所有研究生均享受学业奖学金，可抵扣全部或部分学费。第一学年的学业奖学金依据入学成绩评定；第二学年以后的学业奖学金依据学业成绩（包括课程成绩、科研表现、学术成果及科技活动、社会工作）评定。
另约有22%的学生能获得其他各类奖学金5000-800元不等。学院还设有“王嘉廉”、“合胜”、“众恒”和“上海计算所”等专项奖学金3000-2000元。
研究生可以申请三助（助教、助研和助管）岗位，月津贴300元左右。在课题研究阶段，导师提供助研经费补助，激励研究生从事科研创新。
对于特困学生，学校帮助提供助学贷款。此外还配备了助学金10000-5000元不等，资助优秀的困难学生完成学业。