马涛，教授，博士生导师
邮箱：matao.yz [AT] gmail.com
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学习和工作经历
· 2017年至今：四川大学生命科学学院，教授
· 2014 -- 2016：四川大学生命科学学院，副研究员
· 2009 -- 2014：兰州大学生命科学学院，博士学位
· 2005 -- 2009：兰州大学生命科学学院，学士学位

研究方向
以杨柳科植物为主要研究对象，整合植物组学数据（Genome、Regulatome、Epigenome、Transcriptome、scRNA-seq），开展其演化历史和环境适应机制研究，包括以下几个方面:
· 植物性别决定机制、演化历史及其性别二态性
· 关键性状（树木次生生长和抗逆）的分子调控及其动态变化
· 物种的起源和多样化过程
· 基因组重要功能元件（Accessible chromatin regions、Gene、Repetitive elements）和表观修饰（3D organization、histone modification、DNA methylation）在植物发育、抗逆、以及物种分化中的作用


主持和参与的科研项目
· 国家自然科学基金-优秀青年科学基金项目（**），林木进化基因组学，2020.01-2022.12，主持
· 国家自然科学基金-面上项目，**，两个温带-热带分布杨属物种复合体的生物地理学研究，2019.01-2022.12，主持
· 国家自然科学基金-青年科学基金项目，**，胡杨耐盐的表观基因组学研究，2016.01-2018.12，主持
· 国家重点研发计划课题，2016YFD**，林木次生生长的分子调控和环境胁迫机制（课题名称：树木次生生长的基因组学基础），2016.07-2020.12，课题骨干
· 国家自然科学基金委与美国国家科学基金会（NSFC-NSF）生物多样性合作研究项目，，Dimensions合作研究项目：植物性染色体和雌雄异株化多层次驱动生物多样性的整合研究，2016.01-2020.12，课题骨干

获奖情况
· 2019年度四川大学·唐立新优秀****奖
· 2019年四川大学·优秀科技人才奖
· 2018年四川大学·优秀科技人才奖
· 2018年四川大学·学术新人奖

发表的主要文章（第一作者^#；通讯作者^*）
1. Zeyuan Chen^#, Fandi Ai^#, Junlin Zhang, Xinzhi Ma, Wenlu Yang, Weiwei Wang, Yutao Su, Mingcheng Wang, Yongzhi Yang, Kangshan Mao, …, Tao Ma^*. Survival in the Tropics despite isolation, inbreeding and asexual reproduction: insights from the genome of the world’s southernmost poplar (Populus ilicifolia). The Plant Journal, 2020, in press.
2. Zhiyang Zhang^#, Yang Chen^#, Junlin Zhang, Xinzhi Ma, Yiling Li, Mengmeng Li, Deyan Wang, Minghui Kang, Haolin Wu, Yongzhi Yang, …, Tao Ma^*. Improved genome assembly provides new insights into genome evolution in a desert poplar (Populus euphratica). Molecular Ecology Resources, 2020.
3. Mingcheng Wang^#, Lei Zhang^#, Zhiyang Zhang, Mengmeng Li, Deyan Wang, Xu Zhang, Zhenxiang Xi, Ken Keefover-Ring, Lawrence B Smart, Stephen P DiFazio, …, Tao Ma^*. Phylogenomics of the genus Populus reveals extensive interspecific gene flow and balancing selection. New Phytologist, 2020, 225(3): 1370-1382.
4. Jianchao Ma^#, Dongshi Wan^#, Bingbing Duan, Xiaotao Bai, Qiuxian Bai, Ningning Chen, Tao Ma^*. Genome sequence and genetic transformation of a widely distributed and cultivated poplar. Plant biotechnology journal, 2019, 17(2): 451-460.
5. Tao Ma^#, Kun Wang^#, Quanjun Hu^#, Zhenxiang Xi^#, Dongshi Wan, Qian Wang, Jianju Feng, Dechun Jiang, Hamid Ahani, Richard J Abbott, …, Jianquan Liu^*. Ancient polymorphisms and divergence hitchhiking contribute to genomic islands of divergence within a poplar species complex. Proceedings of the National Academy of Sciences, 2018, 115(2): E236-E243.
6. Yongzhi Yang^#, Tao Ma^#, Zefu Wang, Zhiqiang Lu, Ying Li, Chengxin Fu, Xiaoyong Chen, Mingshui Zhao, Matthew S Olson, Jianquan Liu^*. Genomic effects of population collapse in a critically endangered ironwood tree Ostrya rehderiana. Nature Communications 2018, 9(1): 1-9.
7. Yutao Su^#, Xiaotao Bai, Wenlu Yang, Weiwei Wang, Zeyuan Chen, Jianchao Ma, Tao Ma^*. Single-base-resolution methylomes of Populus euphratica reveal the association between DNA methylation and salt stress. Tree Genetics & Genomes, 2018, 14(6): 86.
8. Lei Zhang^#, Zhenxiang Xi, Mingcheng Wang, Xinyi Guo, Tao Ma^*. Plastome phylogeny and lineage diversification of Salicaceae with focus on poplars and willows. Ecology and evolution, 2018, 8(16): 7817-7823.
9. Wenlu Yang^#, Kun Wang, Jian Zhang, Jianchao Ma, Jianquan Liu, Tao Ma^*. The draft genome sequence of a desert tree Populus pruinosa. GigaScience, 2017, 6(9): gix075.
10. Tao Ma^#, Junyi Wang^#, Gongke Zhou^#, Zhen Yue, Quanjun Hu, Yan Chen, Bingbing Liu, Qiang Qiu, Zhuo Wang, Jian Zhang, …, Jianquan Liu^*. Genomic insights into salt adaptation in a desert poplar. Nature communications, 2013, 4(1): 1-9.