个人简历
姓名: 张永清 工学博士，副教授
Email: zhangyq@cuit.edu.cn
科研和研究生招生方向：
1、人工智能与数据挖掘
2、机器学习与生物信息学
个人简介：
张永清博士，副教授，研究生导师。由四川大学和美国加州大学圣地亚哥分校（UCSD, University of California, San Diego）博士联合培养，长期从事机器学习、数据挖掘、生物信息学、脑机接口方面的应用研究。目前在国内外具有影响力期刊和国际会议上发表SCI、EI论文30余篇，申请发明专利5项。高质量期刊包括：Nucleic Acids Research, BMC Bioinformatics, Engineering Applications of Artificial Intelligence, International Journal of Machine Learning and Cybernetics、Chemometrics and Intelligent Laboratory、自动化学报等。主持国家自然科学基金1项、中国博士后面上基金1项、四川省教育厅重点项目1项，参研国家自然科学基金2项、军委科技委基金2项；获得2016年ACM成都分会优秀博士论文奖。目前担任CCF生物信息专业委员会委员、CCF YOCSEF成都分论坛副主席、中国自动化学会智能健康与生物信息专业委员会委员、中国人工智能学会生物信息学与人工生命专业委员会委员、四川省生物信息学会理事会委员，国家基金委项目评审专家，TCBB、NCAA、Briefings in Bioinformatics、IEEE J BIOMED HEALTH、IEEE ACCESS、J BIOINF COMPUT BIOL等期刊审稿人。
目前承担科研项目：
1. 国家自然科学基金青年科学基金项目（**），高通量数据和深度学习在基因调控层次网络构建中的应用研究，2018-2020年，主持。
2. 中国博士后科学基金面上资助（2017M612948），基于膜电压驱动的Spiking神经网络学习算法研究，2017-2018年，主持。
3. 成都信息工程大学中青年学术带头人科研基金（J201706），基于智能计算的基因网络研究，2017-2020年，主持。
目前授课：
“计算机组成原理”，本科生
“人工智能”，本科/研究生

近5年发表论文（*为通讯作者）：
1. Yongqing Zhang, Qingyuan Chen, Dongrui Gao, and Quan Zou*, GRRFNet: Guided Regularized Random Forest-based Gene Regulatory Network Inference Using Data Integration, IEEE BIBM 2020, 132-139.
2. Yuanqi Zeng, Meiqin Gong, Meng Lin, Dongrui Gao, Yongqing Zhang*, A Review about Transcription Factor Binding Sites Prediction Based on Deep Learning, IEEE ACCESS, 2020(8): 219256-219274.
3. Dongrui Gao, Qingyuan Chen, Yuanqi Zeng, Meng Jiang, Yongqing Zhang*, Application of Machine Learning on Drug Target Discovery, Current Drug Metabolism, 2020; 21(10): 790-803.
4. 张永清、卢荣钊、乔少杰*，周激流，一种基于样本空间的类别不平衡数据采样方法，自动化学报，2020(46)11.
5. Yongqing Zhang, Yanjian Rong, Siyu Chen, Meiqin Gong, Dongrui Gao, Min Zhu*, Wei Gan, A Review on the Application of Deep Learning in Bioinformatics, Current Bioinformatics, 2020:15 (8), 898-911.
6. Yongqing Zhang, Shaojie Qiao*, Rongzhao Lu, Nan Han, Dingxiang Liu, Jiliu Zhou, “How to balance the bioinformatics data: pseudo-negative sampling”, BMC Bioinformatics. 20(S25).
7. Yongqing Zhang, Shaojie Qiao*, Shengjie Ji, Yizhou Li, “DeepSite: Bidirectional LSTM and CNN Models for Predicting DNA-protein Binding”, International Journal of Machine Learning and Cybernetics. 11, 841-851(2020).
8. Yongqing Zhang, Shaojie Qiao*, Shengjie Ji, Nan Han, Dingxiang Liu, Jiliu Zhou, “Identification of DNA-Protein Binding Sites by Bootstrap Multiple Convolutional Neural Networks”, Engineering Applications of Artificial Intelligence, Volume 79, March 2019, Pages 58-66.
9. Zhang, Yongqing; Cao, Xiaoyi; Zhong, Sheng*, “GeNemo: a search engine for web-based functional genomic data”, Nucleic Acids Research, 20 April, 2016,44,W122-127.
10. Yongqing Zhang, Tianyu Geng, Malu Zhang, Xi Wu, Jiliu Zhou, Hong Qu*, “An Efficient and Robustness Supervised Learning Algorithm for Spiking Neural Networks”, Sensing and Imaging, (2018)19:8.