上海中医药大学中药研究所，是以上海中医药大学和上海市中医药研究院为依托，致力于中药现代化研究的科研机构。1992年，胡之璧院士在全国率先创立了“中药生物工程研究室”，为中药研究所的成立和发展奠定第一块基石。春华十载多秋实，中药研究所已发展成为一所学科门类齐全、硬件设施先进、人才梯队完善、科研和学术水平在国内具有较强影响力的中药科研单位。

　　中药研究所主要由中药生物工程研究室、中药标准化研究中心、中药复方药理机理研究室组成，所在的中药学科属于教育部重点学科、国家中医药管理局重点学科、上海市（重中之重）重点学科，拥有中药标准化教育部重点实验室、国家中医药管理局中药生物工程重点实验室、上海市复方中药机理重点实验室等技术平台，涉及中药资源的可持续利用研究、现代生物技术在生产名贵及濒危药材中的应用研究、利用生物工程定向生产中药活性成分研究、中药对照品研究、活性成分与质量标准研究、中药材及中药饮片质量标准研究、中药材国际行业标准研究、中药药性理论研究、中药“毒性”及相关机理研究、中药药效物质基础与作用机理研究等与中药现代化密切相关的基础、应用基础和应用研究领域，先后承担国家自然科学基金、“八五”攻关、“九五”攀登、国家973项目、国家“十五”重大科技专项（863专项）、国家科技部中国APEC科技产业合作基金、国家中医药管理局、上海市科委、上海市教委等资助的重大科研课题四十余项，并荣获国家科学进步二等奖两项、国家中医药管理局中医药科学进步一等奖一项、上海市科技进步一等奖一项、二等奖一项；获得专利授权三项；近年在主要学术期刊上共发表论文五百余篇，其中SCI收载75篇。

　　上海中医药大学入驻张江高科技园区以来，中药研究所在学校的关心和支持下，抓住“融入张江、共铸药谷”的历史机遇，以成立上海市中药标准化研究中心为契机，携手中科院上海药物研究所、上海新药开发研究中心等多家科研机构，与国家新药筛选中心、国家药物安全评价中心、国家中药制药工程中心、南方基因组中心等单位共同构筑中药现代化与现代中药产业化开发的网络群体和技术高地，逐渐成为中药现代化和产业化的高级人才培养基地和国内、国际交流与合作中心。