天然林培育与管理：研究天然林维持、利用、经营及保护的理论与技术体系；天然林在洪涝灾害防治、生物多样性保护、全球碳平衡等方面的贡献；天然林保护工程综合效益评价；天然林资源可持续经营决策支持系统等。
次生林生态系统生态过程与经营：研究次生林自然干扰过程、结构调控与定向分类；主要类型次生林土壤养分和水分循环；干扰条件下次生林主要建群种生理生态；次生林人为干扰和自然干扰（雪/风灾）后的生物多样性变化；次生林天然更新障碍因子与人工促进天然更新；次生林培育理论与技术；山区森林资源综合利用开发试验示范等。
防护林营造与经营管理：研究防护林优化配置和结构调控；防护林生态系统健康管理理论与技术；防护林近自然更新与低价防护林改造理论与技术；防护林人工生态系统养分循环及其利用效率，森林植被结构组成与水平衡；退化生态生态恢复的生态过程与生态评价。
人工用材林培育：研究用材林为主体的多功能人工林生态经营技术；人工林生态系统结构、功能及生态过程；人工林长期生产力的形成机制；单一树种组成对林地土壤结构、功能和生态过程的影响；人工林土壤有机C、N积累与转化过程等。