现任上海音乐学院硕士研究生导师、苏州科技大学兼职教授、上海国乐研究会会长。2012年被授予“上海市非物质文化遗产——江南丝竹传承人”、2015年第五批上海市非物质文化遗产代表性项目“浙派筝艺”负责人。
在53年的古筝教学中培养了千余名古筝专业与业余古筝人才。曾荣获1989年人民音乐主办的ART杯国际器乐比赛与文化部教育司主办的1995全国青少年东方杯比赛的“园丁奖”；多次获得上海音乐学院教学优秀奖；2011年荣获第七届“长三角”地区民乐展演“德艺双馨奖”；2014年12月被上海市非物质文化遗产保护中心授予“特殊贡献奖”；2015年12月荣获中国音乐家协会古筝学会“中国古筝艺术杰出成就奖”；1998年3月入选《世界华人文学艺术界名人录》。
1985年起配合叶栋教授对唐代筝曲曲谱《仁智要录》的解译工作，先后参加了60余首唐代筝曲的曲谱录音。1989年参与组建上海音乐学院古筝乐团。1992年同何宝泉一起率上海音乐学院古筝乐团赴新加坡和马来西亚进行巡回演出。同年与何宝泉一起发起与组织了中国首届古筝考级活动。
孙文妍与何宝泉共同主编与出版了古筝教程七套、其他古筝曲集和名曲演释四册，在人民音乐等刊物上发表古筝与江南丝竹文章三十余篇。
1981年孙文妍开始主持上海业余丝竹团体“上海国乐研究会”并担任会长职务。该会对上海和周边地区的江南丝竹的传承和发展有较高的影响和贡献。