011,ISBN：9787122101839.
吴更

导师姓名
吴更
研究方向研究与癌症相关的细胞信号通路中关键蛋白复合物的结构与功能;探索关键的细菌代谢调控酶的底物识别与催化机理
联系方式通讯地址：上海交通大学生命科学技术学院

邮政编码：200240

联系电话：34205914

Email：geng.wu@sjtu.edu.cn
个人简介

1997年在中国科学技术大学生物系获学士学位，主修分子生物学，辅修化学物理学。2001年在普林斯顿大学化学系获博士学位，从事TGF-beta信号通路与细胞凋亡通路中蛋白质复合物的结构生物学研究。2001-2003年在美国MemorialSloanKettering癌症研究所/HowardHughesMedicalInstitute做博士后，从事介导蛋白质泛素化的E3泛素连接酶的结构生物学研究。2003-2008年在哈佛大学医学院做博士后，从事Wnt信号通路的生物化学研究。2008年起在上海交大生命学院任教授、博导。2009年加入上海交通大学“微生物代谢”国家重点实验室。2005-2008年，获美国“白血病与淋巴癌学会”的specialfellowship资助。2008年，被评为上海市“东方学者”特聘教授、上海市“曙光学者”。2009年，被评为教育部“新世纪优秀人才”、上海市“浦江学者”。发表SCI论文28篇（总计被引用1500次以上）、核心期刊论文5篇。被引用100次以上的论文6篇（3篇为第一作者）。所解析的蛋白质晶体结构被Genentech、Novartis等世界大型制药公司作为筛选、设计抗癌药物的参考依据。
代表性论著
#：并列作者，*：通讯作者1.YZhang#,LFu#,XQi,ZZhang,YXia,JJia,JJiang,YZhao*,GWu*(2013)StructuralinsightintothemutualrecognitionandregulationbetweenSuppressorofFusedandGli/Ci.NatureCommunications(Accepted).2.ZZhang#,LChen#,LGao#,KLin#*,LZhu,YLu,XShi,YGao,JZhou,PXu,JZhang*,GWu*(2012)StructuralbasisfortherecognitionofAsefbyAdenomatousPolyposisColi.CellResearch22,372-386.(被英国皇家科学院院士MariannBienz选为国际生物医学类权威数据库Facultyof1000推荐论文)3.DChen#,HTang#,YLv,ZZhang,KShen,KLin,YLZhao,GWu*,PXu*(2013)StructuralandcomputationalstudiesofthemaleateisomerasefromPseudomonasputidaS16revealabreathingmotionwrappingthesubstrateinside.MolecularMicrobiology87(6):1237-1244.4.FChen#,ZZhang#,KLin#*,TQian,YZhang,DYou,XHe,ZWang,JLiang,ZDeng,GWu*(2012)CrystalstructureofthecysteinedesulfuraseDndAfromStreptomyceslividanswhichisinvolvedinDNAphosphorothioation.PLoSOne7(5):e36635.5.ZZhang#,HLi#,LChen,XLu,JZhang,PXu,KLin#*,GWu*(2011)MolecularbasisfortherecognitionofAdenomatousPolyposisColibytheDiscsLarge1protein.PLoSOne6(8):e23507.6.GWu*,HHuang,JGAbreu,XiHe*(2009)InhibitionofGSK3phosphorylationofβ-cateninviaphosphorylatedPPPSPXSmotifsofWntcoreceptorLRP6.PLoSOne4(3):e4926.7.GWu,XiHe*(2006)Threonine41inbeta-cateninservesasakeyphosphorylationrelayresidueinbeta-catenindegradation.Biochemistry45(16):5319-23.8.GWu,CLiu,XHe*(2004)Ozz,anewnameonthelonglistofbeta-Catenin’snemeses.MolecularCell13(4):451-3.9.GWu,GXu,BSchulman,PJeffrey,JWHarper,NPPavletich*(2003)Structureofabeta-TrCP1–Skp1–beta-Catenincomplex:destruction-motifbindingandlysinespecificityoftheSCFbeta-TrCP1ubiquitinligase.MolecularCell11(6):1445-1456.
吴际

导师姓名
吴际
研究方向干细胞生物学;分子生殖生物学
联系方式通讯地址：东川路800号生物药学楼4-205

邮政编码：200240

联系电话：021-34207263

Email：jiwu@sjtu.edu.cn
个人简介

吴际,博士,特聘教授,博士生导师。1997年北京大学博士毕业，1997年至2004年11月分别到德国哥廷根大学和德国灵长中心做博士后，美国康涅狄格大学访问学者，美国犹他大学ResearchFellow，美国天普大学AssociateScientist。2004年11月至今任上海交通大学生命学院、Bio-X研究院教授、特聘教授、博士生导师。曾主持上海市浦江人才计划基金、国家自然科学基金重点项目、国家自然科学基金重大研究计划培育项目、上海市优秀学科带头人基金、农业部重大项目子课题、国家自然科学基金国际合作与交流项目、教育部高等学校博士点基金和教育部留学回国人员基金。已在<<NatureCellBiology>>,　<<CurrTopDevBiol.>>,<<JournalofMolecularCellBiology>>,<<MolecularBiologyoftheCell>>,<<DevelopmentalBiology>>,<<CellularSignalling>>,<<JournalofCellularPhysiology>>，<<BiologyofReproduction>>,　<<CellProliferation>>等重要学术刊物上发表论文近60篇。最新研究成果（发现成年哺乳动物卵巢内具有自我更新和分化潜能的生殖干细胞）改变人们80多年的传统观点，开辟一个崭新研究领域。　Science，Nature,NatureMedicine和众多家杂志刊发评论文章，NatureChina将这一成果列入最新研究亮点。为国际Facultyof1000Biology推荐论文，世界各大媒体（包括《纽约时报》、《华盛顿邮报》、《路透社》、《泰晤士报》）等纷纷报道。该成果入选2009年度“中国高等学校十大科技进展”；2010年获“上海市优秀学科带头人”称号等。现为美国ReproductiveBiologyandEndocrinology等数家国际杂志编委，<<JournalofBiomedicineandBiotechnology>>杂志GuestEditor，国际Facultyof1000Biologymember，国家重大科学研究计划首席科学家，香港研究资助局大学教育资助委员会国际评委，国家自然科学基金委员会第十三届评审专家,中国动物学会生殖生物学分会理事。<<NatureCellBiology>>,<<NatureProtocol>>,<<PNAS>>,<<JournalofMolecularCellBiology>>,<<MolecularHumanReproduction>>,<<StemCellReviewsandReports>>,<<CellProliferation>>,<<DevelopmentalDynamics>>等十余家杂志特邀审稿人。
代表性论著
1.WuJ*,LuoH,WangH.Germlinestemcells.CurrTopDevBiol.,102,97-126,2013(IF9.09)2.ZouK,HouL,SunK,XieW,WuJ*.ImprovedEfficiencyofFemaleGermlineStemCellPurificationUsingFragilis-BasedMagneticBeadSorting.StemCellsandDevelopment,20,2197-2204,2011(IF4.79)3.XiongJ,WangH,GuoG,WangS,HeL*,ChenH*,WuJ*.MaleGermCellApoptosisandEpigeneticHistoneModificationInducedbyTripterygiumwilfordiiHookF.,PLoSOne,6,e20751,2011(IF4.41)4.ZhangY,YangZ,YangY,WangS,ShiL,XieW,SunK,ZouK,WangL,XiongJ,XiangJ,WuJ*.Productionoftransgenicmicebyrandomrecombinationoftargetedgenesinfemalegermlinestemcells,JournalofMolecularCellBiology,3,132-141,2011(IF13.40)5.YangZ.,SunN.,WangS.,TianG.G.,WuJ*.Molecularcloningandexpressionofanewgene,GON-SJTU1intherattestis,ReproductiveBiologyandEndocrinology,8,43,2010(IF2.63)6.ZouK,YuanZ,YangZ,LuoH,SunK,ZhouL,XiangJ,ShiL,YuQ,ZhangY,HouR,WuJ*.Productionofoffspringfromagermlinestemcelllinederivedfromovaries,NatureCellBiology,11,631-636,2009(TableofContentsCoverStory)(IF21.94).7.YuanZ,HouR,WuJ*.Generationofmicebytransplantationofanadultspermatogonialcelllineaftercryopreservation,CellProliferation,42,123-131,2009(IF4.49)8.ZhangY,WuJ*.Molecularcloningandcharacterizationofanewgene,Oocyte-G1,JcellPhysiol.,218,75-83,2009(CoverStory)(IF5.46)9.YangZ,WuJ*,MouseDyneinAxonemalIntermediateChain2:CloningandExpression,DNAandCellBiology,27,479-488,2008(CoverStory)(IF2.29)10.WuJ*,ZhangY,TianGG,ZouK,LeeCM,YuQ,YuanZ.Short-typePB-cadherinpromotesself-renewalofspermatogonialstemcellsviamultiplesignalingpathways,CellSignal,20,1052-1060,2008(IF5.185)注：IF为2001年至今该期刊最高影响因子;*通讯作者
夏小霞

导师姓名
夏小霞
研究方向微生物代谢工程与合成生物学;生物材料
联系方式通讯地址：上海市东川路800号生物药学楼3-309

邮政编码：200240

联系电话：021-34207028

Email：xiaoxiaxia@sjtu.edu.cn
个人简介

上海交通大学特别研究员、上海市高校特聘教授（东方学者）、博士生导师。2009年1月获韩国科学技术院(KAIST)生命化学工学科博士学位，先后在韩国KAIST及美国Tufts大学从事博士后研究。主要从事系统与合成生物学的研究，尤其致力于其在生物材料、绿色化工和能源等领域的应用基础研究。在国际重要学术刊物上发表论文近二十篇，其中包括PNAS，JACS,Biotechnology&Bioengineering等高水平国际期刊。所发表的论文被选为Nature杂志的ResearchHighlight，NatureChemicalBiology的NewsandViews，Biotechnology&Bioengineering的封面、亮点文章和Editors’Choice。研究成果已申请四个国际专利和数个韩国专利，其中3项韩国专利及1项澳大利亚专利已授权。被邀请为Biotechnology&Bioengineering，Biomacromolecules等五个国际杂志的论文审稿人。主要研究方向：1.组合生物合成新型多功能蛋白生物材料2.生物基化学品及材料的高效制造
代表性论著
18.FanC,QiK,XiaXX*,ZhongJJ*.2013.Efficientethanolproductionfromcorncobresiduesbyrepeatedfermentationofanadaptedyeast.BioresourcesTechnol,2013,136:309-15.17.HuX,Tang-SchomerMD,HuangW,QinG,XiaXX,WeissAS,KaplanDL.Charge-tunableautoclavedsilk-tropoelastinproteinalloysthatcontrolneuroncellresponses.AdvFunctMater,2013,DOI:10.1002/adfm.20120268516.SunZ,QinG,XiaXX,Mark,CG,Omenetto,F,KaplanDL.2013.Photoresponsiveretinal-modifiedsilk-elastincopolymer.JAmChemSoc,2013,135(9):3675–3679.15.XuYN,XiaXX,ZhongJJ.InducedeffectofNa+onganodericacidbiosynthesisinstaticliquidcultureofGanodermalucidumviacalcineurinsignaltransduction.BiotechnolBioeng,2013,DOI:10.1002/bit.2485214.AnB,DesRochersTM,QinG,XiaXX,ThiagarajanG,BrodskyB,KaplanDL.Theinfluenceofspecificbindingofcollagen-silkchimerastosilkbiomaterialsonhMSCbehavior.Biomaterials,2013,34(2):402-12.13.YoonSH,HanMJ,JeongH,LeeCH,XiaXX,LeeDH,ShimJH,LeeSY,OhTK,KimJF.Comparativemulti-omicssystemsanalysisofEscherichiacolistrainsBandK-12.GenomeBiology,2012,13(5):1-13.12.XiaXX,XuQ,HuX,QinG,KaplanDL.Tunableself-assemblyofgeneticallyengineeredsilk-elastinproteinpolymers.Biomacromolecules,2011,12(11):3844-3850.11.HuX,ParkSH,GilES,XiaXX,WeissAS,KaplanDL.Theinfluenceofelasticityandsurfaceroughnessonmyogenicandosteogenic-differentiationofcellsonsilk-elastinbiomaterials.Biomaterials,2011,32(34):8979-8989.10.XiaXX,QianZG,LeeSY.ComparativeproteomicandgeneticanalysesrevealunidentifiedmutationsinEscherichiacoliXL1-BlueandDH5α.FEMSMicrobiolLett,2011,314(2):119-124.9.QianZG,XiaXX,LeeSY.MetabolicengineeringofEscherichiacolifortheproductionofcadaverine:Afivecarbondiamine.BiotechnolBioeng,2011,108(1):93-103.8.XiaXX,QianZG,KiCS,ParkYH,KaplanDL,LeeSY.Native-sizedrecombinantspidersilkproteinproducedinmetabolicallyengineeredEscherichiacoliresultsinastrongfiber.ProcNatlAcadSciUSA,2010,107(32):14059-14063.7.QianZG,XiaXX,LeeSY.MetabolicengineeringofEscherichiacolifortheproductionofputrescine:Afourcarbondiamine.BiotechnolBioeng,2009,104(4):651-662.6.XiaXX,HanMJ,LeeSY,YooJS.ComparisonoftheextracellularproteomesofEscherichiacoliBandK-12strainsduringhighcelldensitycultivation.Proteomics,2008,8(1):2089-2103.5.QianZG*,XiaXX*,LeeSY.Proteome-basedidentificationoffusionpartnerforhigh-levelextracellularproductionofrecombinantproteinsinEscherichiacoli.BiotechnolBioeng,2008,101(3):587-601.(*equalcontribution)4.XiaXX,ShenYL,WeiDZ.PurificationandCharacterizationofRecombinantsTRAILExpressedinEscherichiacoli.ActaBiochBiophSin,2004,36(2):118-122.3.ShenYL,ZhangY,SunAY,XiaXX,WeiDZ,YangSL.High-levelproductionofsolubletumornecrosisfactor-relatedapoptosis-inducingligand(Apo2L/TRAIL)inhigh-densitycultivationofrecombinantEscherichiacoliusingacombinedfeedingstrategy.BiotechnolLett,2004,26:981-984.2.ZhangY,ShenYL,XiaXX,SunAY,WeiDZ,ZhouJS,ZhangGJ,WangLH,JiaoBH.High-celldensitycultivationofrecombinantEscherichiacoliforproductionofTRAILbyusinga2-stagefeedingstrategy.ChinJBiotechnol,2004,20(3):408-413.1.ShenYL,XiaXX,ZhangY,LiuJW,WeiDZ,YangSL.RefoldingandpurificationofApo2L/TRAILproducedasinclusionbodiesinhigh-cell-densityculturesofrecombinantEscherichiacoli.BiotechnolLett,2003,25(24):2097-2101.
肖华

导师姓名
肖华
研究方向生物分析技术;重大疾病的无损伤分子诊断
联系方式通讯地址：上海交通大学生命科学技术学院上海市闵行区东川路800号，200240

邮政编码：200240

联系电话：021-34205820

Email：xiaohuacn@gmail.com
个人简介

上海交通大学特别研究员，中央组织部“青年****”入选者。2007年获中国科学院大连化学物理研究所分析化学博士学位，先后在美国加州大学欧文分校、加州大学洛杉矶分校和密西根大学安娜堡分校从事研究工作。研究方向主要包括生物分析技术和重大疾病的无损伤分子诊断。
代表性论著
1.Xiao,H.*,Zhang,L.,Zhou,H.,Lee,J.M.,Garon,E.B.,Wong,D.T.W.*Proteomicanalysisofhumansalivafromlungcancerpatientsusingtwo-dimensionaldifferencegelelectrophoresisandmassspectrometry.Mol.Cell.Proteomics2012,11(2):M111.012112.2.Xiao,H.*,Wong,D.T.W.*ProteomicAnalysisofMicrovesiclesinHumanSalivabyGeLC-MS/MS.Anal.Chim.Acta2012,723,61-67.3.Xiao,H.*,Wong,D.T.W.*MethodDevelopmentforProteomeStabilizationinHumanSaliva.Anal.Chim.Acta2012,722,63-69.4.Zhang,L.&#8224;,Xiao,H.*&#8224;,Zhou,H.,Santiago,S.,Lee,J.,Garon,E.,Yang,J.P.,Brinkmann,O.,Yan,X.M.,Akin,D.,Chia,D.,Elashoff,D.,Park,N.H.,Wong,D.T.W.*DevelopmentofTranscriptomicBiomarkerSignatureinHumanSalivatoDetectLungCancer.Cell.Mol.LifeSci.2012,69,3341-3350.(&#8224;EqualContribution)5.Zhang,L.&#8224;,Xiao,H.&#8224;,Karlan,S.&#8224;,Zhou,H.&#8224;,Gross,J.,Elashoff,D.,Akin,D.,Yan,X.M.,Chia,D.,Karlan,B.,Wong,D.T.DiscoveryandPreclinicalValidationofSalivaryTranscriptomicandProteomicBiomarkersfortheNon-InvasiveDetectionofBreastCancer.PLoSONE2010,5,e15573.(&#8224;EqualContribution)6.Xiao,H.,Yang,L.S.,Zou,H.F.,Yang,L.,Le,X.C.Analysisofoxidizedmulti-walledcarbonnanotubesinsingleK562cellsbycapillaryelectrophoresiswithlaser-inducedfluorescence.Anal.Bioanal.Chem.2007,387,119-126.7.Xiao,H.,Zou,H.F.,Pan,C.S.,Jiang,X.G.,Le,X.C.,Yang,L.Quantitativedeterminationofoxidizedcarbonnanotubeprobesinyeastbycapillaryelectrophoresiswithlaser-inducedfluorescencedetection.Anal.Chim.Acta2006,580,194-199.8.Xiao,H.,Li,X.,Zou,H.F.,Yang,L.,Yang,Y.Q.,Wang,Y.L.,Wang,H.L.,Le,X.C.ImmunoassayofP-glycoproteinonsinglecellbycapillaryelectrophoresiswithlaserinducedfluorescencedetection.Anal.Chim.Acta2006,556,340-346.9.Xiao,H.,Li,X.,Zou,H.F.,Yang,L.,Wang,Y.L.,Wang,H.L.,Le,X.C.CE-LIFcoupledwithflowcytometryforhigh-throughputquantitationoffluorophoresinsingleintactcells.Electrophoresis2006,27,3452-3459.
肖湘

导师姓名
肖湘
研究方向海洋微生物;分子生物学
联系方式通讯地址：闵行区东川路800号

邮政编码：361005

联系电话：021-34207206

Email：xoxiang@sjtu.edu.cn
个人简介

肖湘：男，博士，上海交通大学特聘教授，1968年出生，1998毕业于华中农业大学，获分子生物学博士学位，1998年获首届德国学术交流协会首届“生物科学特别项目奖”，1999-2001在德国Osnabrueck大学任博士后研究员，2001年被聘为中国大洋协会深海生物基因资源开发项目责任专家，2004-2008年任国家海洋局海洋生物遗传资源重点实验室室主任，现任中国微生物协会海洋微生物分会副主任,中国生物工程协会理事；中国药协会海洋药物分会理事；参与组织实施了我国第一个深海生物基因资源研究开发计划，2007年作为中国代表团代表赴纽约参加联合国关于深海生物基因资源保护的讨论。2007年获得“新世纪百千万人才工程”国家级人选称号。2008年被评为厦门市劳动模范，2008年担任中国大洋深海考察第一个生物航段首席科学家，在国内率先开展了深海微生物的研究。参与组织建设了深海微生物研究平台体系，发展了深海嗜压细菌菌分离培养、极端嗜热嗜压古菌分离培养、深海环境基因组构建分析等三项关键技术，分离培养出一系列深海耐嗜压细菌，包括迄今唯一一株极端嗜热嗜压古菌。尝试将工程技术、生物学技术及生物地球化学手段相结合，从新的视角-即生命科学和地球科学交叉、整合来进行研究。在新的理论框架下，回答单一学科难以解决的科学问题。目前主要从事深海超嗜热/嗜压，嗜冷/嗜压微生物；及深海热液、冷泉及深部生物圈等极端生命系统的研究。近年来，主持了国家杰出青年基金、自然科学基金重点项目、海洋863重点项目、中国大洋专项、973子项目等。发表SCI论文70余篇，2009年两篇论文分别被NatureChina网站选为亮点论文及推荐为优秀论文。
代表性论著
1MengJ,WangF,WangF,ZhengY,PengX,ZhouH,XiaoX(correspondingauthor).Anuncultivatedcrenarchaeotacontainsfunctionalbacteriochlorophyllasynthase.ISMEJ.2009Jan;3(1):106-16.2XiangZeng,Jean-LouisBirrien,YvesFouquet,GeorgyCherkashov,MohamedJebbar,Jo&euml;lQuerellou,PhilippeOger,Marie-AnneCambon-Bonavita,XiangXiao*andDanielPrieur*(correspondingauthor).PyrococcusCH1,anobligatepiezophilichyperthermophileisolatedfromadeep-seahydrothermalventISMEJ.2009Jul;3(7):873-63FengpingWang,HuaiyangZhou,JunMeng,XiaotongPeng,LijingJiang,PingSun,ChuanlunZhang,JoyD.VanNostrand‖,YeDeng,ZhiliHe,LiyouWu,JizhongZhou&,andXiangXiao&(correspondingauthor)GeoChip-basedAnalysisofMetabolicDiversityofMicrobialCommunitiesattheJuandeFucaRidgeHydrothermalVent.PNAS2009Mar24;106(12):4840-5.4WangF,WangFP,LiQ,XiaoX(correspondingauthor)AnovelfilamentousphagefromadeepseabacteriumShewanellapiezotoloransWP3isinducedatlowtemperature.JB2007Oct;189(19):7151-35FengpingWang,JianbinWang,ShengkangLi,XiangZeng,DouglasHoytBartlett,SongnianHu,XiangXiao(correspondingauthor)GenomesequenceandexpressionanalysisofShewanellapiezotoleransWP3,apiezotolerantandpsychrotolerantdeep-seaironreducingbacteriumPLoSONE.2008Apr9;3(4):e1937.6ChenY,WangF,XuJ,MehmoodMA,XiaoX*(correspondingauthor).PhysiologicalandevolutionarystudiesofNAPsystemsinShewanellapiezotoleransWP3.ISMEJ.2010Dec2.[Epubaheadofprint]
徐俊

导师姓名
徐俊
研究方向海洋微生物分子遗传学;海洋天然产物生物合成机理
联系方式通讯地址：上海市东川路800号

邮政编码：200240

联系电话：34207208

Email：xujunn@sjtu.edu.cn
个人简介

教育经历&#8226;1990年－1994年，华中农业大学，微生物学系，本科；&#8226;1994年－1997年，华中农业大学，微生物学系，硕士；&#8226;2000年－2003年，日本筑波大学，应用生物化学系，博士；工作经历&#8226;1997年－1999年，北京生物医药研究所，助理研究员；&#8226;2003年－2004年，日本国立食品综合研究所，博士后；&#8226;2005年－2008年，国家海洋局第三海洋研究所，副研究员；&#8226;2009年－至今，上海交通大学生命科学技术学院，研究员；研究方向主要从事海洋放线菌天然产物生物合成途径的遗传调控和海洋极端微生物适应性机理的研究。围绕红树林和深海这两类特殊海洋生态环境中微生物资源，开展以下研究工作：1)、极端微生物环境适应性机理研究；2)、海洋微生物特殊代谢途径及天然产物研究；3)、海洋放线菌多样性及系统分类学研究；4)、极端嗜热嗜压古菌的分子遗传学研究。研究成果已主持完成福建省青年科技人才项目课题、973前期课题、国家自然科学基金、国家863课题各一项，主持在研国家自然科学基金一项。迄今已发表研究论文21篇，其中SCI论文15篇。
代表性论著
1.Xiao-JinLiu,Min-JuanXu,Si-TengFan,ZhengWu,JunLi,Xiao-MeiYang,Ya-HuiWang,JunXu*andZhi-GangZhang,Xiamenmycinattenuateshypertrophicscarsbysuppressinglocalinflammationandtheeffectsofmechanicalstress,JournalofInvestigativeDermatology,133,1351-1360，2013.2.信号分子ppGpp与微生物环境适应性,卢文珺，王金文，徐俊，生命科学，24(4):385-389,2012.3.李晓玲，游中元，徐　俊，徐岷涓,红树林来源白浅灰链霉菌中生物碱类次级代谢产物研究及核糖体工程优化,台湾海峡，31(1):143-149.4.Tian,C.,Jiao,X.,Liu,X.,Li,R.,Dong,L.,Liu,X.,Zhang,Z.,Xu,J.,Xu,M.,Xie,P.,Firsttotalsynthesisanddeterminationoftheabsoluteconfigurationof1-N-methyl-3-methylamino-[Nbutanoicacid-3-(9-methyl-8-propen-7-one)-amide]-benzo[f][1,7]naphthyridine-2-one,anovelbenzonaphthyridinealkaloid,TetrahedronLetters,2012.5.HuahuaJian,JunXu,XiangXiao,FengpingWang,DynamicModulationofDNAReplicationandGeneTranscriptioninDeep-SeaFilamentousPhageSW1inResponsetoChangesofHostGrowthandTemperature,PLoSONE.7(8):e41578,2012.6.MinjuanXu,XiaojinLiu,YileiZhao,DongLiu,ZhenhaoXu,XiaomengLang,PingAo,WenhanLin,SonglinYang,ZhigangZhangandJunXu,IdentificationandCharacterizationofanAnti-FibroticBenzopyranCompoundIsolatedfromMangrove-DerivedStreptomycesxiamenensis,MarineDrugs10,639-654,2012.7.XuJun,LiuLupeng,XuMinjuan,PhilippeOger,WangFengping,MohamedJebbarandXiaoXiang,CompleteGenomeSequenceoftheObligatePiezophilicHyperthermophilicArchaeonPyrococcusyayanosiiCH1.J.Bacteriology193(16):4297-4298,2011.8.JingXiao,YingxueLuoandJunXu,GenomeSequenceofSerinicoccusprofundi,aNovelActinomyceteIsolatedfromDeep-SeaSediment,J.Bacteriology193(22):6413,2011.9.JingXiao,YingxueLuo,JingXu,ShujieXie,andJunXu*.Modestobactermarinussp.nov.,apsychrotolerantactinobacteriumfromdeep-seasedimentandemendeddescriptionofthegenusModestobacter.IntJSystEvolMicrobiol.61(7):1710-1714,2011.10.ChenY,WangFP,XuJun，MehmoodMA,XiaoX.PhysiologicalandevolutionarystudiesofNAPsystemsinShewanellapiezotoleransWP3.ISMEJournal5:843–855,2011.11.LuoY,XiaoJ,WangY,XuJ,XieS,XuJun*.Streptomycesindicussp.nov.,anovelactinomyceteisolatedfromdeep-seasedimentoftheIndianOcean.IntJSystEvolMicrobiol.61(11):2712-2716，2011.12.JingXiao,YingxueLuo,ShujieXieandJunXu*,Serinicoccusprofundisp.nov.,anovelactinomyceteisolatedfromDeep-seasedimentandemendeddescriptionofthegenusSerinicoccus,IntJSystEvolMicrobiol.59(3):472-476，2010.13.Xiao-LingLi,Min-JuanXu,Yi-LeiZhaoandJunXu*,ANovelBenzo[f][1,7]naphthyridineProducedbyStreptomycesalbogriseolusfromMangroveSediments.Molecules15:9298-9307,2010.14.JunXu*,YinWang,JingXu,Shu-JieXie,JingXiaoandJi-ShengRuan,Streptomycesxiamenensissp.nov.,anovelactinomyceteisolatedfromamangrovesedimentsample,IntJSystEvolMicrobiol.59(3):472-476,2009.15.JingXiao,YinWang,YingxueLuo,Shu-JieXie,Ji-ShengRuanandJunXu*,Streptomycesavicenniaesp.nov.,anovelactinomyceteisolatedfromrhizosphereofthemangroveplantAvicenniamariana,IntJSystEvolMicrobiol.59(10):2624-2628,2009.
许明清

导师姓名
许明清
研究方向分子遗传学;计算系统生物学
联系方式通讯地址：上海市华山路1954号中心小白楼209室

邮政编码：200030

联系电话：62932779

Email：mingqingxu@gmail.com
个人简介

1.个人基本信息：许明清，1977年生，博士，上海交通大学研究员。许明清博士长期从事复杂疾病的分子遗传学、流行病学和生物信息学研究，近年来工作重心围绕在心血管、癌症和神经精神性疾病多组学整合交叉分析及系统生物学研究以揭示疾病发生发展的分子机理，并利用多组学数据中的分子标记物构建疾病风险和药物疗效预测模型为基础医学研究的临床转化服务。2.教育和工作经历：2011年—现在，上海交通大学Bio-X研究院，研究员；2008年—2011年，美国哈佛大学医学院，副研究员/讲师；2007年—2008年，美国哥伦比亚大学公共卫生学院，研究科学家；2006年—2007年，美国哈佛大学公共卫生学院，博士后；2002年—2006年，上海交通大学生命科学与技术学院，博士研究生3.其他学术职务：“遗传发育与精神神经疾病”教育部重点实验室课题组长；上海交通大学Bio-X研究院转化医学平台主任；上海交通大学Bio-X研究院整合组学转化研究中心主任；上海交通大学数学系统计学专业兼职教授；国家重点基础研究发展计划（973计划）项目专家组成员4.国际学术期刊任职情况：2013年至今《PLOSONE》(2011年影响因子：4.09)学术编辑；2011年至今《BMCMedicalGenomics》(2011年影响因子：3.77)副主编；2010年至今《BMCPsychiatry》(2011年影响因子：2.89)副主编；2012年至今《ExperimentalBiologyandMedicine》（2011年影响因子：2.954）编委会成员；2011年至今《ProgressinNeuro-PsychopharmacologyandBiologicalPsychiatry》（2011年影响因子：2.877）编委会成员；5.主要学术成就：许博士已发表通讯作者和第一作者论文16篇（其中通讯作者9篇），总影响因子超过200，总引用次数超过700次。作为通讯作者，许博士对血管紧张素系统基因与冠心病发生发展的分子遗传学机理的研究发表在心血管领域最好的杂志《Circulation》上（2011年影响因子15）。作为通讯作者，许博士于2010年发表在《Atherosclerosis》的论文因其系统严密的试验设计和新颖的统计分析方法得到同期特邀社论的高度评价。作为第一作者，许博士发表在《JAMA》(2011年影响因子30)上的论文被引用超过380次。继许博士在《JAMA》上报道出生前营养缺乏会导致精神分裂症的发病风险之后不久，许博士又在2009年用另一大规模的队列研究证实出生前营养缺乏对精神分裂症发病风险的影响，并将成果以第一作者的身份发表于国际著名精神分裂症研究杂志《SchizophreniaBulletin》上（2011年影响因子9，引用超过70次）。许博士的这项关于出生前营养缺乏与成年后精神分裂症发病风险的研究被《环球时报》、《中国青年报》、《文汇报》、《新民晚报》、《解放日报》等20多家国内媒体，及英国BBC新闻网，美国《纽约时报》、《洛杉矶时报》，国际顶级学术期刊《Nature》和《Science》等30多家国际媒体广泛报道。在前期工作的基础之上，作为唯一通讯作者，许博士近期通过多中心队列研究发现了孕期和婴幼儿期饥荒暴露会增加对个体青少年期精神发育迟的滞3倍以上的风险，相关论文修回稿已投向国际顶级期刊。许博士同时也在中国人群中发现了若干与精神疾病和心血管疾病相关的风险基因。
代表性论著
1.ChangF.Quo,ChanchalaKaddi,JohnPhan,AminZollanvari,MingqingXu,MayD.Wang,GilAlterovitz.ReverseEngineeringBio-molecularSystems(REBMS)Using-OmicData:Challenges,Progress,andOpportunities.BriefingsinBioinformatics.2012Jul;13(4):430-452.Ming-QingXu,Wen-ShengSun,Ben-XiuLiu,Guo-YinFeng,LanYu,LarryYang,GuangHe,PakSham,EzraSusser,DavidStClair,LinHe.Prenatalmalnutritionandadultschizophrenia:furtherevidencefromthe1959-1961Chinesefamine.SchizophreniaBulletin.2009May;35(3):568-576.3.Ming-QingXu,DavidStClair,Guo-YinFeng,Zhi-GuangLin,GuangHe,Xing-WangLi,LinHe.BDNFgeneisageneticriskfactorforschizophreniaandisrelatedtothechlorpromazine-inducedextrapyramidalsyndromeintheChinesepopulation.PharmacogeneticsandGenomics.2008Jun;18(6):449-457.4.Ming-QingXu,ZhengYe,FrankB.Hu,LinHe.Quantitativeassessmentoftheeffectofangiotensinogengenepolymorphismsontheriskofcoronaryheartdisease.Circulation2007Sep18;116(12):1356-66.5.Ming-QingXu,Qing-HeXing,Yong-LanZheng,ShengLi,Jian-JunGao,FengXu,LinHe.AssociationofAKT1genepolymorphismswithriskofschizophreniaandwithresponsetoantipsychoticsintheChinesepopulation.JournalofClinicalPsychiatry2007;68(9):1358–1367.6.Ming-QingXu,OttJurg,DavidStClair,Guo-YinFeng,LinHe.Brain-derivedneurotrophicfactorgeneC-270TandVal66Metfunctionalpolymorphismsandriskofschizophrenia:amoderate-scalepopulation-basedstudyandmeta-analysis.SchizophreniaResearch.2007Mar;91(1-3):6-13.Epub2007Feb7.7.Ming-QingXu,DavidStClair,LinHe.Meta-analysisofassociationbetweenApoEepsilon4alleleandschizophrenia.SchizophreniaResearch.2006Jun;84(2-3):228-35.8.DavidStClair*,Ming-QingXu*,PengWang,Ya-QinYu,You-RongFang,FengZhang,Xiao-YingZheng,Niu-FanGu,Guo-YinFeng,PakSham,LinHe.RatesofadultschizophreniafollowingprenatalexposuretotheChinesefamineof1959-1961.JAMA.2005Aug3;294(5):557-62.(*Jointfirstauthor)
许平

导师姓名
许平
研究方向工业环境微生物学;合成生物学
联系方式通讯地址：上海市闵行区东川路800号上海交通大学生命科学技术学院3－409许平课题组

邮政编码：200240

联系电话：021－34206647

Email：pingxu@sjtu.edu.cn
个人简介

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代表性论著
null
严志强

导师姓名
严志强
研究方向心血管力学生物学;干细胞与组织工程
联系方式通讯地址：上海市东川路800号888信箱文选医学大楼344室

邮政编码：200240

联系电话：13764160736

Email：zqyan@sjtu.edu.cn
个人简介

严志强，医学博士,2003年10月至今任上海交通大学生命科学技术学院教授，期间在美国加利福尼亚大学伯克利分校生物工程系访问研究。现兼任中国生物物理学会生物力学与生物流变学学专业委员会委员和上海市力学学会生物力学专业委员会委员。作为项目负责人先后主持6项国家自然科学基金项目，并参加了2项国家自然科学基金重点项目的研究。主要研究方向：1）心血管力学生物学。2）干细胞与血管组织工程
代表性论著
【1】QiYX,JiangJ,JiangXH,WangXD,JiSY,HanY,LongDK,ShenBR,YanZQ,ChienS,JiangZL.ParacrinecontrolofPDGF-BBandTGFβ1oncross-talkbetweenendothelialcellsandvascularsmoothmusclecellsduringlowshearstressinducedvascularremodeling.PNAS,2011,108(5):1908-1913.【2】WangYH,YanZQ,QiYX,ChengBB,WangXD,ZhaoD,ShenBR,JiangZL.Normalshearstressandvascularsmoothmusclecellsmodulatemigrationofendothelialcellsthroughhistonedeacetylase6activationandtubulinacetylation.AnnBiomedEng.2010;38(3):729-37【3】WangYH,YanZQ,ShenBR,ZhangL,ZhangP,JiangZL.Vascularsmoothmusclecellspromoteendothelialcelladhesionviamicrotubuledynamicsandactivationofpaxillinandtheextracellularsignal-regulatedkinase(ERK)pathwayinaco-culturesystem.EurJCellBiol.2009;88(11):701-9【4】QiYX,QuMJ,YanZQ,ZhaoD,JiangXH,ShenBR,JiangZL.CyclicstrainmodulatesmigrationandproliferationofvascularsmoothmusclecellsviaRho-GDIalpha,Rac1,andp38pathway.JCellBiochem.2010;109(5):906-14.【5】YanZQ,YaoQP,ZhangML,QiYX,GuoZY,ShenBR,JiangZL.Histonedeacetylasesmodulatevascularsmoothmusclecellmigrationinducedbycyclicmechanicalstrain.JBiomech.2009;42(7):945-8.【6】BianYL,QiYX,YanZQ,LongDK,ShenBR,JiangZLAproteomicanalysisofaortafromspontaneouslyhypertensiverat:RhoGDIalphaupregulationbyangiotensinIIviaAT(1)receptor.EurJCellBiol.2008Feb;87(2):101-10.【7】YeC,BaiL,YanZQ,WangYH,JiangZLShearstressandvascularsmoothmusclecellspromoteendothelialdifferentiationofendothelialprogenitorcellsviaactivationofAkt.ClinBiomech(Bristol,Avon).2008;23Suppl1:S118-24.t【8】GuoZY,YanZQ,BaiL,ZhangML,JiangZL.Flowshearstressaffectsmacromolecularaccumulationthroughmodulationofinternalelasticlaminafenestrae.ClinBiomech(Bristol,Avon).2008;23Suppl1:S104-11.【9】QuMJ,LiuB,WangHQ,YanZQ,ShenBR,JiangZL.Frequency-dependentphenotypemodulationofvascularsmoothmusclecellsundercyclicmechanicalstrain.JVascRes.2007;44(5):345-53.【10】WangHQ,BaiL,ShenBR,YanZQ,JiangZLCoculturewithendothelialcellsenhancesvascularsmoothmusclecelladhesionandspreadingviaactivationofbeta1-integrinandphosphatidylinositol3-kinase/Akt.EurJCellBiol.2007；86(1):51-6
杨虹

导师姓名
杨虹
研究方向环境微生物;应用微生物
联系方式通讯地址：上海市东川路800号，上海交通大学生命科学技术学院

邮政编码：200240

联系电话：021-34205343

Email：hongyang@sjtu.edu.cn
个人简介

杨虹，教授，博士生导师，工学博士1993年7月于无锡轻工大学（现江南大学）发酵工程专业获得工学博士学位。1993年8月至今于上海交通大学生命科学技术学院工作，2002年起任教授，2003年起任博士生导师。曾分别在德国Hannover大学、日本筑波大学和加拿大LAVAL大学留学和访问研究。作为项目负责人先后主持多项国家自然科学基金项目、国家"863"和"973"子课题、上海市和企业委托等研究课题。目前从事的主要研究方向：（1）环境微生物：富营养化湖泊中总浮游细菌、蓝藻（特别是产微囊藻毒素蓝藻）和溶藻细菌等多个微生物群落结构分析及变迁规律的研究，溶藻细菌筛选、溶藻活性物质分离纯化、溶藻功能基因的克隆、和溶藻机制的研究。（2）食品益生微生物：益生双歧杆菌和乳杆菌的定向筛选和应用研究、双歧杆菌和乳杆菌等的降胆固醇和抗氧化功能基因的克隆和异源表达研究、菌株的热应激和酸应激机制研究、有害产物的检测和产生机制研究、益生菌耐药性生物安全研究。
代表性论著
近年来的代表性论著：（*correspondingauthor）1）ChuanTian,XianglongLiu,JingTan,ShengqinLin,DaotangLi,,HongYang*.Isolation,identificationandcharacterizationofanalgicidalbacteriumfromlakeTaihuandpreliminarystudiesonitsalgicidalcompounds，JournalofEnvironmentalScience,Accepted,2012.2）QiulinLiu,XiaominHang,XianglongLiu,JingTan,DaotangLi,HongYang*.CloningandHeterologousExpressionoftheManganeseSuperoxideDismutaseGenefromLactobacilluscaseiLc18.AnnalsofMicrobiology,62:129–137,2012.3）WenjinYe,JingTan,XianglongLiu,ShengqinLin,JianliangPan,DaotangLi,HongYang*.TemporalvariabilityofcyanobacterialpopulationsinthewaterandsedimentsamplesofLakeTaihuasdeterminedbyDGGEandreal-timePCR.HarmfulAlgae,10:472–479,2011.4）QingLiao,XiaominHang,XianglongLiu,JianliangPan,HechunZhang,HongYang*.TheinfluenceofpHonheatstressresponsebyprobioticLactobacillusplantarumLP-Onlly.AnnalsofMicrobiology,60:341-348,2010.5）JinkangJiang,XiaominHang,MinZhang,XianglongLiu,DaotangLi,HongYang*.Diversityofbilesalthydrolaseactivitiesindifferentlactobacillitowardhumanbilesalts.AnnalsofMicrobiology,60:81–88,2010.6）WenjinYe,XianglongLiu,ShengqinLin,JingTan,JianliangPan,DaotangLi,HongYang*.TheverticaldistributionofbacterialandarchaealcommunitiesinthewaterandsedimentofLakeTaihu.FEMSMicrobiologyEcology，70：263-276，20097）ChuanTian;JingTan;XinWu;WenjinYe;XianglongLiu;DaotangLi;HongYang*.Spatiotemporaltransitionofbacterioplanktondiversityinalargeshallowhypertrophicfreshwaterlake,asdeterminedbydenaturinggradientgelelectrophoresis.JournalofPlanktonResearch,2009,31(8):885-897.8）WenjinYe,XianglongLiu,JinTan,Dao-tangLi,HongYang*.Diversityanddynamicsofmicrocystin-producingcyanobacteriainChina’sthirdlargestlake,lakeTaihu.HarmfulAlgae,2009,8:637-644.9）Xiu-JuanWu,Jian-LiangPan,Xiang-LongLiu,JingTan,Dao-TangLi,andHongYang*.Sulfate-ReducingBacteriainLeachate-PollutedAquifersalongtheShoreoftheEastChinaSea.CanadianJournalofMicrobiology,2009,55(7):818-828.10）Ying-yingQin,Xiao-wenZhang,Hong-qiangRen,Dao-tangLi,HongYang*.Populationdynamicsofammonia-oxidizingbacteriainanaeratedsubmergedbiofilmreactorformicropollutedrawwaterpretreatment.AppliedMicrobiologyandBiotechnology,2008,79:135-145.11）Xiao-wenZhang,Ying-yingQin,Hong-qiangRen,Dao-tangLi,HongYang*.Seasonalvariationincommunitiesofammonia-oxidizingbacteriabasedonpolymerasechainreaction–denaturinggradientgelelectrophoresisinabiofilmreactorfordrinkingwaterpretreatment.CanadianJournalofMicrobiology,2008,54(5):358-365.12）MinZhang,XiaobinFan,XiaominHang,daotangLi,HongYang*.CharacterizationandselectionofLactobacillusstrainsfortheireffectonbiletolerance,taurocholatedeconjugationandcholesterolremoval.WorldJournalofMicrobiology&Biotechnology.2008,24：7-14.13）Wu,Xin;Xi,Wanyan;Ye,Wenjin;HongYang*．BacterialcommunitycompositionofashallowhypertrophicfreshwaterlakeinChina,revealedby16SrRNAgenesequences．FEMSMicrobiologyEcology，2007，61：85~96.14）Ying-yingQin,Dao-tangLiandHongYang*.Investigationoftotalbacterialandammonia-oxidizingbacterialcommunitycompositioninafull-scaleaeratedsubmergedbiofilmreactorfordrinkingwaterpretreatmentinChina.FEMSMicrobiolLett,2007,268:126~134.15）FangZhang,XiaominHang,XiaobinFan,HongYang*.Theselectionandoptimizationprocedureofsynbioticforcholesterolremoval.Anaerobe,2007,13:185-192.
杨洪全

导师姓名
杨洪全
研究方向高等植物光信号转导的分子机理;
联系方式通讯地址：上海市东川路800号上海交通大学生命科学技术学院

邮政编码：200240

联系电话：34206005

Email：hqyang@sjtu.edu.cn
个人简介

1987年和1990年先后在四川农业大学农学系获得学士和硕士学位。1995年在中国科学院上海植物生理研究所获得植物分子遗传学博士学位。1995年至2001年在美国宾夕法尼亚大学生物系植物科学研究所先后做博士后和ResearchAssociate。2001年8月至2006年3月任中国科学院上海生命科学研究院植物生理生态研究所研究员、博士生导师。2006年4月至2012年5月任上海交通大学农业与生物学院教授、博士生导师。2012年6月起任上海交通大学生命科学技术学院教授、博士生导师。获得的荣誉包括：2001年度中科院“百人计划”获得者、2003年度国家杰出青年科学基金获得者、2005年度教育部“****”特聘教授、2006年度“中国科学院研究生院优秀教师荣誉称号”获得者、2007年度国家“新世纪百千万人才工程”入选者、2010年度上海市优秀学科带头人。从事的研究领域是，以拟南芥为主要模式系统，利用遗传学、生物化学、细胞生物学和分子生物学等综合手段，研究高等植物光控发育的分子机理。通过我们的工作，发现拟南芥蓝光受体CRY通过C端功能区传递光信号，并找到了CRY1信号转导途径的下游信号传递因子COP1和SPA1，建立了CRY1信号转导的基本途径；发现蓝光依赖性的CRY1-SPA1的直接蛋白相互作用抑制SPA1与COP1的相互作用，从而可能抑制COP1的E3泛素连接酶的活性，促进其底物HY5的蛋白稳定性，最终促进光形态建成；揭示了CRY介导蓝光诱导气孔开放的新功能，证明了CRY和向光素蓝光受体PHOT共同完成对蓝光诱导的气孔开放的调节；阐明了COP1直接与CO发生相互作用，并导致其泛素化和蛋白降解，建立了CRY-COP1信号系统调控光周期开花时间的遗传和生化途径，以及相关的调控机理；发现CRY1、phyB和phyA光受体分别介导蓝光、红光和远红光诱导的气孔发育过程，建立了光信号促进气孔发育的遗传途径。
代表性论著
1.Lian,H.L.,He,S.B.,Zhang,Y.C.,Zhu,D.M.,Zhang,J.Y.,Jia,K.P.,Sun,X.X.,Li,L.,andYangH.Q.*(2011).Blue-light-dependentinteractionofcryptochrome1withSPA1definesadynamicsignalingmechanism.Genes&Development25:1023-1028..2.Kang,C.Y.,Lian,H.L.,Wang,F.F.,Huang,J.R.,andYangH.Q.*(2009).Cryptochromes,Phytochromes,andCOP1RegulateLight-ControlledStomatalDevelopmentinArabidopsis.ThePlantCell21:2624-2641.3.Liu,L.J.,Zhang,Y.C.,Li,Q.H.,Sang,Y.,Mao,J.,Lian,H.L.,Wang,L.,andYangH.Q.*(2008).COP1-mediatedubiquitinationofCONSTANSisimplicatedincryptochromeregulationoffloweringinArabidopsis.ThePlantCell20:292-306.4.Mao,J.,Zhang,Y.C.,Sang,Y.,Li,Q.H.,andYangH.Q.*(2005)AroleforArabidopsiscryptochromesandCOP1intheregulationofstomatalopening.PNAS102:12270-12275(coverstory).5.Sang,Y.,Li,Q.H.,Rubio,V.,Zhang,Y.C.,Mao,J.,Deng,X.W.,andYangH.Q.*(2005).N-Terminaldomain-mediatedhomodimerizationisrequiredforphotoreceptoractivityofArabidopsisCRYPTOCHROME1.ThePlantCell17:1569-1584.6.Yang,H.Q.,Tang,R.H.,andCashmore,A.R.(2001).ThesignalingmechanismofArabidopsisCRY1involvesdirectinteractionwithCOP1.ThePlantCell13:2573-2587.7.Yang,H.Q.,Wu,Y.J.,Tang,R.H.,Liu,D.,Liu,Y.,andCashmore,A.R.(2000).TheCterminiofArabidopsiscryptochromesmediateaconstitutivelightresponse.Cell103:815-827(coverstory).
由德林

导师姓名
由德林
研究方向DNA骨架的磷硫酰化;微生物天然产物的生物合成
联系方式通讯地址：上海市华山路1954号科学馆

邮政编码：200030

联系电话：021-62932943转2111

Email：dlyou@sjtu.edu.cn
个人简介

研究方向：1.DNA骨架的磷硫酰化在DNA骨架上发现DNA磷硫酰化生理修饰结构基础上，以表观遗传学领域的新技术和新方法，研究新型表观遗传修饰-DNA磷硫酰化的生物化学途径和全基因组上的修饰序列特征，并深入探索这种新型表观遗传修饰在细胞防卫、基因表达调控等方面潜在的生理功能。2.微生物天然产物的生物合成以具有新颖结构、独特生理活性的微生物次级代谢产物为研究对象，综合运用生物化学、分子遗传学和化学生物学等手段，开展微生物次级代谢产物的分离鉴定、生物合成基因簇的克隆、生物合成途径和调控机制及生物活性与功能的研究，并在此基础上开展活性天然产物的结构修饰和组合生物合成改造。目前集中在微生物天然产物Xantholipin、Piericidin、Chlortetracycline、Agri-Antibiotic120（Anisomycin和Tetramycin）和Candicidin的生物合成途径和酶反应机制研究。
代表性论著
1.ZhangC,KongL,LiuQ,LeiX,ZhuT,YinJ,LinB,DengZ,YouD*.Invitrocharacterizationofechinomycinbiosynthesis:formationandhydroxylationofL-tryptophanyl-S-enzymeandoxidationof(2S,3S)β-hydroxytryptophan.PLoSOne2013,8(2):e56772.2.LeiX,KongL,ZhangC,LiuQ,YaoF,ZhangW,DengZ,YouD*.InvivoinvestigationofthesubstraterecognitioncapabilityandactivityaffectingaminoacidresiduesofglycosyltransferaseFscMIinbiosynthesisofcandicidin.MolBioSyst.2013,9(3):422-430.3.CaoB,YaoF,ZhengX,CuiD,ShaoY,ZhuC,DengZ,YouD*.GenomeminingofthebiosyntheticgeneclusterofthepolyenemacrolideantibiotictetramycinandcharacterizationofaP450monooxygenaseinvolvedinthehydroxylationofthetetramycinBpolyolsegment.ChemBioChem2012,13(15):2234-424.ZhangW,WangL,KongL,WangT,ChuY,DengZ,YouD*.Unveilingthepost-PKSredoxtailoringstepsinbiosynthesisofthetypeIIpolyketideantitumorantibioticxantholipin.ChemBiol.2012,19(3):422-32.5.LiuQ,YaoF,ChooiY,KangQ,XuW,LiY,ShaoY,ShiY,DengZ,TangY*,YouD*.ElucidationofpiericidinA1biosyntheticlocusrevealedathioesterase-dependentmechanismofα-pyridoneringformation.ChemBiol.2012,19(2):243-53.6.WangT,BaiL,ZhuD,LeiX,LiuG,DengZ,YouD*.EnhancingmacrolideproductioninStreptomycesbycoexpressingthreeheterologousgenes.EnzymeMicrob.Tech.2012,50:5-9.7.XuT,YaoF,ZhouX,DengZ*,YouD*.Anovelhost-specificrestrictionsystemassociatedwithDNAbackboneS-modificationinSalmonella.NucleicAcidsResearch.2010,38(20):7133-41.8.YaoF,XuT,ZhouX,DengZ*,YouD*.FunctionalanalysisofspfDgeneinvolvedinDNAphosphorothioationinPseudomonasfluorescensPf0-1.FEBSLett.2009,583(4):729-33.9.ChenW,HuangT,HeX,MengQ,YouD,BaiL,LiJ,WuM,LiR,XieZ,ZhouH,ZhouX,TanH,DengZ*.CharacterizationofthepolyoxinbiosyntheticgeneclusterfromStreptomycescacaoiandengineeredproductionofpolyoxinH.JBiolChem.2009,284(16):10627-38.10.XuT,LiangJ,ChenS,WangL,HeX,YouD,WangZ,LiA,XuZ,ZhouX,DengZ*.DNAphosphorothioationinStreptomyceslividans:mutationalanalysisofthedndlocus.BMCMicrobiol.2009,9:41.11.ZhouY,MengQ,YouD,LiJ,ChenS,DingD,ZhouX,ZhouH,BaiL,DengZ*.SelectiveremovalofaberrantextenderunitsbyatypeIIthioesteraseforefficientFR-008/candicidinbiosynthesisinStreptomycessp.strainFR-008.ApplEnvironMicrobiol.2008,74(23):7235-42.12.YouD*,XuT,YaoF,ZhouX,DengZ*.DirectevidencethatThiIisanATPpyrophosphatasefortheadenylationofuridinein4-thiouridinebiosynthesis.ChemBioChem2008,9(12):1879-82.13.WangL,ChenS,XuT,TaghizadehK,WishnokJS,ZhouX,YouD,DengZ*,DedonPC*.PhosphorothioationofDNAinbacteriabydndgenes.NatChemBiol.2007,3(11):709-10.14.YouD,WangL,YaoF,ZhouX,DengZ*.AnovelDNAmodificationbysulfur:DndAisaNifS-likecysteinedesulfurasecapableofassemblingDndCasaniron-sulfurclusterproteininStreptomyceslividans.Biochemistry.2007,46(20):6126-33.15.LiuT,YouD,ValenzanoC,SunY,LiJ,YuQ,ZhouX,CaneDE,DengZ*.IdentificationofNanEasthethioesteraseforpolyetherchainreleaseinnanchangmycinbiosynthesis.ChemBiol.2006,13(9):945-55.16.WangL,ChenS,XiaoX,HuangX,YouD,ZhouX,DengZ*.arsRBOCTarsenicresistancesystemencodedbylinearplasmidpHZ227inStreptomycessp.strainFR-008.ApplEnvironMicrobiol.2006,72(5):3738-42.
张大兵

导师姓名
张大兵
研究方向植物发育生物学;生物安全
联系方式通讯地址：东川路800号上海交通大学生物药学楼2-503

邮政编码：200240

联系电话：021-34205073

Email：zhangdb@sjtu.edu.cn
个人简介

张大兵，教育部****奖励计划特聘教授和国家百千万人才工程、国家杰出青年基金获得者、上海市优秀学科带头人、上海科技启明星、上海市曙光学者、教育部新世纪优秀人才等。1998年2月于中科院上海植物生理生态研究所获博士学位。中国植物学会第十三届理事会植物生理及分子生物学专业委员会委员；上海市生物化学与分子生物学会理事；上海市科学技术委员会技术预见专家；《JournalofIntegrativePlantBiology》、《JournalofPlantPhysiology》、《JournalofGenetics&Genomics》、《JournalofFoodSafety&Quality》等期刊编委；上海交通大学Bio-X中心伦理委员会委员。张大兵教授研究组主要开展水稻遗传学、花器官和花药形成分子基础以及分子辅助育种等研究工作。在控制水稻花和花序分生组织控制、花粉形成功能基因克隆等方面开展了系统地工作，主持了国家杰出青年基金项目、国家自然科学基金重点等国家和省、部委的研究课题，分离了控制水稻重要农艺性状关键基因FON4（FlowerOrganNumber4）、TDR(TapetumDegradationRetardation)、REP1(RetardedPalea1)、CYP704B2和CSA(CarbonStarvedAnther)等。近年来以通讯作者身份在PlantCell等期刊上发表论文80多篇。作为第一完成人获得上海市科技进步奖一项。组织申报教育部“生物技术”特色专业、“生物化学与分子生物学“国家以及上海市重点学科等。
代表性论著
1)LiH,…ZhangDB*..PlantPhysioloy.2011,10.1104/pp.111.175760.2)LiHF,…ZhangDB*.PlantPhysioloy.2011,10.1104/pp.111.172080.3)WangCMandZhangDB*.NucleicAcidsResearch,10(2011),1093/nar/gkr009.4)HuLF,…ZhangDB*..ThePlantCell,23(2)(2011),515-533.5)ZhangZ…ZhangDB*.ThePlantCell,23(2)(2011),681–700.6)XuJ…ZhangDB*etal.ThePlantCell,22(1)(2010),91-107.7)WangCM,…ZhangDB*.BMCBioinformatics,11(2010),81.8)LiH…ZhangDB*.ThePlantCell,22(1)(2010),173-190.9)LiHF…ZhangDB*.CellResearch,20(3)(2010),299-313.10)ZhangH…ZhangDB*.ThePlantCell,22(3)(2010),672-689.11)ZhangDS…ZhangDB*.PlantPhysiology,154(1)(2010),149-162.12)GaoXC…ZhangDB*.PlantPhysiology,153(2)(2010),728-740.13)WangC…ZhangDB*.JournalofAgricultureFoodChemistry,58(22)(2010),11543-11547.14)YuanZ…ZhangDB*.PlantPhysiology,149(1)(2009),235-244.15)ZhangDB*,andWilsonZA.ChineseScienceBulletin,54(14)(2009),2342-2353.16)WilsonZA*,andZhangDB.JournalofExperimentalBotany,60(5)(2009),1479-1492.17)LiuJ…ZhangDB*.JournalofAgricultureFoodChemistry,57(22)(2009),10524-10530.18)GuoJC…ZhangDB*.JournalofAgricultureFoodChemistry,57(15)(2009),6502-6509.19)GuoJC…ZhangDB*.JournalofAgricultureFoodChemistry,57(16)(2009),7205-7212.20)JiangLX…ZhangDB*.JournalofAgricultureFoodChemistry,57(9)(2009),3525-3532..21)YangLT…ZhangDB*.JournalofAgricultureFoodChemistry,56(6)(2008),1804-1809.22)YangLT…ZhangDB*.JournalofAgricultureFoodChemistry,56(10)(2008),3438-3443.23)DongW…ZhangDB*.BMCBioinformatics,9(2008),260.24)YangLT…ZhangDB*BMCMolecularBiology,9(2008),54.25)ZhangDS…ZhangDB*.MolecularPlant,1(4)(2008),599-610.26)ZhangHB…ZhangDB*.JournalofAgricultureFoodChemistry,56(14)(2008),5514-5520.27)LiN…ZhangDB*.ThePlantCell,18(11)(2006),2999-3014.28)ChuHW…ZhangDB*.PlantPhysiology,142(3)(2006),1039-1052.29)LiXX,…ZhangDB*.PlantPhysiology,141(4)(2006),1167-1184..30)JiangDH…ZhangDB*.CellResearch,16(5)(2006),507-518.31)ZhangYL,ZhangDB*etal.NucleicAcidsResearch,31(20)(2003),e123.
张晓君

导师姓名
张晓君
研究方向微生物生态学;环境微生物学
联系方式通讯地址：上海市东川路800号上海交通大学生命学院

邮政编码：200240

联系电话：021-34204878

Email：xjzhang68@sjtu.edu.cn
个人简介

男，博士，研究员，中国微生物学会环境微生物专业委员会委员，上海市微生物学会理事，上海市微生物学会环境微生物专业委员会委员。多个国际SCI刊物及国内核心期刊的审稿人。2002年至2004年在挪威农业大学（现挪威生命科学大学）博士后研究。参加法国﹑德国﹑挪威﹑意大利﹑荷兰等国合作的欧盟项目“TRANSBAC”，主要从事分子微生物生态学与基因转移的研究。2004年起在上海交通大学生命科学技术学院从事微生物分子生态学与生态基因组的研究。2006年赴法国进行5个月的合作研究,与PascalSimonet教授合作进行了环境微生物功能基因的克隆新策略的研究。先后主持国家自然科学基金项目两项，及教育部留学回国人员启动基金、上海市农委重点科技攻关项目各一项、上海市国际合作项目两项，参与国家自然科学基金重点项目一项，还承担了863重点项目的研究工作及其它横向课题。主要从事工业废水微生物处理过程微生物群落结构与功能分析、功能菌分离、功能基因的克隆、农业土壤环境的分子生态学、石油油藏微生物分析等方面的研究工作。我们实验室具有广泛的国际合作与交流，注重学生的国际化培养。热忱欢迎有志于微生物、微生物生态与生态基因组学研究的同学来我们实验室参观学习和攻读研究生！
代表性论著
1.XiaojunZhang*,PascalSimonetand&#197;saFrosteg&#229;rd.Fateofinvadingbacteriainsoilandsurvivaloftransformantsaftersimulateduptakeoftransgenes,asevaluatedbyamodelsystembasedonlindanedegradation.ResearchinMicrobiology,2012，10.1016/j.resmic.2012.01.0072.XieB#;,XiongS,LiangS,HuC,ZhangX#,LuJ..Performanceandbacterialcompositionsofagedrefusereactorstreatingmaturelandfillleachate.BioresourceTechnology,2011,doi:10.1016/j.biortech.2011.09.114.(#Jointfirstauthors)3.RenH,ZhangX*,SongZ,RupertW,GaoG,GuoS,ZhaoL.ComparisonofMicrobialCommunityCompositionsofInjectionandProductionWellSamplesinaLong-termWater-FloodedPetroleumReservoir.PlosOne,2011，6(8):e23258.doi:10.1371/journal.pone.00232584.ZhangX*，YueS,ZhongH,HuaW,ChenR,CaoY,andZhaoL.Adiversebacterialcommunityinananoxicquinoline-degradingbioreactordeterminedbyusingpyrosequencingandclonelibraryanalysis.AppliedMicrobialandBiotechnology,2011,2011,91:425–434.5.WangT,ZhangX*,ZhangM,WangL,ZhaoL.DevelopmentofaSequencer-basedrRNARestrictionTyping(SRT)MethodforMonitoringStructuralShiftsofMicrobialCommunities.ArchivesinMicrobiology,2011,193:341–350.6.MaoY,ZhangX*,XiaX,ZhongH,ZhaoL.Versatilearomaticcompound-degradingcapacityandmicrodiversityofThauerastrainsisolatedfromacokingwastewatertreatmentbioreactor.JIndMicrobiolBiotechnol.2010,37:927-934.7.HongX,ZhangX*,LiuB,MaoY,LiuY,andZhaoL.Structuraldifferentiationofmicrobialcommunitiesintwoefficientindoledegradingbioreactorsusingdifferenttreatmentprocesses.ResearchinMicrobiology,2010,161(8):687-693.8.WangL.,JinY.,ZhaoL.,PangX.andZhangX*.ERIC-PCR-basedstrain-specificdetectionofphenol-degradingbacteriainactivatedsludgeofwastewatertreatmentsystems.LettersinAppliedMicrobiology,2009,49:522-528.9.ZhangX,MaX,WangN,YaoT.NewsubgroupofBacteroidetesanddiversemicroorganismsinTibetanplateauglacialiceprovideabiologicalrecordofenvironmentalconditions.FEMSMicrob.Ecol.,2009,67：21-29.10.MaoY,ZhangX*,YanX,LiuB,ZhaoL.Developmentofgroup-specificPCR-DGGEfingerprintingformonitoringstructuralchangesofThaueraspp.inanindustrialwastewatertreatmentplantrespondingtooperationalperturbations.JMicrobiolMethods.2008,75:231-236.
张雪洪

导师姓名
张雪洪
研究方向微生物代谢工程;生物物质分离纯化
联系方式通讯地址：上海市东川路800号生命科学技术学院

邮政编码：200240

联系电话：021-34206715;34204854

Email：xuehzhang@sjtu.edu.cn
个人简介

现任上海交通大学生命科学技术学院副院长、生物工程系教授、博士生导师。1966年生于浙江，1982-1986年浙江大学化学工程本科，1986-1989年浙江大学生物化工硕士，自研究生毕业起，即在上海交通大学生物工程系工作，一直从事生物工程上下游的教学和研究，历任助教、讲师、副教授、教授。1997-1999年在日本东京大学进修。1999年获得生物工程博士学位。2000年起先后任上海交大生命科学技术学院副院长、常务副院长。2004年入选教育部新世纪优秀人才。近五年来，主持和参加包括国家自然科学基金面上项目与重点项目、国家“十一五”863重大项目、973子课题等科研项目。共发表论文40余篇，其中SCI收录论文20余篇，出版著作两部。曾获国家发明专利授权四项，多项成果实现了产业化，包括微生物生态制剂、生化试剂蛋白胨、生物农药等。科研成果先后于1996年获国内贸易部科技进步三等奖，1999年、2001年分别两次获上海市产学研优秀工程项目二等奖。2005年获明治乳业生命科学奖。2007年获上海市科技进步一等奖（3）。2009年获上海市教学成果一等奖。主要研究方向：微生物发酵与代谢工程、生物物质的分离与纯化、基因表达与蛋白质工程等。
代表性论著
1、LingHuang,MingminChen,WeiWang,HongboHu,HuasongPeng,YuquanXu,XuehongZhang.(2011)Enhancedproductionof2-hydroxyphenazineinPseudomonaschlororaphisGP72.AppliedMicrobiologyandBiotechnology.2011,89：169-177.2、JieChen,WeiWang,YuquanXu,andXuehongZhangSlow-ReleaseFormulationofaNewBiologicalPesticide,Pyoluteorin,withMesoporousSilica.J.Agric.FoodChem.2011,59:307-311.3、JingfangZhang,WeiWang,XiaohuiLu,YuquanXuandXuehongZhang.Thestabilityanddegradationofanewbiologicalpesticide,pyoluteorin.PestManagSci.2010,66(3):248-252.
赵立平

导师姓名
赵立平
研究方向微生物分子生态学;人体系统生物学
联系方式通讯地址：东川路800号生命科学技术学院

邮政编码：200240

联系电话：34204877

Email：lpzhao@sjtu.edu.cn
个人简介

在国内最早系统开展微生物分子生态学研究，在复杂微生物群落结构分析技术和统计计算方法等方面做了很多创新性工作。对广泛使用的PCR-DGGE技术做了重要改进，成为国际上使用该技术研究微生物生态学的先进实验室之一；创新建立了基于随机扩增指纹图技术和分子杂交技术，分析对比群落结构，发现重要功能细菌基因组片段作为分子标记的技术方法。对人和动物的肠道、处理工业废水的生化池、土壤、油藏等环境中的微生物群落结构与功能的关系做了大量的研究工作，取得了有意义的结果。在PNAS(ProceedingsofNationalAcademyofSciences),NRDD(NatureReviewDrugDiscovery),AEM(AppliedandEnvironmentalMicrobiology)、ISMEJournal,BMCBioinformatics,JournalofProteomeResearch,JournalofClinicalMicrobiology,MicrobialEcology、FEMSMicrobiologyEcology、JournalofMicrobiologicalMethods、FEMSMicrobiologyLetters、《微生物学报》、《生态学报》等刊物发表相关论文二十余篇，研究工作得到国际同行的关注。应邀在第八届细菌遗传学与生态学国际研讨会（法国里昂）上做keynote报告，在第十届国际微生物生态大会环境生物技术分会（墨西哥坎昆）做报告。在第十一届国际微生物生态大会人体微生态分会（奥地利维也纳）做报告，并联合主持“污泥元基因组学”圆桌讨论会。在2006年8月被选为国际微生物生态学会12名常务理事之一。近年来，积极推动系统生物学理念在微生物生态学领域特别是人体肠道菌群研究中的应用，注重发展用代谢组学和元基因组学相结合的方法研究肠道菌群在肥胖、糖尿病等复杂疾病中的作用，并积极探讨用肠道菌群的整体结构变化来监测人体健康变化、评价中医药疗效的问题，开始形成一个新的以元基因组学研究为核心的人体系统生物学新方向。
代表性论著
ZhaoLipingandShenJian.Whole-bodysystemsapproachesforgutmicrobiota-targeted,preventivehealthcare.JournalofBiotechnology,2010,doi:10.1016/j.jbiotec.2010.02.008ZhangC,ZhangM,WangS,HanR,CaoY,HuaW,MaoY,ZhangX,PangX,WeiC,ZhaoG,ChenY,ZhaoL..Interactionsbetweengutmicrobiota,hostgenetics,anddietrelevanttodevelopmentofmetabolicsyndromesinmice.ISMEJ,2010.4(2):232-241.LiM,WangB,ZhangM,RantalainenM,WangS,ZhouH,ZhangY,ShenJ,PangX,ZhangM,WeiH,ChenY,LuH,ZuoJ,SuM,QiuY,JiaW,XiaoC,SmithLM,YangS,HolmesE,TangH,ZhaoG,NicholsonJK,LiL,ZhaoL.Symbioticgutmicrobesmodulatehumanmetabolicphenotypes.ProcNatlAcadSciUSA.,105(6):2117-22.,2008JiaW，LiH,ZhaoL&J.K.Nicholson.Gutmicrobiota:apotentialnewterritoryfordrugtargeting.NatureReviewsDrugDiscovery，7:123-129,2008.(IF:20.97)PiaoZ,YangL,ZhaoL,YinS.Actinobacterialcommunitystructureinsoilsreceivinglong-termorganicandinorganicamendments.ApplEnvironMicrobiol.,74(2):526-30,2008WeiG,LuH,ZhouZ,XieH,WangA,NelsonK,ZhaoL.Themicrobialcommunityinthefecesofthegiantpanda(Ailuropodamelanoleuca)asdeterminedbyPCR-TGGEprofilingandclonelibraryanalysis.MicrobEcol.54(1):194-202,2007PangX,XHua,QYang,DDing,CChe,LCui,Wjia,PBucheliandLZhao.Inter-speciestransplantationofgutmicrobiotafromhumantopigs.TheISMEJournal,1(2):156-162,2007ShenJ,BZhang,GWei,XPang,HWei,MLi,YZhang,WJia,andLZhao.MolecularProfilingoftheClostridiumleptumSubgroupinHumanFecalMicroflorabyPCR-DenaturingGradientGelElectrophoresisandCloneLibraryAnalysis.Appliedandenvironmentalmicrobiology,72(8):5232-5238,2006.Cao,Y,L.Wang,K.Xu,C.Kou,Y.Zhang,G.Wei,J.He,Y.Wang,L.Zhao.Informationtheory-basedalgorithmforinsilicopredictionofPCRproductswithwholegenomicsequencesastemplates.BMCBioinformatics,6(1):190-,2005.
赵一雷

导师姓名
赵一雷
研究方向计算化学生物学;结构生物信息学
联系方式通讯地址：上海交通大学生命学院（东川路800号）生物药物楼4号楼

邮政编码：200240

联系电话：021-34207190

Email：yileizhao@sjtu.edu.cn
个人简介

上海交通大学，生命科学技术学院/微生物代谢国家重点实验室，教授（计算化学生物学博士生导师）,致力于计算机在化学和生物化学中的应用研究，相关工作在国内外计算化学领域产生了一定的影响。已发表SCI论文44篇(第一作者或通讯作者20篇)，累积影响因子超过150，H指数14，他引超过500次，部分结果发表在化学领域顶级期刊如J.Am.Chem.Soc.，以及理论计算化学技术领域主流期刊，如J.Phys.Chem.等杂志上。研究成果：第一次阐明了生物学中DNA手性硫修饰的结构效应和被H2O2氧化所产生的中间体结构。首先，利用量子力学从头计算法构建硫修饰的打分函数，并对核酸晶体数据库NDB中全部DNA分子进行虚拟的手性磷硫酰化修饰，进一步通过结构模型分析，发现Rp手性磷硫酰化修饰通过打破原磷酸基团的氧与脱氧核糖C2’上氢之间的[CH---O]弱氢键，产生了类似RNA中C2’羟基化所导致结构排斥效应（stericeffect），相关结果发表在J.Phys.Chem.B.上【Zhangetal.,2012】。进一步对硫修饰DNA在H2O2作用下的氧化中间产物的HPLC-MS/MS谱进行理论计算分析，成功发现磷硫酰化核苷氧化脱硫生成三配位三价有机磷衍生物亚膦酸二酯（三角锥形）中间体，通过阿尔布佐夫(Arbuzov)重排反应，生成相对稳定的含P=O键四配位互变异构体，而后进一步被氧化为正常DNA中的磷酸二酯,相关结果发表在Nuc.AcidsRes.上【Xieetal.,2012】。受教育经历（从大学本科开始，按时间倒排序）：1998/12–2002/06，香港科技大学，化学系/理论与计算有机化学实验室，博士（导师：吴云东院士）1994/09–1997/06，北京大学，化学与分子工程学院/稀土材料化学及应用国家重点实验室，硕士（导师：黄春辉院士）1989/09–1994/06，中国科技大学，应用化学系，本科研究工作经历（按时间倒排序）：2011/01–至今，上海交通大学，微生物代谢国家重点实验室，教授2010/10–至今，上海交通大学，生物信息学与生物统计学系，副系主任2009/05–至今，上海交通大学，生命科学技术学院，教授、博士生导师2005/10–2009/04，美国国家标准与技术研究院，化学科学技术研究所化学科学部，研究员（获INEST-Fellowship资助）。部门主任：CarlosGonzalez博士2002/10–2005/09，美国加州大学洛杉矶分校，化学与生物化学系，博士后访问学者（获UCLA优秀博士后嘉奖）。导师：KendallN.Houk院士奖励：1．赵一雷，新世纪优秀人才，教育部，20122．赵一雷，上海市“浦江人才”计划，上海市科委，20103．赵一雷，上海市“东方学者”特聘教授，上海市教委，20094．ZhaoYi-Lei,INESTFellowship,美国PMUSA，2005-20075．ZhaoYi-Lei,优秀博士后嘉奖,美国加州大学洛杉矶分校（UCLA），2005最近主持的科研项目：１）“酶分子规模化改造计算设计关键技术研究及应用”科技部863计划　项目编号：2012AA020403，2012-2015，357万元，子课题四负责人２）“重编程造血细胞的基础与临床应用研究”科技部973计划　项目编号：2013CB966800，2013-2016，1237万元，子课题二任务四负责人３）“重要微生物合成与降解代谢的分子机理”国家自然科学基金创新群体　项目编号：30821005/31121064，　2008-2013，1100万元，计算化学子课题负责人４）“漆酶介体体系(LMS)中活性物质的形成与演化分子机理”国家自然科学基金面上项目　项目编号：21377085,2014-2017,82万元，项目负责人５）“酶动态催化活性中心计算机辅助分子设计技术”上海市科委浦江计划　项目编号：10PJ1405200，2010-2012，25万元，项目负责人6）“重要生物化学反应中活性自由基和生物分子的互作与调节关系”教育部博士点新教师基金项目编号Z1025507,2011-2013，项目负责人
代表性论著
(最近更新见：http://202.120.45.208:8080/publication.html)44.ShangliCheng,BaofengLian,JuanLiang,TingShi,LuXieandYi-LeiZhao.Siteselectivityforproteintyrosinenitration:insightsfromfeaturesofstructureandtopologicalnetwork.Mol.BioSyst.DOI:10.1039/c3mb70260j.[epubahead]43.YeHuang,ZhuoChen,YueChen,HaoZhang,YichaoZhang,YileiZhao,ZhenjunYang,andLiheZhang.EffectsofConformationalAlterationInducedbyD&#8209;/L&#8209;IsonucleosideIncorporationinsiRNAonTheirStabilityinSerumandSilencingActivity.BioconjugateChem.2013,24,951&#8722;95942.LeiYuwen,Feng-LiZhang,Qi-HuaChen,Shuang-JunLin,Yi-LeiZhao,Zhi-YongLi.TheroleofaromaticL-aminoaciddecarboxylaseinbacillamideCbiosynthesisbyBacillusatrophaeusC89.SciRep.2013;3:1753.doi:10.1038/srep01753.41.Chen,D.,H.Tang,Y.Lv,Z.Zhang,K.Shen,K.Lin,Y.Zhao,G.WuandP.Xu2013.StructuralandcomputationalstudiesofthemaleateisomerasefromPseudomonasputidaS16revealabreathingmotionwrappingthesubstrateinside.MolecularMicrobiology.87(6):1237–1244.40.Zhang,Y-C;Liang,L;Lian,P;Han,Y-W;Chen,Y-F;Bai,L-Q,WangZ-J,Liang,J-D;Deng,Z-X;ZhaoY-L.(2012)TheoreticalStudyonStericEffectsofDNAPhosphorothioation:B-HelicalDestabilizationinRp-PhosphorothioatedDNA.J.Phys.Chem.B,116(35):10639–10648.39.Liang,J;Cheng,SL;Hou,JW;Xu,Z-H;Zhao,Y-L*.(2012)Car-ParinellomoleculardynamicssimulationsofthionitroxideandS-nitrosothiolinthegasphase,methanol,andwater—AtheoreticalstudyofS-nitrosylation.Sci.ChinaChem.,55(10):2081-2088.38.XieX,LiangJ,PuT,XuF,YaoF,YangY,ZhaoYL,YouD,ZhouX,DengZ,WangZ.(2012)PhosphorothioateDNAasanantioxidantinbacteria.Nucl.AcidsRes.40(18):9115-912437.Xu,M.-J.;Liu,X.-J.;Zhao,Y.-L.;Liu,D.;Xu,Z.-H.;Lang,X.-M.;Ao,P.;Lin,W.-H.;Yang,S.-L.;Zhang,Z.-G.;Xu,J.(2012)IdentificationandCharacterizationofanAnti-FibroticBenzopyranCompoundIsolatedfromMangrove-DerivedStreptomycesxiamenensis.MarineDrugs10,639-654.36.Li,YQ;Du,XL;Lu,ZJ;Wu,DQ;Zhao,YL;Ren,B;Huang,JF;Huang,XQ;Xu,YH;Xu,YQ.(2011)“RegulatoryFeedbackLoopofTwophzGeneClustersthrough5′-UntranslatedRegionsinPseudomonassp.M18”.PLoSONE6(4):e19413.doi:10.1371/journal.pone.0019413.34.Schulz,P.;Zangmeister,C.D.;Zhao,YL;Frail,P.R.;Saudari,S.R.;Gonzalez,C.A.;Kagan,C.R.;Wuttig,M.;vanZee,R.D.(2010)“ComparisonoftheEnergy-levelAlignmentofThiolateandCarbodithiolate-BoundSelf-AssembledMonolayersonGold”.J.Phys.Chem.C,114(48),20843–20851.33.Zhao,YL*;Meot-Ner,M.;Gonzalez,C.(2009)“IonicHydrogenBondNetworksandIonSolvation1.AnEfficientMonteCarlo/QuantumMechanicalMethodforStructuralSearchandEnergyComputations:Ammonium/Water”,J.Phys.Chem.A,113(12),2967-2974.32.Zhao,YL*;Flora,J.W.;Thweatt,W.D.;Garrison,S.L.;Gonzalez,C.;Houk,K.N.;Marquez,M.(2009)“PhosphinePolymerizationbyNitricOxide:ExperimentalCharacterizationandTheoreticalPredictionsofMechanism”,InorganicChemistry,48(3),1223-1231.31.Bartalis,J.;Zhao,YL,Flora,J.W.;Paine,J.B.;Wooten,J.B.(2009)“Carbon-CenteredRadicalsinCigaretteSmoke:AcylandAlkylaminocarbonylRadicals”,AnalyticalChemistry,81(2),631-641.30.Penoni,A.;Palmisano,G.;Zhao,YL;Houk,K.N.;Volkman,J.;Nicholas,K.M.(2009)“OntheMechanismofNitrosoarene-AlkyneCycloaddition”,J.Am.Soc.Chem.131(2),653-661.29.Wu,Y.-D.;Han,W.;Wang,D.-P.;Gao,Y.;Zhao,YL.(2008)“TheoreticalAnalysisofSecondaryStructuresofbeta-Peptides”,AccountsofChemicalResearch,41,1418－1427.
钟建江

导师姓名
钟建江
研究方向分子生物化学工程;发酵工程
联系方式通讯地址：东川路800号生命学院生物楼#3-311

邮政编码：200240

联系电话：021-34206968

Email：jjzhong@sjtu.edu.cn
个人简介

钟建江，教授，博导，****，国家杰出青年科学基金获得者，“新世纪百千万人才工程”国家级人选。1993年获大阪大学工学博士学位。1993年8月任华东理工大学副教授，1996年11月起任华东理工大学教授，1998-2006年任生物反应器工程国家重点实验室主任。2007年任上海交通大学特聘教授。曾获“全国优秀留学回国人员”称号。目前兼任亚洲生物技术联盟(AFoB)秘书长兼常务理事；ProcessBiochemistry(Elsevier)主编，Biotechnology&AppliedBiochemistry(IUBMB&Wiley)主编，BiotechnologyandBioengineering(Wiley)副主编，BioprocessandBiosystemsEngineering(Springer)副主编等10多本国际刊物编委。主要从事生物工程（分子生物化工、发酵工程）与应用微生物学研究，当前研究方向包括(1)分子生物化工(MolecularBioengineering/BiochemicalEngineering)；(2)先进发酵工程技术与系统生物学(AdvancedFermentationTechnology&SystemsBiology)；(3)生物能源与合成生物学(Bioenergy&SyntheticBiology)；等。发表SCI收录论文200余篇（18篇发表在生物化学工程/发酵工程领域之顶尖期刊BiotechnologyandBioengineering），被他引2400余篇次，H指数为26，由Springer出版著作4本，国际会议做特邀报告50余次。曾获日本生物工学会首届国际学术奖YoungAsianBiotechnologistPrize；教育部自然科学一等奖；韩国生物工程与生物技术学会ResearchExchangeAward；黑龙江省自然科学学术成果一等奖；上海市自然科学二等奖。承担973课题、国家自然科学基金项目等。
代表性论著
1.InducedeffectofNa+onganodericacidbiosynthesisinstaticliquidcultureofGanodermalucidumviacalcineurinsignaltransduction.XuYN,XiaXX,ZhongJJ*,BiotechnolBioeng,2013,110(7):1913-19232.Exogenous1,4-butyrolactonestimulatesA-factorcascadeandvalidamycinbiosynthesisinStreptomyceshygroscopicus5008.TanGY,BaiLQ*,ZhongJJ*,BiotechnolBioeng,2013(DOI10.1002/bit.24965)3.Efficientethanolproductionfromcorncobresiduesbyrepeatedfermentationofanadaptedyeast.FanC,QiK,XiaXX,ZhongJJ*,BioresourTechnol,2013,136:309-3154.EnhancedrecoveryofantitumorganodericacidTfromGanodermalucidummyceliabynovelchemicalconversionstrategy.WangJL,GuT,ZhongJJ*,BiotechnolBioeng,2012,109(3):754-7625.ImpactsofcalciumsignaltransductiononthefermentationproductionofantitumorganodericacidsbymedicinalmushroomGanodermalucidum.XuYN,ZhongJJ*,BiotechnolAdv,2012,30:1301-13086.EnhancementofganodericacidaccumulationbyoverexpressionofanN5terminaltruncated3-hydroxy-3-methylglutarylCoAreductasegeneinbasidiomyceteGanodermalucidum.XuJW,XuYN,ZhongJJ*,ApplEnvironMicrobiol,2012,78(22):7968-79767.DesignandconstructionofimprovednewvectorsforZymomonasmobilisrecombinants.DongHW,BaoJ*,RyuDDY*,ZhongJJ*,BiotechnolBioeng,2011,108:1616-16278.Novelantiphytopathogeniccompound2-heptyl-5-hexylfuran-3-carboxylicacid,producedbynewlyisolatedPseudomonassp.strainSJT25.WangXY,XuYQ,LinSJ,LiuZZ,ZhongJJ*,ApplEnvironMicrobiol,2011,77:6253-62579.Zhong,J.J.(ed.):Biomanufacturing.AdvancesinBiochemicalEngineering/Biotechnology,Vol.87,Springer-Verlag,Heidelberg,March2004.ISBN:3-540-20501-210.JJZhong,JHXiao.Secondarymetabolitesfromhigherfungi:discovery,bioactivity,andbioproduction.AdvancesinBiochemicalEngineering/Biotechnology113:79-150,2009.11.ZhongJ-J.(ed.):FutureTrendsinBiotechnology.AdvancesinBiochemicalEngineering/Biotechnology,Vol.131,Springer-Verlag,Heidelberg,2013.ISBN978-3-642-36508-9.DOI10.1007/978-3-642-36508-9
周宁一

导师姓名
周宁一
研究方向有机化合物的微生物分解代谢;合成生物学与污染控制
联系方式通讯地址：上海市东川路800号，生物药学楼上海交通大学生命科学技术学院教务办转

邮政编码：200240

联系电话：13628674371

Email：n.zhou@pentium.whiov.ac.cn
个人简介

武汉大学微生物学学士，英国伦敦帝国理工学院微生物学博士，帝国理工学院和威尔士大学博士后。2000年入选中国科学院"百人计划"。任中国科学院武汉病毒研究所研究员，中国科学院农业与环境微生物学重点实验室主任，武汉病毒所学位评定委员会主任，应用与环境微生物研究中心主任，获"国务院政府特殊津贴”。兼任中国微生物学会环境微生物学专业委员会副主任委员，《微生物通报》副主编，"JournalofAppliedMicrobiology"and"LettersinAppliedMicrobiology"编辑,"AppliedandEnvironmentalMicrobiology"and"Biodegradation"编委"。从事有机化合物的微生物分解代谢，合成生物学与污染控制的研究。
代表性论著
1.ChaoHJandNYZhou*.2013.GenR,anIclR-typeregulator,activatesandrepressesthetranscriptionofgengenesinvolvedin3-hydroxybenzoateandgentisatecatabolisminCorynebacteriumglutamicum.J.Bacteriol.195:1598-16092.LiuK,TTLiuandNYZhou*.2013.HbzFcatalyzesdirecthydrolysisofmaleylpyruvateinthegentisatepathwayofPseudomonasalcaligenesNCIMB9867.Appl.Environ.Microbiol.79:1044-10473.LiuTTandNYZhou*.2012.NovelL-cysteine-dependentmaleylpyruvateisomeraseinthegentisatepathwayofPaenibacillussp.StrainNyZ101.J.Bacteriol.194:3987-39944.XiaoY,TTLiu,HDai,JJZhang,HLiu,HTang,DJLeakandNYZhou*.2012.OnpA,anunusualflavin-dependentmonooxygenasecontainingacytochromeb5domain.J.Bacteriol.194:1342-13495.XuY,XGao,SHWang,HLiu,PAWilliamsandNYZhou*.2012.MhbTisaSpecificTransporterfor3-HydroxybenzoateUptakebyGram-NegativeBacteria.Appl.Environ.Microbiol.78:6113-61206.LiuH,SJWang,JJZhang,HDai,HTang,andNYZhou*.2011.Patchworkassemblyofnag-likenitroarenedioxygenasegenesand3-chlorocatecholdegradationclusterforthepathwayevolutionof2-chloronitrobenzenecatabolisminPseudomonasstutzeriZWLR2-1.Appl.Environ.Microbiol.77:4547-45527.ZhangJJ,HLiu,YXiao,XEZhang,NYZhou*.2009.Identificationandcharacterizationofcatabolicpara-nitrophenol4-monooxygenaseandpara-benzoquinonereductasefromPseudomonassp.strainWBC-3.J.Bacteriol.191:2703-27108.ZhaoS,ARamette,GLNiu,HLiu,NYZhou*.2009.Effectsofnitrobenzenecontaminationandofbioaugmentationonnitrificationandammonia-oxidizingbacteriainsoil.FEMSMicrobiolEcol.70:315-3239.XiaoY,JJZhang,HLiu,andNYZhou*.2007.Molecularcharacterizationofanovelortho-nitrophenolcatabolicgeneclusterinAlcaligenessp.strainNyZ215.J.Bacteriol.189:6587-6593.10.YanDZ,H.Liu,andNYZhou*.2006.ConversionofSphingobiumchlorophenolicumATCC39723toahexachlorobenzenedegraderbymetabolicengineering.Appl.Environ.Microbiol.72:2283-2286.11.Zhou,NY,JAl-Dulayymi,MSBaird,andPAWilliams*.2002.Salicylate5-hydroxylasefromRalstoniasp.strainU2:amonooxygenasewithcloserelationshipstoandsharedelectrontransportproteinswithnaphthalenedioxygenase.J.Bacteriol.184:1547-1555.12.Zhou,NY.SLFuenmayor,andPAWilliams*.2001.naggenesofRalstonia(formerlyPseudomonas)sp.strainU2encodingenzymesforgentisatecatabolism.J.Bacteriol.183:700-708.13.Zhou,NY,AJenkins,CKChanKwoChion,andDJLeak*.1999.ThealkenemonooxygenasefromXanthobacterstrainPy2iscloselyrelatedtoaromaticmonooxygenasesandcatalyzesaromaticmonohydroxylationofbenzene,toluene,andphenol.Appl.Environ.Microbiol.65:1589-1595.(*通讯作者)
周秀芬

导师姓名
周秀芬
研究方向DNA硫修饰生物学;抗生素生物合成
联系方式通讯地址：上海交通大学生命学院

邮政编码：200030

联系电话：021-62933404

Email：xfzhou@sjtu.edu.cn
个人简介

周秀芬，1960年8月出生，1982年7月毕业于南开大学获学士学位；1987年7月毕业于华中农业大学获硕士学位;l992年12月毕业于英国东英格兰大学获得博士学位。1993年至1999年每年去英国JohnInnes研究所从事合作研究。1988年7月至2000年6月在华中农业大学历任助教、讲师、副教授、教授、博士生导师；2000年7月调入上海交通大学Bio-X生命科学研究中心，任教授、博士生导师。己先后发表论文80余篇。1995年被授予农业部有突出贡献的中青年专家；1996年获湖北省青年科技奖，并被授予"百名跨世纪优秀青年人才"和"新长征突击手标兵"荣誉称号；同年获得国家自然科学基金委优秀中青年人才专项基金；1998年获得国家杰出青年科学基金并入选教育部“跨世纪人才”计划；2000年获明治乳业生命科学优秀奖；2003年获上海市教育系统三八红旗手；2004年入选首批新世纪百千万人才工程国家级人选；2005年获上海市科技进步奖一等奖;其科研成果于2005、2006连续两年入选中国高校十大科技进展、2007年全球十大科技新闻；2008年获国家自然科学二等奖。
代表性论著
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缪晓玲

导师姓名
缪晓玲
研究方向微藻固碳及生物能源技术;微藻活性物质与生物制药
联系方式通讯地址：东川路800号上海交通大学生命科学技术学院

邮政编码：200240

联系电话：021-34207028,13585964361

Email：miaoxiaoling@sjtu.edu.cn
个人简介

缪晓玲，博士，研究员，博士生导师。1984年华东师范大学生物系本科毕业，2005年1月清华大学博士毕业，1996年10月至1997年10月在英国UniversityofWalesSwansea作访问学者。SCI期刊BioMedResearchInternational编委。主讲上海交通大学本科生课程《生物学概论》、《分子生物学》及研究生课程《分子遗传学》。主要从事微藻生物能源技术、微藻固碳及分子生物学、微藻活性物质与生物制药等方面的研究。主持或作为子课题负责人承担上海科技创新行动计划项目、国家863、973、转基因重大专项以及中海油等科研项目。研究方向：1、微藻生物能源技术；2、微藻固碳及分子生物学；3、微藻活性物质与生物制药。
代表性论著
最近论文：1.WeiHan,ChunyingLi,XiaolingMiao*,GuangxinYu.AnovelminiatureculturesystemtoscreenCO2-sequesteringmicroalgae.Energies,2012,5(11):4372-43892．DahaiTang,WeiHan,PenglinLi,XiaolingMiao*,JianjiangZhong.CO2biofixationandfattyacidcompositionofScenedesmusobliquusandChlorellapyrenoidosainresponsetodifferentCO2levels.BioresourceTechnology,2011,102(3):3071-30763．PenglinLi,XiaolingMiao*,RongxiuLi,JianjiangZhong.Insitubiodieselproductionfromfast-growingandhighoilcontentChlorellapyrenoidosainricestrawhydrolysate.JournalofBiomedicineandBiotechnology,2011,doi:10.1155/2011/1412074．XiaolingMiao*,RongxiuLi,HongyanYao.Effectiveacid-catalyzedtransesterificationforbiodieselproduction.EnergyConversionandManagement2009,50(10):2680-26845．XiaolingMiao,QingyuWu.Biodieselproductionfromheterotrophicmicroalgaloil.BioresourceTechnology,2006,97(6):841-846
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导师姓名
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研究方向医学基因组学国家重点实验室招生7人
联系方式通讯地址：null

邮政编码：null

联系电话：null

Email：null
个人简介

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代表性论著
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