主要聚焦于以木质纤维素等生物质为原料，经过预处理和酶水解技术获得可发酵单糖，进而通过先进的发酵和酶催化技术进行单糖的深度生物加工，在获得液体生物燃料、生物基化学品和可降解生物材料的同时，实现生物炼制技术的过程节能、废弃物减排与二氧化碳的固定。主要研究方向为：1. 木质纤维素生物炼制相关的过程工程应用基础研究和工业应用研究；2. 能源微生物的代谢工程改造和超级能源微生物细胞的构建。

近期以第一作者或通讯作者发表的代表性论文：
1.Bioresource Technology (IF 4.98) 2012.118:13-14.
2.Bioresource Technology (IF 4.98) 2012.116:74-79.
3.Biotechnology and Bioengineering (IF 3.95) 2011, 108:1616-1627.
4.Bioresource Technology (IF 4.98) 2011, 102:9705-9709.
5.Bioresource Technology (IF 4.98) 2011, 102:4480-4488.
6.Biotechnology and Bioengineering (IF 3.95) 2010, 105:718-728.
7.Nature Chemical Biology (IF 14.69) 2010, 6:316-318.
8.Biotechnology for Biofuels (IF 6.09) 2010, 3:26.
9.Journal of Biotechnology (IF 3.04) 2010, 148:105-112.
10.Biotechnology and Bioengineering (IF 3.95) 2007, 98:1-11.
11.Biotechnology and Bioengineering (IF 3.95) 2006, 93:572-580.
12.Biotechnology and Bioengineering (IF 3.95) 2005, 89:485-491.
近期以第一作者发表的专著：
1.现代生物能源技术，科学出版社，2009. ISBN 978-7-03-024519-9。