计算机科学与技术系设有计算机科学与技术、网络工程和物联网工程三个本科专业。计算机科学与技术专业创建于60年代初，1978年由中科院院士曹建猷教授等主持恢复开办计算机科学及应用专业，1981年首批获得该专业硕士学位授予权，1985年成为铁道部重点学科。现有“计算机科学与技术”一级学科博士学位授权点，“计算机应用技术”四川省重点学科, 以及“交通信息工程及控制”博士后科研流动站。其中“计算机应用技术”在2008-2010年全国研究生教育评价中连续3年获得A级，本专业在全国大学本科教育专业排行A+级。2007年计算机科学与技术专业成为四川省特色专业，2010年成为国家级特色专业建设点。截至2010年为止，本专业培养的学生人数已达2700多人，其中不少优秀毕业生被保送我校及其他985/211高校硕士研究生和直读博士研究生。
　　计算机科学与技术系有一支数量充足、素质优良和结构合理的校级教学团队。共有教职工22人，其中教授5名，副教授9名，讲师5名。教师中大多数具有博士学位，数名具有丰富的各类科技竞赛指导经验。在教学改革与实践中，获得了“以特色专业建设为龙头，全面提高计算机专业人才培养质量”等一批优秀教学成果奖，发表教改文章20余篇，编写出版教材10余本。
　　计算机科学与技术学科是我校“交通信息工程及控制”国家重点学科、国家优势学科创新平台建设项目（特色“985”）、筹建中的“轨道交通国家实验室”等国家级学科和项目的支撑学科之一。历年来承担了国家自然科学基金、国家“863”计划项目、国家科技支撑计划项目、国家“211”工程建设项目、国家优势学科创新平台建设项目和铁道部科技开发项目，以及教育部、四川省、铁道部和企业等的各类科技开发项目100余项。目前，主动适应我国轨道交通的快速发展，在智能化高速列车、数字化铁路、智慧轨道交通、智能信息处理和嵌入式应用等方向积极开展科学研究并承担科研项目，形成了一定的特色和优势。多项科研成果获国家和省、部级奖励，发表学术论文300余篇，发明专利10余项。
　　本专业注重计算机软硬件知识的全面系统学习和应用技能的培养，软硬件并重，软硬件结合，培养学生具有扎实的理论基础、宽广的专业知识和良好的实践技能。本专业已经建成四川省精品课程“计算机原理”、“计算机网络”和“操作系统”，以及校级精品课程“微机与接口技术”和“微机与接口技术实验”。为适应我国轨道交通的快速发展，为客运专线和高速铁路建设，以及磁浮列车和城市轨道交通的发展，输送既具有计算机专业知识，又熟悉轨道交通领域的专业人才，制定了“基础课群”和“专业特色套餐”相结合的课程框架，设有“智能信息处理”、“人机交互与虚拟现实”、“嵌入式应用”、“网络技术”四个专业特色套餐和培养方向，供学生根据自己的兴趣爱好和就业情况进行选修。四个方向均以“高速铁路概论”和“现代铁路信息技术导论”课程为基础，充分体现了信息技术与轨道交通技术的有机结合，具有鲜明的轨道交通特色。
　　本专业在重视知识传授的同时，大力加强学生分析和解决问题能力的培养，注重培养学生创新和实践动手能力。由科研一线的教授以及科研骨干教师，密切结合科研的实际课题，带领博士生、硕士生团队参与本科生创新实践指导。依托“网络通信技术”和“云计算与智能技术”四川省高校重点实验室、“交通信息工程”铁道部重点实验室向本科生开放的举措，以及计算机硬件基础实验中心和计算机网络工程本科专业实验室，开展“国家大学生创新性实验计划项目”、“大学生科研训练计划（SRTP）”、“个性化实验” 等各类、各层次的科研实践和大赛活动，将提高学生的创新能力和实践动手能力贯穿于教学计划的始终，取得了令人瞩目的成绩。2006年本专业教授指导的参赛队，凭借“基于XML的车载富信息平台”获得英特尔杯大学生电子设计竞赛嵌入式系统专题邀请赛最高荣誉奖——“英特尔杯”奖。本专业副教授指导的参赛队2007年获挑战杯机器人大赛全国前4名，2008年获瑞萨超级MCU模型车大赛全国三等奖。2007和2008年本专业学生连续两年在四川省“锐捷杯”网络设计大赛中蝉联第一。2010年在Intel杯全国多核程序设计大赛中获得全国唯一的一等奖。