复旦大学药学院（原上海医科大学药学院）创建于1936年，是我国最具影响的5所高等药学院校之一。现为全国医药教育学会药学教育研究会副理事长单位。药学院下设药物化学、天然药物化学、生物合成药物化学、生药学、药剂学、药理学、医院药学、药物分析化学、放射药学、生物化学和物理化学等11个教研室和1个药用化学综合实验室，药学研究所和中国临床药学杂志社各1个，还拥有1个卫生部上海市临床药学培训中心 学院具有药学一级学科博士学位授予权，拥有药学一级学科博士后流动站1个、二级学科博士点5个（药剂学、药物化学、药理学、生药学和生物化学）、二级学科硕士点6个（药剂学、药物化学、药理学、生药学、生物化学和药物分析）。药学一级学科曾被列为上海市“重中之重”建设学科和复旦大学“985”重点建设学科，药物化学也是上海市教委重点学科。药学院与复旦大学生命科学学院联合设立“国家生命科学与技术人才培养基地—生物医药点”。目前，上海市多家医院、制药公司和研究院所已成为药学院学生的实习基地。

药学院现有教职员工108人，其中教授（含研究员、主任技师）25人，副教授（含副研究员、副主任技师）32人，其中：博士生导师19人、硕士生导师34人。药学院教授在药学领域享有较高的知名度，并兼任重要学术职务，如：中国药学会常务理事、上海市药学会副理事长，中国药理学会常务理事、上海市药理学会常务理事、名誉理事长，上海市新药评审专家委员会主任委员，上海市药品不良反应专家委员会主任委员，中国临床药学杂志主编、副主编，药学学报副主编，药学教育副主编，国家自然科学基金委员会、国家食品药品监督管理局等机构的评审专家等。

新中国成立以来，药学院已培养本科生5200余名、专科生1300余名。1978年以来，已培养硕士生440余 名、博士生100余名。本院各类毕业生在药学领域大多已成为业务骨干，其中4名当选为中国科学院和中国工程院院士。现在读各类学生1500余人。平均每年招收研究生60名左右（博士生约20名），每年招收药学专业本科生110名（学制四年），分为药学、药物化学、药理学、药品营销与管理等四个专业方向，由学生通过选修课程自由选择。与生命科学学院联合招收国家生命科学与技术人才培养基地生物技术专业学生40名。为了提高学生的基础知识和整体素质，药学院一年级新生集中在学校复旦学院接受一年文理基础教育，从二年级开始进入药学院接受专业基础和专业教育。药学院接受本校及外校（上海地区）一年级优秀学生转系和转校插班生，并招收国外留学生、进修生和研究生。全部学生实行学分制。成人夜大学每年招收药学专业专科生100名、药学专业专升本学生150名、医药营销与管理专业专升本学生50名，药学专业高中起点本科生100名。治学严谨、基础扎实、动手能力强是药学院教学特色，历届毕业生深受用人单位欢迎。药学院为医药事业创新人才的成长提供了广阔的舞台。药学院也是国家执业药师培训中心之一，承担执业药师继续教育及执业药师考前辅导任务， 继续教育的人次和经辅导后考试通过率均名列国内前茅。教学成果曾获得国家教学成果二等奖、上海市教学成果一等奖和三等奖等，多本教材获得教育部和卫生部优秀教材成果奖。

药学院教师在完成教学任务的同时，积极开展科研工作。曾取得了一大批重大教学和医药科研成果，其中包括：国家科技进步一等奖、国家中医药科技进步一等奖、国家科技进步三等奖。近年来，药物靶向递释系统、抗病毒药物研究为学院新药研究特色领域，在肿瘤、脑、肺、肝、淋巴、脾及结肠等靶向策略及其递释系统、抗乙肝爱滋病病毒药物、抗肿瘤研究等方面开展了重点研究，获得新药证书多项，申请新药发明专利76项（截止2004年底已授权发明专利10项）。在雷公藤多甙、他莫昔芬等10余个新药开发方面，取得了显著的社会和经济效益。获省部级以上奖项有：上海科技博览会金奖和上海市产学研工程一等奖等、上海市科技进步二等奖、上海市发明专利三等奖和上海市医药科技进步二等奖等。 近年来，为改善教师工作条件，学院对实验室和办公室进行了大面积改造，并添置了1700余万元各类仪器设备（其中大型仪器34件/台），有力地支撑了学院研科工作。

复旦大学被教育部列为力争跻身世界百所名校的少数国内高校之一，为药学院进一步发展提供了契机，也吸引了一大批国内外优秀人才的加盟，为药学学科的再次腾飞正在快速积聚人才资源。经教育部和上海市政府批准，复旦大学已经启动了校园拓展规划并开始实施。按学校总体规划，复旦大学张江校区校园配套场馆已于2005年竣工并已投入运行，药学院作为张江校区二期工程并将于2007年入住，届时一个工作用房面积为2.5万平方米的崭新的复旦大学药学院将矗立在上海东方的张江药谷，她将为人类的医药科技事业发展作出更大的贡献。