招生简介致考生书招生院系与专业导师介绍参考书籍联系方式信息公告
DanielMarkCzajkowsky

导师姓名
DanielMarkCzajkowsky
研究方向生物单分子结构与功能;纳米生物医药
联系方式通讯地址：上海市东川路800号系统生物医学研究院D204

邮政编码：200240

联系电话：13564384222

Email：dczaj@sjtu.edu.cn
个人简介

博士，研究员。1992年毕业于加拿大阿尔伯塔大学物理系，获学士学位；2000年毕业于美国弗吉尼亚大学分子生理与生物物理系，获生物物理学博士学位。2000年至2010年于美国弗吉尼亚大学任研究助理（ResearchAssociate）；2010年至2012年，获聘中科院外籍青年科学家（YoungInternationalFellowship），在中国科学院上海应用物理研究所全职工作。2013年起进入上海交通大学系统生物医学研究院，获聘研究员。Czajkowsky博士已发表期刊论文40余篇，以第一作者或通讯作者在PNAS,ACSNano,EMBOMolMed,Appl.Phys.Lett.以及Nature子刊等期刊发表了多篇论文，2篇入选“Facultyof1000”，h-index：19（ISI）。主要研究方向：（1）应用单分子及计算模拟方法研究蛋白质分子的基本性质；（2）研究抗体与其它分子的超分子复合物以及多聚Fc融合蛋白的结构与功能研究，发展新的治疗方法和疫苗；（3）研究建立高通量单分子技术体系；（4）生物检测仪器的开发，如低温原子力显微镜等。
代表性论著
1.J.Zhang,D.M.Czajkowsky*,Y.Shen,J.Sun,C.Fan,J.HuandZ.Shao*,Biascontrolledcapacitivedrivencantileveroscillationforhighresolutiondynamicforcemicroscopy,AppliedPhysicsLetters,102,0731101-731104,2013.2.D.M.Czajkowsky,J.Hu,Z.ShaoandR.J.Pleass,Fc-fusionproteins:newdevelopmentsandfutureperspectives,EMBOMolecularMedicine,4,1015-1028,2012.3.D.M.Czajkowsky,L.Li,J.Sun,J.HuandZ.Shao,HeteroepitaxialStreptavidinNanocrystalsRevealCriticalRoleofProton"Fingers"andSubsurfaceAtomsinDeterminingAdsorbedProteinOrientation,ACSNano,6,190-198,2012.4.D.M.CzajkowskyandZ.Shao,RedefiningtheStructureoftheHumanIgMPentamer:AMushroom-ShapedComplexwithaFlexuralBias.ProceedingsofNationalAcademyofSciencesUSA,106,14960-14965,2009.5.D.M.Czajkowsky,H.Iwamoto,T.Cover,andZ.Shao,TheVacuolatingToxinFromHelicobacterpyloriFormsHexamericPoresinLipidBilayersatLowpH.ProceedingsofNationalAcademyofSciencesUSA,96,2001-2006,1999.
敖平

导师姓名
敖平
研究方向系统生物;癌症与代谢及其相关现象机理研究
联系方式通讯地址：上海闵行区东川路800号系统生物医学研究楼C203室

邮政编码：200240

联系电话：021-34207042

Email：aoping@u.washington.edu
个人简介

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代表性论著
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陈赛娟

导师姓名
陈赛娟
研究方向白血病发病机制研究;白血病产物靶向治疗
联系方式通讯地址：上海市瑞金二路197号瑞金医院上海血液学研究所

邮政编码：200025

联系电话：021-64370045-610604

Email：sjchen@stn.sh.cn
个人简介

中国工程院院士。1975年毕业于上海交通大学医学院(原上海第二医科大学)，1981年获医学硕士学位，1989年获法国巴黎第七大学科学博士。现任中国科学技术协会副主席、上海交通大学医学院教授、博士生导师，上海血液学研究所研究员、所长，医学基因组学国家重点实验室主任，十届、十一届全国人大代表。她主要从事肿瘤的细胞遗传部和分子遗传学研究，在大量白血病核型分析的基础上发现了一组新的染色体易位的白血病。在多种白血病发生、发展的细胞和分子机制研究方面取得了一系列创新性成果。获得包括国家自然科学二等奖在内的国家和省部级科技奖9项，并获全国劳动模范、全国“三八”红旗手、全国十佳女职工、全国十大女杰等国家级荣誉称号。
代表性论著
1.GuBW,XiongH,ZhouY,ChenB,WangL,DongS,YuZY,LuLF,ZhongM,YinHF,ZhuGF,HuangWH,RenSX,RE.Gallagher,SWaxman,ChenGQ,WangZG,ChenZ,FuG,ChenSJ.Variant-typePML-RARfusiontranscriptinacutepromyelocyticleukemia:Useofacrypticcodingsequencefromintron2oftheRARgeneandidentificationofanewclinicalsubtyperesistanttoretinoicacidtherapy.ProcNatlAcadSciUSA2002;99:7640–76452.ShenZX,ShiZZ,FangJ,GuBW,LiJM,ZhuYM,ShiJY,ZhengPZ,YanH,ChenY,ShenY,WuW,TangW,WaxmanS,deThéH,WangZY,ChenSJ,ChenZ.All-transretinoicacid/As2O3combinationyieldsahighqualityremissionandsurvivalinnewlydiagnosedacutepromyelocyticleukemia.ProcNatlAcadSciUSA2004;101:5328-5335.3.LiuH,ChenB,XiongH,HuangQH,ZhangQH,WangZG,LiBL,ChenZ,ChenSJ.FunctionalcontributionofEENtoleukemogenictransformationbyMLL-EENfusionprotein.Oncogene2004;23:3385-3394.4.WangYY,ZhouGB,YinT,ChenB,ShiJY,LiangWX,JinXL,YouJH,YangG,ShenZX,ChenJ,XiongSM,ChenGQ,XuF,LiuYW,ChenZ,ChenSJ.AML1-ETOandC-KITmutation/overexpressionint(8;21)leukemia:implicationinstepwiseleukemogenesisandresponsetoGleevec.ProcNatlAcadSciUSA2005;102:1104-1109.5.ChenB,ZhaoWL,JinJ,XueYQ,ChengX,ChenXT,CuiJ,ChenZM,CaoQ,YangG,YaoY,XiaHL,TongJH,LiJM,ChenJ,XiongSM,ShenZX,WaxmanS,ChenZ,ChenSJ.Clinicalandcytogeneticfeaturesof508ChinesepatientswithmyelodysplasticsyndromeandcomparisonwiththoseinWesterncountries.Leukemia2005;19:767-775.6.BaiXT,GuBW,YinT,NiuC,XiXD,ZhangJ,ChenZ,ChenSJ.Trans-repressiveeffectofNUP98-PMX1onPMX1-regulatedc-FOSgenethroughrecruitmentofhistonedeacetylase1byFGrepeats.CancerResearch2006;66:4584-4590.7.ZhuYM,ZhaoWL,FuJF,ShiJY,PanQ,HuJ,GaoXD,ChenB,LiJM,XiongSM,GuLJ,TangJY,LiangH,JiangH,XueYQ,ShenZX,ChenZ,ChenSJ.NOTCH1mutationsinT-cellacutelymphoblasticleukemia:prognosticsignificanceandimplicationinmultifactorialleukemogenesis.ClinCancerRes.2006;12:3043-3049.8.WangL,ZhaoWL,YanJS,LiuP,SunHP,ZhouGB,WengZY,WuWL,WengXQ,SunXJ,ChenZ,SunHD,ChenSJ.EriocalyxinBinducesapoptosisoft(8;21)leukemiacellsthroughNF-kappaBandMAPKsignalingpathwaysandtriggersdegradationofAML1-ETOoncoproteininacaspase-3-dependentmanner.CellDeathandDifferentiation2007;14:306-317.9.MaLH,LiuH,XiongH,ChenB,ZhangXW,WangYY,LeHY,HuangQH,ZhangQH,LiBL,ChenZ,ChenSJ.AberrantTranscriptionalRegulationoftheMLLFusionPartnerEENGenebyAML1-ETOandItsImplicationinLeukemogenesis.Blood2007;109:769-777.10.ZhangSJ,MaLY,HuangQH,LiG,GuBW,GaoXD,ShiJX,WangYY,GaoL,CaiX,RenRB,ZhuJ,ChenZ,ChenSJ.Gain-of-functionmutationofGATA-2inacutemyeloidtransformationofchronicmyeloidleukemia.ProcNatlAcadSciUSA2008;105:2076-208111.WangL,ZhouGB,LiuP,SongJH,LiangY,YangXJ,XuF,WangBS,MaoJH,ShenZY,ChenSJ,ChenZ.DissectionofmechanismsofChinesemedicinalformulaRealgar-Indigonaturalisasaneffectivetreatmentforpromyelocyticleukemia.ProcNatlAcadSciUSA2008;105:4826-4831.12.HuJ,LiuYF,WuCF,XuF,ShiZX,ZhuYM,LiJM,TangW,ZhaoWL,WuW,SunHP,ChenQS,ChenB,ZhouGB,ZelentA,WaxmanS,WangZY,ChenSJ,ChenZ.Long-termefficacyandsafetyofall-transretinoicacid/arsenictrioxidebasedtherapyinnewlydiagnosedacutepromyelocyticleukemia.ProcNatlAcadSciUSA2009;106:3342-3347.13.ZhangXW,YanXJ,YangFF,ZhouZR,WuZY,SunHB,LiangWX,SongAX,HuangQH,ZhouGB,TongJH,ZhangY,WuJH,HuHY,ChenSJ,ChenZ.ArsenictrioxidecontrolsthefateofthePML-RARoncoproteinbydirectlybindingPML.Science2010;329:240-243.
陈竺

导师姓名
陈竺
研究方向白血病发病机制研究;白血病产物靶向治疗
联系方式通讯地址：上海市瑞金二路197号瑞金医院血液学研究所

邮政编码：200025

联系电话：021-64370045-610604

Email：zchen@stn.sh.cn
个人简介

中国科学院院士，美国科学院和美国医学科学院外籍院士，欧洲艺术、科学和人文学院院士，第三世界科学院院士，法国科学院外籍院士，欧洲科学院外籍院士，香港医学专科学院荣誉院士，英国医学科学院荣誉院士，上海交通大学医学院教授，上海交通大学医学院附属瑞金医院终身教授。1989年毕业于法国巴黎第七大学，获博士学位。现任中国卫生部部长，国际科学院协作组织主席，上海血液学研究所名誉所长，国家人类基因组南方研究中心主任，国务院学位委员会委员，国家“973”计划首席科学家，国家“863”计划生物与现代农业技术领域专家咨询委员会主任，意大利热那亚大学名誉教授，香港大学名誉科学博士，法国巴黎第五大学和巴黎第七大学名誉博士，德国马普学会分子遗传研究所科学委员会委员。在国际著名刊物如《Science》、《JCI》、《JExpMed》、《Blood》、《AmJHumGenet》、《PNAS》、《BMBOJ》、《Leukemia》、《Oncogene》等以及国内核心刊物发表论文300多篇，据SCI统计被引用约12000次。获得国家自然科学1993年三等奖、1995年国家科技进步二等奖、1996年度何梁何利基金科学技术奖、1997年法国全国抗癌联盟卢瓦兹奖、1998年度“求是”基金青年科学家奖、1999年****成就奖一等奖、2001年国家自然科学二等奖，卫生部、国家教委和上海市科技进步一等奖（1994年,1997年和2002年）等多个奖项。2002年获得法国政府颁发的“法兰西共和国总统骑士荣誉勋章”。
代表性论著
1.ChenGQ,ZhuJ,ShiXG,NiJH,ZhongHJ,SiGY,JinXL,TangW,LiXS,XongSM,ShenZX,SunGL,MaJ,ZhangP,ZhangTD,GazinC,NaoeT,ChenSJ,WangZY,ChenZ.Invitrostudiesoncellularandmolecularmechanismsofarsenictrioxide(As2O3)inthetreatmentofacutepromyelocyticleukemia:As2O3inducesNB4cellapoptosiswithdownregulationofBcl-2expressionandmodulationofPML-RARa/PMLproteins.Blood1996;88:1052-1061.2.ShenZX,ShiZZ,FangJ,GuBW,LiJM,ZhuYM,ShiJY,ZhengPZ,YanH,ChenY,ShenY,WuW,TangW,WaxmanS,deThéH,WangZY,ChenSJ,ChenZ.All-transretinoicacid/As2O3combinationyieldsahighqualityremissionandsurvivalinnewlydiagnosedacutepromyelocyticleukemia.ProcNatlAcadSciUSA2004;101:5328-5335.3.YinT,WuYL,SunHP,SunGL,DuYZ,WangKK,ZhangJ,ChenGQ,ChenSJ,ChenZ.CombinedEffectsofAs4S4andImatinibonChronicMyeloidLeukemiaCellsandBCR-ABLOncoprotein.Blood2004;36:566-570.4.SongHD,SunXJ,DengM,ZhangGW,ZhouY,WuXY,ShengY,ChenY,RuanZ,JiangCL,FanHY,ZonLI,KankiJP,LiuTX,LookAT,ChenZ.HematopoieticGeneExpressionProfileinZebrafishKidneyMarrow.ProcNatlAcadSciUSA2004.101:16240-16245.5.ZhengPZ,WangKK,ZhangQY,HuangQH,DuYZ,ZhangQH,XiaoDK,ShenSH,ImbeaudS,EvenoE,ZhaoCJ,ChenYL,FanHY,WaxmanS,AuffrayC,JinG,ChenSJ,ChenZ,ZhangJ.Systemsanalysisoftranscriptomeandproteomeinretinoicacid/arsenictrioxide-inducedcelldifferentiation/apoptosisofpromyelocyticleukemia.ProcNatlAcadSciUSA2005;102:7653-7658.6.ZhouGB,KangH,WangL,GaoL,LiuP,XieJ,ZhangFX,WengXQ,ShenZX,ChenJ,GuLJ,YanM,ZhangDE,ChenSJ,WangZY,ChenZ.Oridonin,aditerpenoidextractedfrommedicinalherbs,targetsAML1-ETOfusionproteinandshowspotentantitumoractivitywithlowadverseeffectsont(8;21)leukemiainvitroandinvivo.Blood2007;109:3441-3450.7.WangL,ZhouGB,LiuP,SongJH,LiangY,YangXJ,XuF,WangBS,MaoJH,ShenZY,ChenSJ,ChenZ.DissectionofmechanismsofChinesemedicinalformulaRealgar-Indigonaturalisasaneffectivetreatmentforpromyelocyticleukemia.ProcNatlAcidSciUSA2008;105:4826-4831.8.WangZY,ChenZ.Acutepromyelocyticleukemia:fromhighlyfataltohighlycurable.Blood2008;111:2505-2515.9.HuJ,LiuYF,WuCF,XuF,ShiZX,ZhuYM,LiJM,TangW,ZhaoWL,WuW,SunHP,ChenQS,ChenB,ZhouGB,ZelentA,WaxmanS,WangZY,ChenSJ,ChenZ.Long-termefficacyandsafetyofall-transretinoicacid/arsenictrioxidebasedtherapyinnewlydiagnosedacutepromyelocyticleukemia.ProcNatlAcadSciUSA2009;106:3342-3347.10.ZhangQY,MaoJH,LiuP,HuangQH,LuJ,XieYY,WengL,ZhangY,ChenQ,ChenSJ,ChenZ.AsystemsbiologyunderstandingofthesynergisticeffectsofarsenicsulfideandImatinibinBCR/ABLassociatedleukemia.ProcNatlAcadSciUSA2009;106:3378-3383.11.SchistosomajaponicumGenomeSequencingandFunctionalAnalysisConsortium,LiuF,ZhouY,WangZQ,LuG,ZhengH,BrindleyPJ,McManusDP,BlairD,ZhangQH,ZhongY,WangS,HanZG,ChenZ.TheSchistosomajaponicumgenomerevealsfeaturesofhost-parasiteinterplay.Nature.2009Jul16;460:345-351.12.ZhangXW,YanXJ,YangFF,ZhouZR,WuZY,SunHB,LiangWX,SongAX,HuangQH,ZhouGB,TongJH,ZhangY,WuJH,HuHY,ChenSJ,ChenZ.ArsenictrioxidecontrolsthefateofthePML-RARoncoproteinbydirectlybindingPML.Science2010;329:240-243.
韩泽广

导师姓名
韩泽广
研究方向肿瘤遗传学和基因组学;系统生物学技术和应用
联系方式通讯地址：闵行东川路800号系统生物医学研究院A308

邮政编码：200240

联系电话：34207304

Email：hanzg@sjtu.edu.cn
个人简介

系统生物医学研究院常务副院长、教育部****奖励计划特聘教授、国家杰出青年基金获得者、“新世纪百千万人才工程”国家级人选、国家科技部“973”项目首席科学家、瑞金医院研究员、国家人类基因组南方研究中心省部共建健康与卫生重点实验室（基地）常务副主任、主任助理、功能基因组部主任。　　1964年1月生；1998年7月于上海交通大学医学院获博士学位；2002年任研究员并先后任国家人类基因组南方研究中心主任助理、功能基因组部主任和省部共建健康与卫生重点实验室（基地）常务副主任。现为国际学术期刊BMCBioinformatics副主编、THEOPENPARASITOLOGYJOURNAL、TheOpenSystemsBiologyJournal、AmericanJournalofTranslationalResearch编委以及《科学通报》特约编辑。先后主持了包括国家杰出青年基金项目，国家自然科学基金项目、国家“863”项目，国家“973”项目、科技部国际合作项目、上海市优秀学科带头人计划项目以及国家艾滋病和病毒性肝炎等重大传染病防治科技重大专项课题等。在SCI杂志发表相关论文90余篇，包括以通讯作者在国际一流学术杂志《自然（Nature）》、《自然遗传学（NatureGenetics）》、《临床调查杂志（JCI）》、《美国科学院院报（PNAS）》、PLoSPathogens、Hepatology、CancerResearch等,被国际同行引用3300余次。多次被国际会议邀请做学术报告和在权威杂志发表综述。研究成果多次被评为中国基础科学研究十大新闻、中国生物医药十大新闻等。先后获得上海市科技进步奖、自然科学奖、国家自然科学奖以及全国优秀博士学位论文、政府特殊津贴、“第十届上海市科技精英”提名奖等。
代表性论著
1.HuangJ,DengQ,WangQ,LiKY,DaiJH,LiN,ZhuZD,ZhouB,LiuXY,LiuRF,FeiQL,ChenH,CaiB,ZhouB,XiaoHS,QinLX,HanZG.ExomesequencingofhepatitisBvirus-associatedhepatocellularcarcinoma.NatGenet.2012;44(10):1117-1121(配发评述：NewsandViewsbyZhangZ:Genomiclandscapeoflivercancer.NatGenet.2012;44(10):1075-7;JournalofHepatology评述：GeneticalterationsinadvancedHBV-relatedHCCwithportalveintumorthrombosis:InsightsfromnextgenerationDNAsequencing.doi:10.1016/j.jhep.2012.11.046)(通讯作者)（影响因子35.532）2.HanZG.FunctionalGenomicStudies:InsightsintothePathogenesisofLiverCancer.AnnuRevGenomicsHumGenet.2012;13:171-205(受邀请综述)(通讯作者)（影响因子14.829）3.TheSchistosomajaponicumGenomeSequencingandFunctionalAnalysisConsortium.TheSchistosomajaponicumgenomerevealsfeaturesofhost-parasiteinterplay.Nature,2009;460,345-351(Cover,全文article)(NatureChinaResearchHighlights)(TrendsinParasitology发表述评)(通讯作者)(IF=31.434)4.LiuF,CuiSJ,HuW,FengZ,WangZQ,HanZG.Excretory/secretoryproteomeoftheadultdevelopmentalstageofhumanbloodfluke,Schistosomajaponicum.MolCellProteomics.2009;8(6):1236-1251(TrendsinParasitology发表Update述评)(通讯作者)(影响因子9.425)5.HanZG,BrindleyPJ,WangSY,ChenZ.Schistosomagenomics:newperspectivesonschistosomebiologyandhost-parasiteinteraction.AnnualReviewofGenomicsandHumanGenetics,2009;10:211-240(受邀请综述)(通讯作者)（影响因子14.829）6.ZhengDL,ZhangL,ChengN,XuX,DengQ,TengXM,WangKS,ZhangX,HuangJ,HanZG.EpigeneticmodificationinducedbyhepatitisBvirusXproteinviainteractionwithdenovoDNAmethyltransferaseDNMT3A.JournalofHepatology,2009;50(2):377-387(配发Editorialforcommentonthispaper:HercegZ,PaliwalA.HBVproteinasadouble-barrelshot-guntargetsepigeneticlandscapeinlivercancer.JHepatol.2009;50(2):252-255)(通讯作者)（影响因子9.264）7.HuangJ,ZhengDL,QinFS,ChengN,ChenH,WanBB,WangYP,XiaoHS,HanZG.GeneticandepigeneticsilencingofSCARA5maycontributetohepatocellularcarcinomabyactivatingFAKsignaling.JClinInvest.2010;120(1):223-241(配发highlightinthisissue:EpigeneticsilencingofanHCCsuppressor)(NatureChinaResearchHighlights:Medicalgenetics:Silenceofthegene)(Epigenomics:News:SCARA5identifiedasanewcandidatetumorsuppressorgeneinhumanhepatocellularcarcinoma)(通讯作者)（影响因子13.069）8.ChengN,LiY,HanZG.Ago2promotestumormetastasisviaupregulatingFAKexpressioninhepatocellularcarcinoma.Hepatology2013May;57(5):1906-1918(通讯作者)（影响因子11.665）9.XuX,LiuRF,ZhangX,HuangLY,ChenF,FeiQL,HanZG.DLK1asapotentialtargetagainstcancerstem/progenitorcellsofhepatocellularcarcinoma.MolCancerTher.2012Mar;11(3):629-638(通讯作者)（影响因子5.226）10.DengQ,WangQ,ZongWY,ZhengDL,WenYX,WangKS,TengXM,ZhangX,HuangJ,HanZG.E2F8ContributestoHumanHepatocellularCarcinomaviaRegulatingCellProliferation.CancerRes.2010Jan15;70(2):782-791(通讯作者)（影响因子7.856）
侯尚伟

导师姓名
侯尚伟
研究方向膜蛋白生物物理;离子通道和疾病
联系方式通讯地址：上海市闵行区东川路800号上海交通大学系统生物医学研究院D201

邮政编码：200240

联系电话：34207547

Email：shangweih@gmail.com
个人简介

侯尚伟，研究员，2004年获复旦大学医学神经生物学博士学位。同年8月赴美留学，在宾夕法尼亚大学医学院生理学系从事离子通道调节的结构和功能关系研究。迄今为止，以第一作者或联系作者身份在NatureStructure&MolecularBiology,PNAS,JournalofBiologicalChemistry等国际著名刊物发表了数十篇研究论文，并为TheJournalofPhysiology(London),JournalofBiologicalChemistry和Neuroscience杂志审稿。2011年教育部自然科学一等奖第二完成人。2012年上海市浦江学者。主持国家自然科学基金和上海市基础研究重点项目，目前担任WorldJournalofBiologicalChemistry杂志编委。研究方向主要有以下两个方面：1）以电生理学、生物化学和分子生物学为主要研究手段，揭示生理和病理条件下内源性信号分子对疾病相关离子通道的调节及其分子机制；2）利用高通量方法发现新的离子通道调节剂并阐明这些化合物和通道作用的分子机制。
代表性论著
1.HoshiT.，TianY.,XuR.,HeinemannS.H.,HouS.（2013）MechanismofthemodulationofBKpotassiumchannelcomplexeswithdifferentauxiliarysubunitcompositionsbytheomega-3fattyacidDHA.Proc.Natl.Acad.Sci.USA110(12):4822-72.HoshiT.，WissuwaB.，TianY.，TajimaN.，XuR.，BauerM.，HeinemannS.H.,HouS.(2013)Omega-3fattyacidslowerbloodpressurebydirectlyactivatinglarge-conductanceCa2+-dependentK+channels.Proc.Natl.Acad.Sci.USA110(12):4816-213.Hou,S.,R.Xu,W.L.Wurster,J.F.Clark,S.H.HeinemannandT.Hoshi(2011).ModulationofBKchannelsbybilirubinoxidationproducts,anovelmechanismforcerebralvasospasminsubarachnoidhemorrhage.JournalofCerebralBloodFlow&Metabolism31(1):102-124.Satz,JS.,AP.Ostendorf,S.Hou,A.Turner,H.Kusano,J.Lee,R.Turk,H.Nguyen,S.Ross-Barta,S.Westra,RM.Weiss,T.Hoshi,SA.Moore,andKP.Campbell(2010)Distinctfunctionsofglialandneuronaldystroglycaninthedevelopingandadultmousebrain.JNeurosci.30(43):14560-72.5.*Hou,S.,L.E.Vigeland,G.Zhang,R.Xu,M.Li,S.H.HeinemannandT.Hoshi(2010).Zn2+activateshumanlarge-conductanceCa2+-activatedK+channelviaanintracellulardomain.JournalofBiologicalChemistry285:6434-42(*Correspondingauthor).6.*Hou,S.,*F.T.Horrigan,S.H.HeinemannandT.Hoshi(2009).ComparativemechanismsofactivationoftheSlo1BKchannelbyCa2+andH+mediatedbytheRCK1domain.Channels(Austin)3:249-58(*Cofirstauthor)7.Hou,S.,S.H.HeinemannandT.Hoshi(2009).ModulationofBKCachannelgatingbyendogenoussignalingmolecules.Physiology24:26-35.Review.8.*Hou,S.,*YQ.Wang,M.Xu,DH.Shen,JJ.Wang,F.Huang,Y.ZhangandFY.Sun(2008)Functionalintegrationofnewbornneuronsintostriatumfollowingcerebralischemiainadultratbrain.Stroke39:2837-2844.(Cofirstauthor)9.Hou,S.,R.Xu,S.H.HeinemannandT.Hoshi(2008)ReciprocalregulationoftheCa2+andH+sensitivityintheSLO1BKchannelconferredbytheRCK1domain.NatureStructural&MolecularBiology15:403-410.10.Hou,S.,R.Xu,S.H.HeinemannandT.Hoshi(2008)TheRCK1high-affinityCa2+sensorconferscarbonmonoxidesensitivitytoSlo1BKchannels.Proc.Natl.Acad.Sci.,105:4039-4043.11.Hou,S.,M.F.Reynolds,F.T.Horrigan,S.H.HeinemannandT.Hoshi(2006)Reversiblebindingofhemetoproteinsincellularsignaltransduction.Acc.Chem.Res.39:918-924.Review.12.Hou,S.,P.ZhengandFY.Sun(2004)MelatonininhibitsoutwarddelayedrectifierpotassiumcurrentsinhippocampalCA1pyramidalneuronviaintracellularindole-relateddomains.JPinealRes.,36:242-24913.Hou,S.,JS.Qi,Y.ZhangandJT.Qiao(2003)Spinalantinociceptiveeffectofagmatineandtentativeanalysisofinvolvedreceptors:studyinanelectrophysiologicalmodelofrats.BrainRes.,968:277-280
邵志峰

导师姓名
邵志峰
研究方向肿瘤分子机制研究;基因组学
联系方式通讯地址：上海闵行东川路800号系统生物医学研究院D206

邮政编码：200240

联系电话：021-34205188

Email：zs9q@virginia.edu
个人简介

上海交通大学王宽诚讲席教授、系统生物医学教育部重点实验室主任、生物医学工程学院副院长。2008年入选中央组织部首批“****”。1982年毕业于南京大学物理系，同年考取李政道先生主持的CUSPEA项目，1988年在美国芝加哥大学获得博士学位。1989年起进入弗吉尼亚大学分子生理与生物物理系工作，历任助理教授（1989－1993），副教授（1993－1998，1994年获终身教职），终身正教授（1998-2009）。应陈竺院士邀请，2008年3月签约上海交通大学。以交叉学科为主旨，长期从事生物物理学和单分子生物学研究，研究领域包括方法学的创新和若干生物学基本问题的机理研究，如细菌毒素的作用机理，染色体DNA复制以及多构型大分子的结构等。曾担任美国电报电话公司贝尔实验室顾问，美国能源部人类基因组计划评审专家，并为美国NSF，NIH，威康信托基金会,老年性痴呆协会和其他的联邦基金机构、州基金机构以及一些欧洲基金评委等。迄今已在国际权威学术杂志发表论文近120篇，总引用超过4100次。由于对低温原子力显微学的贡献，2000年当选为AAASFellow。
代表性论著
GongB.,ShaoZ.F.Self-AssemblingOrganicNanotubeswithPreciselyDefined,Sub-nanometerPores:FormationandMassTransportCharacteristics.AccChemRes.DOI:10.1021/ar400030e(2013)Czajkowsky,D.M.,Li,L.,Sun,J.L.,Hu,J.&Shao,Z.F.HeteroepitaxialStreptavidinNanocrystalsRevealCriticalRoleofProton"Fingers"andSubsurfaceAtomsinDeterminingAdsorbedProteinOrientation.AcsNano6,190-198,doi:10.1021/nn203356p(2012)Czajkowsky,D.M.,Hu,J.,Shao,Z.F.&Pleass,R.J.Fc-fusionproteins:newdevelopmentsandfutureperspectives.EmboMolecularMedicine4,1015-1028,doi:10.1002/emmm.201201379(2012).Zhou,X.etal.Self-assemblingsubnanometerporeswithunusualmass-transportproperties.NatureCommunications3,doi:10.1038/ncomms1949(2012)Czajkowsky,D.M.andShao,Z.RedefiningtheStructureoftheHumanIgMPentamer:AMushroom-ShapedComplexwithaFlexuralBias.ProceedingsofNationalAcademyofSciencesUSA106,14960-14965(2009).Helsel,A.J.,Brown,A.,Yamato,K.,Feng,W.,Yuan,L.,Clements,A.,Harding,S.V.,Szabo,G.,Shao,Z.andGong,G.HighlyConductingTransmembranePoresFormedbyAromaticOligoamideMacrocycles.JournalofAmericanChemicalSociety(communications)130,15784(2008).Czajkowsky,D.M.,Liu,J.,Hamlin,J.L.andShao,Z.DNACombingRevealsIntrinsicTemporalDisorderintheReplicationofYeastChromosomeVI.JournalofMolecularBiology375,12-19(2008).Czajkowsky,D.M.,Hotze,E.M.,Shao,Z.andTweten,R.K.VerticalCollapseofaCytolysinPreporeMovesItsTransmembrane-HairpinsToTheMembrane.EMBOJournal23:3206-3215(2004).Sheng,S.,Gao,Y.,Somlyo,A.V.,Somlyo,A.P.andShao,Z.CryoAtomicForceMicroscopyofUnphosphorylatedAndThiophosphorylatedSingleSmoothMuscleMyosinMolecules.JournalofBiologicalChemistry278:39892-39896(2003).Mannelquist,A.,Iwamoto,H.,Szabo,G.andShao,Z.NearFieldOpticalMicroscopywithaVibratingProbeinAqueousSolution.AppliedPhysicsLetters78,2076-2078(2001)Czajkowsky,D.,Iwamoto,H.,Cover,TandShao,Z.TheVacuolatingToxinFromHelicobacterpyloriFormsHexamericPoresinLipidBilayersatLowpH.ProceedingsofNationalAcademyofSciencesUSA96,2001-2006(1999)Shao,Z.,Mou,J.,Czajkowsky,D.M.,Yang,J.andYuan,J.Y.BiologicalAtomicForceMicroscopy:WhatIsAchieved&WhatIsNeeded.AdvancesinPhysics45,1-86(1996).Shao,Z.andYang,J.ProgressInHighResolutionAtomicForceMicroscopyinBiology.QuarterlyReviewsofBiophysics28,195-251(1995).Shao,Z.,Yang,J.andSomlyo,A.P.BiologicalAtomicForceMicroscopy:FromMicronstoNanometersandBeyond.AnnualReviewofCellandDevelopmentalBiology11,241-265(1995).Mou,J.,Yang,J.andShao,Z.AnOpticalDetectionLowTemperatureAtomicForceMicroscopeatAmbientPressureforBiologicalResearch.ReviewofScientificInstruments64,1483-1488(1993).Yuan,J.-Y.,Shao,Z.,andGao,C.AnAlternativeMethodofImagingSurfaceTopologiesofNon-conductingBulkSpecimensbyScanningTunnelingMicroscopy.PhysicalReviewLetters67,863-866(1991).Shao,Z.OntheFifthOrderAberrationinaSextupoleCorrectedProbeFormingSystem.ReviewofScientificInstruments59,2429-2437(1988).
沈玉梅

导师姓名
沈玉梅
研究方向生物有机化学;药物合成化学
联系方式通讯地址：上海闵行东川路800号系统生物医学研究院D404

邮政编码：200240

联系电话：021-34204561

Email：yumeishen@sjtu.edu.cn
个人简介

1999年于大连理工大学获工学博士学位,之后在中国科学院上海有机化学研究所工作，从事具有C2对称轴手性配体的设计合成、不对称环丙烷化反应及化学方法固定CO2反应。2002年3月起在美国科罗拉多州立大学(ColoradoStateUniversity)化学系从事博士后研究，科研方向为有机催化剂催化的氮杂环丙烷化反应以及不对称环氧化、对映选择性异构化反应，以制备手性2-芳基环戊酮，其S构型ee值达96%，R构型ee值达93%，这是迄今为止所报道的最高ee值，并且同时得到两种构型的2-芳基环戊酮。2004年10月以“百人计划”引进中国科学院上海应用物理研究所，从事放射性同位素标记及相关研究。2011年1月进入上海交通大学系统生物医学研究院，从事两亲性嵌段共聚物自组装纳米胶束的合成及应用；具有生物活性小分子化合物的荧光标记；酸敏感可裂解连接单元及其在DNA合成测序中的应用。
代表性论著
1.HuaZhu,XiaopingXu,WeiCui,YuanqingZhang,HuapingMo,Yu-MeiShen*SynthesisandCharacterizationofWellDefinedLacticAcid-PEGCooligomersanditsTricarbonylRheniumConjugatesJournalofPolymerSciencePartA:PolymerChemistry2011,49,1745–17522.XiaopingXu,YuanqingZhang,XudongWang,XunxiangGuo,XuezhuZhang,YujinQi,Yu-MeiShen*Radiosynthesis,biodistributionandmicro-SPECTimagingstudyofdendrimer-avidinconjugateBioorganic&MedicinalChemistry2011,19,1643–1648.3.YuanqingZhang,YanhongSun,XiaopingXu,XuezhuZhang,HuaZhu,LiliangHuang,YujinQi,Yu-MeiShen*Synthesis,Biodistribution,andMicrosinglePhotonEmissionComputedTomography(SPECT)ImagingStudyofTechnetium-99mLabeledPEGylatedDendrimerPoly(amidoamine)(PAMAM)-FolicAcidConjugatesJournalofMedicinalChemistry,2010,53(8),3262–3272.4.HuaZhu,LiliangHuang,XiaopingXu,YuanqingZhang,YanhongSun,Yu-MeiShen*Design,synthesisandevaluationofcyclofenilderivativesforpotentialSPECTimagingagentsJournalofBiologicalInorganicChemistry,2010,15,591–599.5.YanhongSun,GuifengLiu,YuanqingZhang,HuaZhu,YunfengRen,Yu-MeiShen*Synthesisandinvitroanti-proliferativeactivityofβ-elemenemonosubstitutedderivativesinHeLacellsmediatedthrougharrestofcellcycleattheG1phaseBioorganic&MedicinalChemistry2009,17,1118-1124.6.Yu-MeiShen,Mei-XinZhao,JiaxiXu,andYianShi*AnAmine-PromotedNH-Aziridinationofa,b-UnsaturatedKetonesAngew.Chem.Int.Ed.2006,45,8005-8008.7.Yu-MeiShen,BinWangandYianShi*EnantioselectiveSynthesisof2-ArylCyclopentanonesbyAsymmetricEpoxidationandEpoxideRearrangementAngew.Chem.Int.Ed.2006,45,1429-1432.8.Yu-MeiShen,Wei-LiangDuanandMinShi*ChemicalFixationofCarbonDioxideCo-CatalyzedbyacombinationofSchiffBasesorPhenolsandOrganicBasesEuropeanJournalofOrganicChemistry2004,14,3080-3089.9.Yu-MeiShen,Wei-LiangDuanandMinShi*Phenolandorganicbasesco-catalyzedchemicalfixationofcarbondioxidewithterminalepoxidestoformcycliccarbonatesAdvancedSynthesis&Catalysis2003,345(3),337-340.10.Yu-MeiShen,Wei-LiangDuanandMinShi*ChemicalFixationofCarbonDioxideCatalyzedbyBinaphthyldiaminoZn,Cu,andCoSalen-TypeComplexJournalofOrganicChemistry2003,68(4),1559-1562.
施奇惠

导师姓名
施奇惠
研究方向单细胞蛋白质组学;微流控芯片技术
联系方式通讯地址：上海市东川路800号上海交通大学系统生物医学研究院D207

邮政编码：200240

联系电话：13621793216

Email：qihuishi@sjtu.edu.cn
个人简介

施奇惠：男，博士，教授。2003年本科毕业于复旦大学化学系，2008年在加州大学圣芭芭拉分校（UniversityofCalifornia,SantaBarbara）化学系获博士学位，期间师从著名的材料化学专家GalenD.Stucky教授从事无机及聚合物功能材料的研究。在化学和材料领域权威杂志论文26篇，被引用超过1000次，其中第一及共同第一作者论文8篇，包括2篇J.Am.Chem.Soc.，2篇Adv.Mater.，2篇Small，获一项美国专利，同时申请了4项美国专利与3项国际（PCT）专利。2008至2011年在美国加州理工学院（CaliforniaInstituteofTechnology）化学系JamesR.Heath教授研究组从事生物医学工程方面的博士后研究，发展了一系列生物医学新技术与临床诊断仪器并将其用于癌症早期诊断和个体化治疗，发表的工作包括2篇PNAS，NatureMedicine，Lab-on-a-chip等杂志。在婉拒了美国纽约州立大学布法罗分校（TheStateUniversityofNewYork,Buffalo）生物医学工程系助理教授（tenure-trackassistantprofessor）的聘用后，于2011年9月受聘于上海交通大学系统生物医学研究院，并于2012年2月入选第二批国家“青年千人”计划。主要从事基于微流控芯片技术的单细胞蛋白质组学以及临床诊断芯片。
代表性论著
（1）主要论文1.WeiW*,ShiQH*,RemacleF*,QinLD,ShackelfordD,ShinYS,Mischel,PS,LevineRD,HeathJR,“HypoxiaInducesaPhaseTransitionwithinaKinaseSignalingNetworkinCancerCells”,Proc.Natl.Acad.Sci.USA2013,110,E1352(*并列第一作者).2.ShiQH,QinLD,WeiW,GengF,FanR,ShinYS,GuoDL,HoodL,MischelPS,HeathJR,“Single-cellproteomicchipsforprofilingintracellularsignalingpathwaysinsingletumorcells”,”,Proc.Natl.Acad.Sci.USA2012,109,419.3.MaC,FanR,AhmadH,ShiQH,Comin-AnduixB,ChodonT,Koya,RC,LiuCC,KwongGA,RaduCG,RibasA,HeathJR,“AclinicalmicrochipforevaluationofsingleimmunecellsrevealshighfunctionalheterogeneityinphenotypicallysimilarTcells”,Nat.Med.2011,17,738.4.ShiQH,Liang,HJ,FengD,WangJF,StuckyGD,“PorousCarbonandCarbon/MetalOxideMicrofiberswithWell-DefinedPoreStructureandInterface”,J.Am.Chem.Soc.2008,130,5034(被C&EN作为新闻报道，由RachelPetkewich撰写并发表在2008年4月7日号的C&EN第50页).5.ShiQH,An,ZS,TsungC-K,LiangHF,ZhengNF,HawkerCJ,StuckyGD,“Ice-TemplatingofCore/ShellMicrogelFibersthrough‘Bricks-and-Mortar’Assembly”Adv.Mater.2007,19,4539.6.ShiQH,WangJF,ZhangJP,FanJ,StuckyGD,“Rapid-SettingMesoporousBioactiveGlassCementsThatInduceAcceleratedInVitroApatiteFormation”Adv.Mater.2006,18,1038.7.ShiQH,WangJF,WyrstaMD,StuckyGD,“VesicleArray-TemplatedLarge-AreaSilicaSurfacePatterns”J.Am.Chem.Soc.2005,127,10154.（2）主要专利及专利申请1.StuckyGD,OstomelTA,ShiQH,StoimenovPK,HoldenPA,“Inorganicmaterialsforhemostaticmodulationandtherapeuticwoundhealing”,U.S.Patent7,858,123,Dec.28,2010.2.StuckyGD,OstomelTA,ShiQH,SawvelA,BakerS,“OxidesforWoundHealingandBodyRepair”,U.S.Pat.Appl.Publ.US20100209531A2,Aug.19,2010.3.StuckyGD,KellerAA,ShiYF,ShiQH,WangP,LiangHJ,“UseofMagneticNanoparticlestoRemoveEnvironmentalContaminants”,PCTInt.Appl.WO2009/151490,Dec.17,2009.
陶生策

导师姓名
陶生策
研究方向蛋白质组学;系统生物学
联系方式通讯地址：上海市东川路800号系统生物医学大楼B207

邮政编码：200240

联系电话：34207069

Email：327tao@gmail.com
个人简介

男，湖北武穴人。博士，研究员。教育部新世纪优秀人才（2010），上海市青年科技启明星（2010）。1997年毕业于山东大学获学士学位。2000年毕业于中国科学院武汉病毒研究所获硕士学位。2004年毕业于清华大学获博士学位。2004年赴美在约翰霍普金斯大学从事博士后研究。2009年1月回国。迄今为止，已发表以NatureBiotechnology，Cell，NatureMethods为代表的科研论文30余篇，参与了7部中英文学术专著的编写,翻译和导读工作。获得包括一项国际专利在内的7项专利授权。主要研究方向为蛋白质芯片的构建和应用研究、系统生物序高通量技术研发以及蛋白质翻译后修饰（糖基化，乙酰化）。已获得包括国家重点基础研究发展计划（973），自然科学基金，教育部新世纪优秀人才计划等在内的多项经费支持。主要研究领域和方向：1.蛋白质芯片的构建和应用研究2.生物芯片相关新技术的研发3.肺结核分支杆菌系统生物学研究
代表性论著
研究论文1.ZhangQF,GuJ,GongP,WangXD,TuS,BiLJ,YuZN,ZhangZP,CuiZQ,WeiHP,TaoSCandZhangXE(2013).ReversiblyacetylatedlysineresiduesplayimportantrolesontheenzymaticactivityofEscherichiacoliN-hydroxyarylamine-acetyltransferase.FEBSJ.280(9):1966-79.(Co-corresponding)2.TuS,JiangHW,LiuCX,ZhouSM,TaoSC(2013).ProteinMicroarraysforStudiesofDrugMechanismsandBiomarkerDiscoveryintheEraofSystemsBiology.CurrentPharmaceuticalDesign.PMID:23530501(Corresponding)3.WangZX,DengRP,JiangHW,GuoSJ,LeHY,ZhaoXD,ChenCS,ZhangJBandTaoSC(2012).GlobalidentificationofprokaryoticglycoproteinsbasedonanEscherichiacoliproteomemicroarray.PLoSOne.e0049080.(Corresponding)4.LuKY,TaoSC,YangTC,HoYH,LeeCH,LinCC,JuanHF,HuangHC,YangCY,ChenMS,LinYY,LuJY,ZhuH,ChenCS(2012).Profilinglipid-proteininteractionsusingnon-quenchedfluorescentliposomalnanovesiclesandproteomemicroarrays.MolCellProteomics.11(11):1177-90.5.LiY,GuoSJ,ShaoN,TuS,XuM,RenZR,LingX,WangGQ,LinZX,TaoSC(2011).AuniversalmultiplexPCRstrategyfor100-plexamplificationusingahydrophobicallypatternedmicroarray.LabChip.11(21):3609-3618.(Corresponding)6.ZhouSM,ChengL,GuoSJ,ZhuH,TaoSC(2011).Lectinmicroarray:Apowerfultoolforglycanrelatedbiomarkerdiscovery.CombChemHighThroughputScreen.14(8):711-9.(Corresponding)7.YangLN,GuoSJ,LiY,ZhouSM,TaoSC(2011).Proteinmicroarraysforsystemsbiology.ActaBiochimBiophysSin.43(3):161-71.(Corresponding)8.LinYY,LuJY,ZhangJM,WalterW,DangWW,WanJ,TaoSC,QianJ,ZhaoYM,BoekeJD,BergerSL,ZhuH（2009）ProteinAcetylationMicroarrayRevealsNuA4ControlsKeyMetabolicTargetRegulatingGluconeogenesis.Cell.136(6):1073-1084.9.TaoSC*,LiY*,ZhouJB*,QianJ,SchnaarRL,ZhangY,GoldsteinIJ,ZhuH,SchneckJP(2008).Lectinmicroarraysidentifycell-specificandfunctionallysignificantcellsurfaceglycanmarkers.Glycobiology.18(10):761-769.(*contributedequally)10.KungLA*,TaoSC*,QianJ,SnyderM,andZhuH(2009).GlobalAnalysisofS.cerevisiaeProteomeRevealsNewRolesforProteinGlycosylationinEucaryotes.MolecularSystemsBiology.5:308.(*contributedequally)11.LuJY,LinYY,QianJ,TaoSC,ZhuJ,ZhuH(2008).FunctionaldissectionofaHECTubiquitinE3ligase.MolecularandCellularProteomics.7(1):35-45.12.ChenCS,KorobkovaE,ChenH,JianX,ZhuJ,TaoSC,HeC&ZhuH(2008).AProteomeChipApproachRevealsNewDNABaseDamageRecognitionActivitiesinEscherichiacoli.NatureMethods.5(1):69-74.13.Evans-NguyenKM,TaoSC,ZhuH,andCotterRJ(2008).ProteinArraysonPatternedPorousGoldSubstratesInterrogatedwithMassSpectrometry:DetectionofPeptidesinPlasma.AnalyticalChemistry.80(5),1448-1458.14.TaoSC,ZhuH(2006).Proteinchipfabricationbycaptureofnascentpolypeptides.NatureBiotechnology.24:1253-1254.15.TaoSC,ChenCSandZhuH(2007).Applicationsofproteinmicroarraytechnology.CombinatorialChemistry&HighThroughputScreening.10(8):706-18.16.ZhouYM*,YangRQ*,TaoSC*,et.al.(2005).ThedesignandapplicationofDNAchipsforearlydetectionofSARS-CoVfromclinicalsamples.Journalofclinicalvirology.33(2):123-31.(*Contributedequally).
吴方

导师姓名
吴方
研究方向生物化学/药物设计;老年痴呆症机理的研究
联系方式通讯地址：上海交通大学东川路800号

邮政编码：200240

联系电话：021-34207545

Email：wufanggg@gmail.com
个人简介

吴方，研究员，课题组负责人，博士生导师，上海浦江人才（2012）。1999年毕业于上海交通大学生物化学专业，获得理学学士学位；2002年毕业于中国科学院上海生命科学学院生物工程研究中心，获得理学硕士学位；2002-2003年在瑞士诺华制药公司巴塞尔总部临床前安全部门进行药物研发工作；2007年在瑞士苏黎世大学生物化学系获得理学博士学位，主要从事基于酶反应过渡态的药物设计与发现，小分子抑制剂的药学研究及助教工作；2007-2010年先后在瑞士巴塞尔大学有机化学系和瑞士联邦理工大学脑思维研究所进行博士后的研究工作,并负责与瑞士雀巢公司研发总部的项目合作。研究主要包括多肽纳米药物的发现和抑制老年痴呆症的小分子化合物的发现等，到目前为止，已针对多个热点疾病（肿瘤、疟疾、老年痴呆和过敏等）的相关靶点蛋白，通过计算机辅助的药物设计或构建高通量的细胞/体外生物筛选方法，发现了多种新型的高效抑制剂，并以第一作者在美国实验生物学联合会杂志FASEBJ.、美国《公共图书馆综合》杂志PLoSOne、美国分子癌症治疗学杂志Mol.Cancer.Ther.等国际刊物上发表了多篇关于新型抑制剂发现的研究论文。并被同行在国际文章评价网站Faculty1000Biology药理学和药物发现（Pharmacology&DrugDiscovery）领域收录和推荐。目前主持2项国家自然科学基金，1项教育部留学回国人员科研启动基金，1项上海市科委项目；承担1项科技部重大科学研究计划（973）子课题项目。主要研究领域和方向：1.小分子药物先导化合物的设计和发现；2.神经退行性疾病分子作用机理和治疗手段的研究
代表性论著
1.FangWu,PhilippChristen,HeinzGehring.AnovelapproachtoinhibitintracellularvitaminB6-dependentenzymes:proofofprinciplewithhumanandplasmodiumornithinedecarboxylaseandhumanhistidinedecarboxylase(综述文章,上海交通大学为第一完成单位)美国实验生物学联合会杂志FASEBJ.2011,Inpress2.FangWu,ClaudeSchweizer,NikitaRudinskiy,DavidM.Taylor,AlekseyKazantsev,RuthLuthiCarterandPatrickC.Fraering.Novelgamma-secretaseinhibitorsuncoveracommonnucleotide-bindingsiteinJAK3,SIRT2andPS1美国实验生物学联合会杂志FASEBJ.2010Jul;24(7):2464-74.Epub2010Mar173.MullerIB*,FangWu*,etal.Poisoningpyridoxal5-phosphate(PLP)-dependentenzymes:AnewstrategytotargetthemalariaparasitePlasmodiumfalciparum美国《公共图书馆·综合》杂志PloSONE,2009,4(2):e4406（*共同第一作者）此文被同行积极评价并被著名生物文章评价网站Faculty1000Biology在药理学和药物发现领域（Pharmacology&DrugDiscovery）收录和推荐。4.FangWuandHeinzGehring.Structuralrequirementsfornovelcoenzyme-substratederivativestoinhibitintracellularhumanornithinedecarboxylaseandcellproliferation.美国实验生物学联合会杂志FASEBJ.2009,23(2):565-745.FangWu,JingYuandHeinzGehring.Inhibitoryandstructuralstudiesofnovelcoenzyme-substrateanalogsofhumanhistidinedecarboxylase.美国实验生物学联合会杂志FASEBJ.2008,22(3):890-76.FangWu,DorisGrossenbacherandHeinzGehring.Transitionstatebased-inhibitorofhumanornithinedecarboxylaseinhibitinggrowthoftumorcells.美国分子癌症治疗学杂志MolecularCancerTherapeutics.2007,6(6):1831-9
吴强

导师姓名
吴强
研究方向分子遗传学;细胞发育学
联系方式通讯地址：东川路800号

邮政编码：200240

联系电话：34204300

Email：qiangwu@1
个人简介

男，博士，上海交通大学特聘教授。吴强教授长期从事复杂基因家族的表达调控和在体功能研究。吴强团队以研究原钙粘蛋白（protocadherin）家族在脑发育和脑功能中的细胞分子机制以及UGT基因家族在药物代谢中的表达调控和结构功能为主要研究方向。我们以小鼠为模式动物对这些基因的研究将为阐明人类重要常见复杂神经精神疾病（自闭症autismspectrumdisorders、精神分裂症schizophrenia、双极性障碍bipolardisorders等）的发生发展机理以及最终对其有效治疗做出贡献。欢迎有志从事科学研究的青年加入我们团队。吴强教授先后获得的科技奖励有：ExcellenceResearchRecognitionAward;TheSecondAnnualRibozymePharmaceuticals/RNAPrizeforYoungScientists;MarchofDimesBasicO’ConnerScholar;AmericanCancerSocietyResearchScholar。研究论文先后发表于Science,MolecularandCellularBiology,Cell,PNAS,MolecularCell,GenomeResearch和NatureGenetics等期刊上，总影响因子超过160，总引用超过730。现任ActaBiochimicaetBiophysicaSinica《生物化学与生物物理学报》Editor，并为多个国际知名期刊审稿。
代表性论著
HuangH.andWu,Q*.(2010).CloningandcomparativeanalysesofthezebrafishUgtrepertoirerevealitsevolutionarydiversity.PLoSONE5:E9144.Ying,G.,Wu,S.,Hou,R.,Huang,W.,Capecchi,M.,Wu,Q*.(2009).ProtocadherinCelsr3isrequiredforinterneuronmigrationinthemouseforebrain.MolecularandCellularBiology29:3045-3061.Wu,S.,Ying,G.,Wu,Q.,andCapecchi,M.R.(2008).Aprotocolforconstructinggenetargetingvectors:generatingknockoutmiceforthecadherinfamilyandbeyond.NatureProtocol3:1056-1076.Zou,C.,Huang,W.,Ying,G.,andWu,Q*.(2007).Sequenceanalysisandexpressionmappingoftheratclusteredprotocadheringenerepertoires.Neuroscience144:579-603.Wu,S.,Ying,G.,Wu,Q.,andCapecchi,M.R.(2007).Towardssimplerandfastergenome-widemutagenesisinmice.NatureGenetics39:922-930.Li,C.andWu,Q*.(2007).Evolutionofvertebratemultiplevariablefirstexonsandstructuraldiversityofdrugmetabolizingenzymes.BMCEvolutionaryBiology7:69.Wu,Q*#.(2005).Comparativegenomicsanddiversifyingselectionoftheclusteredvertebrateprotocadheringenes.Genetics169:2179-2188.Zhang,T.,Haws,P.,andWu,Q*.(2004)Multiplevariablefirstexons:amechanismforcell-andtissue-specificgeneregulation.GenomeResearch14:70-89.Tasic,B.,Nabholz,C.E.,Baldwin,K.K.,Kim,Y.,Rueckert,E.H.,Ribich,S.A.,Cramer,P.,Wu,Q.,Axel,R.,andManiatisT.(2002).Promoterchoicedeterminessplicesiteselectioninprotocadherinandpre-mRNAsplicing.Mol.Cell10:21-33.Wu,Q#.,Zhang,T.,Cheng,J.-F.,Kim,Y.,Grimwood,J.,Schmutz,J.,Dickson,M.,Noonan,J.P.,Zhang,M.Q.,Myers,R.M.,andManiatis,T.(2001).ComparativeDNAsequenceanalysisofmouseandhumanprotocadheringeneclusters.GenomeResearch11:389-404.Wu,Q#.andManiatis,T.(2000).Largeexonsencodingmultipleectodomainsareacharacteristicfeatureofprotocadheringenes.ProcNatlAcadSciUSA97:3124-3129.PohlU.,SmithJ.S.,TachibanaI.,UekiK.,LeeH.K.,RamaswamyS.,WuQ.,MohrenweiserH.W.,JenkinsR.B.,LouisD.N.(2000).EHD2,EHD3,andEHD4encodenovelmembersofahighlyconservedfamilyofEHdomain-containingproteins.Genomics63:255-262.Wu,Q#.andManiatis,T.(1999)Astrikingorganizationofalargefamilyofhumanneuralcadherin-likecelladhesiongenes.Cell97:779-790.Wu,Q#.andKrainer,A.R.(1999)AT-ACpre-mRNAsplicingmechanismsandconservationofminorintronsinvoltage-gatedionchannelgenes.MolecularandCellularBiology19:3225-3236.Wu,Q#.andKrainer,A.R.(1998)Purine-richenhancersfunctionintheAT-ACsplicingpathwayanddosoindependentlyofintactU1snRNP.RNA4:1664-1673.Wu,Q#.andKrainer,A.R.(1997)SplicingofadivergentsubclassofAT-ACintronsrequiresthemajorspliceosomalsnRNAs.RNA3:586-601.Wu,Q#.andKrainer,A.R.(1996)U1-mediatedexondefinitioninteractionsbetweenAT-ACandGT-AGintrons.Science274:1005-1008.
张延

导师姓名
张延
研究方向肿瘤的功能糖生物学;糖链修饰蛋白质组学
联系方式通讯地址：东川路800号系统生物医学大楼B208

邮政编码：200240

联系电话：021-3420-6778

Email：yanzhang2006@sjtu.edu.cn
个人简介

研究员,博士生导师。SCSB-AIST中日医学糖组学联合实验室中方主任，上海浦江人才（2007）。1986年毕业于山东大学微生物学专业。1986-1989年在上海交通大学生物与技术系工作。1993年和1996年分别获得日本东京大学应用生物工程专业硕士和博士学位。1996-2006年先后在日本产业技术综合研究所（AIST），日本动物卫生研究所工作。现为系统生物医学研究院糖生物学实验室课题组长。张延研究员主要从事蛋白质的O-糖基化机制和修饰蛋白质组学研究。现任中国生物化学与分子生物学会糖复合物专业委员会常务委员，中国蛋白质组学专业委员会委员，亚洲糖组学研究联盟（ACGG）成员。获得国家自然基金面上项目（3项），国家重点基础研究发展计划（973计划）蛋白质重大研究课题，国家863项目子课题及科技部国际合作项目的支持。目前实验室主要研究内容：1.肿瘤功能糖生物学（糖链对肿瘤细胞生物学行为的影响及调控机制），2.糖链修饰蛋白质组学新技术新方法，3.疾病的血液早期诊断糖链生物标志物的发现。
代表性论著
1.Li,X.,Wang,J.,LiW.,Xu,Y.J.,Shao,D.,Xie,Y.Y.,Xie,W.X.,Kubota,T.,Narimatsu,H.andZhang,Y*.2012.CharacterizationofppGalNAc-T18,amemberofthevertebrate-specificYsubfamilyofUDP-N-acetyl-α-D-galactosamine:polypeptideN-acetylgalactosaminyltransferases.Glycobiology,22:602-615.2.Wang,S.,Xie,X.,Zhang,X.,Zou,X.,andZhang,Y*.2012.Disulfide-andterminalalkyne-functionalizedmagneticsilicaparticlesforenrichmentofazidoglycopeptides.Chem.Commun.,DOI:10.1039/C2CC18160F3.Cheng,Y.,Xie,G.X.,Chen,T.L.,Qiu,Y.P.,Zou,X.,Zheng,M.H.,Tan,B.B.,Feng,B.,Dong,T.T.,He,P.G.,Zhao,L.J.,Zhao,A.H.,Xu,L.,Zhang,Y*.&Jia,W*.，2012.ADistinctUrinaryMetabolicProfileofHumanColorectalCancer,JournalofProteomeResearch.11:1354-1363.4.Peng,C.,Togayachi,A.,Kwon,Y.D.,Xie,C.,Wu,G.,Zou,X.,Sato,T.,Ito,H.,Tachibana,K.,Kubota,T.,Noce,T.,Narimatsu,H.andZhang,Y*.2010,IdentificationofanovelhumanUDP-GalNActransferasewithuniquecatalyticactivityandexpressionprofile.BiochemBiophysResCommun402(4):680-686.5.Wang,J.,Peng,C.,&Zhang,Y*.2011.CatalyticActivityandStructureAnalysisoftheIntialGlycosyltransferaseofO-glycosylation.ChineseBulletinofLifeSciences,23:619-629.(inChinese)6.Wang,S.,Zou,X.andZhang,Y*.2010.MassSpectrometryBasedAnalysisofProteinO-glycosylation.ProgressinChemistry22(12):2388-2395.(inChinese)
赵小东

导师姓名
赵小东
研究方向功能基因组学;基因表达调控
联系方式通讯地址：上海市闵行区东川路800号系统生物医学研究院D203

邮政编码：200240

联系电话：34206846

Email：xiaodong122@gmail.com
个人简介

研究员。2003年毕业于中国疾病预防控制中心，获博士学位。2003年底赴新新加坡基因组研究所从事博士后研究。自2008年5月起，赴英国剑桥大学医学研究所工作。2010年1月回国，供职于上海交通大学系统生物医学研究院。该团队主要从事基于高通量测序的转录组学、转录调控网络和表观遗传学研究。主要研究领域包括干细胞表观遗传学的研究和肿瘤细胞转录组学、转录调控网络的研究。目前获得国家自然科学基金委重大研究计划经费资助。
代表性论著
1.ZhaoXD,RuanY,WeiCL.Tacklingtheepigenomeinthepluripotentstemcells.JGenetGenomics.2008;35(7):403-12.2.ZhaoXD,HanX,ChewJL,LiuJ,ChiuKP,etal.WholegenomemappingofhistoneH3Lys4and27trimethylationsrevealsdistinctgenomiccompartmentsinhumanembryonicstemcells.CellStemCell,2007;1(3):286-9.3.RuanY,OoiHS,ChooSW,ChiuKP,ZhaoXD,etal.FusiontranscriptsandtranscribedretrotransposedlocidiscoveredthroughcomprehensivetranscriptomeanalysisusingPaired-EnddiTags(PETs).GenomeRes.2007;17(6):828-38.4.ZellerKI*,ZhaoXD*(*equalcontributor),LeeCW,ChiuKP,YaoF,etal.GlobalMappingofc-MYCBindingSitesandTargetGeneNetworksinHumanBCells.PNAS.2006;103(47):17834-9.5.ENCODEProjectConsortium(includingZhaoXD).Identificationandanalysisoffunctionalelementsin1%ofthehumangenomebytheENCODEpilotproject.Nature.2007;447(7146):799-816.6.WeiCL,WuQ,VegaVB,ChiuKP,NgP,ZhangT,ShahabA,YongHC,FuY,WengZ,LiuJ,ZhaoXD,etal.Aglobalmapofp53ranscription-factorbindingsitesinthehumangenome.Cell.2006;124(1):207-19.