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上海生命科学研究院在岗研究生导师简介-秦樾

上海生命科学研究院 免费考研网/2013-05-07

中国科学院上海生命科学研究院
在岗研究生导师情况介绍
 姓名秦樾
所系名称健康科学研究所
性别
专业名称生物化学与分子生物学
技术职务研究员
行政职务研究组组长
Mail地址e_mcchin@yahoo.com
指导博士
生总数
8指导硕士
生总数
6已毕业学生通讯地址上海市重庆南路225号
目前博士
生数
3目前硕士
生数
4目前在校生邮政编码200025
研究方向干细胞与肿瘤信号转导
研究工作我实验室主要开展有关肿瘤与炎症免疫相关性的研究,重点关注肿瘤转移干细胞中,信号转导的表观遗传变化(信号蛋白质译后修饰,如乙酰化和甲基化)。我实验室首次证实了表观遗传变化在细胞生长因子受体(e.g.,IFNaR,PRLR)和信号转导蛋白(e.g.,STAT,IRF)中所起的激活作用。
酪丝磷酸化(酪氨酸、丝氨酸磷酸化)长久以来被认为在信号转导中发挥着主要作用。STAT和IRF是细胞内的信号转导及转录因子,能转导多种细胞因子受体的信号并调节基因表达。在细胞因子刺激下,STAT家族的成员在C-端区的发生酪丝磷酸化,酪丝磷酸化后的STAT形成二聚体并进入核内与DNA结合启动基因转录。我们发现在干扰素激活下的STAT3C-端区和IRF9N-端区发生乙酰化.STAT3C-端区乙酰化促进STAT3二聚体形成。在OSM刺激下,乙酰化STAT3二聚体形成促进细胞生长相关基因的转录和细胞生长。干扰素具有广谱抗病毒、抗肿瘤和免疫调节功能。Ⅰ型干扰素的受体2(IFNaR2)胞内区含有5个赖氨酸残基。其中,K399片段和组蛋白H3的“RKS”片段相同。IFNaR2的“RKS”片段乙酰化诱导了IRF9N-端区乙酰化。乙酰化的IRF9和乙酰化的STAT2,乙酰化的STAT1形成有活性的乙酰化聚合体。乙酰化在促使蛋白-蛋白间相互作用的过程中,发挥了酪丝磷酸化不一样的作用。相关研究工作发表在PNAS,Science和Cell上。
信号转导的过程是对立,互根,消长,和转化的。目前我们正在研究在肿瘤转移干细胞中,细胞生长因子受体与STAT成员在信号转导的调控中的不同的乙酰化、甲基化译后修饰。乙酰化与去乙酰化、甲基化与去甲基化等这样的动态平衡过程在细胞分化、发育以及稳态维持的作用。一旦这样的对立和转化遭到破坏就会影响细胞的正常生理功能。我们主要关注细胞环境变化所引起的乙酰化、甲基化级联反应在细胞从正常状态到发生炎症及肿瘤中的作用;细胞因子受体和STAT介导的炎症信号是怎样使细胞转化的;是否恢复STAT的乙酰化/甲基化与去乙酰化/去甲基化的动态平衡就可以抑制癌细胞的转移。
具体研究方向和内容主要包括:
1.去乙酰化去甲基化双重作用的新型赖氨酸修饰酶的研究.
2.Stemcell跨膜蛋白受体及胞内信号蛋白乙酰化和甲基化功能的研究.
3.细胞受体-STAT信号转导的蛋白质译后修饰的肿瘤转移研究.
4.肿瘤转移干细胞中的乙酰化调控.正常细胞和肿瘤细胞的对立,互根,消长,和转化的研究.
获奖情况1996-1998NIH博士后奖学金
2001,2002美国布朗大学医学院院长教学优秀奖
2008布朗大学GraduArtiumMagistriAdEundem荣誉学位

指导研究
生情况

指导博士生8人,硕士生6人.
个人简介1994-1998美国耶鲁大学医学院博士后
1998-2004美国布朗大学医学院助理教授
2004-至今美国布朗大学医学院副教授
2010-至今中国科学院上海生命科学研究院/上海交通大学医学院健康科学研究所研究员


近期论文MaL,GaoJS,GuanYJ,ShiXY,ZhangH,AyrapetovM,ZhangZZ,XuL,HyunYM,KimM,ZhuangS,andChinYE.(2010)Acetylationmodulatescytokinereceptordimerization.PNAS.

PangM,KothapallyJ,MaoH,TolbertE,PonnusamyM,ChinYE,ZhuangS.(2009)InhibitionofHistoneDeacetylaseActivityAttenuatesRenalFibroblastActivationandInterstitialFibrosisinObstructiveNephropathy.AmJPhysiolRenalPhysiol.297(4):F996-F1005.

SunY,ChinYE,WeisigerE,MalterC,TawaraI,ToubaiT,GatzaE,MascagniP,DinarelloCA,ReddyP.(2009)Cuttingedge:NegativeregulationofdendriticcellsthroughacetylationofthenonhistoneproteinSTAT-3.JImmunol.182,5899-5903.

SunZ,ChinYE,ZhangDD.(2009)AcetylationofNrf2byp300/CBPaugmentspromoter-specificDNAbindingofNrf2duringtheantioxidantresponse.MolCellBiol.29,2658-2672.

ZhangZ,XingJ,MaL,GongR,ChinYE,ZhuangS.(2009)Transglutaminase-1regulatesrenalepithelialcellproliferationthroughactivationofStat-3.JBiolChem.284,3345-3353.

MorinNA,OakesPW,HyunYM,LeeD,ChinYE,KingMR,SpringerTA,ShimaokaM,TangJX,ReichnerJS,KimM.(2008)NonmusclemyosinheavychainIIAmediatesintegrinLFA-1de-adhesionduringTlymphocytemigration.JExpMed.205,195-205.

XuC,XieJ,KohlerN,EdwardG,WalshEG,ChinYE,andSunS.(2008)Monodispersemagnetite(Fe3O4)nanoparticlescoupledwithnuclearlocalizationsignal(NLS)peptideforcellnucleartargeting.ChemAsianJ.3,548-552.

XuC,XieJ,HoD,WangC,KohlerN,WalshEG,MorganJR,ChinYE,andSunS.(2008)Au-Fe3O4dumbbellnanoparticlesasdualfunctionalprobes.AngewChemIntEdEngl.47,173-176.

SiJ,FuX,BeharJ,WandsJ,BeerDG,LambethD,ChinYE,andCaoW.(2008)STAT5mediatesplatelet-activatingfactor(PAF)-inducedNADPHoxidaseNOX5-SexpressioninBarrett’sesophagealadenocarcinomacells.AmJPhysiolGastrointestLiverPhysiol.294,G174-183.

TangX,GaoJS,GuanYJ,McLaneK,RamaratnamB,andChinYE.(2007)Acetylation-dependentsignaltransductionfortypeIinterferonreceptor.Cell.131,93-105.

DarnowskiJ,CousensLP,GuanYJ,ChatterjeeD,GouletteFA,andChinYE.(2006)STAT3proteindemolitionbycaspases:cellularandfunctionalanalysis.JBiolChem.281,17707-17717.

ChungAS,GuanYJ,YuanZL,AlbinaJE,andChinYE.(2005)AnkyrinrepeatandSOCSbox3(ASB3)mediatesubiquitinationanddegradationoftumornecrosisfactorreceptorII.MolCellBiol.25,4716-4726.

YuanZL,GuanAY,ChatterjeeD,andChinYE.(2005)STAT3dimerizationregulatedbyreversibleacetylationofasinglelysineresiduewithinSTAT3Cterminalregion.Science.307,269-273.

IvanovSS,ChungAS,YuanZL,GuanAY,SachsKV,ReichnerJ,andChinYE.(2004)Antibodiesimmobilizedasarraystoprofileproteinpost-translationalmodificationsinmammaliancells.MolCellProteomics.3,705-714.

GaoQ,HuaJ,KumuriR,HeaddJJ,FuXY,andChinYE.(2004)IdentificationofSTAT’slinker-SH2domainastheSH2domainoriginusingtwodimensionalstructuralanalysis.MolCellProteomics.3,510-521.

KimS.,KogaT.,IsobeM.,KernBE,YokochiT,ChinYE,KarsentyG,TaniguchiT,andTakayanagiH.(2003)Stat1functionsasacytoplasmicattenuatorofRunx2inthetranscriptionalprogramofosteoblastdifferentiation.GenesDev.17,1979-1991.

WuT,HongKY,WangXD,LingML,DragoiAM,ChungAS,CampbellA,FengGS,andChinYE.(2002)SHP-2isadual-specificityphosphatasetodephosphorylateStat1atbothtyrosineandserineresiduesinnuclei.JBiolChem.277,47572-47580.

XiaL,WangL,ChungAS,IvanovSS,LingMY,DragoiAM,PlattA.,GilmerTM,FuXY,andChinYE.(2002)IdentificationofboththepositiveandnegativemotifsforSTATactivationwithinEGFRcytoplasmicdomain.JBiolChem.277,30716-30723.

WangYJ,WuTR,CaiSY,WeltT,andChinYE.(2000)Stat1asacomponentofTNFalphareceptor1-TRADDsignalingcomplextoinhibitNF-κBactivation.MolCellBiol.20,4505-4512.

LiuXD,QuinnAM,ChinYE,andFuXY.(1999)STATgenesdiscoveredinC.Elegans.Science.285,167-168.

WelteT,LeitenbergD,DittelBN,ChinYE,BothwellAL,JanewayCAJr.,andFuXY.(1999)STAT5activationisessentialforTCRregulationofgeneexpressioninTcells.Science.283,222-225.

IwamotoY,ChinYE,PengXB,andFuXY.(1998)IdentificationandcharacterizationofanEGFreceptorassociatedSTATinhibitor.JBiolChem.273,18198-18204.

JiangT,ChinYE,andTongT.(1998)ScreeningtyrosinekinaseinhibitorsforselectivelyinhibitionofEGFRinbreastcancercelllines.ChinJBiochemMolBiol.14,314-317.

ChinYE,KitagawaM,KuidaK,FlavellRA,andFuXY.(1997)ActivationofSTATsignalingpathwaycancauseexpressionofCaspase1andapoptosis.MolCellBiol.17,5328-5337.

ChinYE,KitagawaM,SuWC,YouZH,IwamotoY,andFuXY.(1996)Cellgrowtharrestandinductionofcyclin-dependentkinaseinhibitorp21WAF1/CIP1mediatedbySTAT1.Science.272,719-722.

ChinYE,SnowET,andChristieNT.(1994)ThestimulatoryeffectsofnickelchlorideonDNAreplicationinHeLacellsandE.coli.Carcinogenesis.15,1013-1016.

ChinYE,SnowET,CohenMD,andChristieNT.(1994)Theeffectsofdivalentnickel(Ni2+)onDNAreplicationinvitrobyDNApolymeraseα.CancerRes.54,2337-2341.

ChinYE,SnowET,andChristieNT.(1994)AsinglestrandedDNAbindingproteinisolatedfromHeLacellsfacilitatesNi2+activationofDNApolymerasesinvitro.Biochemistry.33,15141-15148.
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