在岗研究生导师情况介绍
所系名称植生生态研究所
性别男
专业名称生物化学与分子生物学
技术职务副研究员
行政职务无
Mail地址qfeng@ncgr.ac.cn
指导博士
生总数0指导硕士
生总数0已毕业学生通讯地址上海市徐汇区漕宝路500号
目前博士
生数0目前硕士
生数0目前在校生邮政编码200233
研究方向植物基因组学/植物分子遗传学
研究工作负责基因中心测序平台的运行与管理,参与基因中心承担的国际水稻基因组测序计划(IRGSP)第四号染色体的测序任务、水稻第四号染色体tiling芯片的制备、水稻全长cDNA测序、国际水稻OMAP(OryzaMapAlignmentProject)计划。主持完成水稻AA和CC基因组两个共线性区段的序列比较分析课题。负责第二代高通量测序平台,在水稻重测序以及其它物种的基因组全新测序方面取得了一系列成果。主持完成转基因生物新品种培育科技重大专项课题(2009ZX08009-008B)——水稻单片段替换系的基因型鉴定工作。参与水稻转录组测序分析,水稻地方品种的全基因组关联分析(GWAS)等。
目前主要从事植物基因组全新测序组装分析,以及水稻重测序分析。基于水稻全基因组关联分析,对关联位点进行精细分析研究,筛选和鉴定水稻重要农艺性状的功能基因。
获奖情况2007年12月国家自然科学奖二等奖(第二获奖人)
2004年1月上海市科委联合利华奖学金
2003年12月上海市科技进步一等奖(第二获奖人)
2003年9月第九届上海市科协青年优秀科技论文一等奖
指导研究
生情况0
个人简介2009年10月-至今中科院上海生命科学研究院植生生态所/国家基因研究中心副研究员
2003年9月-2010年5月上海交通大学完成博士论文获得博士学位
2003年6月-2009年10月中科院上海生命科学研究院植生生态所/国家基因研究中心助理研究员
1998年8月-2003年6月中科院国家基因研究中心研究实习员
1994年9月-1998年6月复旦大学生命科学院获学士学位
近期论文1.Huang,X.H.,Zhao,Y.,Wei,X.H.,Li,C.Y.,Wang,A.H.,Zhao,Q.,Li,W.J.,Guo,Y.L.,Deng,L.W.,Zhu,C.R.,Fan,D.L.,Lu,Y.Q.,Weng,Q.J.,Liu,K.Y.,Zhou,T.Y.,Jing,Y.F.,Si,L.Z.,Dong,G.J.,Huang,T.,Lu,T.T.,Feng,Q.,Qian,Q.,Li,J.Y.,andHan,B.(2012).Genome-wideassociationstudyoffloweringtimeandgrainyieldtraitsinaworldwidecollectionofricegermplasm.Nat.Genet.44:32-39.
2.Huang,X.H.,Wei,X.H.,Sang,T.,Zhao,Q.,Feng,Q.,Zhao,Y.,Li,C.Y.,Zhu,C.R.,Lu,T.T.,Zhang,Z.W.,Li,M.,Fan,D.L.,Guo,Y.L.,Wang,A.H.,Wang,L.,Deng,L.W.,Li,W.J.,Lu,Y.Q.,Weng,Q.J.,Liu,K.Y.,Huang,T.,Zhou,T.Y.,Jing,Y.F.,Li,W.,Lin,Z.,Edward,S.B.,Qian,Q.,Zhang,Q.F.,Li,J.Y.,andHan,B.(2010).Genome-wideassociationstudiesof14agronomictraitsinricelandraces.Nat.Genet.42:961-967.(并列第一作者)
3.Xie,W.B.,Feng,Q.,Yu,H.H.,Huang,X.H.,Zhao,Q.,Xing,Y.Z.,Yu,S.B.,Han,B.,andZhang,Q.F.(2010).Parent-independentgenotypingforconstructinganultrahigh-densitylinkagemapbasedonpopulationsequencing.Proc.Natl.Acad.Sci.USA.107:10578-83.
4.Xu,J.J.,Zhao,Q.,Du,P.N.,Xu,C.W.,Wang,B.H.,Feng,Q.,Liu,Q.Q.,Tang,S.Z.,Gu,M.H.,Han,B.,andLiang,G.H.(2010).Developinghighthroughputgenotypedchromosomesegmentsubstitutionlinesbasedonpopulationwhole-genomere-sequencinginrice(OryzasativaL.).BMCGenomics.11:656.(项目负责人之一)
5.Lu,T.T.,Lu,G.J.,Fan,D.L.,Zhu,C.R.,Li,W.,Zhao,Q.,Feng,Q.,Zhao,Y.,Guo,Y.L.,Li,W.J.,Huang,X.H.,andHan,B.(2010).Functionannotationofthericetranscriptomeatsingle-nucleotideresolutionbyRNA-seq.GenomeRes.20:1238-1249.
6.Feng,Q.,Huang,T.,Zhao,Q.,Zhu,J.J.,Lin,Z.X.,andHan,B.(2009).AnalysisofcollinearregionsofOryzaAAandCCgenomes.J.Genet.Genomics.11(36):667-677.
7.Huang,X.H.,Feng,Q.,Qian,Q.,Zhao,Q.,Wang,L.,Wang,A.H.,Guan,J.P.,Fan,D.L.,Weng,Q.J.,Huang,T.,Dong,G.J.,Sang,T.,andHan,B.(2009).High-throughputgenotypingbywhole-genomeresequencing.GenomeRes.19:1068-1076.(并列第一作者)
8.Gao,Z.Y.,Qian,Q.,Liu,X.H.,Yan,M.X.,Feng,Q.,Dong,G.J.,Liu,J.,Han,B.(2009).Dwarf88,anovelputativeesterasegeneaffectingarchitectureofriceplant.PlantMol.Biol.71:265-276.
9.Liu,X.H.,Lu,T.T.,Yu,S.L.,Li,Y.,Huang,Y.C.,Huang,T.,Zhang,L.,Zhu,J.J.,Zhao,Q.,Fan,D.L.,Mu,J.,Shangguan,Y.Y.,Feng,Q.,Guan,J.P.,Ying,K.,Zhang,Y.,Lin,Z.X.,Sun,Z.X.,Qian,Q.,Lu,Y.P.andHan,B.(2007).Acollectionof10,096indicaricefull-lengthcDNAsrevealshighlyexpressedsequencedivergencebetweenOryzasativaindicaandjaponicasubspecies.PlantMol.Biol.65:403-415.
10.Zhang,J.W.,Feng,Q.,Jin,C.Q.,Qiu,D.Y.,Zhang,L.D.,Xie,K.B.,Yuan,D.J.,Han,B.,Zhang,Q.F.,Wang,S.P.(2005).Featuresoftheexpressedsequencesrevealedbyalarge-scaleanalysisofESTsfromanormalizedcDNAlibraryoftheeliteindicaricecultivarMinghui63.PlantJournal.42(5):772-780.
11.Jiao,Y.L.,Jia,P.X.,Wang,X.F.,Su,N.,Yu,S.L.,Zhang,D.F.,Ma,L.G.,Feng,Q.,Jin,Z.Q.,Li,L.,Xue,Y.B.,Cheng,Z.K.,Zhao,H.Y.,Han,B.,Deng,X.W.(2005).Atilingmicroarrayexpressionanalysisofricechromosome4suggestsachromosome-levelregulationoftranscription.PlantCell.17(6):1641-1657.
12.Feng,Q.,Zhang,Y.J.,Hao,P.,Wang,S.Y.,Fu,G.,Huang,Y.C.,Li,Y.,Zhu,J.J.,Liu,Y.L.,Hu,X.,Jia,P.X.,Zhang,Y.,Zhao,Q.,Ying,K.,Yu,S.L.,Tang,Y.S.,Weng,Q.J.,Zhang,L.,Lu,Y.,Mu,J.,Lu,Y.Q.,Zhang,L.,Yu,Z.,Fan,D.L.,Liu,X.H.,Lu,T.T.,Li,C.,Wu,Y.R.,Sun,T.G.,Lei,H.Y.,Li,T.,Hu,H.,Guan,J.P.,Wu,M.,Zhang,R.Q.,Zhou,B.,Chen,Z.H.,Chen,L.,Jin,Z.Q.,Wang,R.,Yin,H.F.,Cai,Z.,Ren,S.X.,Lv,G.,Gu,W.Y.,Zhu,G.F.,Tu,Y.F.,Jia,J.,Zhang,Y.,Chen,J.,Kang,H.,Chen,X.Y.,Shao,C.Y.,Sun,Y.,Hu,Q.P.,Zhang,X.L.,Zhang,W.,Wang,L.J.,Ding,C.W.,Sheng,H.H.,Gu,G.L.,Chen,S.T.,Ni,L.,Zhu,F.H.,Chen,W.,Lan,L.F.,Lai,Y.,Cheng,Z.K.,Gu,M.H.,Jiang,J.M.,Li,J.Y.,Hong,G.F.,Xue,Y.B.,andHan,B.(2002).Sequenceandanalysisofricechromosome4.Nature.420(21):336-340.(并列第一作者)