在岗研究生导师情况介绍
所系名称植生生态研究所
性别男
专业名称微生物学
技术职务研究员
行政职务所长专项助理
Mail地址syang@sibs.ac.cn
指导博士
生总数10指导硕士
生总数14已毕业学生通讯地址上海市枫林路300号
目前博士
生数2目前硕士
生数4目前在校生邮政编码200032
研究方向酶工程，代谢工程与合成生物学
研究工作理想的催化剂应能将最廉价易得的原料以接近理论转化率的水平高速地转变为高浓度的所需产品。比如将葡萄糖转化为氨基酸，将木质纤维素水解液中的六碳糖和五碳糖转化为丁醇；将二氧化碳利用光能转化为异戊二烯。实现方法是将原料转化到产品所需的酶编码基因，在一个合适的宿主细胞中协调表达。
我们实验室主要研究重要大宗化学品及其衍生物，生物燃料的重要合成途径（如氨基酸，丁醇，异戊二烯等），以及五碳糖转运与代谢；同时发展和运用合成生物学，系统生物学和代谢工程的新方法；在大肠杆菌、酵母、梭菌与乳酸菌等工业微生物中进行改造，重构与调试；开发和优化基于重组DNA的生物产品及制备过程。
我们实验室采用的主要技术手段是计算机辅助设计，有理设计，进化基因库构建和高通量筛选以及它们的组合运用。
以我们实验室为技术依托的工业生物中心(http://www.cibt.ac.cn)，致力于完善酶工程和代谢工程平台，引进、消化、吸收、集成、创新先进工业生物技术，专注于医药中间体和生物能源的生产技术开发,促进工业生物技术的技术转移与产业化，为产研瓶颈的疏通探索可行的道路和模式。
获奖情况杜邦青年教授奖（DuPontYoungProfessorAward）2006
国务院政府特殊津贴2010
中国科学院院地合作奖科技类先进个人一等奖2010
与袁中一研究员共同主译的《载体固定化酶---原理、应用和设计》获2010年中国石油和化学工业优秀出版物奖(图书奖)一等奖
指导研究
生情况研发研究生苏流利2005年硕士毕业在Eppendorf公司工作；
联合培养硕士生张燕与陈茂林两口子现在青岛，张燕在药检所工作，陈茂林自己办公司；
联合培养博士生郑华宝2005年获第五届全国酶工程学术研讨会优秀青年学术论文奖，现在佛罗里达大学LonnieIngram实验室做博士后；
以上学生在数据库中无正式记录。
博士生王金刚2005年获第五届全国酶工程学术研讨会优秀青年学术论文奖，2007年获地奥奖学金二等奖，2007年12月通过答辩，赴美国GeorgiaInstituteofTechnology从事博士后研究，现在瑞阳制药公司上海研发中心工作。
博士生杨俊杰获第7届全国微生物学暨第3届全国微生物遗传学青年学者学术研讨会论文交流二等奖，2009年获三好学生称号，同年12月通过答辩，目前留实验室工作；
博士生张大龙2011年5月毕业，现在中科院天津工业生物技术研究所工作；
博士生朱丽2011年6月毕业，现在上海来益生物药物开发技术中心工作；
博士生邵丽君获辉瑞奖学金，2011年7月毕业，现从事翻译工作；
博士生孙周通2011年12月28日毕业，现在新加坡南洋理工大学做博士后；
博士生刁刘洋获DAAD-CAS项目资助作为交换学生赴德国合作研究2年；2012年5月16日通过答辩，现留实验室工作；
博士生肖晗2012年5月17日通过答辩，现在美国伊利诺伊大学原野分校赵惠民实验室做博士后；
博士生李键获辉瑞奖学金，2012年5月21日通过答辩，现在诺和诺德中国研发中心工作。
硕士生赵蒙2012年5月底通过答辩，在中科院上海生科院计算生物学研究所工作；
硕士生唐玮2012年7月通过答辩，在金佰利公司工作；
博士生张凝在2012全国博士生学术论坛（发酵工程）上的分会报告获最佳学术创意奖。
在读还有博士生徐晓庶，交换生JuditMaur,硕士生徐舒，江源，刘金乐与王心，共有2名博士生4名硕士生。
有意者请在大三下学期即联系来暑期实习，以便在推免生面试前即相互了解。
个人简介1995年本科毕业于浙江大学化学工程系生物化学工程专业
2000年博士毕业于中国科学院上海生物化学研究所
2000-2002中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所助理研究员
2002-2006中国科学院上海生命科学研究院植物生理生态研究所次生代谢分子调控研究开放实验室副研究员
2002-2007中国微生物学会酶工程专业委员会委员
2006-2008中国科学院上海生命科学研究院植物生理生态研究所分子微生物学开放实验室副主任研究员
2006-2010上海市药学会抗生素专业委员会委员
2006年至今中国科学院上海生命科学研究院湖州工业生物技术中心主任；中国科学院上海生命科学研究院植物生理生态研究所所长专项助理
2007年至今中国微生物学会酶工程专业委员会副主任委员
2008年至今上海工业生物技术研发中心主任；中国科学院合成生物学重点实验室研究员
2010年至今上海市生物工程学会副秘书长
2011年至今中国科学院天津工业生物技术研究所(筹)学术委员会委员
2011年至今工业酶国家工程实验室技术委员会委员
2011年至今中国生物工程学会工业与环境生物技术专业委员会副主任委员
2011年至今中国微生物学会分子微生物学与生物工程专业委员会委员
2011年至今中国科学院研究生院工程硕士(生物工程领域)专业学位教育指导委员会委员
2012年至今《工业微生物》《生物工程学报》编委
近期论文HanXiao,ZhilinLi,YuJiang,YunliuYang,WeihongJiang,YangGu*,ShengYang*(2012)MetabolicengineeringofD-xylosepathwayinClostridiumbeijerinckiitooptimizesolventproductionfromxylosemotherliquid.MetabolicEngineering14:565-578
HanXiao,YangGu,YuanyuanNing,YunliuYang,W.J.Mitchell,WeihongJiang*,ShengYang*(2011)Confirmationandeliminationofxylose-metabolicbottlenecksinglucose-PTS-deficientClostridiumacetobutylicumtorealizesimultaneousutilizationofglucose,xyloseandarabinose.Appl.Environ.Microbiol77:7886-7895
ZhoutongSun,YuanyuanNing,LixiaLiu,YingmiaoLiu,BingbingSun,WeihongJiang,ChenYangandShengYang*(2011)MetabolicengineeringoftheL-phenylalaninepathwayinEscherichiacolifortheproductionofS-orR-mandelicacid.MicrobialCellFactories.10:71HighlyAccessed
ShiyuanHu,HuajunZheng,YangGu,JingboZhao,WeiwenZhang,YunliuYang,ShengyueWang,GuopingZhao,ShengYang*,WeihongJiang*(2011)ComparativegenomicandtranscriptomicanalysisrevealedgeneticcharacteristicsrelatedtosolventformationandxyloseutilizationinClostridiumacetobutylicumEA2018.BMCGenomics12(1):93.
LiZhu,RongshengTao,YiWang,YuJiang,XinLin,YunliuYang,HuabaoZheng,WeihongJiang,ShengYang*(2011)RemovalofL-alaninefromtheproductionofL-2-aminobutyricacidbyintroductionofalanineracemaseandD-aminoacidoxidase.ApplMicrobiolBiotechnol.90:903-910
DalongZhang,FuyunZhu,WenchaoFan,RongshengTao,HongYu,YunliuYang,WeihongJiang,ShengYang*(2011)GraduallyaccumulatingbeneficialmutationstoimprovethethermostabilityofN-carbamoyl-D-aminoacidamidohydrolasebystep-wiseevolution.Appl.Microbiol.Biotechnol.90:1361-1371.
CongREN,YangGU,ShiyuanHU,YanWU,PanWANG,ChenYANG,ShengYANG*,WeihongJIANG*(2010)IdentificationandinactivationofpleiotropicregulatorCcpAtoeliminateglucoserepressionofxyloseutilizationinClostridiumacetobutylicum.MetabolicEngineering12(5):446-454
JianLI,JingboZHAO,MengZHAO,YunliuYANG,WeihongJIANG,ShengYANG*(2010)ScreeningandCharacterizationofButanolTolerantMicroorganisms.LettersinAppliedMicrobiology50:373-9
YangGU,JianLI,LeiZHANG,JunCHEN,LixiaNIU,YunliuYANG,ShengYANG*,WeihongJIANG*(2009)ImprovementofxyloseutilizationinClostridiumacetobutylicumviaexpressionofthetalAgeneencodingtransaldolasefromEscherichiacoli.JournalofBiotechnology143：284-287
YuJIANG,ChongmaoXU,FengDONG,YunliuYANG,WeihongJIANG*,ShengYANG*(2009)Disruptionoftheacetoacetatedecarboxylasegeneinsolvent-producingClostridiumacetobutylicumincreasesthebutanolratio.MetabolicEngineering11:284-91
YangGU,ShiyuanHU,JunCHEN,LijunSHAO,HuiqiHE,YunliuYANG,ShengYANG*,WeihongJIANG*（2009）.AmmoniumacetateenhancessolventproductionbyClostridiumacetobutylicumEA2018usingcassavaasafermentationmedium.JIndMicrobiolBiotechnol,36:1225-1232.
JunjieYANG,WeihongJIANG,ShengYANG*(2009).mazFasacounter-selectablemarkerforunmarkedgeneticmodificationofPichiapastoris.FEMSYeastResearch.9(4):600-9
HongYU,JianLI,DalongZHANG,YunliuYANG,WeihongJIANG,ShengYANG*(2009).ImprovingthethermostabilityofN-carbamyl-D-aminoacidamidohydrolasebyerror-pronePCR.Appl.Microbiol.Biotechnol.82(2):279-85
LijunSHAO,ShiyuanHU,YiYANG,YangGU,JunCHEN,YunliuYANG,WeihongJIANG*,ShengYANG*(2007)TargetedgenedisruptionbyuseofagroupIIintron(targetron)vectorinClostridiumacetobutylicum.CellResearch.17:963-5
HuabaoZHENG,JunCHEN,LiuliSU,YuhuaZHAO,YunliuYANG,ShengYANG*andWeihongJIANG(2007)One-steppurificationandimmobilizationofGL-7-ACAacylasebyaffinityresins.EnzymaticandMicrobialTechnology.41:474-9.
JingangWANG,QingZHANG,HeHUANG,ZhongyiYUAN,DafuDING,ShengYANG*,WeihongJIANG(2007)IncreasingSyntheticPerformanceofPenicillinGAcylasefromBacillusmegateriumbySite-directedMutagenesis.AppliedMicrobiologyandBiotechnology.74:1023-30.
HuabaoZHENG,XiaolanWANG,JunCHEN,KeZHU,YuhuaZHAO,YunliuYANG,ShengYANG*,WeihongJIANG(2006)Expression,purificationandimmobilizationofHis-taggedD-aminoacidoxidaseofTrigonopsisvariabilisinPichiapastoris,AppliedMicrobiologyandBiotechnology,70(6):683-9
TianfanCHENG,MaolinCHEN,HuabaoZHENG,JingangWANG,ShengYANG*,WeihongJIANG(2006)ExpressionandPurificationofPenicillinGAcylaseEnzymesfromFourDifferentMicro-organisms,andaComparativeEvaluationofTheirSynthesis/HydrolysisRatiosforCephalexin.ProteinExpressionandPurification,46,107-13
YuXIA,WeiCHEN,ShengYANG*,XiaoyanFU,HaoZHANG*,XiaolinDING(2005)Constructionofanintegrativefood-gradeexpressionsystemforBacillussubtilis.FoodResearchInternational.38(3),251-6
LiPENG,ZhinanXU*,XiangmingFANG,FangWANG,ShengYANG*,PeilinCEN(2004)Preferentialcodonsenhancingtheexpressionlevelofhumanβ-defensin-2inrecombinantEscherichiacoli.ProteinandPeptideLetters11(4),339-44
ZhengZHOU,AihuiZHANG,JingruWANG,MaolinCHEN,RenbaoLI,ShengYANG*,ZhongyiYUAN*(2003)ImprovingthespecificsyntheticactivityofapenicillinGacylaseusingDNAfamilyshuffling.ACTABIOCHIMICAetBIOPHYSICASINICA35(6):573-9
