青年研究员
电话:
邮箱:he_huang@fudan.edu.cn
地址:复旦大学2号交叉学科楼D7023室
个人简介
黄河,主攻基于质谱技术的代谢组学/脂质组学/蛋白组学的方法学研究,2012年获武汉大学化学专业学士学位,2017年获美国Akron大学分析化学博士学位,2017年起在美国哈佛大学医学院进行博士后研究并兼任美国贝斯以色列女执事医学中心(Beth Israel Deaconess Medical Center)质谱分析中心助理研究员,同期担任F1000细胞生物学方向评审助理,2019年7月全职回国任复旦大学代谢与整合生物学研究所青年研究员,并担任单细胞代谢组学与脂质组学平台主管。致力于运用高通量的液相色谱-质谱联用技术建立靶向和非靶向的代谢组学和脂质组学的方法学,同时将代谢组学和脂质组学方法应用于癌症、神经退行性疾病等研究。主要工作包括:基于体外/体内的稳定同位素标记方法建立的新型靶向和非靶向代谢/脂质流组学(Nature Protocols 2019);运用靶向代谢组学方法研究肺腺癌中miR-147调节的三羧酸循环代谢、假性缺氧和EGFR抑制剂药物耐受性的关系(Nature Metabolism 2019);运用非靶向代谢/脂质组学研究富马酸二甲酯对寡树突胶质细胞抗氧化代谢物和脂质代谢调控(Redox Biology 2015)。
主要研究方向
主要研究基于高分辨质谱技术的代谢组学和脂质组学方法学研究。包括靶向/非靶向的代谢组学和脂质组学技术,以及组学数据相关的生物统计学、生物信息学分析。
代表性成果
He Huang, Min Yuan, Phillip Seitzer, Susan Ludwigsen, John M Asara. IsoSearch: An Untargeted and Unbiased Metabolite and Lipid Isotopomer Tracing Strategy from HR-LC-MS/MS Datasets. Methods Protoc. 2020 Jul 30;3(3):54. doi: 10.3390/mps**.
Min Yuan*, Daniel M. Kremer*, He Huang*, Susanne B. Breitkopf, Issam Ben Sahra, Brendan D. Manning, Costas A. Lyssiotis, John M. Asara, Ex Vivo and In Vivo Stable Isotope Labelling of Central Carbon Metabolism and Related Pathways with analysis by LC-MS/MS, Nature Protocols, 2019 Feb;14(2):313-330. doi: 10.1038/s41596-018-0102-x. (*Co-first author)
Wen Cai Zhang, Julie Wells, Kin-Hoe Chow, He Huang, Min Yuan, Tanvi Saxena, Mary Ann Melnick, Katerina Politi, John Asara, Daniel Costa, Carol Bult, Frank Slack, miR-147b-mediated TCA cycle dysfunction and pseudohypoxia initiate drug tolerance to EGFR inhibitors in lung adenocarcinoma, Nature Metabolism, 2019, April (1) 460–474. doi: 10.1038/s42255-019-0052-9.
He Huang, Jun Yang, Mark Luciano, Leah P. Shriver, Longitudinal metabolite profiling of cerebrospinal fluid in normal pressure hydrocephalus links brain metabolism with exercise-induced VEGF production and clinical outcome, Neurochem Res., 2016(7) 1713-22 doi: 10.1007/s11064-016-1887-z.
He Huang, Alexandra Taraboletti, Leah P. Shriver, Dimethyl fumarate modulates antioxidant and lipid metabolism in oligodendrocytes, Redox Biology, 2015 (5) 169-175, doi:10.1016/j.redox.2015.04.011.
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复旦大学代谢与整合生物学研究院导师教师师资介绍简介-黄河
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