通信工程系下设通信工程和信息安全两个本科专业。目前，本系学科已涵盖信息与通信工程、交通运输2个一级学科及博士后流动站，通信与信息系统、信息与信号处理、信息安全、交通信息工程及控制4个二级学科及博士学位授权点，通信与信息系统、信息与信号处理、信息安全、密码学硕士、交通信息工程及控制5个二级学科及硕士学位授权点，以及电子与通信工程硕士授权点。现有在站博士后、在读博士生、硕士生与工程硕士200余名，本科生1200余名。本系所在学科获得国家“211”建设和“985”特色平台建设的重点支持，并拥有通信工程实验室和以成都电信局交大分局为实习基地在内的良好的办学条件。本系师资力量雄厚，现有在职教师31人，其中教授16人（博士生导师13人），副教授7人，讲师5人，工程师3人。
　　通信工程本科专业目前为国家级特色专业，四川省品牌专业，在中国大学本科教育专业排行A级。本专业具有“信息与通信工程”一级学科博士授权点，博士后科研流动站，一级学科四川省重点学科，“信息编码与传输”实验室被省科技厅批准为省内唯一的IT类重点实验室。此外，还拥有“移动通信”和“信号与信息处理”省高校重点实验室。
　　信息安全本科专业具有坚实的支撑学科，拥有二级学科“信息安全”博士授权点，“信息安全”、“密码学”硕士授权点，“信息安全与国家计算网格”省高校重点实验室。信息安全本科专业为四川省特色专业。该学科一名博士生论文获2003年度全国百篇优秀博士论文奖，多名博士生获四川省优秀博士论文奖和西南交大优秀博士论文奖。
　　通信工程系注重科研工作，在国内外具有很高的学术声誉。近年来，承担和完成了包括国家重大科技专项、国家杰出青年基金项目、国家自然科学基金项目、国家“863”计划项目、中外国际合作项目、国家科技攻关项目、新世纪人才计划项目、攀登计划项目、铁道部科技研发项目、教育部和四川省以及军事科研项目，以及来自工业界的合作研究课题，在高新技术领域科研成果斐然。获国家级、省部级以上科技进步奖10余项；在国际国内各类学术刊物发表论文数百篇。在移动通信系统、光通信与光器件、通信保密与安全、信号处理及应用、卫星通信等领域取得了大量重要的研究成果。同时，与世界上多所著名大学、企业和研究机构建立起各种协作关系，包括承担研究课题、建立联合实验室、举行学术会议、互派留学生等。
　　目前通信工程和信息安全两个专业的毕业生以其扎实的专业基础知识、良好的专业技能和综合素质，深受用人单位的欢迎，专业发展前景十分广阔。近5年来的就业率一直保持在97%以上，已在通信工程、信息技术、信息安全、电信、交通、航天航海、国防工业和高等教育等领域发挥着重要的骨干作用，学生就业单位包括中国移动、中国联通、中国电信、中兴、华为、大唐、腾讯、高速铁路、城市地铁和快铁、安全部门、计算机和网络企业、铁路局、设计院、工程局等企事业单位，或升入国内外知名高等学府如北京大学、中国邮电大学、东南大学、上海交通大学、电子科技大学、西安电子科技大学和本校攻读硕士或博士研究生学位，毕业后成为国内外出色的学者或领域的专家。