在岗研究生导师情况介绍
所系名称生化与细胞所
性别女
专业名称生物化学与分子生物学
技术职务研究员
行政职务研究组长
Mail地址linglingchen@sibcb.ac.cn
指导博士
生总数0指导硕士
生总数2已毕业学生通讯地址上海市岳阳路320号
目前博士
生数0目前硕士
生数2目前在校生邮政编码200031
研究方向长非编码RNA和干细胞
研究工作人类基因组测序计划发现多于98％的基因组序列转录为非编码RNA（ncRNA）。这些ncRNA除了包括人们所熟知的‘housekeeping’非编码RNA（tRNAs,rRNAs和snRNAs等）、小非编码RNA（miRNAs和piRNAs等），更多的是长非编码RNA（lncRNA，>200nt）。最近几年来的研究表明lncRNAs广泛参与一系列细胞的重要功能调控，包括细胞核亚结构的形成、基因表达的遗传与表观遗传调控等。
我们实验室主要研究哺乳动物细胞中lncRNAs的功能调控，并着重研究其与细胞核亚结构的形成和对人源胚胎干细胞（hESCs）的命运决定的调控。在国际上最早报道lncRNA的功能和hESCs的命运决定密切相关等基础上，近来利用国际前沿高通量测序技术发现了一系列干细胞特有的或全新的lncRNAs。今后将利用分子生物学、细胞生物学和生物化学的手段，以hESCs的多功能潜能性维持和分化为模型，研究这些lncRNAs的产生、功能调控及其在干细胞命运决定中的作用。研究获得成果，不仅能够丰富我们对lncRNAs在哺乳细胞基因组功能和机制的认识，也为hESCs的多功能性维持和命运改变提供一个全新水平的调控。
获奖情况1.ConnecticutStemCellSeedAward(09SCAUCHC16,$200,000/2yrs),USA,2009
2.BestOralPresentationAwardatNewEnglandStemCellConsortium2009JuniorInvestigatorSymposium,Worcester,MA,USA,2009
3.BestPosterPresentationAwardatGordonResearchConference-RNAEditing-RolesofRNAandDNAeditingandmodificationincellularfunction,Galveston,TX,USA,2009
4.TravelAwardatWorkshoponPost-TranscriptionalRegulationofViralGeneExpression,Syria,VA,USA,2008
指导研究
生情况目前指导两名硕博连读研究生
个人简介2009年2月毕业于美国UniversityofConnecticutHealthCenter获得生物医学博士学位，并同时获得商学院工商管理学硕士学位。同年5月作为独立PI获得ConnecticutStemCellSeedAward研究经费资助，受聘于UniversityofConnecticutStemCellInstitute从事博士后研究，并于2010年5月起任助理教授。主要从事RNA编辑和长非编码RNA对基因表达调控和干细胞命运决定的分子机制研究。现任上海生命科学院生物化学与细胞生物学研究所研究员，研究组长。
近期论文1.PengS,ChenLL,LeiX,YangL,LinH,CarmichaelGGandHuangY.Genome-widestudiesrevealthatLin28enhancesthetranslationofgenesimportantforgrowthandsurvivalofhumanembryonicstemcells.(2011)StemCells.Inpress.
2.ChenLL†andCarmichaelGG†.NucleareditingofmRNA3'-untranslatedregionsbyADARs.(2011)Curr.Top.Microbiol.Immunol.Inpress.
3.ChenLL†,YangLandCarmichaelGG†.MolecularbasisforanattenuatedcytoplasmicdsRNAresponseinhumanembryonicstemcells.(2010)CellCycle.9:3552-64.
CommentariesbyNewsandViews:
•WilliamsBRG.Differentiatingtheinterferonpathway.(2010)CellCycle.9:17.September1.
4.ChenLL†andCarmichaelGG.Longnon-codingRNAsinmammaliancells:What,WhereandWhy?(2010)WIREsRNA.1:2-21.
5.ChenLL†andCarmichaelGG†.Decodingthefunctionofnuclearlongnon-codingRNAs.(2010)Curr.Opin.CellBiol.22:357-364.
6.ChenLLandCarmichaelGG.AlterednuclearretentionofmRNAscontaininginvertedrepeatsinhumanembryonicstemcells:functionalroleofanuclearnoncodingRNA.(2009)MolCell.35:467-478.
Commentariesby:
•ScaddenD.ANEATwayofregulatingnuclearexportofmRNAs(2009)MolCell.35:395-396.
•Facultyof1000BiologyasaMUSTREADarticle.
7.ChenLLandCarmichaelGG.GeneregulationbySINESandinosines:biologicalconsequencesofA-to-IeditingofAluelementinvertedrepeats.(2008)CellCycle.2008,7:3297-3301.
8.ChenLL,DecerboJNandCarmichaelGG.Aluelement-mediatedgenesilencing.(2008)EMBOJ.27:1694-1705.
9.ZhouJ,WangQ,ChenLLandCarmichaelGG.OnthemechanismofinductionofheterochromatinbytheRNA-bindingproteinvigilin.(2008)RNA14:1773-1781.
10.ZhouJ,ChenLLandCarmichaelGG.AroleforAtoIeditingingenesilencing.(2008)in“FrontiersofRNAandDNAediting”,H.Smith,ed.,Wiley-Interscience,pp.190-202.
11.CuiYM,HuangQQ,XuJ,ChenLL,LiJY,YeQZ,LiJandNanFJ.IdentificationofpotenttypeIMetAPsinhibitorsbysimplebioisostericreplacement.Part2.(2005)Bioorg.Med.Chem.Lett.15:4130-4135.
12.CuiYM,HuangQQ,XuJ,ChenLL,LiJY,YeQZ,LiJandNanFJ.IdentificationofpotenttypeIMetAPinhibitorsbysimplebioisostericreplacement.Part1:SynthesisandpreliminarySARstudiesofthiazole-4-carboxylicacidthiazol-2-ylamidederivatives.(2005)Bioorg.Med.Chem.Lett.15:3732-3736.
13.LuoQL,LiJY,ChenLL,LiJ,YeQZandNanFJ.InhibitorsoftypeIMetAPscontainingpyridine-2-carboxylicacidthiazol-2-ylamide.Part2:SARstudiesonthepyridinering3-substituent.(2005)Bioorg.Med.Chem.Lett.15:639-644.
14.LuoQL,LiJY,ChenLL,LiJ,YeQZandNanFJ.InhibitorsoftypeIMetAPscontainingpyridine-2-carboxylicacidthiazol-2-ylamide.Part1:SARstudiesonthedeterminationofthekeyscaffold.(2005)Bioorg.Med.Chem.Lett.15:635-638.
15.ChenLL,LiJ,LiJY,LuoQL,MaoWF,ShenQ,NanFJandYeQZ.TypeImethionineaminopeptidasefromSaccharomycescerevisiaeisapotentialtargetforantifungaldrugscreening.(2004)Acta.Pharmacol.Sin.25:907-914.
16.LiJY,ChenLL,CuiYM,LuoQL,GuM,NanFJandYeQZ.CharacterizationoffulllengthandtruncatedtypeIhMetAPexpressedfromE.coli.(2004)Biochemistry43:7892-8.
17.CuiYM,LiJY,ChenLL,LiJ,YeQZandNanFJ.DesignandsynthesisofchromogenicthiopeptolidesubstratesasMetAPsactivesiteprobes.(2004)Bioorg.Med.Chem.Lett.12:2853-2861.
18.LiJY,CuiYM,ChenLL,GuM,LiJ,NanFJandYeQZ.MutationsattheS1sitesofmethionineaminopeptidasesfromEscherichiacoliandHomosapiensrevealtheresiduescriticalforsubstratespecificity.(2004)JBiol.Chem.279:21128-2134.
19.LiJY,ChenLL,CuiYM,LuoQL,LiJ,NanFJandYeQZ.Specificityforinhibitorsofmetal-substitutedmethionineaminopeptidase.(2003)BiochemBiophysResCommun.307:172-179.
20.LuoQL,LiJY,LiuZY,ChenLL,LiJ,NanFJandYeQZ.DiscoveryandstructuralmodificationofinhibitorsofmethionineaminopeptidasesfromEscherichiacoliandSaccharomycescerevisiae.(2003)JMed.Chem.46:2631-2640.
21.ChenLL,LiuMXandWangZR.StudiesontheapoptosisofretinalneuronsfollowingopticnerveinjureinZebrafish(Brachydaniorerio).(2001)JLanzhouUniversity37:76-81.
(†通讯作者)
