在岗研究生导师情况介绍
所系名称计算生物学研究所
性别男
专业名称计算生物学
技术职务研究员
行政职务无
Mail地址yangjin@picb.ac.cn
指导博士
生总数0指导硕士
生总数0已毕业学生通讯地址上海市岳阳路320号计算生物学研究所
目前博士
生数4目前硕士
生数2目前在校生邮政编码200031
研究方向信号传递与生物系统
研究工作研究方向:信号传递与生物系统
1.Computationalsystemsbiologyforimmunesystems
2.Theoreticalandcomputationalapproachestosignaltransduction
3.Single-moleculekinetics
获奖情况
指导研究
生情况
个人简介
88–92重庆大学电气工程本科
95–98中国科技大学生物物理硕士
98–2004美国莱斯大学生物工程博士生
99–2000美国贝勒医学院神经解刨系研究助理
04–2007美国洛斯阿拉莫斯国家试验室理论生物与生物物理组博士后
04–2007美国进化与理论免疫学中心博士后
2007–中科院-马普学会计算生物学伙伴研究所研究员
近期论文SelectedPublications:
JinYang,XinMeng,WilliamS.Hlavacek.Rule-basedModelingandSimulationofBiochemicalSystemswithMolecularFiniteAutomata.IETSystBiol,4(6):453-466
J.Yang,WSHalvacek,.Rejection-freerule-basedkineticMonteCarlosimulationofmultivalentligand-receptorinteractions.arXiv:0812.4619v5,2009,
JinYang,MichaelI.Monine,JamesR.FaederandWilliamS.Hlavacek.KineticMonteCarloMethodforRule-basedModelingofBiochemicalNetworks.PhysicalReview.E,Statistical,Nonlinear,andSoftMatterPhysics，,2008,78(3Pt1):031910
EmiShudo,J.Yang,AkihikoYoshimura,andYohIwasa.RobustnessofthesignaltransductionsystemofthemammalianJAK/STATpathwayanddimerizationsteps.J.Theor.Biol.246,1,2007
M.L.Blinov,J.Yang,J.R.,Faeder,andW.S.Hlavacek.Graphtheoryforrule-basedmodelingofbiochemicalnetworks.Trans.Comput.Sys.Biol.LNCS4230,89,2006
J.Yang,W.J.Bruno,W.S.Hlavacek,andJ.E.Pearson.Onimposingdetailedbalancetocomplexreactionnetworks,BiophysJ.91:1136,2006
M.L.Blinov,J.Yang,J.R.FaederandW.S.Hlavacek.Depictingsignalingcascades,NatureBiotechnology.24.,137,2006
J.Yang,J.W.Clark,R.M.Bryan,andC.S.Robertson.Mathematicalmodelingofthenitricoxide/cGMPpathwaysinthevascularsmoothmusclecell,AmJPhysiolHeartCircPhysiol,289(2),H886,2005
M.L.Blinov,J.R.Faeder,J.Yang,B.Goldstein,andW.S.Hlavacek.“On-the-fly”or“Generatefirst”modeling,NatureBiotechnology.23,1344,2005
W.J.Bruno,J.Yang,J.E.Pearson.Usingthenumberofindependentopen-to-closedtransitionstosimplifytheidentificationofmodelsforionchannelgatingkinetics.ProcNatlAcadSci,U.S.A.,102(18),6326,2005
J.Yang,J.W.Clark,R.M.Bryan,andC.S.Robertson.Themyogenicresponseinisolatedratcerebrovasculararteries:smoothmusclecellmodel,MedEngPhys,25(8),691,2003.Modelavailableat:http://www.cellml.org/models/yang_clark_bryan_robertson_2003_version01
J.Yang,J.W.Clark,R.M.Bryan,andC.S.Robertson.Themyogenicresponseinisolatedratcerebrovasculararteries:vesselmodel,MedEngPhys,25(8),711,2003
