在岗研究生导师情况介绍
所系名称植生生态研究所
性别男
专业名称动物学
技术职务研究员
行政职务无
Mail地址yzxu@sibs.ac.cn
指导博士
生总数9指导硕士
生总数2已毕业学生通讯地址上海枫林路300号
目前博士
生数9目前硕士
生数2目前在校生邮政编码200032
研究方向RNA剪接与昆虫发育
研究工作真核生物基因中编码序列‘外显子’(exon)被大量的非编码序列‘内含子’(intron)所隔断,内含子在哺乳动物中约有20万个,在昆虫中约5万个。内含子的去除由RNA剪接(RNAsplicing)催化完成,是基因表达过程中一个重要的环节。内含子序列中包含三个保守的RNA区域,5’和3’剪接位点(splicesite)、剪接支点(branchsite)区域,这些序列具有一定的保守性(GU—A—AG),同时又有很大的灵活性。错误的RNA剪接将导致编码基因的阅读框移位或提前终止,已知人类15%以上的疾病是由于RNA剪接紊乱产生的,因此研究RNA剪接的保真性(splicingfidelity)具有非常重要的意义。此外,高等生物中普遍存在选择性剪接(alternativesplicing),它使一个基因可以产生多个不同的剪接产物,对细胞分化,组织器官形成和生长发育起着重要的调控作用。昆虫的发育与选择性剪接密切相关,例如双翅目昆虫果蝇的性别决定途径就是由一系列基因的选择性剪接级联反应控制的,但是包括经济昆虫家蚕和众多农业害虫在内的鳞翅目昆虫性别决定机制尚不清楚。
目前我们的研究方向主要集中在四个方面:1.RNA选择性剪接调控的昆虫发育机制;2.RNAhelicase对剪接准确性和灵敏性的调控机制;3.RNA剪接与基因转录的耦联机制;4.SR蛋白在肿瘤发生中的作用。
获奖情况2007年OutstandingPostdoctoralResearchScholarPrize,AlbertEinsteinCollegeofMedicine
2008年中国科学院“百人计划”
2009年上海市“浦江人才”
指导研究
生情况博士生邵伟于2012年获得‘国家奖学金’和‘朱李月华优秀博士生奖’
个人简介1989-1996:安徽农业大学本科,硕士
1996-1999:中科院上海生物化学研究所博士
2000-2008:美国爱因斯坦医学院博士后,研究助理
2008.7-:植物生理生态研究所研究员
近期论文Yang,F.,Wang,XY.,Zhang,ZM.,Pu,J.,Fan,YJ.,Zhou,J.,Query,C.andXu,YZ.*(2013)SplicingProofreadingat5'SpliceSitesbyATPasePrp28p.NucleicAcidsResearch(inpress)
Shao,W.,Zhao,QY.,Wang,XY.,Xu,XY.,Tang,Q.,Li,M.,Li,X.*andXu,YZ.*(2012)Alternativesplicingandtrans-splicingeventsrevealedbyanalysisoftheBombyxmoritranscriptome.RNA18:1395-407.
Shao,W.,Kim,HS.,Cao,Y.,Xu,YZ.*andQuery,CC.*(2012)AU1–U2snRNPinteractionnetworkduringintrondefinition.MolecularandCellularBiology32:470-478.
Xu,YZ.,andQuery,CC.(2007)CompetitionbetweentheATPasePrp5andbranchregion-U2snRNApairingmodulatesthefidelityofspliceosomeassembly.MolecularCell28:838-849.
Xu,YZ.,Newnham,CM.,Kameoka,S.,Huang,T.,Konarska,MM.andQuery,CC.(2004)Prp5bridgesU1andU2snRNPsandenablesstableU2snRNPassociationwithintronRNA.EMBOJournal23:376-385.
*:correspondingauthor