在岗研究生导师情况介绍
所系名称植生生态研究所
性别男
专业名称遗传学
技术职务研究员
行政职务无
Mail地址pengzhang01@sibs.ac.cn
指导博士
生总数4指导硕士
生总数2已毕业学生通讯地址上海市枫林路300号
目前博士
生数4目前硕士
生数2目前在校生邮政编码200032
研究方向结构生物学
研究工作通过对蛋白质/复合物结构的解析,同时利用生物化学、生物物理学、遗传学等手段阐述蛋白发挥功能的分子机制。研究内容主要包括:
(1)跨膜转运蛋白的结构与转运机制研究
ABC/ECF转运蛋白是很多营养成分及矿物质跨膜转运的载体,它广泛存在于各种生物体中。ABC转运蛋白通常由两种跨膜蛋白(Transmembranedomain,TMD)以及胞内的ATP结合蛋白(ATPBindingCassette,ABC)组成。整个过程利用分解ATP产生的能量,驱动跨膜蛋白发生构像变化,完成物质的跨膜转运。ECF转运蛋白属于一类新的ABC转运蛋白,在结构上包括细胞膜上底物特异性结合蛋白S、以及由膜结合蛋白T、胞内ATP结合蛋白A/A’形成的能量耦合模块组成。根据能量耦合模块的使用情况,将ECF转运蛋白分成耦合模块专有型和共享型两类。我们拟通过解析微生物中不同S蛋白和不同状态转运复合体的结构及相关功能分析,阐释ECF转运蛋白对底物特异性识别以及跨膜转运的分子机制。同时,我们也在开展与植物体中同源的其他跨膜转运蛋白的结构与功能研究。
(2)植物次生代谢与激素调控过程蛋白质的结构与功能研究
植物次生代谢是植物进化过程中与环境相互作用的结果,一些次生代谢产物或衍生物在植物体生长发育过程中发挥着非常重要的作用,如脱落酸、独脚金内酯可作为激素,而叶绿素则参与光合作用过程;有些次生代谢产物则可作为药物、香料与食品的营养成分。我们实验室另一研究方向是通过解析参与植物次生代谢以及激素调控过程的蛋白质与底物以及蛋白质复合体的三维结构,阐释特定代谢物(如激素、叶绿素、类胡萝卜素等)合成与分解的机制,代谢物作为植物体内信号分子发挥特定生理功能的作用机理。
获奖情况2007年中科院院长奖学金
2011年上海市“浦江”人才
2012年上海生科院“S”类人才
指导研究
生情况无
个人简介1998.9-2002.7本科山东大学生物化学与分子生物学系
2002.9-2007.7博士中科院生物化学与细胞生物学研究所
2007.7-2008.1研究助理中科院生物化学与细胞生物学研究所
2008.2-2010.10博士后普林斯顿大学分子生物学系
2010.10-现在研究员中科院上海生科院植物生理生态研究所
近期论文(*Correspondence)
1.XuK#,ZhangMH#,ZhaoQ#,YuF#,GuoH,WangCY,HeFY,DingJP,ZhangP*.CrystalstructureofafolateECFtransporter.Nature.(2013.doi:10.1038/nature12046inpress).
2.LiJX#,FangX#,ZhaoQ,RuanJX,YangCQ,WangLJ,David.JMiller,Juan.AFaraldos,Rudolf.KAllemann,ChenXY*,ZhangP*.RationalengineeringplasticityresiduesofsesquiterpenesynthasesfromArtemisiaannua:productspecificityandcatalyticefficiency.BiochemJ.2013.doi:10.1042/BJ20130041.
3.ZhangP,WangJWandShiY.StructureandmechanismoftheScomponentofabacterialECFtransporter.Nature.2010;468:717-720.
4.LiY,DuJ,ZhangP,DingJ.CrystalstructureofhumancopperhomeostasisproteinCutCrevealsapotentialcopper-bindingsite.JStructBiol.2010;169:399-405.
5.ZhangP#,MaJ#,ZhangZ,ZhaM,XuH,ZhaoG,DingJ.MolecularbasisoftheinhibitorselectivityandinsightsintothefeedbackinhibitionmechanismofcitramalatesynthasefromLeptospirainterrogans.BiochemJ.2009;421:133-43.
6.SunB,HongJ,ZhangP,DongX,ShenX,LinD,DingJ.MolecularbasisoftheinteractionofSaccharomycescerevisiaeEaf3chromodomainwithmethylatedH3K36.JBiolChem.2008;283:36504-12.
7.MaJ#,ZhangP#,ZhangZ.L.,ZhaM.W,HaiXu,ZhaoG..P,andDingJ.MolecularbasisofthesubstratespecificityandthecatalyticmechanismofcitramalatesynthasefromLeptospirainterrogans.BiochemJ.2008;415:45-56.
8.ZhangP,ZhaoJ,WangB,DuJ,LuY,ChenJandDing,J.TheMRGdomainofhumanMRG15usesashallowhydrophobicpockettointeractwiththeN-terminalregionofPAM14.ProteinSci.2006;15:2423-34.
9.ZhangP#,DuJ#,SunB,DongX,XuG.,ZhouJ,HuangQ,LiuQ,HaoQandDingJ.StructureofhumanMRG15chromodomainanditsbindingtoLys36-methylatedhistoneH3.NucleicAcidsRes.2006;34:6621-8.