在岗研究生导师情况介绍
所系名称植生生态研究所
性别女
专业名称微生物学
技术职务研究员
行政职务无
Mail地址cyang@cibt.ac.cn
指导博士
生总数3指导硕士
生总数1已毕业学生通讯地址上海枫林路300号
目前博士
生数2目前硕士
生数1目前在校生邮政编码200032
研究方向微生物代谢工程和比较基因组学
研究工作运用生物信息学及代谢工程的最新技术和方法来建立新型的微生物代谢工程技术平台,并将其有效地应用于生物燃料及生物基化学品的生产等过程。
获奖情况
2003年日本生物工学会优秀论文奖
2005年默克研究奖励金
指导研究
生情况目前指导博士生2名、硕士生1名
个人简介1994年毕业于浙江大学化学工程系生物化学工程专业;
2001年获日本九州工业大学生物科学和生物信息学系博士学位;
2001至2004年日本庆应大学先端生命科学研究所博士后;
2004至2007年美国Burnham医学研究所博士后;
现任中国科学院上海生命科学研究院植物生理生态研究所研究员。
已在国内外发表论文20余篇(包括J.Bacteriol.,J.Biol.Chem.,Appl.Environ.Microbiol.,Biotechnol.Bioeng.等国际重要刊物)。2006至2008年获美国加州乳腺癌研究协会项目基金资助,2007年入选中国科学院先进工业生物技术创新基地“百人计划”。
近期论文1.Rodionov,D.A.,Yang,C.,Li,X.,Rodionova,I.A.,Wang,Y.,Obraztsova,A.Y.,Zagnitko,O.P.,Overbeek,R.,Romine,M.F.,Reed,S.,Fredrickson,J.K.,Nealson,K.H.,Osterman,A.L.GenomicencyclopediaofsugarutilizationpathwaysintheShewanellagenus.BMCGenomics,inpress(2010).
2.Xiong,W.,Liu,L.,Wu,C.,Yang,C.*,Wu,Q.*13CtracerandGC-MSanalysisrevealsmetabolicfluxdistributioninoleaginousmicroalgaChlorellaprotothecoides.PlantPhysiol.,inpress(2010).
3.Gu,Y.,Ding,Y.,Ren,C.,Sun,Z.,Rodionov,D.A.,Zhang,W.,Yang,S.,Yang,C.*(correspondingauthor),Jiang,W.*ReconstructionofxyloseutilizationpathwayandregulonsinFirmicutes.BMCGenomics,11:255(2010).
4.Wang,Q.,Zhang,Y.,Yang,C.,Xiong,H.,Lin,Y.,Yao,J.,Li,H.,Xie,L.,Zhao,W.,Yao,Y.,Ning,Z.,Zeng,R.,Xiong,Y.,Guan,K.,ZhaoS.,Zhao,G.Acetylationofmetabolicenzymescoordinatescarbonsourceutilizationandmetabolicflux.Science,327:1004-1007(2010).
5.Pinchuk,G.E.,Rodionov,D.A.,Yang,C.(co-firstauthor),Li,X.,Osterman,A.,Dervyn,E.,Geydebrekht,O.V.,Reed,S.B.,Romine,M.F.,Collart,F.R.,Scott,J.H.,Fredrickson,J.K.,Beliaev,A.S.GenomicreconstructionofShewanellaoneidensisMR-1metabolismrevealsapreviouslyuncharacterizedmachineryforlactateutilization.Proc.Natl.Acad.Sci.USA.,106:2874-2879(2009).
6.Yang,C.,Rodionov,D.A.,Rodionova,I.A.,Li,X.,Osterman,A.Glycerate2-kinasefamilyandgenomicreconstructionofrelatedmetabolicpathways.CasestudyinThermotogamaritima.J.Bacteriol.,190:1773-1782(2008).
7.Knowles,L.M.,Yang,C.,Osterman,A.,Smith,J.W.Inhibitionoffatty-acidsynthaseinducescaspase-8-mediatedtumorcellapoptosisbyup-regulatingDDIT4.J.Biol.Chem.,283:31378-31384(2008).
8.Richardson,A.D.,Yang,C.(co-firstauthor),Osterman,A.,&Smith,J.W.Centralcarbonmetabolismintheprogressionofmammarycarcinoma.BreastCancerRes.Tr.,110:297-307(2008).
9.Yang,C.,Richardson,A.D.,Osterman,A.,&Smith,J.W.ProfilingofCentralMetabolisminHumanCancerCellsbyTwo-dimensionalNMR,GC-MSAnalysis,andIsotopomerModeling.Metabolomics,4:13-29(2008).
10.Yang,C.,Rodionov,D.A.,Li,X.,Laikova,O.N.,Gelfand,M.S.,Zagnitko,O.P.,Romine,M.F.,Obraztsova,A.Y.,Nealson,K.H.,Osterman,A.ComparativegenomicsandexperimentalcharacterizationofN-acetylglucosamineutilizationpathwayofShewanellaoneidensis.J.Biol.Chem.,281:29872-29885(2006).
11.Low,L.Y.,Yang,C.(co-firstauthor),Perego,M.,Osterman,A.,&Liddington,R.C.StructureandlyticactivityofaBacillusanthracisprophageendolysin.J.Biol.Chem.,280:35433-35439(2005).
12.Hua,Q.,Yang,C.,Oshima,T.,Mori,H.,&Shimizu,K.AnalysisofgeneexpressioninEscherichiacoliinresponsetochangesofgrowth-limitingnutrientinchemostatcultures.Appl.Environ.Microbiol.,70:2354-2366(2004).
13.Yang,C.,Hua,Q.,Baba,T.,Mori,H.,&Shimizu,K.AnalysisofEscherichiacolianapleroticmetabolismanditsregulationmechanismsfromthemetabolicresponsestoalterdilutionratesandphosphoenolpyruvatecarboxykinaseknockout",Biotechnol.Bioeng.,84:129-144(2003).
14.Hua,Q.,Yang,C.(co-firstauthor),Baba,T.,Mori,H.,&Shimizu,K.ResponsesofthecentralmetabolisminEscherichiacolitophosphoglucoseisomeraseandglucose-6-phosphatedehydrogenaseknockouts.J.Bacteriol.,185:7053-7067(2003).
15.Yang,C.,Hua,Q.,&Shimizu,K.MetabolicfluxanalysisinSynechocystisusingisotopedistributionfrom13C-labeledglucose.Metab.Eng.,4:202-216(2002).