在岗研究生导师情况介绍
所系名称计算生物学研究所
性别男
专业名称计算生物学
技术职务研究员
行政职务无
Mail地址mosig@sibs.ac.cn
指导博士
生总数0指导硕士
生总数0已毕业学生通讯地址上海市岳阳路320号计算生物学研究所
目前博士
生数4目前硕士
生数2目前在校生邮政编码200031
研究方向计算生物学,比较基因组学,拓扑学。
研究工作研究领域主要包括生物学数据分析的模式识别算法,深入研究了从调控DNA序列中发掘前调控模块的算法及其复杂度。另外,还提出了一个从基因组中(包括部分非编码RNA)提取模式片段的高效搜索算法。目前的研究方向为数据分析方法在拓扑蛋白质组学中的应用;根据MELK技术产生的图像数据,研究相关的分割和比对算法。
生物数据分析中的模式识别算法
前调控模块研究
拓扑蛋白质组学中的分割和比对方法
获奖情况
指导研究
生情况
3
个人简介
1995.9—2001.5德国波恩大学计算机系硕士
1998.7—1998.10德国波恩Iquena公司软件开发者
1997.4—2003.12德国波恩大学计算机系研究助理
2001.9—2004.2德国波恩大学计算机系博士
2004.4—2005.9德国莱比锡大学计算机系博士后
2005.10--中科院-马普学会计算生物学伙伴研究所
近期论文
selectedpiblications
[1]DavidDamm,ChaofengWang,XunbinWei,AxelMosig.CellCountingforinvivoFlowCytometerSignalsusingWavelet-basedDynamicPeakPicking.Proc.2ndInternationalConferenceonBioMedicalEngineeringandInformatics,2009.,
[2]AndreasR.Gruber,DorotaKoper-Emde,ManjaMarz,HakimTafer,StephanBernhart,GregorObernosterer,AxelMosig,IvoL.Hofacker,PeterF.StadlerandBernd-JoachimBenecke.Invertebrate7SKsnRNAs.JournalofMolecularEvolution,,2008,66(2):107-115
[3]MingyiXie,AxelMosig,XiaodongQi,YangLi,PeterF.StadlerandJulianJ.-L.Chen.StructureandFunctionoftheSmallestVertebrateTelomeraseRNAfromTeleostFish.JournalofBiologicalChemistry,,2008,283(4):2049-2059
[4]AndreasR.Gruber,CarstenKilgus,AxelMosig,IvoL.Hofacker,WolfgangHennigandPeterF.Stadler.Arthropod7SKRNA.MolecularBiologyandEvolution,,2008,25(9):1923-1930
[5]AxelMosig,LiangZhu,PeterF.Stadler.CustomizedStrategiesforHomology-BasedncRNAGeneAnnotation.BriefingsinFunctionalGenomics,8:451-460,2009
[6]AthanasiusF.Bompf¨unewerer,ChristophFlamm,ClaudiaFried,GuidoFritzsch,IvoL.Hofacker,J¨orgLehmann,KristinMissal,AxelMosig,BettinaM¨uller,SonjaJ.Prohaska,B¨arbelM.R.Stadler,PeterF.Stadler,AndreaTanzer,StefanWashietl,andChristinaWitwer.Evolutionarypatternsofnon-codingrnas.Th.Biosci.,123:301–369,2005.
[7]M.ClausenandA.Mosig.Approximatelymatchingpolygonalcurveswithrespecttothefrechetdistance.InProc.19thEurop.Worksh.Comp.Geom.,Bonn,2003.
[8]A.Mosig.Algorithmenunddatenstrukturenzureffizientenkonstellationssuche.Master’sthesis,UniversityofBonn,2001.
[9]A.Mosig.Matchingpolygonalcurvesusinggrouptheory.InPosterpresentedattheNATOAdvancedStudyonComputationalNoncommutativeAlgebraandApplications,2003.
[10]A.Mosig.EfficientAlgorithmsforShapeandPatternMatching.PhDthesis,UniversityofBonn,2004.
[11]A.MosigandM.Clausen.Approximatelymatchingpolygonalcurveswithrespecttothefrechetdistance.ComputationalGeometry:TheoryandApplications,2004.inPress.
[12]A.Mosig,K.Sameith,andP.Stadler.fragrep:Efficientsearchforfragmentedpatternsingenomicsequences.Submitted.,2005.
[13]SonjaJ.Prohaska,AxelMosig,andPeterF.Stadler.Regulatorysignalsingenomicsequences.2005.submitted.