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上海生命科学研究院在岗研究生导师简介-李海鹏

上海生命科学研究院 免费考研网/2013-05-07

中国科学院上海生命科学研究院
在岗研究生导师情况介绍
 姓名李海鹏
所系名称计算生物学研究所
性别
专业名称计算生物学
技术职务研究员
行政职务
Mail地址lihaipeng@picb.ac.cn
指导博士
生总数
0指导硕士
生总数
0已毕业学生通讯地址上海市岳阳路320号计算生物学研究所
目前博士
生数
2目前硕士
生数
2目前在校生邮政编码200031
研究方向进化基因组学,群体遗传学
研究工作进化基因组学实验室(LaboratoryofEvolutionaryGenomics)致力于以下两个方面的研究:
研究方向:进化基因组学
1.检测模式生物(人、果蝇、小鼠、拟南芥)基因组内曾经被自然选择影响过的基因。
2.人类大脑发育相关基因的进化研究,尤其是对基因调控区的研究。
研究方向:群体遗传学、生物信息学
1.理论群体遗传学,包括进化理论的假设检验、群体的遗传结构研究。
2.生物信息学。

获奖情况
指导研究
生情况


个人简介
1992–1996山东大学本科
1996–2002中国科学院昆明动物研究所(博士生,导师:张亚平)
2000–2002美国德克萨斯大学人类遗传学研究中心(交换学生,导师:Yun-XinFu)
2002–2003美国德克萨斯大学人类遗传学研究中心(ResearchFellow)
2003–2006德国慕尼黑大学生物学系(科学工作者)
2006–2007德国科隆大学遗传学系(科学工作者)
2007–中科院-马普学会计算生物学伙伴研究所(研究员)
近期论文SelectedPublications:

LIHaipeng(2010).Anewtestfordetectingrecentpositiveselectionthatisfreefromtheconfoundingimpactsofdemography.MolBiolEvol

LINKao,LIHaipeng,SCHLÖTTERERChristian,FUTSCHIKAndreas(2010).Distinguishingpositiveselectionfromneutralevolution:boostingtheperformanceofsummarystatistics.Genetics187:1.

LINKao,QIANZiliang,LULin,LULingyi,LAILihui,GUJieyi,ZENGZhenbing,LIHaipeng,CAIYudong(2009).PredictingmiRNA'stargetfromprimarystructurebythenearestneighboralgorithm.MolDivers14:719-729.

LULingyi,QIANZiliang,SHIXiaohe,LIHaipeng,CAIYudong,LIYixue(2009).Aknowledge-basedmethodtopredictthecooperativerelationshipbetweentranscriptionfactors.MolDivers14:815-819.

XUHuijun,LIJunrui,LIHaipeng(2009).Applicationofdifferentialequationtotheevolutionoftwogroups.ZoologicalResearch30:11-16.

LINKao,LIHaipeng(2009).Advancesindetectingpositiveselectionongenome.Hereditas(Beijing)31:896-902.
LULin,SHIXiaohe,LISujun,XIEZhiqun,FENGYongli,LUWencong,LIYixue,LIHaipeng,CAIYudong(2009).Proteinsumoylationsitespredictionbasedontwo-stagefeatureselection.MolDivers14:81-86.

ZHANGWen,CAIWangwei,ZHOUWeiping,LIHaipeng,LILiang,YANWei,DENGQinkai,ZHANGYaping,FUYunxin,XUXiangmin(2008).Evidenceofgeneconversionintheevolutionaryprocessofthecodon41/42(-CTTT)mutationcausingβ-ThalassemiainSouthernChina.JMolEvol66:436-445.

S.Hutter,H.Li,S.Beisswanger,D.DeLorenzo,W.Stephan.2007.AscanofautosomalsequencevariationinD.melanogaster.Genetics(inpress).

H.Li,W.Stephan.2006.InferringthedemographichistoryandrateofadaptivesubstitutioninDrosophila.PLoSGenet2:e166.DOI:10.1371/journal.pgen.0020166
3.W.Stephan,H.Li.2006.TherecentdemographicandadaptivehistoryofDrosophilamelanogaster.Hereditydoi:10.1038/sj.hdy.6800901.

H.Li,W.Stephan.2005.Maximum-likelihoodmethodsfordetectingrecentpositiveselectionandlocalizingtheselectedsiteinthegenome.Genetics171:377-384.

Z.Zhao,H.Li,X.Wu,Y.Zhong,K.Zhang,Y.-P.Zhang,E.Boerwinkle,Y.-X.Fu.2004.ModeratemutationrateintheSARScoronavirusgenomeanditsimplications.BMCEvolutionaryBiology4:21.

H.Li,Y.Zhang,Y.-P.Zhang,Y.-X.Fu.2003.NeutralitytestsusingDNApolymorphismfrommultiplesamples.Genetics163:1147-1151.

H.Li,S.-J.Meng,Z.-M.Men,Y.-X.Fu,Y.-P.Zhang.2003.Geneticdiversityandpopulationhistoryofgoldenmonkeys(Rhinopithecusroxellana).Genetics164:269-275.

Y.C.Ding,S.Wooding,H.C.Harpending,H.C.Chi,H.Li,Y.-X.Fu,J.F.Pang,Y.G.Yao,J.G.Yu,R.Moyzis,Y.-P.Zhang.2000.PopulationstructureandhistoryinEastAsia.ProcNatlAcadSciUSA97:14003-14006.
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